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研究G/11家族木聚糖酶特征序列与其最适pH的定量构效关系,建立逐步回归方程,模型的相关系数为0.975,显著水平p<0.000 1.利用该方程,计算各木聚糖酶的pH值,结果表明,仅有2个木聚糖酶的最适合pH计算值与实测值相差大于0.6,而有6个木聚糖酶最适pH计算值与测定值相差小于0.1,平均绝对百分比误差为5.91%,平均绝对误差为0.26个pH单位,所得结果优于用二肽进行逐步回归所得模型的结果.通过对计算结果和已知晶体结构的木聚糖酶的比较发现,在1YNA中,这6个氨基酸分别是Pro,Leu,Val,Val,Val和Tyr,前3个氨基酸残基位于第7个转角处,更适合作为突变的位点. 相似文献
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采用谷氨酰胺来确定氨基酸初始添加浓度,分析各种氨基酸对类弹性蛋白多肽[KV8F-40]产量的影响.结果表明:苏氨酸、精氨酸和半胱氨酸都能较大提高产量,其中以苏氨酸最为明显,产量可达126.9mg·L-1,比对照增加54.0%.利用响应面设计对上述3种氨基酸进行3因素3水平实验,经优化后所得理论最大产量为100.3mg·L-1.经实验验证,所得实验值为103.1mg·L-1,与理论值吻合,但其产量低于单个氨基酸.交互作用分析表明:3种对产量有促进作用的氨基酸之间没有互作或者存在拮抗作用. 相似文献
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针对生物信息处理过程中难于找到相关程序进行序列分析的问题,自行设计一套数据处理软件.经实际应用,软件可用于处理生物数据库Transterm中获得的海量原始数据.文中简介Transterm数据库中所需信息的格式,并说明BYSJ软件的设计目标、实现原理、源代码,以及软件的功能及使用. 相似文献
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通过对孟加拉湾西侧盆地群的板块构造演化、地层层序发育、烃源岩-储层-盖层等石油地质要素开展详细
分析,可知该盆地群先后经历了前裂谷期、裂谷期、后裂谷期等3 个板块构造演化阶段,并在后期随着南亚大陆的整体
向北漂移演变为被动大陆边缘盆地群。根据区域板块演化与地层发育特征,可将该盆地群的地层划分为前裂谷、裂谷
和后裂谷3 套巨层序,在各个巨层序内部能够识别出7 个三级层序、6 套成藏组合。从该被动大陆边缘盆地群的油气
地质特征可知,深层的前裂谷巨层序内部二叠系- 三叠系河道砂岩、裂谷巨层序内部的白垩系河流相、三角洲相河道
砂岩、深水地区后裂谷巨层序内部的被动陆缘盆地中发育的第三系河道、三角洲和深水浊积砂岩是该盆地群下一步主
要勘探目标。 相似文献
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师德建设,是高校树立良好形象、提高师生素质的关键因素,故必须抓住“以人为本”这个核心,促进师德师风建设。通过切实贯彻“以人为本”重要思想,营造良好的校园文化氛围,才能造就思想先进、品德高尚、业务过硬、炎爱学生的高素质教师队伍,才能为国家培养出千千万万合格的社会主义建设者和接班人。 相似文献
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一株好氧反硝化菌的特征及系统进化分析 总被引:14,自引:0,他引:14
从土壤中分离出一株好氧反硝化菌,命名为菌株HN.分离菌株呈革兰氏染色阳性,为球状或杆状,菌落颜色显橙红色.该菌株以硝酸钠为氮源时,进行好氧反硝化作用.能以乙酰胺为唯一碳源和氮源进行生长.它的部分长度16SrDNA序列分析表明,分离菌株HN与Rhodococcus ruber的16SrDNA序列具有99%相似性.实验采用PHYLIP程序对该菌株与报道菌进行系统发育进化分析。 相似文献
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运用Bioedit软件,从已知耐热性能较好的G/11木聚糖酶蛋白序列出发,构建调和序列,获得新型木聚糖酶.首先运用InterProScan得出该序列为G/11家族,再运用MotifScan确定其活性部位,对比G/11木聚糖酶的特征序列确定该酶为木聚糖酶.通过SWISS-MODEL对其三级结构进行预测,了解信号肽长度为27个.运用Protparam Tool对其部分理化性质进行预测,得出其理论等电点为6.82,最适温度为81.72 ℃,高于调和前的任何一条序列.最后,通过选择宿主菌最优密码子获得其基因序列. 相似文献
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通过分子动力组学的方法,从原子尺度上分析4组嗜盐酶及其同源非嗜盐酶的分子动力学特性.结果发现:嗜盐酶所形成的盐桥和氢键明显多于非嗜盐酶,嗜盐酶的溶剂可及性表面要小于非嗜盐酶.通过比较嗜盐与非嗜盐的均方根偏差、回旋半径及末端距等参数,发现嗜盐酶的结构较非嗜盐酶更具刚性.同时,非嗜盐酶多个部位的氨基酸残基柔性比嗜盐酶的要大很多.研究表明:能形成较多的盐桥、氢键,较小的溶剂可及性表面和整体结构的刚性,很可能是嗜盐酶在高盐环境中维持其结构稳定的主要原因. 相似文献
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为研究不同盐类型及浓度对蝌蚪状ELPs40相变特性的影响,探究霍夫曼斯特(Hofmeister)离子序中阴、阳离子对蝌蚪状ELPs40相变温度的影响,通过设计、表达和纯化后,获得由谍标签/捕谍器(SpyTag/SpyCatcher),以及由40个重复的线性类弹性蛋白多肽所形成的2个蝌蚪型结构的ELPs40.结果表明:蝌蚪状ELPs40相变温度比ELPs80相变温度高1.35 ℃;阴离子对蝌蚪状ELPs40相变温度的影响符合Hofmeister离子序现象,但NH4+,K+,Na+等阳离子却发生逆Hofmeister离子序现象;在NaCl,Na2SO4,NaNO3,K2SO4,KCl,KNO3,NH4Cl,NH4NO3,(NH4)2SO4等不同浓度缓冲液中,蝌蚪状ELPs40发生相变所需的温度范围显著高于线性ELPs40,这与其特殊的结构密切相关. 相似文献