不同类氨基酸的使用度对蛋白质折叠速率的影响

根据氨基酸约化分类,定义描述氨基酸序列信息的参量—相对氨基酸使用度(RAAU),在现有数据库和相关文献的基础上,建立了包含相对氨基酸使用度和蛋白质折叠信息的蛋白质折叠数据库.在此基础上,分析了相对氨基酸使用度对蛋白质折叠速率的影响.结果表明,强亲水类氨基酸和强疏水类氨基酸的使用对蛋白质的折叠速率的影响截然相反.对不同类蛋白质,其相对氨基酸使用度对蛋白质折叠速率的影响有明显差异.     

基于改进型最小二乘搜索的 GNSS 姿态测量方法

结合全球卫星导航系统(global navigation satellite system,GNSS)用于姿态测量具有基线已知的特点,提出了一种改进型最小二乘搜索算法:将整周模糊度分为基本组和剩余组,在伪距精度和基线长度约束条件下确定出基本模糊度组的搜索空间;然后根据模糊度与基线俯仰角、航向角的关系,并以俯仰、航向角度组合作为联系基本组和剩余组的中间变量,通过搜索基本模糊度组来确定出剩余模糊度组合;最后利用最小二乘解算基线矢量,在二次残差比值检验条件下,完成整周模糊度的固定及姿态解算.实验结果表明,改进算法不仅有效减小了模糊度的搜索空间,而且缩短了模糊度初始化时间,具有较高的测姿精度,适用于GNSS姿态测量.     

同义密码子用语与蛋白质二级结构信息

对人体117个蛋白质和大肠杆菌的185个蛋白质的各二级结构相对应的mRNA序列中的同义密码子与氨基酸上下文关联熵、蛋白质序列中氨基酸与氨基酸上下文关联熵作了统计分析，发现密码子关联确实比氨基酸关联对蛋白质二级结构提供的信息量大，而且人蛋白质中同义密码子提供的二级结构信息比大肠杆菌中多．同时，证明了在相对信息剩余大于等于30％的情况下，Adzhubei给出的九种氨基酸中的八种其同义密码子在某些二级结构中明显的携带结构信息；此外A，N，D，R，H，C，Y这几种氨基酸的同义密码子在某些二级结构中也明显地携带结构信息．     

氨基酸突变分数的精细分裂及其实验检验问题

本文讨论了氨基酸突变分数的精细分裂,考虑了两种形式的颠换突变和氨基酸分类造成的精细结构,将计算的突变分数值和氨基酸主度资料及信息值资料进行比较,得到了基本一致的结果。     

三种市场情形二度价格歧视的比较分析

在线性需求函数条件下，就一个垄断厂商、二个寡头厂商、三个寡头厂商3种市场情形，用完全信息静态博弈的方法对实施二度价格歧视时产量和价格的确定进行了研究，并就3种市场情形在实施二度价格歧视时的歧视价、总产量、总收益、总收益增加率、消费者剩余和获取的消费者剩余率进行了比较分析．结果表明：实施二度价格歧视时，垄断总能提高生产者利润，而竞争总能提高消费者剩余．     

烟叶不同部位、复烤工艺及醇化时间对烟草中氨基酸质量分数的影响研究

为了探索烟叶部位、复烤工艺和醇化时间对烟草中氨基酸的影响,采用氨基酸分析仪测定了72个烟草样品的21种氨基酸的质量分数,并对检测结果进行统计分析.结果表明:1)烟叶部位、复烤工艺及醇化时间对于各类氨基酸质量分数都有较大的影响;2)从氨基酸总量来看,尤其是醇化6个月后,随着醇化时间的延长,氨基酸总量都有所降低,但降低幅度逐渐减小;3)上部烟叶的氨基酸和中、下部烟叶的氨基酸质量分数差异相对较大,而中、下部烟叶氨基酸相似度较高;4)复烤工艺参数对烟草中氨基酸的影响小于醇化时间的影响.     

遗传信息从核酸到蛋白质构象的传输效率

从密码学的观点研究了遗传信息从核酸流各氨基酸和从蛋白质一级结构流向三级结构的信息传输问题，引入了信息传输效率的概念，其对数负正丝 系统的抗干扰能力。导出了信息传输效率与序列长度的关系。发现了信息从核酸流向氨基酸（第一遗传密码）的传输效率和从氨基酸序列流向蛋白质三级结构（第二遗传密码）的传输效率大体相等，这说明了遗传信息的传输效率和抗干扰能力在以上两步传输过程中的匹配性。     

互补型服务合作生产剩余控制权分配

知识密集型服务是客户与供应商合作生产的系统,双方信息黏性大小和正合作外部性强度影响合作剩余控制权的分配.基于相对重要性决定合作剩余控制权分配的研究基础,首先考虑了信息黏性对剩余控制权结构的影响,研究表明在既定的互补型服务合作生产关系中,信息黏性和相对重要性共同影响剩余控制权的分配.进一步分析了正合作外部性强度对剩余控制权结构的影响,研究表明足够强的正合作外部性会使信息黏性和相对重要性决定的合作剩余控制权结构发生转移.参与方的相对重要性、信息黏性大小、正合作外部性强度共同影响合作剩余控制权的分配.     

获得最小剩余度线性阵列的排列方法

在分析线性阵列的最小剩余度理论的基础上，提出两种获得最小剩余度线性阵列的排列方法，使剩余度比其它的排列方法有很大改善，从而使阵列天线获得更高的分辨率。通过分析，总结出任意个阵元的最佳最小剩余度线性阵列的可能结构。根据两种具有不同用途的合成孔和戏微波辐射计的设计要求，对它们的天线阵列的阵元进行了最佳定位。     

2种养殖模式下草鱼肌肉营养成分的比较分析

研究草鱼单养(以下简称单养组)和草鱼-凡纳滨对虾混养(以下简称混养组)2种养殖模式下草鱼肌肉营养成分的差异,为选择适宜的养殖方式、改善养殖草鱼营养品质提供参考。采用生化分析方法对2种养殖模式下草鱼肌肉的一般营养成分、氨基酸含量、脂肪酸含量进行营养成分分析比较。单养组草鱼肌肉水分含量显著高于混养组(P0.05),混养组粗脂肪含量显著高于单养组(P0.05)。单养组和混养组草鱼肌肉均检测出18种氨基酸,除胱氨酸、组氨酸、酪氨酸和色氨酸在两组间不存在显著差异外,其余氨基酸均是单养组显著高于混养组(P0.05),单养组氨基酸总量、非必需氨基酸和鲜味氨基酸含量极显著高于混养组(P0.01),单养组必需氨基酸和半必须氨基酸含量显著高于混养组(P0.05)。根据氨基酸评分,单养组和混养组第一限制性氨基酸均为色氨酸,第二限制性氨基酸均为蛋氨酸+胱氨酸;根据化学评分,单养组和混养组第一限制性氨基酸均为蛋氨酸+胱氨酸,第二限制性氨基酸均为色氨酸;单养组亚油酸C18:2n6和亚麻酸C18:3n6含量均极显著高于混养组(P0.01),EPA、DHA含量显著高于混养组(P0.05),两者之和(EPA+DHA)极显著高于混养组(P0.01),单养组多不饱和脂肪酸总量(ΣPUFA)极显著高于混养组(P0.01)。本试验条件下,两种养殖模式对草鱼肌肉一般营养成分、氨基酸组成含量、脂肪酸组成含量存在显著影响,单养组草鱼肌肉营养品质总体上优于混养模式。     

Evolutionary information for specifying a protein fold

Classical studies show that for many proteins, the information required for specifying the tertiary structure is contained in the amino acid sequence. Here, we attempt to define the sequence rules for specifying a protein fold by computationally creating artificial protein sequences using only statistical information encoded in a multiple sequence alignment and no tertiary structure information. Experimental testing of libraries of artificial WW domain sequences shows that a simple statistical energy function capturing coevolution between amino acid residues is necessary and sufficient to specify sequences that fold into native structures. The artificial proteins show thermodynamic stabilities similar to natural WW domains, and structure determination of one artificial protein shows excellent agreement with the WW fold at atomic resolution. The relative simplicity of the information used for creating sequences suggests a marked reduction to the potential complexity of the protein-folding problem.     

A symmetry-related sequence-structure relation of proteins

Proteins have regular tertiary structures but irregular amino acid sequences. This made it very difficult to decode the structural information in the protein sequences. Here we demonstrate that many small α protein domains have hidden sequence symmetries characteristic of their pseudo-symmetric tertiary structures. We also present a modified method of recurrent plot to reveal this kind of the hidden sequence symmetry. The results may enable us to understand part of the relations between protein sequences and their tertiary structures.     

不同折叠类型蛋白中基于密码子的二级结构偏向性分析

在传统的Chou-Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息,计算了200个蛋白(49种全α结构蛋白,69种全β结构蛋白,38种仅α β结构蛋白,44种α/β结构蛋白)中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构(α：螺旋,β：折叠,C：卷曲)的偏向性参数．通过对这些密码子对应氨基酸二级结构偏向性的分析,得到了氨基酸二级结构偏向性分析中所忽略的同义密码子的蛋白结构信息．这些新的信息量对于指导蛋白质设计以及提高蛋白质二级结构预测的准确率有着一定的作用．     

Quaternary structure-induced photoreduction of haem of haemoglobin.

Spectroscopic studies have provided extensive information on the primary process of visual pigments and photoexcitation of chlorophyll as well as their effects on photoreactivity on the higher-order structures of protein has been observed only rarely. Resonance Raman spectroscopy can reveal the vibrational frequencies of the chromophore in a molecule provided the excitation wavelength is in the absorption band of that molecule. As the visible absorption bands of haemproteins are due to pi pi* transitions of the porphyrin ring, we can selectively observe the vibrational frequencies of iron porphyrin during in situ interactions with immediate amino acid residues of protein when the wavelength of excitation light is close to the Soret or Q band. Correlation of some vibrational frequencies of haem with the oxidation and spin states of the haem iron has been studied in detail and an empirical rules has been established. This method is therefore especially suitable for the study of an effect of higher-order structures of protein on the chromophore. We report here a photoreaction facilitated by a particular quaternary structure of protein--in various haemoglobins resonance Raman spectroscopy showed that reversible photoreduction of haem took place in the T state but not the R state.     

基于循环冗余校验的关系数据库水印算法研究

简介了数字水印技术的基本原理和概念、关系数据库水印技术的基本原理和概念以及其分类．并在此基础上,提出了一种基于循环冗余校验的关系数据库水印算法．该算法首先对原始关系数据库进行分组、秘密排序、以及嵌入比列控制,然后将嵌入了加密信息和经过添加循环冗余校验码的水印信息嵌入到关系数据库中;在检验和提取水印信息时,先对添加了水印信息的数据库进行分组和元组选取,再对相应字段值提出LSB,经过多数选举后,再经循环冗余校验判断有无被攻击和篡改．经实验证明,本文提出的关系数据库水印算法具有安全性好、可用性好、能盲提出盲检测以及能检测攻击和篡改的特点．     

On the Relation Redundancy in Fuzzy Databases

This paper concentrates on the problem of data redundancy under the extended-possibility-based model. Based on the information gain in data classification, a measure - relation redundancy - is proposed to evaluate the degree of a given relation being redundant in whole. The properties of relation redundancy are also investigated. This new measure is useful in dealing with data redundancy.     

蛋白质二级结构由氨基酸和mRNA序列编码

据氨基酸序列,密码子序列和蛋白质二级结构序列的比较,指出约18％的两肽的密切子具有反常的蛋白质结构偏好性,并且这种以常不能用随机涨落解释,因而关于蛋白质折迭的Anfinsen原理可能需要作适当修正。     

α-淀粉酶Amy7C及其突变体最适pH值的定量预测

【目的】pH值是影响酶催化效率的关键参数,通常需要通过实验方式才能确定生物酶的最适 pH 值,而该方式要消耗较多的人力、物力和时间。因此,有必要发展一种利用酶的简单结构信息即可预测其最适 pH 值的方法。【方法】以20-1前馈反向传播的神经网络为模型,完成535种氨基酸属性对α-淀粉酶 pH 值的拟合。同时,将α-淀粉酶 Amy7C及其54个突变体的数据分为2组,用35个酶作为训练组进行拟合,20个酶作为验证组进行检验,并对不同层次及神经元个数的模型进行比较。【结果】109个氨基酸属性可实现20-1神经网络模型收敛,表明这些氨基酸属性可用干预测α-淀粉酶的最适 pH值,但是不同氨基酸属性预测 pH 值的效果差别较大,只有部分指标预测 pH值的效果较好。多模型的分析结果显示,不同模型对训练组R值的结果具有显著性差异,而对训练组P值、验证组R值和验证组P 值结果无显著性差异。【结论】氨基酸分布概率等属性可用干预测α-淀粉酶的最适 pH值。20-1神经网络模型是预测α-淀粉酶最适 pH值相对理想的模型。     

信阳毛尖茶品质和化学成分快速检测方法

探索茶叶品质和化学成分的快速检测方法,利用电子鼻技术对3个品质等级的信阳毛尖茶的挥发性气味进行了分析.对电子鼻检测信号进行主成分分析和线形判别分析结果显示3个品质的茶叶能被很好地区分,各个类的集中性也较强.采用二次多项式逐步回归分析分别建立传感器信号和信阳毛尖茶的氨基酸、茶多酚和咖啡碱含量之间的预测模型.通过测试集对二次多项式逐步回归模型进行验证得到氨基酸、茶多酚和咖啡碱含量的预测值和测试值的相关系数分别为0.95、0.94和0.92,预测标准误差分别为0.08、0.11和0.8,平均误差分别为0.9%、2.8%和1.5%.结果表明,电子鼻技术可以用于茶叶理化成分的快速检测.