基于API函数序列的勒索病毒家族同源性研究

近年来,勒索病毒数量的增长多为已知家族衍生的变种,鲜有出现新型勒索病毒家族。通过对勒索病毒动态提取的API函数序列进行研究,在原有基于序列比对分析勒索病毒家族同源性的方法上作出了改进。使用Cuckoo Sandbox监测勒索病毒的动态行为特征,提取病毒进程对应的API函数调用类别序列并对序列进行规范化处理,去除所有重复子序列后,对同一家族的勒索病毒样本序列使用Multalin、Clustal Omega、T-coffee 3种不同的多序列比对方法并分别设置不同的共性水平提取共性序列,结合局部比对算法计算同家族和家族间的相似性,以确定最佳共性序列并将其作为家族图谱序列。在验证该方案有效性时,设置了以家族样本代表序列和最佳共性序列分别作为家族图谱序列进行对比实验,实验结果表明,使用家族最佳共性序列作为家族图谱序列和局部比对方法计算相似性可以更好地区分勒索病毒家族。     

小波分析用于蛋白质序列相似性比较

蛋白质序列分析是分子生物学分析的基础工作,同时是新兴的生物信息学研究的重要工具,构成生物信息学的基石.为满足蛋白质的进化分析,序列模体的发现,同源模建等工作的需求,人们设计出各种不同方法分析蛋白质序列,试图提取出序列中包含的生物学信息,尤其是与结构,功能相关的信息.目前有代表性的序列比对工具有FASTA,BLAST和PSI-BLAST.     

蛋白质序列与蛋白质结构关系的研究

蛋白质结构与功能的研究一直是分子生物学研究的热点之一.基于混沌理论对蛋白质序列特性进行研究,先将蛋白质序列转为时间序列,再对其进行相空间重构,通过计算确定时间延迟t、嵌入维数m等参数,最后计算得出蛋白质序列的最大Lyapunov指数,通过对蛋白质结构分类数据库SCOP中七类蛋白质结构的蛋白质序列最大Lyapunov指数计算和比较,发现蛋白质整体序列和蛋白质结构没有明显关联.     

犬细小病毒CPV-SHZ分离株VP2基因的克隆与序列分析

以本实验室分离鉴定犬细小病毒新疆石河子株（CPV-SHZ）的DNA为模板,根据基因库已发表CPV序列设计合成了VP2基因的1对特异引物,进行聚合酶链式反应,扩增出约1.7kb的片段,按常规方法克隆进pMD18-T载体,经EcoR I和Sal I双酶切筛选到阳性质粒。测序得到VP2全基因组序列,并登陆Genbank（EU170352）。进一步对该片段进行序列分析,结果表明：所扩增基因片段长度为1755bp,与CPV参考株毒株V154（Type2a）、LCPV-V204（Type2b）、LCPV-V139（Type 2c（a））、LCPV-V203（Type 2c（a））,其核苷酸的同源性分别为99.32%、98.75%、98.97%、98.69%,确定CPV-SHZ株基因型为2a型,将其同我国和世界其他国家主要分离株进行基因系统发生进化关系分析,结果表明,其与我国北京分离株BJ018/07亲缘关系较近。     

两种细小病毒MVM宿主细胞的比较研究

ＭＶＭ属自主性细小病毒，对相当多种类的体内外生长的肿瘤细胞和转化细胞有抑制作用，本文对ＮＢＫ细胞的软琼脂克隆形成率和以体进行了分析，确认ＮＢＫ细胞为转化细胞，且对ＭＶＭ敏感。在此基础上，比较了两种细小病毒ＭＶＭ宿主细胞ＮＢＫ和Ａ９的细胞存活率、单位体积培养液中的细胞产量和病毒产量，认为Ａ９细胞更适合于作为细小病毒ＭＶＭ的宿主细胞进行病毒的制备和生产。     

犬细小病毒的诊治与预防

报告了犬细小病毒感染的临床症状，治疗技术，提出了预防措施。     

犬细小病毒新抗原变异株VP2基因的克隆与序列分析

目的鉴定犬细小病毒(Canine parvovirus,CPV)新抗原变异株的病毒型,为研究CPV变异及制备CPV特异性诊断和治疗试剂奠定基础。方法从病毒细胞培养物中提取基因组DNA,设计合成针对VP2基因的1对特异引物,PCR扩增出VP2基因片段,克隆后测序,应用DNAstar进行序列分析。结果得到CPV-VP-2基因序列15份,其中CPV-2a 10份,CPV-2b 5份;FPV-VP-2基因1份。结论各序列与已发表的标准序列比较,同源性在98%以上,未形成明显分支。     

青海牦牛与云南牦牛乳球蛋白基因5′调控区核苷酸序列同源性比较

利用一对PCR引物,寡聚核苷酸序列的上游引物为5-′gCg,AAT,TCA,TCC,CAC,gTg,CCT,gC-3;′下游引物为5-′gAg,AAT,TCC,Tgg,ggA,ggg,ACC,TT-3′。经68℃退火及30轮循环的PCR程序后,分别克隆来自我国青海和云南地区牦牛的乳球蛋白基因的5′调控区1 447 bp的DNA片段。将该片段从琼脂糖凝胶中回收,克隆在pMD18-T Vector后进行序列测定。序列分析结果表明,青海牦牛该序列的核苷酸序列与文献报道的奶牛该基因的同源性为97.65%,云南牦牛该序列的核苷酸序列与奶牛该基因的同源性为96.8%,青海牦牛与云南牦牛该基因片段的核苷酸序列同源性为99.4%。     

丙烯腈水相沉淀聚合机理及其动力学证据

本文探讨了NaClO_3～Na_2SO_3-H~+引发AN-MA-SMAS水相沉淀聚合体系的引发机理、聚合场所、自加速现象、优先吸附等聚合机理问题,并通过端基分析、分子量及分布、表观竞聚率、种子聚合等有关研究,提出了相应的动力学证据.     

中东缺水探原

本文从中东所在的地理位置分析其严重缺水的现状和原因。重点论述了中东水源之争不仅发生在以色列与阿拉伯之间，也出现于穆斯林国家中间。并指出了解决问题的途径。     

抽象比较原理与Banach空间微分方程唯一解的整体存在性

利用抽象比较原理和类李亚普诺夫泛函将Banach空间微分方程解的整体存在性转化为某类纯量微分方程解的相应属性的判别。     

求树的路长序列的算法

本文根据非负整数序列表示有序树、根树和树的充要条件,给出一个求树的路长序列的算法,并详细地分析了该算法的复杂性,从而得到求树的路长序列的一个相当有效的算法。     

青岛文昌鱼核糖体蛋白Amphil11基因的克隆和同源性分析

对青岛文昌鱼18小时神经胚cDNA文库进行测序，获得了5个AmphiL11的EST，经接接得到文昌鱼核糖体蛋白AmphiL11的编码完整的cDNA序列并演绎出AmphiL11的氨基酸序列，通过对AmphiL11蛋白的结构分析及其与人、鼠、鱼等脊柱动物和果蝇、线虫等无脊动物及酵母中同种核糖体蛋白的同源性分析，发现AmphiL11与脊柱动物核糖体L11蛋白的同源性很高，与高等无脊椎动物甚至酵母的同源性也较高，提示AmphiL11具有较高的进化水平，更接近于脊椎动物的核糖体蛋白L11。同时也表明，真核生物核糖体蛋白L11具有高度的保守性。     

不连序水文系列C_v计算公式的改进

本文首先推导出不连序系列方差的无偏估计公式，然后提出一个估算ＣＶ的改进公式．许多实例说明改进的公式比现行的克－闵公式精确．     

青岛文昌鱼核糖体蛋白AmphiL 37a基因的克隆和同源性分析

对青岛文昌鱼神经胚cDNA进行测序,获得了3个AmphiL 37a的EST,经拼接得到编码文昌鱼核糖体蛋白的AmphiL37a基因全长cDNA序列并演绎出AmphiL37a的氨基酸序列.通过对AmphiL37a蛋白的结构分析及其与多种脊椎动物和无脊椎动物中同种蛋白的同源性进行比较,发现AmphiL37a具有典型的四个半胱氨酸的锌指结构,与人、鼠、鸡的L37a,尤其与果蝇、隐板石鳖等高等无脊椎动物核糖体L37a具有较高的同源性,说明文昌鱼在进化上更接近于高等无脊椎动物;同时说明核糖体蛋白L37a基因在进化上具有较高保守性.     

钨、锡液态分离成矿作用的新证据

花岗质岩浆体系中，钨、锡的流－熔分配和熔－熔分配实验结果为花岗质岩浆液态分离成矿作用提供了新证据，在实验范围内，钨、锡的流－熔分配系数和都很小，其最大值然而，钨、锡的熔－熔分配系数都大于１，其最大值分析估算表明，花岗质岩浆期后热液成矿作用难以形成大、中型钨锡矿床，而液态分离作用是形成钨锡矿床的主要途径。