蛋白质折迭时标和分子伴侣的一个简单模型

利用大分子构象动力学导出蛋白质折迭的时标，讨论了折迭时间和分子参量的依赖，着重研究了对构象变化中原子团转动惯量的依赖，在此基础上提出了分子伴侣的一个简单模型。     

液体分子自由程压力系数与温度系数研究

Ｊａｃｏｂｓｏｎ在Ｅｙｒｉｎｇ分子模型基础上提出了液体分子自由程理论．根据这个理论，液体分子自由程即分子表面之间的距离应为Ｌ＝２Ｖａ／Ｙ．本文在Ｊａｃｏｂｓｏｎ理论基础上，给出了液体分子自由程压力系数与温度系数两个参量，研究了部分烷烃、烯烃、醇、苯及其卤代物的自由程压力系数与温度系数．在以后的研究中，我们还发现这两个参量与分子力及液体声速系数有密切联系     

应用休克尔分子轨道理论计算共轭分子的参量

用Ｆｏｒｔｒａｎ语言编程,应用休克尔分子轨道理论计算共轭分子的能量和分子轨道系数,进而求得电荷密度,键级,自由价等参量。     

盐酸胍诱导的蛋白质变性现象研究

考虑常用变性剂盐酸胍（GuHCl)分子与蛋白质主链上的相邻二肽形成双氢键，利用吸附反应动力学方法，得到了描述蛋白质变性物理参量与盐酸胍浓度之间关系的式。结果表明计算得到的理论值与实验值符合良好，说明所给出的蛋白质分子与盐酸分子相互作用模型，能够较好地描述盐酸胍诱导的蛋白质变性现象。     

有机液体中声参量与液体分子半径的联系

由Schaaffs理论得到有机液声速温度系数、压力系数及非线性声参量的表达式。结果表明,上述声参量与液体分子半径密切联系。在常温常压下,有机液声速系数c/T_p<0,(c/p)_T>0,非线性声参量B/A≥8。     

液体非线性声参量与分子结构的关系研究

为了寻求简单液体的非线性声参量与分子微观量的关系，基于Flory液体理论，推导出有机液体的非线性声参量与表征分子结构参量的关系式，并通过理论值与试验值的比较，验证了该关系的可靠性．结果表明，液体的非线性声参量决定于分子的结构，从而表达了分子级的信息．     

流体非线性声学参量B／A的分子热力学研究

提出了流体非线性声学参量Ｂ／Ａ的体积模量表述，主意服Ｂ／Ａ是流体体积模量的函数，研究了理想气体，硬球液体Ｂ／Ａ的性质，得到硬球体系液体的Ｂ／Ａ表达式。为用热力学，分子热力学方法计算流体的Ｂ／Ａ提供了理论依据。     

分子有效直径对费米气体热力学性质的影响

从内能的修正出发,推导了弱简并非理想费米气体的状态方程,并以此为基础,利用相关的热力学关系,推导了系统的热容量和熵等热力学参量,分析了分子有效直径对这些热力学参量的影响机制．结果发现：分子有效直径在一定值上会使内能和熵发生突变,而在该值两边,内能和熵的变化规律都不相同,分子有效直径对热容量几乎没有影响．     

分子有效直径对费米气体热力学性质的影响

从内能的修正出发,推导了弱简并非理想费米气体的状态方程,并以此为基础,利用相关的热力学关系,推导了系统的热容量和熵等热力学参量,分析了分子有效直径对这些热力学参量的影响机制．结果发现：分子有效直径在一定值上会使内能和熵发生突变,而在该值两边,内能和熵的变化规律都不相同,分子有效直径对热容量几乎没有影响．     

应用拓扑指数和路径数预测烷烃的物理化学性质

拓扑指数ｘｚ和路径数Ｐ１、Ｐ３、Ｐ４是表征烷烃分子大小、支化度和形状等结构特征的重要参量．据此，本文将ｘｚ、Ｐ１、Ｐ３、Ｐ４作为独立参量，用多元线性模型系统地研究了烷烃结构－性质的定量关系，预测了含２～９个碳原子烷烃的原子化焓、标准生成焓、汽化焓、摩尔体积、摩尔折射度、正常沸点、密度、溶解度等１０项物理化学性质．计算方法简单，结构意义明确，结果令人满意     

半经验分子轨道方法计算吸附分子几何构型的可靠性

运用半经验分子轨道AM1方法计算了金刚石（111）面上乙炔吸附分子的几何构型，通过与相似结构的丙烯分子实验参数的比较，分析论证了半经验分子轨道方法用于碳氢化合物吸附分子几何构型计算的可靠性．     

溶于液晶的二向色性染料有序参数的研究

研究了宾主盒的二向色性染料的有序参数(S)与其分子长度(l)、宽度等分子构型以及分子的偶极和诱导偶极的关系,发现S随l的增长而增大。当l增加到一定值时,有序参数增大缓慢,如果l超过液晶分子太大时,则出现下降趋势。而在平均分子长度为1.4 nm的E_7液晶中,染料分子长度达到2.30nm时,其有序参数将趋于饱和。染料分子的侧向取代基由于增加其分子宽度,也会使有序参数下降。宾主盒的有序参数随染料分子与液晶分子间偶极作用的增加而增大。宾主盒有序参数越大,其二色比越高,显示对比度一般也越高。     

用基团贡献法预测原油平衡闪蒸气化率

用正构烷烃模型分子法确定假组分的基团组成,根据ＵＮＩＦＡＣ基团贡献法饱和蒸气压模型与活度系数模型,以及修正的活度系数模型,计算了假组分的相平衡常数Ｋ,并预测了大庆原油平衡闪蒸气化率。结果表明,用平均沸点确定基团组成,ＲｉａｚｉＤａｕｂｅｒｔ关联式计算相对分子质量的ＲａｕＫ模型的预测值与实验值的偏差最小,为３．３６％;用ＡＰＩ式计算相对分子质量的ＫｉｋＫ模型和ＬａｒＫ模型次之,预测偏差低于５．５％,均可满足工程计算的要求。而且运用正构烷烃模型分子ＵＮＩＦＡＣ基团贡献法时,仅需平均沸点或相对分子质量之中的一个物性参数即可确定假组分的基团组成,计算过程更加简单。     

S_2Cl_2分子电子结构外电场特性理论研究

采用B3LYP/aug-cc-pVTZ方法研究了不同外电场对S2Cl2分子基态结构参数键长、键角、二面角、偶极矩及分子振动光谱的影响规律.结果表明外电场电场强度增大,相应SS键长逐渐变长,SCl键长逐渐变短,分子极性增强.外电场对分子不同振动模式的振动频率数值、强度影响存在差异.因而可利用外电场影响分子的特定振动模式以获得特定的振动光谱.     

聚合物老化降解的组分模型建立与应用

 聚合物老化降解是影响油藏中聚合物驱效果的重要因素.聚合老化降解表观上是其特征黏度和黏度降低的过程,实质是聚合物分子量断裂引起的大分子向小分子降解的过程,聚合物降解过程中分子量分布发生变化,但其总质量浓度不变.假设聚合物由多个不同分子量的纯组分构成,建立的多组分模型可以描述聚合物老化降解过程中各组分质量浓度变化的过程.基于组分模型的构建思想,将多组分模型进行简化处理,构建了聚合物降解的两组分模型.假设聚合物老化降解发生在两组分之间,平均分子量较大的高组分聚合物向分子量较小的低组分聚合物降解.通过拟合具体的实验数据得到两组分模型的两个参数:低组分聚合物特征黏度和降解系数,进而通过两组分模型描述聚合物降解过程中特征黏度的变化过程,再结合特征黏度与黏度的半经验公式表征聚合物降解过程中黏度的变化.相对于多组分模型,两组分模型的参数更易获取,也不失对聚合物降解机制的体现,可以通过两组分模型描述聚合物的老化降解过程.     

分子模型对接的平滑积分变换方法

提出了三维分子对接模型果上互作用的势能函数采用平 积分变换方法进行全局极小化寻找对拉的最佳结合构型,计算本的算法对接问题效果良好,讨论了势能函数拟合参数选取和极小追踪方法问题。     

丝氨酸手性分子与离子单重低激发态特性的理论计算

采用密度泛函理论(DFT)中的B3P86方法, 在6-311++G(-d,p-)基组水平上优化手性左旋体丝氨酸(S-Ser)分子、 正负一价离子、 负二价离子的基态稳定几何构型, 并用含时密度泛函理论(TD-DFT)方法, 计算手性S Ser分子及S-Ser-2-轨道跃迁等单重低激发态特性. 结果表明： 手性S-Ser分子和S-Ser-2-结构参数随分子体系俘获电子数目的增加而发生变化, 其中键长R变化最明显; 分子轨道(MO)结合自然跃迁轨道(NTO)特征分析法可较好地描述手性S Ser体系各激发态的电子激发特性, 对Rydberg激发特征指认效果较好.     

量子化学法研究苯并芘分子的结构和性质

结合HF、B3LYP、B3PW91、MP2等不同经典量子化学方法,在6-311++G(d,p)水平上计算苯并芘的分子结构和电子结构,并对苯并芘分子的几何构型、Wiberg键级、光谱、静电荷布居等进行分析,结合前线轨道理论探讨分子的稳定性和反应活性.结果表明:苯并芘分子呈环状平面型,其中碳原子的活性不同,C(8)的反应活性最高,最容易接受亲电试剂的进攻.前线轨道分析表明:苯并芘分子以接受电子为主,计算得出ΔE L-H=3.048 eV,表明该分子具有适合的能带宽度,可作为有机发光材料的原料.同时计算其在不同温度下的热力学性质.MP2方法在能量计算方面体现出较精确的优势.     

分子线的电子结构研究

分子通过硫氢官能团可以很强地吸附于金表面上,从而可作为连接体用于纳米电子学中的分子器件.本文利用密度泛函理论计算了分子的电子结构,讨论了温度对分子结构的影响,并利用轨道的扩展情况讨论了分子电子结构对分子线电导的影响.