AFLP在水稻线粒体DNA研究中的应用

对ＡＦＬＰ应用于水稻粒体基因组研究中的问题进行了研究。结果表明：ＡＦＬＰ对ｍｔ６ＤＮＡ质量要求高，ｍｔＤＮＡ应完整并反复抽提以达高纯度。ｍｔＤＮＡ不完全酶切所造成的假阳性可经第二次酶切排除。选择引物一个选择碱基最适合水稻ｍｔＤＮＡ ＡＦＬＰ分析。     

当前线粒体DNA研究及在法医学中的应用

线粒体DNA是人类第二套基因组DNA,它具有母系遗传、拷贝数多、异质性、进化速度快、突变率高等特点。正由于其上述特点,目前国内外对线粒体DNA的研究也越来越多,疾病相关性、线粒体核质基因相互作用、群体遗传学、法医学等方面的研究也都在积极地开展,线粒体DNA分析技术也不断地得到改进,虽然其检测在法医学领域仍然存在许多问题,但法医个人认定和母系遗传亲属的确定的前景还是乐观的。     

红莲型水稻不育系与保持系线粒体DNA酶切分析

为研究红莲型水稻细胞质雄性不育的分子基础，我们提取纯化了红莲型水稻丛广４１Ａ和丛广４１Ｂ的线粒体ＤＮＡ，采用限制性内切酶酶切片段长度多态性（ＲＦＬＰ）方法比较了红莲型不育系和保持系线粒体ＤＮＡ酶切图谱，发现两者之间存在一定的差异，部分支持了细胞质雄性不育与线粒体ＤＮＡ有关的结论。     

衰老与线粒体DNA缺失

简略综述人体衰老过程中出现的线粒体DNA缺失，包括mtDNA与衰老的关系；衰老过程中的mtDNA容易变异的原因；衰老过程中发生的dmtDNA种类和数量改变等内容．     

正常和细胞质雄性不育水稻线粒体DNA限制性内切酶的酶切图谱分析

从N,cms-WA,cms-BT和cms-RL四种不同细胞质源的水稻中制备线粒体DNA。用限制性内切酶Pst Ⅰ,Hind Ⅲ和Xho Ⅰ等酶切线粒体DNA经琼脂糖凝胶电泳,发现水稻N,cms-WA,cms-BT和cms-RL细胞质确有不同的线粒体DNA,不同的保持系之间也存着一定的差异。水稻线粒体DNA最小分子的大小在195～245kb之间。     

氯化三丁基锡对鲤鱼肝胰脏线粒体DNA的影响

研究了氯化三丁基锡(TBT-Cl)对鲤鱼肝胰脏线粒体DNA(mtDNA)在体内和体外的毒性作用.结果表明,在体外反应中,200mg/LTBT-Cl可以引起双链闭环的mtDNA部分单链打开的损伤,浓度为600mg/L时,导致大部分mtDNA被切断成线状的严重损伤.体内实验0.05μg/L浓度即可引起mtDNA的严重损伤.     

水稻马协细胞质雄性不育及其保持系线粒体体外热分析

以新选育出的水稻细胞质雄性不育系马协Ａ及其相应保持系协青早为材料,分别从它们黄化苗中提取线粒体。一方面于体外测定线粒体能量代谢谱,进行热化学分析,得到一系列热力学参数和动力学参数,建立起反映线粒体体外能量代谢模式的热动力学方程,通过对不育系和保持系的比较发现,不育系线粒体在能量释放大小,代谢时间,能量代谢阶段的复杂性上明显低于保持系,从而得出不育系线粒本能量代谢水平低,造成供能匮乏从而导致不育;同     

上海四膜虫(Tetrahymena shanghaiensis)线粒体DNA的酶切分析

该文以六种限制性内切酶对上海四膜虫ｍｔＤＮＡ进行单酶完全酶切,ＥｃｏＲⅠ、ＨｉｎｄⅢ、ＨｈａⅠ酶切均产生４个片段,ＰｓｔⅠ、ＨｐａⅡ、ＨａｅⅢ酶切分别产生５、６、７个片段。不同的酶切征段大小及总和有一定的差异,酶切结果比较,有较大的差异。同其它方法如四膜虫大核ｒＤＮＡ限制性内切酶分析、同工酶分析及皮层细胞骨架组分分析结果一致,进上步证明上海四膜虫是梨形四膜虫复合种的一种。     

提取水稻线粒体DNA的一种简易方法

介绍了一种利用常用的普通试剂提取水稻线粒体DNA的简便方法 .与其它方法相比较 ,它具有省时、省钱、高效、快捷、简单等特点 .用该方法提取的水稻线粒体DNA ,经紫外分光光度计测定其纯度、限制性内切酶进行酶切和随机引物进行RAPD反应的结果表明 ,完全可以满足作为RFLP和RAPD等分析质量的要求 .     

具有自主复制功能的水稻高度重复序列ARS2的结构和功能分析

对一个水稻珍汕９７Ａ不育系核ＤＮＡ来源的具有自主复制功能的高度重复顺序片段ＡＲＳ２（全长４７２０ｂｐ）进行了亚克隆构建和测序,获得了它的全顺序。     

中国墨兰品种遗传多样性的AFLP分析

 利用AFLP分析技术,从64对PstI/MseI引物中筛选出9对多态性引物组合,对来源于中国广东、福建、台湾的42个墨兰品种进行了遗传多样性和亲缘关系分析,共扩增出1 384条带,其中多态性带1 333条, 多态性率96.3%。平均每对引物扩增带数154条、多态性带数148条。所有的品种均可区分,其中39个品种具特征带或缺失带。墨兰品种间的遗传多样性丰富,品种间的Dice相似系数0.422 2～0.824 5,平均相似系数0.611 2。“达摩”系列芽变叶艺品种间的遗传多样性显著降低,多态性率76.6%,平均相似系数0.725 6。NTSYS2.10聚类分析表明同一产地来源的品种基本上可聚在一起,反映出了品种间的亲缘关系。     

鳗鲡病原性气单胞菌AFLP分型研究

以32株从养殖鳗鲡分离的病原性气单胞菌为试验材料,采用Biolog自动菌鉴系统对其进行生理生化鉴定,结果表明,有20株被鉴定为嗜水气单胞菌,7株被鉴定为威隆气单胞菌,1株为豚鼠气单胞菌,其余4株未能鉴定到种.为进一步确定20株嗜水气单胞菌和7株威隆气单胞菌的基因型,筛选了2对引物(E-C/M-C,E-C/M-A)分别对这两个菌种进行了AFLP分析.结果表明:20株嗜水气单胞菌中共检测到88个位点,均为多态性位点;7株威隆气单胞菌中共检测到61个位点,其中60个为多态性位点.经UPGMA聚类分析表明:20株嗜水气单胞菌可初步分为3种类型,每种类型之间平均遗传距离为0.449,同一类型内不同菌株的平均遗传距离为0.127;7株威隆气单胞菌可初步分为4种类型,每种类型之间平均遗传距离为0.467,变异范围为0.415～0.525.该结果为鱼类病原菌的DNA分型研究提供了参考.     

籼稻与粳稻品种间叶绿体DNA的RFLP差异

用ＥｃｏＲＩ与ＡｖａＩ对栽培稻的７个籼稻品种和４个粳稻品种进行叶绿体ＤＮＡ（ｃｐＤＮＡ）的ＲＦＬＰ分析，结果显示籼稻品种的ｃｐＤＮＡ具有较高的多态性，粳稻品种的则较为均一．另外，栽培稻的ｃｐＤＮＡ并无严格的亚种特异性．     

扁桃基因组DNA的制备和AFLP技术体系的建立

AFLP技术对DNA模板的质量要求较高。桃属果树扁桃的叶片含有较高的糖分、多酚类等物质,基因组DNA的纯化比较繁琐。笔者采用3×CTAB缓冲液提取基因组DNA,并加以纯化,使DNA质量达到AFLP技术的要求。在AFLP分析中,筛选出合适的引物组合:采用E+3/M+3选择性引物组合时,扩增条带少;改用E+2/M+3引物组合后,扩增产物主要分布在600～100bp内,且扩增条带数目适中,多态性适宜,电泳图谱清晰。     

基于4D表示的DNA序列分析方法

基于DNA序列4种核苷酸的物理化学性质,考虑相邻两个碱基组合形式,提出一种新的DNA序列4D表示.基于这种表示,可以把DNA序列简化成4D空间的一系列点,根据点坐标抽取序列数值特征,再根据数值特征给出方法对DNA序列进行相似性分析.以10个不同物种的a-球蛋白基因的第一个外显子碱基序列的为例子,说明基于4D表示的DNA序列分析方法是有效的.     

65个菊花栽培品种遗传多样性的AFLP分析

利用AFLP技术, 对65个菊花品种进行了遗传多样性分析.选用6对多态性高、分辨力强的引物组合分别对供试材料的基因组DNA进行扩增, 共获得244条清晰可辨的谱带, 其中多态性带178条, 多态位点百分率达72.95%,揭示了菊花栽培种质丰富的遗传多样性.对AFLP扩增结果采用UPGMA法进行聚类分析,多数瓣型相同的菊花种质表现出较为密切的亲缘关系,地域来源与聚类结果也有一定程度的相关性,而花色与聚类结果无明显的相关性.