蛋白质组技术的研究进展

基因组学的研究已从结构基因组学转移到功能基因组学上来。以大规模分析蛋白质作为其主要内容的蛋白质组是功能基因组学研究的一个主要内容。综述了蛋白质组研究所使用的主要技术，包括：二维凝胶电泳技术、质谱技术、蛋白质芯片技术、蛋白质复合物纯化技术、酵母双杂交技术、嗜菌体显示技术。     

蛋白质组技术的研究进展

基因组学的研究已从结构基因组学转移到功能基因组学上来.以大规模分析蛋白质作为其主要内容的蛋白质组是功能基因组学研究的一个主要内容.综述了蛋白质组研究所使用的主要技术,包括:二维凝胶电泳技术、质谱技术、蛋白质芯片技术、蛋白质复合物纯化技术、酵母双杂交技术、嗜菌体显示技术.     

水稻基因组学研究概况

重点对水稻的结构基因组学、功能基因组学和蛋白质组学的主要研究内容、研究方法和研究进展三个方面进行了综述，并对与水稻基因组学研究相关的学科，如生物信息学、比较基因组学等方面进行了阐述，最后对水稻基因组学的发展进行了简单展望．     

植物功能基因组研究进展

基因组学研究已开始从结构基因组学转向功能基因组学。对功能基因组学研究的重要意义及内容、方法进行了综述，并对植物功能基因的研究进展及应用前景作了介绍。     

医学结构基因组学在研制新药中的作用

从药靶的选择、蛋白质片段为基础的新药开发、以寡聚酶为新药开发的靶、工业化的结构和蛋白质数据库以及专门研究传染病的结构基因组学工程等5个方面综述了医学结构基因组学在研制新药中的作用。     

结构基因组学研究进展

在结构基因组学研究方面,北美洲取得了巨大进展,欧洲是缓慢地开始但是强劲地结束,日本是最先开始进行结构基因组学研究的国家之一,并且一直在努力地从事这方面的研究,澳大利亚也在参与结构基因组学研究。核酸结合蛋白对阐明蛋白质-核酸相互作用机理是非常重要的,用结构基因组学研究蛋白质-核酸作用机理将清楚地解释象癌症、糖尿病等疾病的发病机制,这样人类就可以用相关蛋白质的结构信息合成药物来治疗这些疾病。     

结构基因组学综合数据库分析的构建和作用

介绍了结构基因组学综合数据库构建的意义和综合数据库的功能,主要包括Gerstein总结的对有限的蛋白质片段的折叠分类和排列、种系发生信息、蛋白质的功能分类和蛋白质的相互作用信息、基因表达信息和综合数据库对报道结构基因组研究数据和格式的要求。     

网格中基于结构分类和位矩阵编码并行遗传算法的蛋白质二级结构预测

蛋白质二级结构预测是后基因组学的重要内容,是能准确预测蛋白质分子三维空问结构的关键步骤,它被证明是个NP难问题.同时,蛋白质数据库中的数据是巨量的,每天以指数形式在增长,而且不同的数据库位于不同的地域,受不同组织管理.提出一个网格中基于结构分类和位矩阵编码的并行遗传算法,有效地解决这个NP难问题,并且充分利用网格强大的并行计算能力,提高预测效率和准确率.     

41条牦牛CDS序列的密码子偏好性分析

密码子简并性特征造成了不同物种密码子使用偏好性不同．在对牦牛功能基因组学研究的基础上，利用EMBOSS中的CUSP程序、SMS2中的Codon Usage程序和软件CodonW对牦牛功能基因的41条CDS序列进行了密码子偏好性的分析，并与人、普通牛、猪等物种进行了比较基因组学研究．结果显示：TTC、TTG、CTC、CTG、ATT、GGA、GGG等27个密码子为牦牛的偏好性密码子．研究结果为以后进一步开展牦牛新基因的发现、功能基因表达调控研究，蛋白质结构和功能的预测以、与其他牛种的比较基因组学研究以及牦牛分子标记育种等工作，提供了理论基础．     

基于宏基因组数据的微生物群落比较方法

宏基因组学是一门研究直接来自环境的基因材料的新兴学科。传统的微生物学研究,依赖于实验室培养,而宏基因组学,使得对这些未被培养或不可培养的微生物的研究成为可能,也为同一环境中微生物之间相互作用的研究,以及微生物群落的整体研究,指明了新的方向。随着测序技术的迅速发展,大量宏基因组测序数据不断产生,对新的统计分析方法提出了更高的要求。简要介绍了宏基因组学以及其中的几个重要问题,主要针对其中基于测序数据的群落比较问题进行论述,介绍了多种现今常用的统计计算方法,并分析了它们的适用情况。     

癌症与结构基因组学研究

综述了结构基因组学的研究进展,在基因组学水平上对癌症的研究现状及其在癌症研 究中的应用.     

植物差异表达基因克隆技术及研究进展

随着分子生物学技术的深入发展,植物基因组研究已经由以全基因组测序为目标的结构基因组学转向以基因功能鉴定为目标的功能基因组学研究,目前分离并克隆差异表达基因已成为生命科学研究的热点.近些年来,国内外学者发展了多种分析差异表达基因的技术来研究植物在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况,掌握了生命活动过程中的重要信息.文章对建立在RNA水平上克隆植物未知差异表达基因的几种关键技术及其研究进展进行了综述,阐述了各技术的原理、技术路线、优缺点及相应的改进方法,并对它们在植物抗逆研究中的应用现状及前景作了展望.     

hASB-8相互作用蛋白的初步研究

hASB-8基因是对肿瘤细胞生长具有明显抑制作用的人类新基因．其编码蛋白属于人ASB蛋白家族中的一个成员,与小鼠中的ASB-8蛋白同源性达96％．保守结构域分析显示hASB-8在N端包含4个Ankyrin repeats,在C端包含了一个SOCS box．利用酵母双杂交技术,筛选了人的胎盘(Placenta)cDNA文库,获得了与KASB-8相互作用的2个蛋白,Elongin C和CDK4 binding protein;并在二倍体酵母体内进行了验证．这些试验提示hASB-8蛋白可能介导肿瘤细胞中靶蛋白和泛素复合体之间的相互作用,并与肿瘤细胞靶蛋白转录调节有关．     

Numerous potentially functional but non-genic conserved sequences on human chromosome 21

The use of comparative genomics to infer genome function relies on the understanding of how different components of the genome change over evolutionary time. The aim of such comparative analysis is to identify conserved, functionally transcribed sequences such as protein-coding genes and non-coding RNA genes, and other functional sequences such as regulatory regions, as well as other genomic features. Here, we have compared the entire human chromosome 21 with syntenic regions of the mouse genome, and have identified a large number of conserved blocks of unknown function. Although previous studies have made similar observations, it is unknown whether these conserved sequences are genes or not. Here we present an extensive experimental and computational analysis of human chromosome 21 in an effort to assign function to sequences conserved between human chromosome 21 (ref. 8) and the syntenic mouse regions. Our data support the presence of a large number of potentially functional non-genic sequences, probably regulatory and structural. The integration of the properties of the conserved components of human chromosome 21 to the rapidly accumulating functional data for this chromosome will improve considerably our understanding of the role of sequence conservation in mammalian genomes.     

酿酒酵母功能基因组学研究进展

随着各种微生物基因组序列信息的积累和测序工作的不断完成,酿酒酵母基因组学研究的重点已由传统的结构基因组学发展到了功能基因组学,并从单一的基因功能研究转向多个或整个基因组系统地去了解真核生物生命活动的本能。对基因组学水平上酿酒酵母功能基因的生物芯片分析,代谢通路和功能图谱,以及比较基因组学研究进行综述。     

Gene duplication plays a major role in gene co-option: Studies into the evolution of the motilin/ghrelin family and their receptors

Extant genes can be modified, or ‘tinkered with’, to provide new roles or new characteristics of these genes. At the genetic level, this often involves gene duplication and specialization of the resulting genes into particular functions. We investigate how ligand-receptor partnerships evolve after gene duplication. While significant work has been conducted in this area, the examination of additional models should help us better understand the proposed models and potentially reveal novel evolutionary pattern...     

RNAi技术及其在基因组学研究中的应用

RNA干扰（RNA interference，RNAi）是一种真核生物体内的基因调控机制．在介绍RNAi的作用机制及作用特点的基础上，综述了其在基因功能研究、基因组免疫系统、人类疾病的基因治疗及水产养殖病害的防治等基因组学研究领域的最新进展与应用．     

酿酒酵母基因组的研究进展

酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是第一个完成全基因组测序工作的真核生物,目前在结构基因组学、功能基因组学、模式生物、最小基因组、比较基因组学等方面的研究已经获得了重大的进展,为人类更深入地研究高等生物基因组打下了坚实的基础。本文将从这几个方面着手对酿酒酵母基因组的研究进展进行综述。