复方血栓通胶囊基于血液循环和凝血过程相关靶点的网络药理学研究

利用基于计算机分子对接的网络药理学方法,研究复方血栓通胶囊化学成分对血液循环和凝血过程相关靶点的作用,并得到了成分对靶点的作用网络图。研究表明复方血栓通胶囊化学成分对ACE、PDE等多个靶点起作用。研究为在分子水平上揭示复方血栓通胶囊治疗视网膜静脉阻塞的多靶点调控机制提供了依据。     

基于网络药理学的复方当归注射液作用机制研究

通过网络药理学和分子对接来探讨复方当归注射液治疗疾病的分子机制.通过TCMSP数据库获取复方当归注射液的主要成分和靶标;通过UniProt数据库查询基因名,通过GeneCards获得疾病基因,取成分基因与疾病基因的交集,进行GO分析和KEGG分析;借助Cytoscape软件构建成分-靶点-通路网络,并进行拓扑参数分析;将成分-靶点-通路网络中筛选得到的关键化合物与关键靶点进行分子对接.通过网络药理学和分子对接得到的关键化合物有槲皮素和山奈酚,将关键靶点与化合物进行分子对接,其中AKT1、MAPK8、MAPK14、NFKBIA的结合能较小,活性较强.研究为进一步阐明复方当归注射液治疗疾病的作用机制提供一定的理论依据.     

基于网络药理学探讨连翘脂素减肥靶标及作用机制

文章利用网络药理学研究连翘脂素潜在减肥靶标及作用机制。首先通过PharmMapper筛选连翘脂素相关靶标,GnenCards筛选肥胖相关靶标,绘制venn图,共筛选到219个连翘脂素减肥相关靶标。其次通过String平台和Cytoscape 3.6.0构建靶标间相互作用网络图、进行可视化分析并筛选核心靶标,包括ALB、AKT1、MAPK1、EGFR、HRAS、CASP3、SRC、IGF-1、MAPK8、ESR1,其它靶标还包括JAK2、CDC42、NQO2、DHFR等。然后利用DAVID6.8进行GO功能富集分析和KEGG通路分析,GO功能富集涉及811个条目,KEGG通路分析得到111条信号通路,主要包括癌症通路、胰岛素信号通路、MAPK信号通路、ErbB信号通路、黏附斑等。最后利用分子模拟技术对连翘脂素减肥相关靶标进行验证,证明连翘脂素与ALB、AKT1、EGFR、HRAS、CASP3、SRC、IGF-1、MAPK8等都有较好的结合活性（结合能小于-5 kcal/mol）。研究通过对成分-靶标-疾病网络分析,从多靶标、多通路阐释了连翘脂素潜在减肥作用机制,为后续深入研究提供了理论依...     

降脂宁片提取工艺条件的实验研究

目的为降脂宁片的生产选择适宜的溶媒量.方法以提取率为指标,分别对不同溶媒量进行研究.结果与结论保证有效成分提取完全的适宜加水量与加醇量,均为生药量的7倍量.     

基于网络药理学挖掘连翘治疗胆汁淤积的机制

本文首先利用中药系统药理学数据库分析平台TCMSP构建连翘成分-疾病靶点网络及靶蛋白互作网络,采用R语言包进行生物功能（GO）和通路（KEGG）富集分析,再根据网络药理学结果,结合文献资料,采用SYBYL 2.1.1进行分子对接,分析连翘活性成分与胆汁酸调节通路关键靶点的相互作用。网络药理学筛选得到活性成分17个,核心靶点8个,主要涉及胆汁酸代谢转运、核受体反馈调控、胆红素转化、炎症氧化损伤的细胞应答等,分子对接显示这些连翘活性成分与核受体有较好结合,木脂素类可能是连翘抗胆汁淤积的主要活性成分群。连翘显示出通过多成分、多靶点、多途径方式作用于胆汁淤积关键靶标的潜力,通过核受体调控胆汁酸代谢、抗炎抗氧化损伤等可能是其抗胆汁淤积的主要机制,这为连翘治疗肝胆疾病的研究和开发提供了依据和参考。     

基于网络药理学探讨玫瑰花抗抑郁物质基础及作用机制

利用网络药理学和分子对接方法探究玫瑰花抗抑郁的物质基础及作用机制。通过中国知网收集抗抑郁单体和玫瑰花的化学成分,借助PubChem、SwissTargetPrediction数据库预测玫瑰花的抗抑郁活性成分及作用靶点,通过DAVID数据库进行通路富集分析,运用Discovery Studio 2017软件对关键成分和靶点进行分子对接。收集抗抑郁单体117个,玫瑰花成分127个,筛选出玫瑰花与抗抑郁相关的核心成分17个,分子对接显示玫瑰花所含芹菜素、槲皮素、山柰酚、异丁香酚、异槲皮苷、矢车菊素-3-O-葡萄糖苷6个活性成分,可较好地与AKT1、PTGS2、ESR1 3个抑郁相关靶点结合。结果表明玫瑰花抗抑郁的物质基础为芹菜素、槲皮素、山柰酚等黄酮类化合物,主要通过影响HIF-1信号通路、神经活性配体-受体相互作用信号通路、催乳激素信号通路、多巴胺能神经突触信号通路发挥抗抑郁作用。该研究为抗抑郁新药研发提供了理论依据及新的研究思路。     

基于网络药理学和分子对接探讨黄花柳抗氧化作用机制研究

黄花柳（Salix caprea）具有较强的抗氧化作用,但目前关于黄花柳抗氧化作用机制的研究尚未详尽报道。文章通过网络药理学和分子对接技术筛选得到黄花柳活性成分21种,预测到靶点320个,抗氧化相关靶点1056个,取交集得到的黄花柳与抗氧化相关靶点118个,GO富集分析得到基因功能354条,KEGG通路富集分析得到通路146条。分子对接结果显示,核心成分柚皮素、二氢杨梅素、香叶木素等可与核心靶点AKT1、MAPK3、PIK3CA等均具有良好的结合活性。初步验证了黄花柳可通过多成分、多靶点、多途径发挥抗氧化作用,为下一步实验研究提供验证依据和方向。     

基于网络药理学和分子对接研究太子参抗心肌缺血的作用机制

为了探究太子参抗心肌缺血的潜在作用机制,采用网络药理学方法对太子参的活性成分及心肌缺血的相关靶点进行预测,构建太子参抗心肌缺血的关键靶点网络,对其进行基因本体(gene ontology,GO)功能及Pathway富集分析,并将太子参活性成分与关键靶点进行分子对接验证。筛选获得太子参活性成分8个,对应的抗心肌缺血关键靶点50个。GO功能及Pathway富集分析显示：太子参抗心肌缺血主要参与细胞凋亡、血管新生及炎症反应等生物过程,涉及MyD88-independent TLR4 cascade（非依赖MyD88的TLR4信号传导通路）、MyD88:Mal cascade initiated on plasma membrane（MyD88：质膜上启动的MAL级联）及Activated TLR4 signalling（激活的TLR4信号通路）等,其中主要的作用靶点包括JUN、MAPK1、IKBKG、PTPN11、RELA等;分子对接验证蒲公英萜醇与关键靶点AKT1、IL6、MAPK1、TP53的结合性最好。该研究揭示了太子参通过多途径、多靶点抗心肌缺血的作用机制,为进一步研究其抗心肌缺血作用提供了基础。     

基于网络药理学方法探究中药肉桂治疗糖尿病的作用机制

运用网络药理学方法和生物信息学技术,预测中药肉桂治疗糖尿病的药效成分及关键靶点,分析其作用机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台（Traditional Chinese Medicine System Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）以及文献检索,确定肉桂的有效成分并筛选出肉桂对应靶点蛋白;利用GeneCards数据库筛选糖尿病相关基因,构建中药肉桂的成分-靶点网络和蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction,PPI）网络;利用DAVID(Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)和STRING数据库进行基因本体（gene ontology,GO）功能富集分析和京都基因和基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路富集分析;最后,将部分药效成分与关键靶点进行分子对接验证。通过筛选,得到32个有效成分作用于131个相关靶点,核心基因有INS、AKT1、IL6、TNF、VEGFA等20个,GO和KEGG分析肉桂主要参与RNA聚合酶II启动子对转录的正调控等生物过程及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路等发挥治疗作用。对10个关键成分进行分子对接得出,肉桂中的原花青素B1和槲皮素与INS、IL6、VEGFA、TNF有较好的亲和力。本研究初步阐释了肉桂治疗糖尿病的作用机制,有利于指导临床用药。     

基于网络药理学和分子对接探讨三黄泻心汤治疗阿尔茨海默病的机制

运用网络药理学方法探讨三黄泻心汤治疗阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease, AD)的作用机制。利用中药系统药理学数据库与分析平台检索并筛选出三黄泻心汤的有效成分及作用靶点。通过GeneCards数据库检索并筛选出AD相关靶点,维恩图获取药物与疾病交集靶点。使用STRING数据库得到蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络信息。使用Cytoscape构建药物-有效成分-靶点-疾病网络与PPI网络图,通过DAVID数据库对共同靶点进行GO(gene ontology)和KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析。使用SYBYL-X 2.1.1软件进行分子对接验证。筛选出三黄泻心汤47个有效成分,71个药物与疾病交集靶点,主要活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、汉黄芩黄素、黄芩新素、半枝莲种素、苏荠苎黄酮,核心靶点为IL-6、TNF、IL-1β、VEGFA、TP53。GO功能分析主要涉及药物反应、缺氧反应、细胞迁移的正向调节、一氧化氮生物合成过程的正调控等生物过程,KEGG分...     

基于网络药理学和分子对接探讨马兰对非酒精性 脂肪性肝病的作用机制

基于网络药理学与分子对接探讨马兰对非酒精性脂肪性肝病的作用机制,为后期研究 提供理论依据。通过文献检索马兰的化学成分,用 Swiss target prediction 进行靶点预测;利用 OMIM、Gene Card、Drug bank获取非酒精性脂肪性肝病的疾病靶点,再利用Cytoscape 3.9.1构建药 物-成分-靶点网络图;用 String 11.5 进行 PPI 分析,用 R 语言进行 GO 分析、KEGG 分析。筛选出 26个活性化合物,得到交集靶点55个,槲皮素、山柰酚和木犀草素可能是主要活性成分,关键靶点 涉及 ESR1、EGFR、AKT1 等;GO 分析和 KEGG 分析涉及多种生物途径以及 PPAR、PI3K 等信号通 路。分子对接结果显示槲皮素、山柰酚和木犀草素与ESR1、EGFR、AKT1之间具有较好的结合能 力。马兰可能通过多成分、多靶点、多途径对非酒精性脂肪性肝病发挥治疗作用。     

基于网络药理与分子对接研究百合行治疗认知障碍的机制

为了研究百合治疗认知障碍的作用机制,采用网络药理学方法从TCMSP数据库中筛选出百合的7种主要活性成分及其潜在的465个作用靶点.在GeneCards,OMIM,PharmGkb,CTD,DrugBank数据库中获取认知障碍疾病靶点,然后取百合化学成分与认知障碍靶点两者交集,得到“药物成分—疾病”交集靶点44个.采用Metascape利用STRING数据库,构建交集靶点蛋白相互作用（PPI）网络图,筛选后得到核心靶点与核心成分,其中MAOB（单胺氧化酶B）、CASP3（半胱天冬氨酸蛋白酶3）、ESR1（雌激素受体）、JUN（1号染色体的基因）、CASP8（天冬氨酸蛋白水解酶8）、CASP9（天冬氨酸蛋白水解酶9）、PGR（类固醇受体基因）、AR（肾上腺素能受体）、SLC6A3（多巴胺转运蛋白基因）、PTGS2（环氧合酶-2）为百合药效成分抗认知障碍作用的关键靶点蛋白.利用DAVID和Metascape平台进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,采用AutodockVina平台实现分子对接.结果表明,百合的4个活性化合物与10个认知障碍关键核心靶标相关,参与调节的关键信号通路有30条.其中,度值较大的化学成分有豆甾醇、3-去甲秋水仙碱、β-谷甾醇、松香酸;度值较大的靶点蛋白有MAOB,PTGS2,CASP3,CASP9等;主要涉及的通路有神经活动配体—受体相互作用通路、钙离子信号通路、小细胞肺癌通路等.百合治疗认知障碍的作用机制可能是通过抑制单胺氧化酶B的活性,改善认知功能.     

复方肿瘤血管生成抑制因子口服液对小鼠免疫功能的影响

为探讨复方肿瘤血管生成抑制因子口服液（ＣＯＬ－ＴＡＩ）对正常及化疗小鼠免疫功能的影响,应用环磷酰胺（ＣＴＸ）对实验小鼠进行化疗或给实验小鼠以致死量的阿糖胞苷（ＡＲＡ－Ｃ）,然后给小鼠口服ＣＯＬ－ＴＡＩ,比较用药组和对照组之间小鼠腹腔巨噬细胞Ｃ３ｂ受体活性、吞噬功能、淋巴细胞酸性非特异性酯酶和生存时间等免疫指标的影响．结果显示ＣＯＬ－ＴＡＩ可明显提高小鼠腹腔巨噬细胞Ｃ３ｂ受体性活,ＣＯＬ－ＴＡＩ对化疗小鼠的免疫缺损有恢复作用,可提高小鼠巨噬细胞吞噬率和吞噬指数,增加ＡＮＡＥ＋（α－乙酸苯酯酶＋）淋巴细胞百分率;ＣＯＬ－ＴＡＩ可显著延长给阿糖胞苷致死量小鼠的生命（Ｐ＜０．０１）．ＣＯＬ－ＴＡＩ具有增强正常和化疗小鼠特异性和非特异性免疫功能,口服ＣＯＬ－ＴＡＩ可显著提高化疗小鼠的免疫水平．     

正交法优选孔枕益智片五味子的提取工艺

目的 优选孔枕益智片中五味子有效成分五味子醇甲提取工艺方法.方法 采用正交设计试验,以HPLC测得五味子醇甲的含量为观察指标对五味子提取工艺进行优化.结果 优选工艺为五味子以8、6、6倍量80%乙醇提取3次,提取时间均为3 h.结论 所选提取工艺稳定、可行.     

黄连治疗新冠肺炎的作用机理——基于网络药理学方法和分子对接技术

基于网络药理学方法和分子对接技术,初步探索了黄连治疗新冠肺炎（COVID-19）的作用机理.使用中草药系统药理学平台筛选黄连的有效活性成分与作用靶点,GeneCards和OMIM数据库筛选COVID-19的疾病靶点,R软件筛选药物与疾病的共同靶点,并利用Cytoscape软件构建“药物—活性成分—靶点—疾病”互作网络,STRING数据库构建共同靶点蛋白互作网络,ClueGo软件对共同靶点进行基因功能分析,R软件对共同靶点进行KEGG通路富集分析,然后将黄连有效成分中的核心成分与其治疗COVID-19的主要靶点进行分子对接.结果表明,黄连的有效活性成分共14种,靶点共235个;COVID-19的相关基因共341个;黄连治疗COVID-19的关键靶点包括VEGFA,IL6,POR,PLAT.分子对接结果显示,黄连中核心化合物榭皮素与PLAT,VEGFA,IL6对接效果良好.     

基于网络药理学的蒲黄对血瘀证的作用靶点与代谢通路研究

本研究利用网络药理学探讨蒲黄(Pollen typhae)治疗血瘀证的作用靶点与代谢通路.研究首先通过PharmGKB、TTD和CTD数据库筛选出与血瘀证相关的靶点;接着利用String平台构建蛋白质相互作用(PPI)网络,并挖掘PPI网络中潜在的蛋白质功能模块,通过Metascape平台分析蒲黄活性成分作用靶点所参与...     

BP神经网络结合正交试验法优选锦锈杜鹃黄酮的提取工艺

将BP人工神经网络技术与传统的正交试验方法相结合,提出一种新的试验分析和处理方法,利用神经网络特有的自学能力,对主要影响因素进行仿真优化,获得锦锈杜鹃黄酮物质提取的最佳工艺:料液比1∶20(g/mL),超声波提取时间为40 m in,提取温度为60℃,乙醇质量分数为40%.应用优化得到的工艺条件进行验证试验,取得了较好的效果     

复方肿瘤血管生成抑制因子口服液与化疗药物合用对小鼠Ehrlich腹水癌的抑制作用研究

本文研究了复方肿瘤血管生成抑制因子口服液（ＣＯＬ－ＴＡＩ）与化疗药物合用对小鼠Ｅｈｒｌｉｃｈ腹水癌的抑制作用,结果表明,单独服用ＣＯＬ－ＴＡＩ的各实验组生命延长率均大于对照组;单独使用环磷酰胺（ＣＴＸ）或阿霉素（ＡＤＭ）时,生命延长率分别为３６．９８％和１１９．６７％,二者分别与ＣＯＬ－ＴＡＩ合用时,生命延长率分别为７９．６４％和１５２．５０％,由此可见,ＣＯＬ－ＴＡＩ与化疗药物合用有显著协同抑制Ｅｈｒｌｉｃｈ腹水癌生长和延长存活时间的作用．     

基于混合遗传算法和复合形法的翼型优化设计

遗传算法的缺点在于计算过多的目标函数适应值而增加了优化设计的计算量。为了提高遗传算法的优化效率,将遗传算法和复合形法相结合,建立了基于混合遗传算法和复合形法的气动优化设计方法,对超临界翼型进行了单目标和多目标的优化设计,流场计算采用雷诺数平均N-S方程。算例表明,该设计优化方法稳定,设计质量高,效率比单纯遗传算法有很大提高,在工程中有较大的应用价值。