六倍体小黑麦耐盐相关基因cDNA-AFLP技术体系的建立

为建立和优化六倍体小黑麦耐盐相关基因克隆cDNA-AFLP技术反应体系,并探索其应用效果,以对盐胁迫反应不同的4个六倍体小黑麦品种(系)为材料,对其在0.15mol/L氯化钠胁迫72h的cDNA-AFLP技术中DNA聚合酶浓度、模版浓度和引物筛选等过程进行了摸索和优化。结果显示,建立了以1.0UTaqDNA聚合酶为扩增酶、预扩产物稀释20倍、EcoRI和MseI为内切酶及其相应接头为引物的六倍体小黑麦耐盐相关基因cDNA-AFLP技术体系,并从64对引物组合中筛选出稳定、高效的引物组合以及236个差异片段。结果表明,该cDNA-AFLP技术体系更易分离出差异性片段,为六倍体小黑麦在盐胁迫及其它逆境环境下的基因克隆提供一种有效手段。     

棉花耐旱相关基因的cDNA-AFLP差异显示

为鉴定棉花干旱胁迫响应基因,应用cDNA-AFLP技术,以棉花耐旱品种晋棉13号幼苗为研究对象,对干旱胁迫早期叶片基因表达进行了mRNA指纹分析。通过64对引物组合的筛选,共分离得到232个差异表达的转录衍生片段(TDFs),对其中102个TDFs进行了克隆、测序和序列分析。结果表明:45个TDFs与NCBI中已有序列同源,功能涉及信号传导、转录调控以及逆境诱导蛋白等,另有57个TDFs无同源序列或同源性低,预测其为是一些未知功能基因。     

海带叶状体不同部位的过氧化物酶酶型与基因表达的研究

采用垂直板式聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对海带３个材料叶状体８个不同部位的过氧化物酶酶型与基因表达进行了分析．结果表明：海带叶状体的过氧化物酶受３个基因位点控制，由于某些基因不表达，因而各部位酶带表现出不同程度的差异，说明海带叶状体不同部位同工酶基因表达有其特异性．     

Y染色体和雄性生殖细胞生物学在健康与疾病中的作用

由人类基因组计划（Human Genome Project）所带来的人类基因组和相关研究技术方面的进步已经深刻地改变了我们对雄性干细胞发育和分化机制的理解，并提高了我们对此类机制进行研究的能力。本书对后基因组时代雄性生殖腺及干细胞研究所取得的成果进行了总结，着重介绍了精子发生生物学的发展，试图建立一个干细胞发生模型，并对与基因在干细胞发生中的作用有关的一系列问题进行了阐述，主要内容包括Y染色体基因在雄性生殖中的作用、精原干细胞和雄性干细胞的基因表达及生殖过程和干细胞肿瘤中干细胞基因表达的调节等。     

癌症基因表达数据的熵度量分类方法

基因芯片技术的出现和发展为生物医学领域带来了深远影响,运用分类方法研究其产生的海量数据对癌症的分类及治疗有重要意义.该文提出一种利用熵度量作为指标进行癌症基因表达数据特征提取的方法.首先对基因表达数据进行筛选并计算各个基因的熵,然后提取出熵最大的若干基因作为特征基因,并用支持向量机进行分类.对前列腺癌基因表达数据的留一法以及分组法实验都证明了该方法的有效性.     

黑木相思双低频酶cDNA-AFLP反应体系的建立

以黑木相思组培苗为实验材料,对影响cDNA-AFLP反应体系的关键因素进行了研究,建立了适用于黑木相思的cDNA-AFLP分析体系.结果表明:适用于黑木相思dscDNA的限制性酶切组合为EcoR Ⅰ和PstⅠ,dscDNA酶切用量为500 ng.用作预扩增模板的连接产物稀释倍数为1倍,用作选择性扩增模板的预扩增产物稀释倍数为50倍.     

基因表达数据处理工具包GEDPT的设计与实现——基于数据库GEO和TCGA

针对基因表达谱数据，建立机器学习模型，进行数据挖掘，有助于疾病诊断和发展精准医疗.由于基因表达谱的分析结果受到数据处理平台、数据格式、数据批次等因素的影响，因此，研究人员希望有统一的数据处理平台和数据处理方法，以降低这些影响，提升分析结果的准确性.基于R语言设计并实现了基因表达数据处理工具包GEDPT，旨在对数据库GEO和TCGA的基因表达谱进行统一处理，包括预处理、基因注释、表型注释、样本分组、差异分析和分析结果可视化等.利用GEDPT分析了人类直肠癌放疗相关的基因表达谱，得到了与相关文献报道一致的结果；通过对比基因分布发现，GEDPT对多个微阵列原始数据采用相同的预处理可以降低批次效应带来的负面影响.测试结果验证了GEDPT的实用性和有效性.     

基因差异表达技术及其在植物抗逆基因工程中的研究进展

介绍了常用的几种基因差异表达技术的原理、操作方法并对这些方法筛选目的基因的优缺点进行了评价.介绍了近年来利用差异表达技术筛选植物抗逆基因研究状况并对今后差异基因表达技术的发展及其在植物抗逆基因工程中研究提出了展望.     

RNA干扰的研究现状与应用前景

RNA干扰(RNAi)是dsRNA介导的特异性基因表达沉默的现象,是生物在进化上高度保守的基因表达调节机制之一。从RNA干扰的概念入手,系统阐述了RNA干扰的作用机制、作用特点及其最新进展,并对RNA干扰技术的应用前景进行了展望。     

植物基因的化学诱导表达系统研究进展

激活基因表达或使基因表达失活的化学诱导系统在确定基因功能及植物生物技术中有许多潜在的应用。基因表达的精确调控是化学诱导系统的重要方面。综述了植物基因的化学诱导表达系统的种类以及最新应用,并对其发展趋势进行了展望。     

植物基因差异表达的研究方法及进展

对目前在植物基因差异表达研究领域主要采用的消减杂交,DDRT-PCR,cDNA-RDA,cDNA-AFLP,SSH,基因芯片和SAGE等研究方法的原理、特点、研究进展以及发展趋势进行了综述.这些方法各有特点,可根据研究工作的需要选择合适的研究方法.     

Relationship between differ- ential gene expression pat- terns in functional leaves of maize (Zea mays L.) at milk filling stage and heterosis using cDNA-AFLP

The genetic mechanism of heterosis has been one of the most challenging subjects in life science since the 20th century. However, because of the complexity of its genetic basis and the limitations of research methods and means, there was no substantial progress in the research of heterosis from the beginning of the 20th century to the 1990s. The development in molecular biology and bio- technology, especially that in quantitative trait loci (QTL) mapping methods, has made it possible to resea…     

Relationship between differential gene expression patterns in functional leaves of maize (<Emphasis Type="Italic">Zea mays</Emphasis> L.) at milk filling stage and heterosis using cDNA-AFLP

To understand the molecular mechanism of maize heterosis ,differential gene expression patterns in the functional leaves of 35 maize hybrids relative to their parents involving 10 elite inbreds at milk filling stage were analyzed hy using cDNA-AFLP,the correlation analyses of various differential expression patterns with the performance and heterosis of main maize agronomic traits were evaluated.The main results were as follows:For uniparental specific expression ,significant positive correlations were detected with the performance of seed weight per ear and 100-seed weight at 0.01 and 0.05 probability levels respectively.For biparental specific expression ,significant negative correlations were detected with the performance of ear diameter and seed weight per ear at 0.01 probability level .For uniparental specific expression ,significant positive correlations were detected with the heterosis of ear diameter and seed weight per ear at 0.01 and 0.05 probability levls rspectively,For biparental specific expression .significant negtive correlation was detected with theheterosis of ear diameter at 0.05 probability level ,However,for F1-spectific expression,for fragments detected only in one parent and F1,and for fragments detected only in two parents or only in F1,no significant correlation was detected with the performance or heterosis of all agronomic traits surveyed.     

几种常用的基因敲除技术

随着功能基因组学研究的深入发展，基因敲除技术逐渐成为基因功能研究的重要手段，本文就常用的三种基因敲除技术，即同源重组、插入突变、RNA干扰各自的原理、适用的范围和优缺点作简要介绍。     

1个Avr/Cf介导的差异表达基因在番茄抗叶霉病中作用的基因沉默分析

Avr/Cf介导产生过敏性反应时特异表达的cDNA-AFLP片段,称为ACE(Avr/Cf-elicited)片段,从中挑选1个未知功能的基因(记为ACE5)(GeneBank登录号为CK348288),利用VIGS技术对该片段相应基因进行基因沉默分析,分析该基因在植株生长和发育以及番茄抗叶霉病中的作用。结果表明该差异表达片段相应基因对本氏烟的生长发育以及Avr/Cf介导的HR反应均无影响。