小RNA基因药研发的现状和展望

RNA干扰技术的核心成份包括siRNA,miRNA,shRNA和dsRNA,由于其在沉默疾病特异的靶基因方面的高度特异性和有效性,已成为一个人类研发未来新型基因药的战略平台.然而十多年的小RNA基因药研发显示,此技术的产业化路程充满挑战.本综述总结了小RNA基因药研发的现状、存在的问题和未来愿景.     

细菌中小RNA靶标识别的研究进展

细菌的小RNA（small RNA,sRNA）是一类长度在50~500nt之间的RNA分子,目前已在细菌内发现150多种sRNA.随着越来越多的sRNA被证实,识别sRNA的靶标进而研究sRNA的功能已具有越来越重要的意义.目前,对sRNA靶标的研究主要采用生物信息学预测结合分子生物学实验的方法.本文就细菌中sRNA靶标识别方法的研究进展做一简要综述.     

秀丽线虫细胞核内小干扰RNA调控基因表达的机制研究

生物体内存在大量的不编码蛋白质序列的非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),这些非编码RNA广泛参与生命活动的各个过程,包括基因表达调控、基因组稳定性维持、抵抗外源核酸侵染、发育的时序调节以及肿瘤发生等.越来越多的证据表明一系列重大疾病的发生、发展与这些非编码RNA的产生和调控失衡相关.小调节性RNA正在成为潜在的疾病标志物、药物靶点和生物分子药物.我们的研究主要集中在高等多细胞生物中细胞核里小干扰RNA调控基因表达的分子机制和生物学功能.我们在模式生物秀丽线虫中通过遗传筛选的方法发现了一条小干扰RNA在细胞核内调控基因表达的通路,以及参与这条通路的几个关键的细胞核RNA干扰缺陷型基因(nuclear RNAi defective,Nrde).这一发现不仅解决了高等多细胞生物中细胞核内是否存在小RNA干扰现象的争论,而且发现小RNA可能通过主动转运的方式进入细胞核并调控RNA聚合酶Ⅱ(RNAPⅡ)介导的转录延伸.这一通路还可能参与了生物体的获得性遗传过程.本文重点阐述这一小干扰RNA调控基因表达的分子机制,并提出未来亟待解决的科学问题和发展方向.     

科学家发现了新的小RNA类型

小RNA是近年来的热门研究领域，科学家于2006年发现一个新类型的小RNA，命名为Piwi-干扰RNA，它们大量存在于老鼠和人的睾丸中，这类小RNA能关闭基因的表达。     

反义RNA技术及其在农业领域的应用

介绍了反义RNA的概念及作用机理,对反义RNA技术及其在农业领域的应用进行了概述．反义RNA技术是借助基因重组技术,根据碱基互补原理,用人工合成或生物体合成的特定RNA片段（或其化学修饰物）抑制或封闭基因表达的技术。在农业领域反义RNA技术主要应用于果实性状及品质的调控,对观赏植物性状的调控,植物抗病,控制油料种子中脂肪酸的合成,控制雄性不育,降低或去除食物中有害化学成分等方面其功能获得可靠的成效．     

基于集成学习的神经网络对小RNA的预测

通过计算智能的方法,即粒子群算法优化的前向人工神经网络和集成神经网络来预测小RNA。从小RNA前体序列中提取36维特征用于训练神经网络模型,利用训练好的模型分别对阳性和阴性小RNA数据集进行测试,预测平均精度达到90%以上,并且通过集成神经网络的方法取得了更高的精度。实验结果表明,利用集成神经网络建模进行小RNA的预测是一条行之有效的途径。     

RNA研究的新进展

RNA研究的新成果不断出现和有关RNA操作新技术的应用是进入21世纪以来分子生物学研究的重要突破之一。依据国内外的大量最新资料,主要述评RNA研究中所揭示的新理念、反义RNA技术应用进展、RNA干扰等新突破和新技术的研究进展,包括植物、动物、医学等各个领域的内容。     

用体外转录法制备小干扰RNA抑制Hela细胞CUEDC2基因表达

CUEDC2是一个广泛表达于各种真核生物、功能尚不明确的基因.利用一种改进的体外转录方法获得包含CUEDC2基因靶序列的长链RNA,进而通过RNA酶H切割引导序列形成成熟siRNA.转染Hela细胞并进行免疫印迹检测.结果显示,运用此方法得到的siRNA能够有效地抑制细胞中内源CUEDC2的表达,此项方法为CUEDC2的深入功能分析奠定了基础.     

RNA干扰技术及其在医学研究中的应用

RNA干扰(RNAi)是指生物体内利用双链RNA(dsRNA)诱导同源靶基因的mRNA特异性降解,从而导致转录后基因沉默的现象.RNAi主要通过核酸酶Dicer切割dsRNA生成21-23 nt的小干扰RNA(siRNA),继而由siRNA识别并靶向降解同源靶基因mRNA,从而抑制靶基因的蛋白表达.近年来,RNAi技术在医学研究中的广泛应用均取得了显著的基因沉默效果,RNAi以其高特异性、高效性等显著优势将成为研究基因功能的全新手段.文中综述了该技术在医学研究中的应用.     

RNA干涉及其在肿瘤研究中的应用

RNAi是双链RNA介导的转录后基因沉默的过程，是一种高效的高特异性抑制基因表达的新途径。通过双链小干涉RNA(siRNA)与一系列蛋白质结合形成siRNA诱导的沉默复合体(RISC)并活化，然后，RISC对靶基因进行识别、降解。与反义方法相比，siRNA具有更好的抑制效果。RNAi的应用将为癌症的基因治疗提供新的方法。     

非编码RNA研究进展

多年来,人们已经清楚的认识了一系列结构RNA和调节RNA。最近,由Tuschel,Bartel和Ambro实验室发表的一系列文章里,记述了这些结构RNA和调节RNA外,还包括有许多最近发现的仅由22个核苷酸组成的微小RNA(miRNA)的研究前景。由于这些RNA不编码蛋白质,所以统称为非编码RNA(ncRNA)。最近的研究表明,ncRNA比以前所想像的要丰富和重要的多,它们在转录调节,染色体复制,RNA加工、修饰,mRNA稳定性和翻译,甚至蛋白质降解和转运过程中都起作用。本文就对ncRNA的研究进展和最近发现的miRNA作一简要综述。     

锐顶镰孢菌Fusarium acuminatum小RNA的鉴定与分析

用高通量测序技术分析了Fusarium acuminatum细胞内小RNA的组成、长度分布、碱基偏好性、分类以及潜在的调控靶标,预测了11个新的miRNAs和6 503个潜在的siRNAs.其中,miRNAs的靶基因多定位于膜组织,具有催化或结合活性,主要与代谢相关.研究结果为农业生产中合理有效防治F.acuminatum引起的病害提供了理论基础.     

RNA沉默研究进展

本文概述了RNA沉默的发现、发展,RNA沉默的特征、作用机制、涉及的主要作用因子以及RNA沉默在药物开发、功能基因组研究中的应用前景.     

RNA干扰及其应用

RNA干扰现象是指外源双链RNA进入细胞后引起与其同源的mRNA特异性降解，从而导致该基因表达的沉默。它是真核生物在长期的进化中形成的一种保守的防御机制，它的出现为生物学家提供了一种快速、简便的反向遗传学技术。RNA干扰已成为一种进行基因功能分析的强有力的工具，并有望在对病毒的防御及基因治疗中发挥重要的作用。     

双链RNA对基因表达的抑制及其应用

RNAi(RNA interference)为研究未知功能基因提供了新的反向遗传学手段;并能应用于人类的基因治疗.文中就RNAi的研究进展、作用机制及其应用进行了评述,并与基因敲除及反义RNA抑制进行了比较.     

反义RNA

1981年美国NIH的Tomizawa在细茵中发现了一种新的RNA分子,即反义RNA。反义RNA是指其核苷酸序列可以与其靶RNA(主要是mRNA)互补杂交产生双链RNA,影响靶RNA的正常加工修饰、翻译等过程,从而调控基因的表达的一类RNA分子。后来的研究均证明在原核生物中普遍存在这种RNA。1984年,Izant和Weitraub将这种RNA定义为反义RNA。随后,1986年Williams发现,在真核生物细胞中也存在自然的反义RNA。不同的     

肌肉抑制素基因与RNA干扰的应用前景

本文综述了肌肉抑制素基因的研究进展,以及RNA干扰技术的功能.展望了RNA干扰技术在肌肉抑制素基因中的应用前景.     

微RNA在非小细胞肺癌中的研究进展

微RNA(miRNA)是一类内源性、非编码的单链小分子RNA,作用广泛,参与生命活动中的一系列重要进程,并与肿瘤的发生、发展密切相关。大量研究表明,微RNA参与肺癌的发生、发展和预后,具有与原癌基因或肿瘤抑制基因相似的作用。在肺癌组织中微RNA有特定的表达谱,参与调节肿瘤血管生成等多个过程,并可作为生物标志物用以早期诊断,靶向治疗及临床预后。作为一类新的分子靶标,微RNA为肺癌的诊断和治疗提供了新的方向。     

基于改进适应度函数的RNA结构预测

RNA二级结构预测是生物信息学的重要研究内容。本文提出了一个新的启发式算法进行带假节的RNA结构预测。本文首先通过对RNA序列的若干特征和RNA二级结构进行相关性分析,从中选择跟RNA结构有较大相关性的特征,然后依据遗传算法、综合自由能、被选择茎区的条数以及被选择茎区的平均长度等特征来构造打分函数预测RNA的结构。本文对该方法进行了测试,结果表明本文所采用的从特征分析中得出的打分函数以及通过启发式算法来叠加茎的方法是有效的,在对tRNA以及5SrRNA等序列的预测上相比单纯的自由能最小方法有更高的准确性。并且该方法进一步推广到预测含假结的RNA的二级结构时也有较好的结果。