绿头鸭基因组微卫星分布规律研究

[目的]研究绿头鸭(Anas platyrhynchos)的全基因组微卫星分布特征及规律.[方法]利用生物信息学方法对已报道的绿头鸭全基因组查询搜索并进行特征分析.[结果]在绿头鸭1 070 Mbp的基因组中,1～6个碱基重复的微卫星数量有476 957个,总长度为9 101 935 bp,相对丰度为445.77个·Mb-1,占全基因长度的0.83％.不同重复类型的微卫星中单碱基的数量最多,有326 468个,长度为5 444 144 bp,占基因组微卫星总数的68.45％;然后依次是四碱基、二碱基、三碱基、五碱基和六碱基,数量分别为66 753,30 262,29 712,20 248和3 514个,长度分别为1 504 868,501 244,527 310,920 915和203 454 bp,分别占基因组微卫星总数的14％,6.34％,6.22％,4.25％和0.74％.绿头鸭基因组中,分布数量最多的14种拷贝类型按数量由多到少排列依次是A,A A AC,A A AT,AT,A AT,AC,A AC,A A A AC,C,AG,AAAAT,AAAG,AAGG和AGG,这些拷贝类型的数量均超过2 500个,合计占基因组微卫星总数的95.1％,有明显的A偏倚.[结论]研究结果为绿头鸭微卫星的筛选和开展进一步的分子生物学研究奠定了基础.     

白鹭脱落羽毛的微卫星个体识别研究

利用鹭科鸟类已有微卫星引物进行跨种扩增筛选,获得12对可用于白鹭(Egretta garzetta)的微卫星引物,结合非损伤采集的脱落羽毛样品,在物种分子鉴定和性别分子鉴定的基础上,建立适用于羽毛样品个体识别分析的微卫星基因分型技术体系.在中国沿海的3个白鹭繁殖种群的181样品中,19个羽毛样品由于DNA质量较差未能有效鉴定物种.119个羽毛样品成功地鉴定为白鹭个体,物种鉴定结果可重复率达93.8%.性别鉴定结果可重复率94.1%,119个白鹭羽毛样品当中的28.57%为雄性.基因分型得到各个位点的等位基因数7~22个,观察杂合度和期望杂合度分别为0.623~0.875和0.779~0.918,没有位点偏离哈迪-温伯格平衡,基因分型错误率为1.2%.个体识别分析发现其中的2个样品为相同基因型,为重复采集自同一个体脱落的不同羽毛.本研究结果将为深入研究白鹭种群遗传结构、扩散模式等保护遗传学问题奠定了基础,并且能够为其他鹭科鸟类的脱落羽毛的物种鉴定、性别鉴定、个体识别提供参考.     

山羊和藏羚羊全基因组微卫星分布规律及其生物信息学分析

本文利用生物信息学方法搜索和统计了山羊和藏羚羊全基因组中完整型SSRs序列,并对其生物信息学特征进行比较分析.山羊和藏羚羊全基因组中SSRs总数量分别为920 300个和913 059个,占其全基因组长度的比例分别为5.56‰和5.39‰.山羊和藏羚羊全基因组SSRs六种重复类型的数量、比例、丰度和密度分布模式如下:单核苷酸SSRs二核苷酸SSRs三核苷酸SSRs五核苷酸SSRs四核苷酸SSRs六核苷酸SSRs,这六种重复类型SSRs特征相互比较有显著差异,而相同重复类型SSRs特征基本一致.山羊基因5′端非翻译区和外显子区均是三核苷酸SSR丰最丰富,其次依次是单核苷酸、二核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸;而其3′端非翻译区和内含子区均是单核苷酸SSR最丰富,其次依次是二核苷酸、四核苷酸、三核苷酸、五核苷酸和六核苷酸.山羊第1条染色体上SSRs数量最多,其次依次是第2条、X染色体、第6条、第4条和第8条染色体,而较少的是第25、28条染色体,所有染色体上SSRs丰度不存在显著差异.山羊和藏羚羊全基因组各重复类型优势SSRs序列基本一致,并与牛、绵羊全基因组中不同重复类型SSRs优势序列相一致.     

应用T载体连接PCR技术分离黄嘴白鹭微卫星位点

传统的微卫星分离策略对于低丰度的物种如鸟类而言,通常是低效的.探讨了一种改良的T载体PCR序列获取法用于黄嘴白鹭(Egretta eulophotes)微卫星DNA的分离,称为T载体连接PCR(T-vector-ligation PCR,TVL-PCR).在获取第一侧微卫星序列的71个阳性克隆中,59个克隆含有重复序列,设计了48对位点特异巢式引物.经过两轮TVL-PCR后,31个位点的扩增产物为预期大小,经测序后获得21个完整的微卫星位点.除去侧翼序列过短和小卫星位点外,设计16个微卫星位点进行多态信息检测,其中7个位点显示出多态性,平均等位基因数为2～20,观察杂合度(HO)和期望杂合度(HE)分别为0.375～0.958和0.477～0.956,所有位点都符合哈迪-温伯格平衡(HWE)和连锁平衡.说明TVL-PCR技术对低丰度微卫星物种的位点分离具有一定的应用价值.     

厦门白鹭自然保护区鹭类繁殖的空间分布

采用样方法,根据生态学原理,分析厦门白鹭自然保护区大屿岛鹭类繁殖的空间分布规律,结果表明：鹭类在大屿岛繁殖时,具有明显的水平分布特征,夜鹭（Nycticorax nycticorax）主要分布于核心中部偏南的中央大片区域,白鹭（Egretta garzetta）各处理能分布、池鹭（Aroleola bacchus）仅分布于核心区的南北;牛背鹭（Bubulcus ibis）和黄嘴白鹭（Egretta eulophotes）只分布在核心中区部偏最高,白鹭、牛背鹭和黄嘴白鹭的巢居中,而且三者巢位相近;在白鹭和池鹭营巢在同一树上的情况下,池鹭的巢处于上层,对鹭类群体繁殖时间的空间分布现象的产生原因也进行了探讨。     

水稻亚种间基因组水平微卫星多态性分析

从公布的水稻两个亚种（籼稻9311和粳稻Nipponbare）基因组草图序列中,搜寻了所有的完整微卫星位点,发现单碱基重复中A/T重复占大多数,二碱基重复中AT/TA、GA/TC、AG/CT重复居多,三碱基中GGC/GCC、GCG/CGC、CCG/CGG重复较多。通过相互比较,不同基序和基因区域的微卫星多态性有较大差异：内含子和基因间区中微卫星的多态性较高（分别约为45%和40%）,外显子中的微卫星多为三碱基重复,而且多态性较低（约为25%）;两个亚种具多态性的微卫星间距平均约为12.7 kb和16.4 kb。     

3种金线鲃属鱼类基因组微卫星的筛选与分析

利用生物信息学的方法,基于已公布的滇池金线鲃、安水金线鲃和犀角金线鲃的全基因组序列,筛选出3种金线鲃全基因组中的微卫星,并对所得数据进行分析。结果显示:在滇池金线鲃、安水金线鲃和犀角金线鲃全基因组中分别筛选出完美微卫星851 732个、849 226个和848 258个,其丰度分别为543. 39个/Mb、561. 32个/Mb和557. 52个/Mb; 3种金线鲃鱼类基因组中二碱基重复类型最多,分别占全部微卫星总数的50. 24%、40. 72%和40. 72%,其次是单碱基四碱基三碱基五碱基六碱基;安水金线鲃和犀角金线鲃基因组中的核心重复类别比例最高的为A,而滇池金线鲃核心重复序列比例最高的为AC; 3种鱼类基因组微卫星序列分布结果表明,位于外显子上的数量远低于内含子和基因间隔区。     

油茶基因组微卫星特征分析

对油茶基因组约10%覆盖度的DNA序列进行微卫星查找,共获得11 344个重复单元长度为1～6碱基的微卫星。在此基础上,通过对这些微卫星序列分析发现:在油茶基因组中长度为二核苷酸的微卫星重复单元最为丰富,占27.1%;在单碱基重复和二碱基重复这两种类型中,最主要的优势重复单元分别是A/T以及AT/TA、AG/TC。三碱基、四碱基、五碱基重复类型中,(AAN)n、(AAAN)n和(AAAAN)n为对应的优势重复单元,这些优势重复单元中富含碱基A和T。油茶基因组中变异程度高的微卫星(长度≥20 bp)约占11.7%。分析还发现,除单核苷酸重复微卫星外,油茶基因组微卫星长度的变异速率与重复单元长度呈负相关,即油茶基因组中长度较短的微卫星变异速率较快,而较长的重复单元变异速度较慢,相对较为稳定。     

黄嘴白鹭的繁殖生态学研究

１９９０年３月～１９９２年９月在河南信阳南湾水库牌坊鸟岛对黄嘴白鹭的繁殖、生长和恒温能力发育进行了研究，结果是：（１）成鸟三月下旬到达繁殖区，九月下旬离去；（２）巢离地平均高１４．７１±１．８０ｍ，巢内径２９：９０±１．２２×２７．１８±１．６６ｃｍ，巢深４．２７±０．９１ｃｍ；（３）平均窝卵数３．７３±０．４７枚，卵平均重３０．６５±３．０９ｇ．卵径４８．０４±２．２１×３５．９５±１．６５ｍｍ，（ＫＷ＝０．４９４）；（４）孵化期为２３．１０±１．２９天，孵出率为９１．６７％，初生重为２３．２５±１．９５ｇ，孵化期间卵的失水率为其体重的２３．８２％，育雏期约为３５～４０天；（５）幼鸟生长模型为Ｗｔ＝３９３／（１＋ｅ２．９３２０－０．２５１１ｔ）Ｒ２＝０．９９；（６）恒温能力发育分三个时期，即迅速发育期、缓慢发育期和恒温期，恒温能力发育完善之日正是鹭鸟羽毛完全覆盖丰满之时；（７）雏鸟食性组成主要有两栖类（４６．７３％），泥鳅（４３．６１％）和鱼（９．６６％）。     

厦门白鹭保护区白鹭体内重金属含量的分析

采用原子吸收法测定及比较厦门白鹭自然保护区鸡屿岛的白鹭(Egrettagarzetta)雏鸟和成鸟体内铅(Pb)、镉(Cd)、铜(Cu)、锌(Zn)的含量.结果显示,4种重金属在白鹭肌肉和羽毛组织中的含量都是Zn>Cu>Pb>Cd;白鹭成鸟羽毛中Pb、Cd、Cu、Zn的含量分别为6.029±0.005,0.356±0.100,7.269±1.452,117.275±63.420(μg/g干质量);成鸟肌肉组织中的4种重金属含量高于雏鸟.提示白鹭体内重金属含量随着分布地区、年龄和器官组织的不同而发生变化,重金属随着年龄增长而产生富集,厦门白鹭体内的Pb、Cd、Zn含量高于香港米埔和法国Camargue区域.     

厦门白鹭自然保护区的白鹭繁殖行为和繁殖力研究

2 0 0 1年 3月至 7月对厦门白鹭自然保护区鸡屿岛的白鹭 (Egrettagarzetta)繁殖行为和繁殖力进行了研究 .白鹭集群、择巢、筑巢于 2月中旬至 3月中旬 ,3月底部分亲鸟开始产卵和孵化 ,4月中旬雏鸟开始出壳 .白鹭窝卵数为 4.43± 0 .6 8(SD)枚 ,孵化期为 2 3.2± 1.4d ,孵化率为 88.5 0 % ,窝雏数为 3.8± 0 .8只 ,育雏期 2 8～ 35d ,雏鸟成活率为 87.7% .每年每只白鹭的繁殖力为 1.96只雏鸟 ,每巢成功繁殖 3.37只雏鸟 .鸡屿岛白鹭繁殖前期的种群数量为 5 0 32只 ,繁殖结束时亲鸟和成活雏鸟数量共 135 0 6只 .本文分析影响白鹭繁殖的主要因素 ,并提出白鹭繁殖期的管理和保护措施     

黄嘴白鹭卵的重金属含量与分布分析

黄嘴白鹭(Egretta eulophotes)是全球性受威胁鸟类,是国家二级重点保护动物.实验采用微波消解和电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)测定比较了福建岛屿黄嘴白鹭卵内容物、卵壳和卵壳膜中铬(Cr)、锰(Mn)、镍(Ni)、铜(Cu)、锌(Zn)、镉(Cd)、铅(Pb)等7种重金属元素的含量.对去膜卵壳与带膜卵壳的7种重金属含量进行了差异性分析.结果表明,黄嘴白鹭去膜卵壳中含量最高的为Ni [(3.412±0.613) μg/g],卵壳膜和内容物中含量最高的均为Zn[(17.769±8.508) μg/g,(29.449±6.443) μg/g];3个部位含量最低的均为Cd[内容物最低(0.004±0.002) μg/g].除Mn元素外,其他元素在去膜卵壳、卵壳膜和内容物中的含量均有显著性差异,重金属主要富集在卵壳膜中.除Mn元素和Cd元素外,其余5种重金属元素在去膜卵壳与带膜卵壳中均存在显著性差异.上述结果提示,今后的相关研究报道中应注明受测卵壳是否带膜,以利于同类研究的正确比对.     

浅析公安情报源分布规律

在分析公安情报源概念的基础上,结合公安情报工作的实际,研究了公安情报源的分布规律。     

肃南县汛期暴雨时空分布规律分析

肃南裕固族自治县,地处河西走廊中部,地域狭长、地形复杂,具有较强的局地气候特色,汛期内暴雨空间分布也是具有鲜明差异。每年汛期内（5—9月份）,其降雨总量为一年中最多,且占比最大,同时也是暴雨天气集中出现和易发时段。利用肃南县近10年降水逐日观测资料,统计分析肃南县近10年汛期暴雨时空分布规律特征。结果表明：汛期内降雨量总体呈现中东部多、西部少的空间分布型,降雨最大值区域均稳定在康乐镇东部、马蹄乡和皇城镇中西部一带,最小值区域均稳定在祁丰乡北部和明花乡一带;出现的暴雨频次,以7月份出现最多,5月份为最少,且暴雨易发地区在祁丰乡东部至大河乡、康乐乡中东部至皇城镇西部一带。     

螺杆泵内部压力分布规律研究

利用有限元方法建立螺杆泵二维模型,分析螺杆泵压力传递规律,计算螺杆泵在不同压差下的接触压力,得出临界接触压力曲线.利用临界接触压力曲线分析螺杆泵内部的压力分布规律.结果表明:螺杆泵密封腔之间的接触压力随着密封腔之间压差的增加而增加,但接触压力比压差增加速度慢,存在一个临界接触压力值;不同内压力的密封腔之间的临界接触压力构成了临界接触压力曲线,随着内压力的增加临界接触压力减小;螺杆泵内部各密封腔压力值沿着螺杆泵轴向从吸入口到排出口逐渐增加,增加速度逐渐减小,最终达到一个最大值,即此螺杆泵的最大压力值.     

鲁南沿海沉积物分布规律的研究

根据１５００个表层底质样品分析资料，将本区沉积分为１２种主要类型，并结合其他资料阐述沉积物分布特点。根据重力取样管， 孔及浅地层资料，分析研究了沉积物厚度和来源。     

丹参根部活性成分分布规律研究

探讨了丹参根部活性成分的分布规律,为丹参药材质量控制提供依据。将丹参根部分别从横向和纵向切段,采用HPLC测定其中7种活性成分的含量。实验结果表明丹参根部活性成分分布具有一定规律性,根部从外向内各成分含量均呈降低趋势,表皮中含量最高。根部从上至下水溶性成分含量呈降低趋势,上部含量最高;而脂溶性成分含量则呈升高趋势,下部含量较高。