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新甲型H1N1流感病毒血凝素基因(HA)突变网络结构 总被引:1,自引:0,他引:1
流感研究上海协作组 何云刚 丁国徽 边超 黄忠 蓝柯 孙兵 王学才 李亦学 王红艳 王小宁 杨忠 钟扬 金维荣 熊慧 戴建新 郭亚军 王皓 车小燕 吴凡 袁政安 张曦 曹志伟 周晓农 周佳海 马志永 童光志 赵国屏 金力 《科学通报》2009,54(12):1645-1647
构建了新甲型H1N1流感病毒血凝素基因的变异网络图. 同源性比对表明, 来自墨西哥的一个病毒序列类型为此次新流感病毒的原始序列类型. 通过血凝素基因658A和1408T突变可将此新流感病毒序列分为墨西哥类型、过渡类型和纽约类型3个主要类型. 这3个类型在地理分布上具有明显差别. 相似文献
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流感研究上海协作组 严安 丁国徽 周正峰 董辉 张亚坤 祝雷 何云刚 边超 张国庆 李亦学 孙兵 黄忠 蓝柯 金力 王红艳 王小宁 杨忠 钟扬 戴建新 郭亚军 王皓 车小燕 吴凡 袁政安 张曦 曹志伟 周晓农 周佳海 马志永 童光志 赵国屏 金维荣 熊慧 《科学通报》2009,54(12):1648-1648
针对甲型流感病毒HA基因的H1, H2, H3, H5, H7和H9亚型的序列特征, 设计专用PCR引物, 通过RT-PCR特异扩增相应片段并测定序列, 可以准确地区分H1和H3感染人类的流感病毒及其亚型. 这种基于流感病毒核酸序列测定的特异性检测方法, 不仅可以用于新型甲型H1N1病毒的快速确诊和分型, 并且还可推广应用于今后其他流感病毒或具有爆发潜力的新型流感病毒的监测. 相似文献
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甲型H1N1流感病毒HA蛋白结构模建与构象表位分析 总被引:2,自引:0,他引:2
流感研究上海协作组 吴迪 徐天磊 孙静 戴建新 丁国徽 何云刚 周正峰 熊慧 董辉 金维荣 边超 金力 王红艳 王小宁 杨忠 钟扬 王皓 车小燕 黄忠 蓝柯 孙兵 吴凡 袁政安 张曦 周晓农 周佳海 马志永 童光志 郭亚军 赵国屏 李亦学 曹志伟 《科学通报》2009,54(12):1642-1644
最近几个月来, 一种新型流感病毒H1N1在全球流行. 本文运用生物信息技术, 从NCBI发布的新型A H1N1流感病毒基因序列出发, 通过同源模建方法构建了HA蛋白三维结构, 利用自主开发的蛋白抗原空间表位预测程序SEPPA预测了HA蛋白潜在空间表位氨基酸, 并与以往流感病毒HA蛋白潜在构象表位进行了比较. 结果发现HA蛋白中58个氨基酸残基具有较强的免疫原性, 大部分在HA蛋白球状头部表面上聚集成簇, 构成空间抗原表位. 与以往流感病毒HA蛋白潜在空间表位相比, 虽然坐落位置相似, 但新的抗原表位在静电势性质上明显不同于以往流感病毒HA蛋白抗原表位. 相似文献
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