基于CDS..join特征域的Exon/Intron数据库的构建

基因进化的研究和重构通常是在序列水平上进行的，包括比对它们的遗传序列或蛋白序列。而对基因外显子/内含子结构的分析能够提供更多有价值的信息，比如绘制更为可靠的系统发生图谱，或更精确地阐明内含子的进化。为此，本文设计了相应的Perl脚本程序来提取、比较和搜索基因说明文档中CDS..join特征域的Exon/Intron结构。通过该方法，可构建相关物种的Exon/Intron数据库（EID），其主要内容包括内含子的相位，Exon或Intron的数量、大小，剪接位点的模式以及选择性剪接（Alternative splicing, AS）的相关信息。     

构建非冗余EID的若干技巧

基于GenBank构建的外显子内含子数据库（EID）含有大量的冗余数据.为了解决冗余问题,构建了基于RefSeq的非冗余EID（non-redundant EID）.RefSeq是由NCBI staff负责维护和更新的参考序列库,为基因组注释、基因识别、基因突变、多态性分析、表达研究和比对分析提供了一个稳定的参考.该EID可用于大规模分析Exon/Intron结构和内含子剪切（Splicing）的研究,并拥有一些内部机制来控制数据质量和可能出现的错误.同时,它的新的改进是增加了基因序列中非翻译区（UTR）的数据内容.该文对构建基于RefSeq的非冗余EID的一些技巧作出说明.     

大型分布式冗余数据库的自动维护与统计

分析了大型分布式冗余数据库的结构、统计与维护应解决的问题,提出了使用大型分布式冗余数据库的应用系统的结构,通过综合运用触发器、存储过程、运行参数与操作系统的任务计划等技术,能使下级及时自动将数据向上维护并自动取回上级变动数据来维护本地数据库;统计对系统其他功能的影响减至最小,并能使用户根据需求变化配置系统.这种采用运行参数的形式由用户自己配置企业规则等技术思想,增大了系统灵活性,降低了维护的费用.     

癌症相关基因选择性剪接进化数据库的构建

选择性剪接是真核生物基因调控的基本调节机制之一,与各种类型的生理和病理活动相关.癌症相关基因的不正常剪接可能与多种癌症的发生发展有关.作为选择性剪接进化的主体,选择性剪接外显子展示了其在不同物种中多样的进化功能.本文系统整理了2 989个癌症相关基因的各项功能,通过比较基因组学的分析方法总结了癌症相关基因的选择性剪接外显子的功能和进化关系,建立了癌症相关基因选择性剪接进化数据库(ASeeDB数据库).ASeeDB包含癌症相关基因外显子区域的进化保守性、结构域预测、Ka/Ks值、以及基因、转录本、外显子区域3个层次的表达量统计等信息,结合这些信息用户可以方便的检索有研究意义的基因或者外显子.外显子区域蛋白质结构域的预测可以帮助了解其可能的功能,而外显子是否存在选择性剪接又可以推及包含该外显子的转录本是否具有相似的功能以及推测剪接是否会对蛋白质功能发生影响.数据库提供的物种间的序列比对可以帮助用户发现没有注释的外显子区域或者是保留的失去功能的外显子.相比于基因层面的Ka/Ks,数据库提供的外显子层面的Ka/Ks对于发现适应性进化事件具有更高的敏感性,可以更加方便地预示基因中未知功能的区域.     

广域传感器数据库中数据冗余问题的研究

传感器网络在监控、采集、处理和传播信息过程中体现着准确、实时、方便、可靠等特点,引起了越来越多国家的军事界、学术界和工业界的高度重视.本文详细分析了广域传感器数据库中存在的结点信息重复存储问题,并针对此问题提出了一种采用单链表存储兄弟结点之间相同文档碎片的方法,有效地解决数据冗余问题.     

核酸序列非均匀指数(HI)的约化

考虑到在计算 H I值时 ,任何一种碱基在序列中出现的理论频数都应该大于 5 ,故而对原 H I公式进行了约化处理 ,并将约化后的 H I值与原 H I值作了对比 ,发现不同的约化方式所得到的 H I值在描述序列不均匀性时的效果是不同的 ,用编码区所偏好的约化语言进行约化后所得到的 H I值在应用于高 GC含量、中 GC含量以及总共的外显子和内含子的识别时 ,其效果要优于原 H I值     

演绎数据库推理冗余的产生和一个新的处理算法

对演绎数据库推理过程中出现的推理冗余问题,给出了一种新的解决算法,与其它算法此较,能极大地消除重复推理。     

用于软判决译码时的非冗余纠错差分检测

提出了非冗余纠错差分检测在软判决译码时的应用.结合π/4-DQPSK差分解调,着重研究了非冗余纠错在软判决译码时的应用,给出了具体系统实现时的软件流程图.用计算机仿真了该算法在加性白高斯噪声(AWGN)信道和Rician信道中的性能.仿真表明,相对于软判决译码时传统的差分解调,该算法在误比特率BER为10-4时在AWGN信道中有1.4dB的性能改善,在Rician信道中同样有显著的性能改善.考虑到了实现损耗,实际系统的测试结果与仿真结果相一致.这使得NEC能够在普遍采用软判决译码的卫星通信系统中应用,拓展了NEC只能用于硬判决的局限,从而提高了系统容量和通信质量.     

基于视觉显著度的H.264冗余片编码技术

针对现有显著度模型不能同时兼顾快速运动场景和慢速运动场景的问题,对显著度模型建模方法中的运动特征提取算法进行改进,提升运动显著度子图的精确性。在此基础上,考虑到人眼视觉系统对图像局部内容更关注的特点,将改进的显著度模型用于H.264视频的冗余片编码技术中,对图像中人眼关注的区域进行冗余片编码,从而提高视频流的传输容错能力。实验结果表明,该技术在丢包网络中能明显提高解码图像的主客观质量。     

线性离散系统的非脆弱混合H2/H∞动态输出反馈控制

基于不等式技术研究了线性离散系统的非脆弱混合H2/H∞控制器设计问题.所考虑的控制器具有乘性控制器增益不确定性.设计的动态输出反馈控制器能够保证闭环系统具有渐近稳定性,同时满足混合H2/H∞性能.针对凸多面体结构的不确定线性系统,其结果可推广到鲁棒非脆弱混合H2/H∞控制器的设计当中.最后,通过仿真算例证实了文中所给设计方法的有效性.     

油藏经营管理数据库建设和应用

油藏经营管理数据库是油藏经营管理系统的基石和核心。要实现油藏经营管理的目标,一个重要的环节就是建立基于现代数据库技术、适合我国油田开发现状的油藏经营管理数据库系统。介绍了油藏经营管理数据库系统在整个油藏经营管理中的核心地位、数据库内容、数据库的设计和建设、管理和维护及在油藏经营管理中的应用。油藏经营管理数据库通过给油藏经营管理软件各个子系统提供安全、可靠的数据,从而实现油藏管理的目的。     

数据库访问中间件的研究与构造

研究和分析了三层客户机 /服务器体系结构及其核心商务服务层 ,并就商务服务层的数据服务 ,提出并实现了一种数据访问中间件的新方法 .通过数据库连接管理和数据访问管理 ,真正做到将用户和数据访问的复杂性相隔离 .详细说明了数据访问中间件的设计特点及实现技术     

四川大学植物标本馆馆藏标本网络数据库的构建

开发和利用西部地区的资源巳成为中国经济建设中的热点,而建立一个植物资源数据库可以为了解和合理利用或保护植物资源提供很大的帮助。作者构建了四川大学植物标本馆馆藏标本网络数据库,将ASP（Active Server Page）技术引入植物标本数据库网络查询系统,不仅能方便Internet网络用户查询植物标本数据,而且可提高标本数据的利用率,有利于实现资源共享。     

广东地理环境科学文献数据库的建设

论述了地理学在广东省国民经济建设中所起的重要作用. 针对地理学科具有综合性,其文献资料分散的特征,以广东省地理环境信息资源为主线,重点选择体现本区域和专业特色的科研成果及相关学科文献资源,与有关同行兄弟单位共同建立有地区特色的广东地理环境科学数据库. 在阐述了构建广东地理环境科学文献数据库意义的基础上,提出建库的目标、原则、内容、功能和作用以及实现机制.     

基于GIS的生态系统服务空间数据库构建研究

根据我国两屏三带生态安全战略以及国家公园自然保护地体系建设的具体情况,基于ArcSDE空间数据库引擎关键技术,以湘西州1980-2018年时间段四个年度Landsat-TM遥感影像为基础数据源,结合同类型的生态系统服务多源异构指标数据及统计年鉴相关自然灾害、生态环境和社会经济方面数据,进行空间数据库的图层架构和逻辑结构属性设置,在Visual C#系统中对ArcGIS进行二次开发,建成空间数据库平台。实验结果表明,平台能更好地为各类型生态系统服务查询数据、计算价值,及生态系统服务效应评估与决策支持等利用。     

人MiTERF3基因启动子的克隆及其荧光素酶报告基因载体的构建

人MiTERF3基因编码线粒体基因转录和能量代谢的负调控因子。采用PCR技术对人MiTERF3基因5''侧翼上游1251 bp启动子序列进行扩增,并将其克隆至荧光素酶表达载体pGL6-TA,构建人MiTERF3基因启动子荧光素酶报告基因质粒。经酶切、测序鉴定后,将其用脂质体转染体外培养的HEK293细胞株,利用双荧光素酶测定系统检测其表达活性。研究结果表明,克隆获得的1251 bp DNA序列与GenBank报道的一致,且插入方向正确。含人MiTERF3基因启动子的报告基因荧光素酶的表达活性显著提高（P<0.05）,约为对照组（空载体pGL6-TA）的9.8倍。本研究通过对人MiTERF3基因启动子的克隆及其荧光素酶表达载体构建与表达活性的测定,为进一步阐明人MiTERF3基因表达的调控机制奠定实验基础。     

自然灾害案例数据库的建立与应用：以中国1998年洪 …

综述了各种自然灾害数据库的研究进程，给出了中国自然灾害数据库的分类体系，认为自然灾害案例数据库是一种过程关系数据库，它对于自然灾害成因机制的深入研究具有重要意义，以中国１９９８年洪水案例数据库来说明自然灾害案例数据的本征特征及其应用。     

自然灾害案例数据库的建立与应用--以中国1998年洪水灾害案例数据库为例

综述了各种自然灾害数据库的研究进程,给出了中国自然灾害数据库的分类体系.认为自然灾害案例数据库是一种过程关系型数据库,它对于自然灾害成因机制的深入研究具有重要意义.以中国1998年洪水案例数据库来说明自然灾害案例数据的基本特征及其应用.