凉水、丰林国家自然保护区红松遗传多样性的ISSR分析

采用了ISSR分子标记技术对凉水和丰林地区的两个红松种群的74个个体进行了遗传多样性分析．13个随机引物共检测到103个可重复的位点，其中82个具有多态性。多态位点百分比分别为73．79％和71．84％．Shannon信息指数和Nei指数的统计结果都表明，红松的遗传多样性凉水种群大于丰林种群。红松种内的遗传变异主要存在于群体内，种群内存在一定的遗传分化．     

凉水、丰林国家自然保护区红松遗传样性的ISSR分析

采用了ISSR分子标记技术对凉水和丰林地区的两个红松种群的74个个体进行了遗传多样性分析.13个随机引物共检测到103个可重复的位点,其中82个具有多态性,多态位点百分比分别为73.79%和71.84%.Shanron信息指数和Nei指数的统计结果都表明,红松的遗传多样性凉水种群大于丰林种群,红松种内的遗传变异主要存在于群体内,种群内存在一定的遗传分化.     

厦门近海横带髭鲷野生群体遗传结构分析

采用RAPD和ISSR分子标记技术对厦门近海横带髭鲷野生群体46个个体进行遗传多样性分析.在RAPD分析中筛选出31个随机引物,共扩增产生235个可统计的条带,其中多态性条带106个,多态位点百分率为45.11%,Shannon's遗传多样性指数为0.243 0;在ISSR分析中筛选出16个ISSR引物,共扩增产生119个可统计的条带,其中多态性条带76个,多态位点百分率为63.78%,Shannon's遗传多样性指数为0.348 9.与其它鱼类横向对比显示,厦门近海横带髭鲷野生群体的遗传变异处于中上水平,具有较高的遗传多样性.     

1731-1900年期间凉水国家自然保护区红松遗传多样性变化的RAPD分析

应用RAPD技术对凉水国家自然保护区的天然红松(Pinus koraiensis)种群的遗传多样性变化和遗传分化进行了分析．共选择77个年龄在100～270年间的红松个体，连续分4龄级．筛选出11个随机引物共检测到71个位点，其中55个多态位点，多态位点比率为77．46％．利用POPGENE分析软件计算了该年龄段凉水地区红松遗传多样性指数，分析了遗传多样性在龄级间变化．研究结果表明，凉水保护区内的红松遗传多样性在1731-1900年的时间段内没有太大的波动；龄级间遗传多样性分化不明显；红松遗传多样性主要存在于龄级内．对照这一时期环境变化，对红松的遗传多样性演化与环境变化关系进行了讨论。     

地黄居群遗传多样性的ISSR分析

采用ISSR分子标记,对地黄（Rehnwmnia glutinosa）14个自然居群、1个栽培居群和属内近缘种5个居群的遗传多样性与遗传结构进行了研究．结果表明：地黄不同居群的平均多态位点百分率（PPB）为40．53％,平均Shannon多样性指数为0．1915,平均Nei’s基因多样性指数h为0．1253,遗传多样性水平较低．AMOVA分析结果和基因分化系数显示遗传变异主要发生在居群内,居群间的遗传分化显著,其遗传分化水平介于异交物种和自交物种之间．地黄居群间的基因交流程度有限（基因流为0．3784）．Mantel检测显示自然居群间遗传距离与地理距离之间没有明显相关性．推断营养繁殖占优势和受人类栽培活动的长期影响可能是导致地黄遗传多样性水平低、居群间遗传分化显著的主要原因．     

角倍蚜与其唯一夏寄主植物盐肤木种群遗传多样性比较

基于ISSR分子标记技术对贵州省8个种群共106个盐肤木样本进行遗传多样性和遗传分化分析,并与对应的角倍蚜种群ISSR研究结果进行比较.结果显示8个盐肤木种群11条引物随机扩增检测到171个多态位点,多态位点比率为100%,Shannon多样性指数和Nei基因多样性指数分析反映了与多态位点比率相一致的结果.该结果与角倍蚜多样性指数进行比较,发现角倍蚜和盐肤木种群的遗传多样性具有同样的变异趋势,且盐肤木种群的遗传多样性高于角倍蚜种群遗传多样性,相关性检验(P＜0.01)表明二者之间具有明显的相关性;由Nei指数估计角倍蚜和盐肤木种群的遗传分化系数分别为0.23和0.19,二者具有相似的遗传分化水平,这种相似性表明二者具有明显的协同进化关系.UPGMA聚类结果表明,不同地域角倍蚜与盐肤木种群遗传距离与地理距离不相关,从二者聚类关系来看,也没有对应关系,这可能主要与二者属于明显不同的生物类群,以及本身固有的不同的生存方式和繁殖系统有关.     

27个菜心品种遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR技术对27个菜心品种的遗传多样性进行了分析.结果表明,12条引物共检测到103个可重复位点,其中多态位点58个,多态位点百分率(P)为56.31%.平均多样性指数(1)为0.229,遗传相似系数(H)为0.144,观察等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)分别为1.563和1.225,遗传距离(GD)的范围在0.029～0.344之间,表明菜心遗传多样性较低.经UPGMA聚类分析,将27个菜心品种分为六大类群.     

双棘黄姑鱼人工繁育群体遗传多样性的RAPD分析

采用22个随机引物对双棘黄姑鱼人工繁育群体的遗传多样性水平进行随机扩增多态DNA（RAPD）分析，共检测出248个位点，其中有104个多态位点，平均多态位点百分率P为41．9％；其个体间的平均遗传距离L为0．0657，平均相似系数S为0．9343，Shannon遗传多样性指数H0为0．2829．通过与其他一些鱼类的RAPD研究结果进行对比，对双棘黄姑鱼人工繁育群体的遗传多样性水平进行了分析评估,文中同时就人工繁育及鱼类种质资源的可持续利用问题进行了初步讨论．     

不同种群狭叶小羽藓(Haplocladium angustifolium)重金属含量及遗传多样性

以上海市狭叶小羽藓居群为实验材料,测定不同居群植物体中的重金属元素含量,利用随机扩增多态DNA标记技术（random amplified polymorphic DNA,RAPD）对不同浓度重金属污染下的小羽藓居群的遗传多样性和遗传分化进行了初步分析．结果表明：104个检测位点中发现94个多态性位点,多态位点百分率为91．35％,总的居群的Nei基因多样性指数（H）为0．2682,Shannon指数（I）为0．4108,小羽藓种群表现出较高的遗传多样性．总的遗传居群间遗传分化系数（Gst）为0．5591,居群内遗传分化系数（协）为0．1182,居群间的变异程度远远大于居群内的变异程度．将各个样点居群的Shannon信息指数同重金属含量做相关性分析得出,Shannon信息指数的增加同Cr含量呈明显正相关,表明Cr胁迫对小羽藓种群的遗传分化有较大程度的影响．     

甘肃南部双盾木属植物的ISSR分析

采用ISSR技术分析了甘肃南部分布的4种双盾木的遗传多样性和遗传分化．根据研究结果,指出4种双盾木属总的多态位点百分率（PPB）很高,达100％。其遗传多样性很丰富,但在种间的分布是不均匀的,结果与Nei’s基因多样度和Shahnon信息指数的遗传多样性分析结果一致,根据非加全算术平均聚类法以及ISSR特征图谱可以将不同种区分开来,得出ISSR分子标记可很好地用于双盾木属的分子鉴定和遗传背景研究的结论。     

山东长岛南4岛狗尾草（Setaira viridis（L.）Beauv）种群遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术研究了山东省长岛县南部4岛90份狗尾草材料的遗传多样性及遗传结构.13个ISSR引物共扩增出148个位点,多态性位点比率为70.30%,Shannon信息指数在物种水平上为0.344 9.根据Gst值,遗传变异有16.53%发生在种群间.遗传距离分析表明,NCS种群与DHS种群遗传一致度最高,遗传距离与地理距离之间没有相关性.     

利用ISSR技术研究虾夷扇贝不同地理种群的遗传多样性及其分化

利用10个ISSR引物对虾夷扇贝天然群体、人工养殖群体、象牙白群体、俄罗斯群体和日本群体进行遗传多样性分析,共获得134个多态位点,其比例分别为78.36%、73.88%、76.87%、89.55%、89.55%;Shannon指数为0.5159,遗传多样性指数为0.3378.结果显示5个群体特异性位点16个,占被检测位点总数的11.94%,这些特异位点可为种群的判别提供依据.群体聚类结果显示:天然群体、人工养殖群体、象牙白群体首先聚为一类,尔后与日本群体聚在一起,俄罗斯群体单独聚为一类.本研究还进行了个体聚类分析,个体聚类分析对虾夷扇贝育苗过程中的选种具有一定的指导意义.     

Development of simple sequence repeats (SSR) markers of ramie and comparison of SSR and inter-SSR marker systems

Ramie (Boehmeria nivea L. ) is an important bast fiber crop. To study genetic background of this species, we isolated and characterized microsatellite markers of ramie. A genomic library containing inserts of rapid amplification of polymorphic DNA (RAPD)fragments was constructed, and screened by PCR amplification using anchored simple sequence repeats as primers. A total of 26 clones were identified as positives, and 13 microsatellite loci were found after sequencing. The polymorphism of these 13 microsatellite loci was examined and the utility of simple sequence repeats (SSR) and inter-SSR (ISSR) marker systems for genetic characterization compared using 19 selected ramie cultivars. Both approaches successfully discriminated the 19 cultivars which differed in the amount of polymorphism detected. The level of polymorphism detected by SSR was 95.0 %, higher than that by ISSR (72.3 % ), but the average polymorphism information content (PIC) of ISSR (0. 651) was higher than that of SSR (0. 441). The higher PIC value of ISSR suggests that ISSR is more efficient for fingerprinting ramie cultivars than SSR markers. However, because the SSR loci are codominant, they are more suitable for determining the homozygosity levels of ramie, constructing linkage map, quantitative trait loci study of complex traits and marker-as-sisted selection.     

野生和人工选育黄河鲤遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术,对采集于长垣天然文岩渠(野生群体)、河南省水产科学研究院(黄河品系Ⅰ群体)、小浪底水库(野生群体)、河南黄河鲤鱼良种场(豫选黄河鲤群体)的4个群体黄河鲤的120个个体的遗传多样性进行了分析.8个ISSR引物共获得64个扩增位点,其中多态位点31个,多态位点比例为48.44%.4个群体的多态位点比例分别为14.06%,32.81%,34.38%和20.31%,遗传距离分别为0.0576、0.1657、0.1674和0.0800,Nei基因多样性分别为0.0538、0.1099、0.1308和0.0723,Shannon信息指数分别为0.0784、0.1669、0.1923和0.1072.文岩渠群体与黄河品系Ⅰ群体遗传距离最远(0.1717),与小浪底水库群体遗传距离最近(0.0558).表明这些群体间发生了较弱的遗传分化.UPGMA聚类结果为文岩渠群体与小浪底群体先聚在一起,其次是与豫选黄河鲤,最后与黄河鲤品系Ⅰ相聚.用AMOVA进行遗传变异方差分析得到遗传变异固定指数(Φst=0.0179,P0.05),显示黄河鲤大部分变异(98.21%)发生在群体内,群体间变异较小(1.79%).说明人工选育群体的遗传结构尚未发生明显变化.     

深圳梅林仙湖苏铁野生种群遗传多样性ISSR分析

仙湖苏铁Cycas fairylakeaD.Y.W ang是国家濒危保护植物,目前仅在我国广东省深圳市和曲江县发现有自然分布,个体总数已不足2 000株。本文应用ISSR标记对深圳梅林郊野公园仙湖苏铁野生种群的遗传多样性进行了研究。从100个引物中筛选出10个用于正式扩增,在14个个体中共检测到77个清晰的扩增位点,其中多态性位点67个,多态位点百分率为87.01%。根据所得数据求出的观察等位基因数为1.870 1,有效等位基因数为1.356 8,Ne i基因多样性指数为0.219 6,Shannon多样性指数为0.344 5。与其他苏铁类植物和濒危植物相比,仙湖苏铁仍然保持很高的遗传多样性水平。基于Jaccard相似性系数的UPGMA树系图表明,梅林郊野公园的仙湖苏铁个体明显地分为2个亚群,ISSR表型特征的主成分分析(PCA)也支持了聚类分析结果。研究结果对仙湖苏铁的保育和管理具有重要意义。     

基于ISSR数据探讨节茎曲柄藓(Campylopus umbellatus(Arn.) Paris)遗传多样性和居群遗传结构

选用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)分子标记,对分布于浙江清凉峰国家级自然保护区顺溪坞和凉源、浙江台州临海天台山、浙江舟山嵊泗列岛、江苏苏州天平山、广西上思十万大山、台湾宜兰县马告生态公园和云南西双版纳纳板河流域国家自然保护区8个自然居群的40份节茎曲柄藓(Campylopus umbellatus(Arn.) Par.)的遗传多样性进行了研究.应用筛选出的12条引物,共扩增出172条清晰、重复性高的条带.使用POPGENE 3.2分析发现:其中158条条带的多态性位点百分率(PPB)为91.86%,根井正利基因多样性指数(H)为0.292 2,香农-维纳多样性指数(I)为0.445 9,说明节茎曲柄藓居群遗传多样性水平较高.8个居群的遗传分化系数(G_(st))为0.634 6,居群间的基因流(N_m)为0.287 9,63.33%的遗传变异存在于居群间,36.67%的遗传变异存在于居群内,说明节茎曲柄藓居群间的遗传分化明显.基于ISSR数据的聚类分析表明:以遗传距离65为分组阈值,8个居群可被分为6组,节茎曲柄藓居群间的遗传分化主要由地理因素造成,居群内的遗传分化可能与生境的异质性有关.     

长筒石蒜种质资源的ISSR研究

借助ISSR分子标记对长筒石蒜变异类型进行了研究,结果表明:ISSR扩增得到的67个位点中,其中62个位点具有遗传多态性,约占总数的92.5%.因此,长筒石蒜遗传多样性是十分丰富的,可以作为育种材料储备种质资源.从UPGMA聚类图来看,依据花色区分的3种类型,被聚在一起,表明亲缘关系较近.在未来的长筒石蒜种质资源利用中,不同花色的长筒石蒜可以作为品系进行开发.     

Genetic diversity and geographic pattern of wild lotus （Nelumbo nucifera） in Heilongjiang Province

1MATERIALS AND METHODS1.1PLANT MATERIALS FROM AUGUST TO SEPTEMBER IN2004,WE TRAVELED EX-TENSIVELY IN HEILONGJIANG PROVINCE LOOKING FOR THE WILD LOTUS.THE WILD LOTUS WAS FOUND AT40LOCALITIES AND49ACCESSIONS OF SAMPLES WERE COLLECTED AT THESE LOCALITIES(FIG…