水稻基因组学研究概况

重点对水稻的结构基因组学、功能基因组学和蛋白质组学的主要研究内容、研究方法和研究进展三个方面进行了综述，并对与水稻基因组学研究相关的学科，如生物信息学、比较基因组学等方面进行了阐述，最后对水稻基因组学的发展进行了简单展望．     

生物信息学中的MicroRNA预测研究

为microRNA预测的研究提供参考,讨论了生物信息学中有关MicroRNA预测研究的若干问题.根据最新的研究成果,由MicroRNA预测的特征信息和数据源,从结构序列分析方法、比较基因组方法和机器学习方法等方面对MicroRNA预测的生物信息学方法做了回顾和展望,指出了该领域研究的趋势.通过对3类方法的比较结果表明,采用机器学习方法的效果更优越,能较精确地预测出MicroRNA.     

生物信息学中的计算智能

生物信息学作为一门利用计算手段来研究分子水平层面的生物学问题,采用了包括计算智能、应用数学、统计学、信息学和现代生物学等方法。目前主要的应用集中在序列分析、基因预测、基因组注释、蛋白质结构分析和预测、基因表达谱分析、蛋白质相互作用和进化模型等领域。计算智能包括神经网络、模糊系统、粗糙集、进化计算、群体智能、概率推理和多智能体系统等技术方法,它的发展趋势是整合不同的方法以达到一个协同的系统。     

远海梭子蟹Sox9基因序列测序验证与进化分析

采用全长转录组文库结合三代高通量测序的方法得到远海梭子蟹Sox9基因的全长序列,通过引物设计及PCR产物直接测序验证三代测序结果,最终准确地获得Sox9基因序列。对Sox9基因全长序列进行生物信息学及基因进化分析。结果表明该基因CDS基因序列全长1461bp,蛋白质的无规则卷曲、α-螺旋、β-折叠区域分别占58.64%、25.93%、0%。进化树分析结果表明,远海梭子蟹Sox9与三疣梭子蟹的Sox10基因同源性较高,其核酸序列和氨基酸序列的相似性分别为96.24%和98.77%。远海梭子蟹的Sox9基因鉴定和蛋白质结构预测与功能分析,将为该物种遗传资源挖掘与利用分析奠定重要基础。     

应用文格式与内容模板整合开发研究

针对各类机关、企事业单位普遍存在应用文写作不规范的现状,对应用文格式与内容模板进行整合研究,提出系统的总体结构,探讨格式模板与内容模板的实现,并对两者的整合给出应用文生成算法.经用户试用,该系统有助于应用文格式的规范化及更便捷地完成应用文的写作.     

计算机辅助区域经济发展规划决策研究与设计

本文讨论了计算机辅助区域经济发展规划决策研究的实现目标,介绍了计算机辅助区域经济发展规划决策系统的设计思想和总体结构.显示了用此系统就天津市后10年来的经济发展前景进行预测的结果,总结了此系统的特点.     

牛精子发生相关新基因b-DAZL的克隆、生物信息学分析与组织表达研究

人和多种动物的DAZL(Deleted in AZoosPermia-like)基因是精子发生的重要调控因子,DAZL基因突变或表达缺乏将导致精子发生过程减数分裂障碍和雄性不育.文中采用电子克隆和克隆测序方法获得了黄牛DAZL,基因cDNA全序列,利用生物信息学方法进行黄牛DAZL基因序列和蛋白结构分析,并对黄牛、牦牛和犏牛DAZL基因的组织表达特征进行了分析.结果发现黄牛DAZL,基因cDNA全长2509 bp,编码295个氨基酸(命名为b-DAZL);b-DAZL基因含有12个外显子和11个内含子,定位于牛1号染色体末端;b-DAZL基因与哺乳纲各物种同功能基因开放阅读框的同源性为90%一94%,其编码蛋白含有DAZL典型的RNA识别基序(RRM),DAZ重复基序,Pumilio一2和PABP作用位点.RT-PCR结果显示b-DAZL,基因仅在成年黄牛和成年牦牛睾丸、卵巢组织中表达,在成年F1代犏牛的卵巢组织中表达而在睾丸组织中检测不到表达信号,且犏牛睾丸组织切片表现出DAZL,基因缺失的典型精子发生障碍表型,因此推测b-DAZL基因在牛精子发生过程中发挥重要作用,可能与F1代犏牛雄性不育相关,是犏牛雄性不育的候选基因.