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miRNA是一类重要的基因表达调节因子.准确预测miRNA的靶基因对研究miRNA的功能和作用机制至关重要.文中提出一种考虑靶位点可趋近性(accessibility)的miRNA靶基因预测算法.算法首先选择满足种子互补条件的“部分可趋近性”位点;然后用二阶马尔科夫模型计算与miRNA种子区互补的特定核苷酸片段(寡聚体)在3′UTR任意位置上出现的概率并统计“部分可趋近位点”上寡聚体出现的次数;采用过表达水平值评估一个或多个互补位点上至少出现一次寡聚体的概率;最后根据过表达水平值排序miRNA-3UTR对,并取排序的前N个miRNA-3′UTR对作为预测结果.在果蝇和人类数据集上测试的实验结果表明此算法具有较高的灵敏性和精确性. 相似文献
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本文利用明格尔定理,惠特尼定理及文献[1]的结论,对λ(G)=δ(G)=n 的一类图证明了它的棱凝聚度的最小值上界为[n/2].并同时证明了极小 n——连通图棱凝聚度的最小值上界为1. 相似文献
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本文对δ(G)≥[p+1/2]的一类简单连通图棱凝聚度的最小值上界给出进一步的估计,並指出这个最小值如果不是负整数,只能是0,或者是1。 相似文献