对分子进化的中性学说的理解

阐述了对分子进化中的中性学说的理解和认识。并论述了自然选择和中性学说的内在联系。     

分子进化工程的应用研究

介绍了分子进化工程的概念及其在若干领域的应用研究现状,同时阐述了它与经典生物进化理论的关系,并展望了其未来的发展前景。     

杨树系统发育和分子进化研究

采用 PCR直接测序法测定了杨属 5个组主要代表种的 ITS全序列和叶绿体 Trn L-Trn F基因间隔区序列 ,通过序列分析探讨杨属植物各组之间系统发育关系和分子进化规律。杨属 ITS序列长度为 594 bp,其中 ITS-1是 2 2 0 bp,ITS-2为 2 1 0 bp,5.8s是 1 6 4bp,青杨组部分种在 ITS-2区有一段 9bp碱基的缺失。G+C含量大约是 6 9%。ITS-1序列的碱基变化以转换和颠换为主 ,而 ITS-2序列则以转换和插入、缺失形式存在。具有系统发育意义的信息位点主要分布在 ITS-2区间。从序列分析所得系统树可看出 ,杨属为单系起源 ,其 Bootstrap值支持率达到 1 0 0 %。各组在杨属中明显是独立的 ,黑杨组、胡杨组、青杨组和大叶杨组 4组亦为单系起源 ,并得到了 Bootstrap值的有力支持 ( 97% )。白杨组起源较早 ,而胡杨组和黑杨组则起源较晚 ,白杨组与其它各组之间的亲缘关系相对较远。各组在分歧以后沿着各自的方向演化。ITS全序列分析对研究杨属各组间系统发育关系是一种较好的分子标记。杨属 Trn L-Trn F基因间隔区序列长度约 350 bp左右 ,但由于插入和缺失造成长度上的较大变化 ,使其具有系统发育意义的信息位点大大高于以前在其他植物上的报道 ,未能很好地反映出杨属 5组之间的系统发育关系。ITS序列分析表明青杨组遗传变化较     

钙调素分子进化的研究

本文以计算机为工具，对不同生物来源钙调素一级结构全序列保守性和变异性进行了数量分析，并与细胞色素ｃ的保守性进行了比较，表明ＣａＭ保守性强于同类生物的细胞色素ｃ；同时对钙调素分子的进化速率进行了比较，发现钙调素是除组蛋白和Ｕｂｉｑｕｉｔｉｎ以外目前已知最保守的蛋白质     

关于生物分子进化和分子适应策略的研究

从生物的C值矛盾、基因表达调控、基因表达产物的准确性以及DNA的复制方向等分子水平的相关研究来解读生物分子进化和分子适应的策略问题，同时从比较基因组学和分子生态学的角度深入探讨了分子进化和分子适应的研究方向和特点，为进一步研究相关问题提供文献和理论支持．     

分子进化的基本化学规律

N-磷酰-α-氨基酸在水或有机溶剂中可能同时自组装生成肽及核苷酸,而β-氨基酸或γ-氨基酸在同样条件下则不发生任何反应。这种分子结构的特征是由磷化学的特性所决定的。五配位磷化合物对α-氨基酸及核糖具有专一的化学选择性,这种化学选择性推动了自然选择。     

核苷酸序列的有序片段和分子进化

定义了核苷酸序列的有序片段（Ｘ１，Ｘ２…Ｘｋ）ｎ，Ｘｉ表示碱基的嘌呤嘧啶分类或强弱健分类，ｎ为重复次数，通过统计分析６．８Ｍｂｐ资料找出全部ｋ＝２，３的有序片段，发现若干有序片段的含量具有较好的进化相关性。     

分子序列告诉我们什么?——构象功能和进化

本文着重结合我们组的工作,从三方面对分子序列的理论研究进行了评述和展望。一是讨论了分子序列与空间构象的联系,二是讨论了在确定生物大分子空间构象的基础上,建立量子的构象动力学的问题,特别探讨了长时标(～10~(-9)秒)运动的可能机理及几种重要的运动形式,三是评述了从分子序列的统计分析出发,研究遗传语言进化问题的新近进展。     

猛禽和夜鹰类的线粒体DNA序列比较和分子进化关系的研究

测定和比对了隼形目、鸮形目、夜鹰目的12SrRNA基因片段，长度为415bp．使用MEGA2．1软件构建分子系统树并分析其系统进化关系．数据显示，该基因片段的DNA序列变异丰富，转换和颠换数未随着遗传距离的增加而出现饱和现象，反映出较高真实水平的鸟类系统发育关系．重建系统进化树表明：与隼形目隼科相比，隼形目鹰科与鸮形目、夜鹰目的亲缘关系更近，提示了隼形目隼科和鹰科之间可能存在着较大的遗传变异；与夜鹰目相比，鸮形目和隼形目鹰科鸟类的亲缘关系较近，与传统分类观点相同，不支持将鸮形目和夜鹰目合并为鸮形目的观点．     

分子序列进化方程的解的研究

利用龙格─库塔（５，６）法，对分子序列进化方程作了数值解，并求出了信息参数Ｄ＿１、Ｄ＿２、Ｘ的进化，及其与突变率和选择强度的依赖关系。分析了Ｄ＿１、Ｄ＿２、Ｘ的稳定值与选择参数之间的各种可能关系。     

植物病毒、类病毒分子进化研究的现状和展望

对植物病毒、类病毒的分子进化进行了综述，通过分析和比较其全碱基序列，探讨了病毒、类病毒内部的亲缘关系和进化关系。     

猛禽和夜鹰类的线粒体DNA序列比较和分子进化关系的研究

测定和比对了隼形目、鸮形目、夜鹰目的12SrRNA基因片段,长度为415 bp.使用MEGA2.1软件构建分子系统树并分析其系统进化关系.数据显示,该基因片段的DNA序列变异丰富,转换和颠换数未随着遗传距离的增加而出现饱和现象,反映出较高真实水平的鸟类系统发育关系.重建系统进化树表明:与隼形目隼科相比,隼形目鹰科与鸮形目、夜鹰目的亲缘关系更近,提示了隼形目隼科和鹰科之间可能存在着较大的遗传变异;与夜鹰目相比,鸮形目和隼形目鹰科鸟类的亲缘关系较近,与传统分类观点相同,不支持将鸮形目和夜鹰目合并为鸮形目的观点.     

热激蛋白的分子进化研究

热激蛋白是细胞内含量最丰富的蛋白质之一,在各种生物体内广泛分布.近年来对热激蛋白的研究已深入到结构、性质、功能等各面,其研究主要集中在:1)作为分子伴侣协助细胞内肽链的折叠;2)参与MHCⅠ类的分子呈递;3)使抗原通过内吞作用进入靶细胞;4)肿瘤免疫和分子疫苗开发.然而,虽然热激蛋白的研究已成为医学、生物学上的热点,其在分子进化上的研究也日渐增多,但这方面的报道仍然较少,本文主要从热激蛋白分子进化方面作一综述,这对理论研究、生物进化分析上都有着重要的意义.     

蛋白质分子进化过程中氨基酸替代数估计和距离测度的统计方法

氨基酸替代数的估计是测定蛋白质分子间进化距离的基本统计方法，是研究蛋白质分子进化的基础．估计氨基酸替代数和测定两个氨基酸序列间进化距离的统计方法分别是P距离、PC距离和Г距离的计算模型．同时，本文还对各个模型的特点作了比较．     

番茄黄化曲叶病毒自然种群的分子变异和进化研究

研究目的：创新要点：研究方法：重要结论：2006年我国上海首次发现番茄黄化曲叶病毒（TYLCV）,随后TYLCV迅速蔓延至全国13个省份和自治区。本研究分析了2006至2010年期间TYLCV在我国首发地上海市的分子变异规律。本研究持续五年追踪田间TYLCV,分析TYLCV的全长基因组序列、分子变异及种群遗传结构,为防控TYLCV提供理论依据。2006至2010年从上海采集了26个TYLCV的分离物,利用高保真性的滚环扩增技术获得TYLCV分离物的全长基因组。应用MEGA5等生物信息学软件分析TYLCV的分子变异。TYLCV自然种群具有与RNA病毒相似的突变率,以基因间隔区的分子变异最大,平均突变率为4．81×10-3（见图2和表2）。TYLCV的大部分基因都处于负向选择,但包含在c1开放阅读框内的C4,却与c1承受着不同的选择压而处于正向选择（见图3和表6）。     

啮齿目中RNase4基因的分子进化研究

RNase4基因是RNASE A基因超家族中的一个重要成员,是分子进化研究的最佳模型之一.首次在基因组水平对啮齿目中的16个物种进行RNase4基因深入分析.在白臀豚鼠、几内亚猪、鹿白足鼠和非洲跳鼠中检测到不同程度的RNase4基因扩张,并且经历了3次独立的基因复制事件.其中,在白臀豚鼠和几内亚猪中检测到1次基因复制事件;在鹿白足鼠和非洲跳鼠中发生2次基因复制事件,并且经历了生与灭的进化模式.     

Jie遗动物新疆北鲵的分子特征及其进化生物学研究（Ⅰ）

通过对Ｊｉｅ遗两栖动物新疆北鲵核糖体１８Ｓ ＲＮＡ基因全序列的测定与分析,从基因水平揭示北鲵的特征,为进一步探讨了Ｊｉｅ遗动物的发生及其演化的分子机制研制奠定了基础。首次对新疆北鲵核糖体１８Ｓ ＲＮＡ基因进行报道。     

现代生物技术应用于抗衰老研究的新进展

论述了生物体衰老的分子机理，探讨了抗衰老的途径，归纳了将现代生物技术应用于抗衰老研究的新进展。     

法学研究的新范式——进化生物学范式及其展望

进化生物学已对几乎所有社会科学产生影响,并成为经济学、心理学和人类学等学科的主导研究范式之一,但在法学研究中仍未取得与之相称的进展。进化生物学既研究有机体进化也研究文化进化,法律是一种文化现象并有其进化上的根源,因而在法学研究中引入进化生物学范式就成为可能。     

现代化学的炼丹者——记武汉大学化学与分子科学学院无机化学研究所所长彭天右

原始人类即能辨别自然界存在的物质的性质而加以利用．后来偶然发现自然物质能变化成性质不同的新物质,于是加以仿效．这就是古代化学工艺的开始;进而,古老的炼丹术成为化学科学的先驱。随着科技的进步,化学研究早已成熟并成规模化．对人类科技发展与社会进步都有着不可估量的带动作用。近几年我国无机化学在国家自然科学基金及其他基础研究项目的支持下取得了突出进展,成果累累,一批中青年专家从实验室脱颖而出。武汉大学化学与分子科学学院无机化学研究所所长彭天右就是其中一位。