Stretching and imaging studies of single DNA molecules

DNA molecules were stretched on silanized mica surface with the molecular combing technique, and detected with fluorescence microscopy and atomic force microscopy. Meantime, DNA molecules were stretched with a modified dynamic molecular combing technique and studied with atomic force microscopy. The results indicate that, compared with the dynamic molecular combing technique, the modified dynamic molecular combing technique has advantages of less-sample demand and less contamination to sample; as compared with the molecular combing technique, it has better aligning effect and reproducibility. Combination of this kind of DNA molecular manipulating technique with the single DNA molecule detecting technique by atomic force microscopy and fluorescence microscopy will play an important role in the basic research of molecular dynamics and the application of gene research.     

DNA粘接计算模型及其应用

DNA计算是应用分子生物技术进行计算的新方法。应用形式语言及自动机理论技术研究DNA计算理论,有利于推动理论计算科学的发展。本文根据DNA分子的结构及特点给出了DNA分子的形式化描述,介绍了DNA粘接计算模型的文法结构和计算能力,并应用DNA计算方法求解3-SAT问题。     

DNA计算原理与发展

DNA计算是一种摸拟生物分子DNA的结构并借助分子生物技术进行计算的新方法,为NP完全问题的解决提供了一种全新的途径,具有广阔的应用前景。本文首先介绍了DNA计算的基本思想;然后综述了DNA算例及其模型;指出了DNA计算的应用及目前存在的问题;最后对DNA计算的发展前景进行展望。     

基于分子重组技术的DNA计算

DNA计算是计算科学和分子生物学相结合的新领域。目前关于DNA计算的研究主要是抽象的计算模型和简单的原理性试验。DNA剪接计算模型是以生物DNA分子重组技术为基础的文法系统。本文主要介绍DNA剪接计算模型的文法结构及计算方法,证明了DNA剪接模型可以计算所有图灵机可计算函数。     

大草履虫总DNA的提取方法比较

快速而稳定地提取大草履虫的基因组DNA是进行后续分子生物学研究的前提.文章通过比较传统SDS法、CTABⅠ法和CTABⅡ法等提取大草履虫DNA的效果,进一步优化提取方法,获得快速稳定地提取大草履虫基因组DNA的方法.结果表明:用CTAB I法提取的DNA浓度低,杂质较多;CTABII提取的DNA电泳时检测不出条带;而SDS法提取的DNA在电泳时带型较整齐,无降解,且DNA的得率和纯度较高,但仍有蛋白质污染.针对蛋白质的去除,用SDS-蛋白酶K法和SDS-NaAc法来提取DNA,经过试验发现这2种方法都能够很好地去除蛋白质,所获DNA样品的纯度和得率都能用于进一步分子试验,而SDS-NaAc法更经济适用.     

两种贝类基因组DNA的提取及RAPD分析

研究了福建沿海两种常见贝类波纹巴非蛤(Paphiaundulata)和菲律宾蛤仔(Ruditapesphilip-pinarum)的性腺和斧足的DNA提取方法,并且对它们进行了RAPD分析,结果显示性腺DNA得率较斧足高,并且成功获得了效果较好的2种随机引物及其相应的反应条件,能够在分子水平上为它们及其近源种的比较研究提供初步的资料.     

DNA分子标记与动物杂种优势的研究

论述了ＤＮＡ分子标记的发展概况、原理和特点,以及在动物杂种优势研究中的应用     

不同方法提取水溞基因组DNA的比较

为获取抽提水溞基因组DNA的最适方法,本研究采用酚-氯仿法,CTAB法和试剂盒法3种方法提取水溞基因组DNA,并用琼脂糖凝胶电泳检测DNA提取的效果.结果表明3种DNA提取方法均获得较好的DNA,其中试剂盒方法提取的DNA最为理想,完全可满足后续分子生物学实验.     

DNA纳米机器药物递送研究进展

 天然分子机器是细胞正常功能（包括DNA复制、细胞内物质运输、离子平衡和细胞运动等）的重要执行者。受天然分子机器的启发,人工分子机器的概念被提出并逐步实践。DNA分子独特的理化性质使得其可作为自组装基元用于构建分子机器类纳米结构。DNA纳米结构具有形状可设计性、精确的可寻址性、结构动态响应性及良好的生物相容性,可以作为一种良好的药物递送载体材料。通过可寻址的负载特定功能元件从而构建DNA纳米载体和治疗型DNA纳米机器,可以靶向性地将药物传递到病变组织和细胞,响应性地释放药物,提高药物的细胞摄取率并降低其毒副作用,有望成为优秀的药物递送系统。基于DNA纳米结构的药物载体已经被用于递送小分子药物、寡核苷酸类药物和蛋白药物。以每类药物分子中的典型药物为例,介绍了DNA纳米载体和DNA纳米机器药物递送系统的研究进展,并讨论了其所面临的挑战及可能的发展趋势。     

不同分子质量软骨多糖对K562细胞的增殖抑制作用

研究不同分子质量的软骨多糖对慢性髓系红白血病K562细胞的增殖抑制作用。用不同浓度的酒精对软骨提取物进行分级沉淀，得到不同分子质量的软骨多糖，并用聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）检测所得软骨多糖的纯度及分子质量；采用噻唑蓝（MTF）比色法测定细胞的增殖活性；用琼脂糖凝胶电泳法检测DNA电泳特征。结果显示，短链软骨多糖（分子质量约为30ku）对K562细胞具有明显的增殖抑制作用，这种抑制作用呈现明显的时间依赖性，且琼脂糖凝胶电泳出现明显的DNA梯状条带。     

Raman spectroscopic study of DNA photodamage sensitized by hypocrellin B and 5-brominated-hypocrellin B

Hypocrellin B (HB) is a highly effective photosensitizer. One of its derivatives, 5-brominated-hypocrellin B (5-Br-HB) has better photosensitive characterlstics than it. Using Raman spectroscopy, the microcosmic photodamage to DNA sensitized by HB and 5-Br-HB was studied at molecular level. The results showed that when HB and 5-Br-HB were added to the solution of DNA and irradiated, the characteristic Raman frequencies and intensities of DNA changed to various degrees. The photodamage occurred on the whole DNA molecule, including phosphate backbone, deoxyribose and four bases. Not only the conformation but also the configuration of DNA was photodamaged: breakage of some H-bonds, disappearance of B-form conformation, scission of double or single strand and serious damage of four bases. The damage to A-T pairs was stronger than that to C-G pairs and DNA became polynucleotides finally. The 5-Br-HB-photosensitized damage to DNA was stronger than HB, which suggested the better photosensitive characteristics of 5-Br-HB in bioactive environment. The molecular mechanisms of photodamage to DNA sensitized by 5-Br-HB and HB were also elucidated.     

DNA分子标记在猫科动物系统发生关系研究中的应用

DNA分子标记的广泛应用,使得系统进化、生物地理、群体遗传及人类学等领域的研究得到前所未有的发展.猫科动物分子系统发育关系的重建是目前猫科动物DNA研究的主要方向,进而可以从DNA分子水平上研究猫科动物的进化过程及系统发育关系的本质.本文对DNA分子标记在猫科动物分子系统学中的部分研究成果做了概括.     

DNA分子标记技术在海水鱼类遗传育种中的应用与展望

DNA分子标记技术自问世以来已被广泛应用于动植物的遗传育种领域,应用该技术来开展海水鱼类遗传育种的研究对海洋鱼类资源的保护与开发有着重要意义.阐述了DNA分子标记技术在海水鱼类遗传育种研究中的应用现状,并对我国鱼类遗传育种工作提出了若干意见,同时就其发展前景作了展望.     

鸡腺病毒内蒙古分离株六邻体蛋白基因片段的合成和分子克隆

根据鸡１０型腺病毒以及人２、５、４０、４１型腺病毒、牛３型、鼠１型腺病毒六邻体蛋白基因序列，选择保守区，设计和合成一对引物，以鸡腺病毒内蒙古分离株基因组ＤＮＡ为模板，进行聚合酶链反应（ＰＣＲ）扩增得到预期大小的０．５５ｋｂＤＮＡ片段．将此ＤＮＡ片段克隆于ｐＵＣ１９的ＳｍａＩ位点，筛选重组质粒，进行限制酶切分析和ＰＣＲ检测，得到含有六邻体蛋白基因片段的重组质粒，为进一步开展此病毒分子生物学研究和分子生物学诊断技术的建立创造了条件     

从蔷薇科果树硅胶干燥叶片中制备DNA

以6种蔷薇科主要树种特别是杏属植物为试材，从DNA提取、模板DNA电泳分析、RAPD扩增和S-基因型特异PCR4个方面对硅胶干燥的样品与传统液氮冷冻的样品进行了综合对比研究，结果表明：硅胶保存的样品完全可以与传统液氮冷冻的样品得到同样的PCR扩增结果，甚至在减小褐变影响方面优于后者，且干制样品的DNA纯度均比液氮速冻样品高。研究表明，用硅胶干燥法保存的植物样品可以满足后期有关RAPD等分子生物学研究的需要，且能保证野外考察时植物样品的DNA在运输过程中不被降解。     

Conformational dynamics of individual DNA molecules during gel electrophoresis

Gel electrophoresis is widely used in molecular biology to separate DNA molecules according to their sizes. The physical basis of this size separation is, however, poorly understood. Here we report observations of individual, fluorescently stained DNA molecules as they migrate during various kinds of gel electrophoresis. Their movement, under the influence of either a steady electric field or a pulsed-field, is characterized by cycles of elongation and contraction. Initially relaxed coils of DNA lengthen into 'hook-shaped' configurations which temporarily 'hang-up' on obstacles in the gel matrix before sliding off, contracting and entering another cycle. The effects of a new electrophoresis technique, termed 'pulse-oriented electrophoresis', which allows the effective angle of the electric field, and hence the molecular orientation of DNA, to be varied without electrode rearrangement, are also studied. In this case the DNA adopts a 'staircase' configuration showing that the net orientation in a direction is given by the vector sum of the pulses used.     

用STM证实质粒pUC18DNA分子新构象的存在

用清高妥液法从大肠杆菌ＢＨ１０１细胞制备出的多拷贝质粒ＰＵＣ１８ＤＮＡ分子的构象具有复杂的多样性，我们在对其进行ＳＴＭ研究计，证实了一种不同于已知构象的新构象的存在。     

DNA分子标记技术在药用植物上的应用

药用植物是我国极其宝贵的自然资源之一,开展药用植物的研究具有重要的理论与现实意义.随着分子生物学的快速发展,DNA分子标记技术作为一种新的遗传标记技术越来越广泛地应用于药用植物研究的许多领域中.本文简要介绍了DNA分子标记在药用植物研究中一些常见技术(如RAPD、RFLP、AFLP、SCAR、ISSR、SNP等),同时对分子标记技术在药用植物种质资源鉴定、药用植物遗传多样性、药用植物亲缘关系鉴定等方面的应用进行了较详尽的阐述.最后,对DNA分子标记技术的应用前景进行了展望.