萝卜叶片总RNA提取方法比较

获得高质量的RNA是进行RNA相关分子生物学实验和研究的前提.尽管目前已建立了多种真核生物总RNA的提取方法,但这些方法是否适用于提取萝卜(Raphanus sativus L.Var.radiculus Pers.)的总RNA还不清楚.本研究分别采用Trizol法、改进的异硫氰酸胍法和改进的SDS--酸酚法提取萝卜叶片总RNA,并通过分析所得RNA的电泳图谱、得率和纯度来判断这三种方法的优劣, 确定了提取满身红萝卜总RNA的最适方法.实验结果表明,Trizol法和改进SDS酸酚法提取的总RNA中蛋白质和DNA污染比较严重,不能用于下一步实验;而改进的异硫氰酸胍法提取的总RNA得率高、纯度高、完整性好、少降解,完全适合用于Northern blotting,小RNA分离、cDNA文库的构建等分子生物学实验.     

几种提取苔藓植物总RNA方法的比较

将3种RNA提取方法加以比较,以期获得提取不同生境毛尖紫萼藓(Grimmia pilifera P.Beauv)总RNA的最适方法.经比较,改进后的SDS法更适合于毛尖紫萼藓总RNA的提取.此方法简单快捷,所得RNA完整性好,纯度高,试验稳定性好,可用于RT-PCR、基因克隆等进一步分子生物学研究.     

适于cDNA-AFLP的黑木相思组培苗总RNA快速提取方法的建立

针对黑木相思富含多酚、多糖等次生代谢物质的特点,以其组培苗为试材,采用改良CTAB裂解法、硼砂-SDS裂解法、改良异硫氰酸胍裂解法、CTAB-异硫氰酸胍裂解法、改良CTAB-异硫氰酸胍裂解法等5种不同的提取方法提取其总RNA.结果发现:改良CTAB-异硫氰酸胍裂解法能有效地控制多酚、多糖、蛋白质以及DNA等对所提取总RNA的污染,所得总RNA质量高、完整性好.紫外分光光度检测,A260/A280比值为1.96～2.00,A260/A230比值1.98～2.20,总RNA得率为118.4～213.6μg.g-1,电泳检测,28SrRNA亮度约为18SrRNA的2倍,所提RNA质量可以满足dscDNA合成和cDNA-AFLP等后续分子操作要求.     

山药总RNA不同提取方法的比较研究

为提取高质量的山药总RNA,以铁棍山药茎段为材料,采用Trizol法、RNAiso for Polysacchariderich Plant Tissue法、改良CTAB法和试剂盒法提取总RNA,利用琼脂糖凝胶电泳分析所提取RNA的完整性,并用超微量分光光度计分析RNA的纯度.结果显示采用Trizol法难以提RNA,RNAiso for Polysacchariderich Plant Tissue法提取效果不理想,存在DNA和蛋白质污染,而用改良CTAB法和试剂盒法提取到的总RNA纯度高、完整性好,其中,改良CTAB法较试剂盒法价格便宜,但提取过程较烦琐.因此,应根据实验需要选择CTAB法或试剂盒法提取铁棍山药总RNA.本结果对其他品种山药或富含多糖多酚类物质植物的RNA的提取也具有一定借鉴意义.     

湘文一号抗虫棉幼叶总RNA提取技术研究

棉花抗虫Bt基因克隆技术第一步就是从抗虫Bt基因特异性表达的幼叶中提取总RNA,基因的表达可以在RNA产生的不同阶段进行调控,纯化完整的总RNA是进行基因表达研究和从cDNA克隆新基因的基础.对比分析了CTAB-licl法、改良异硫氰酸胍一步法、Trizol一步法和试剂盒提取方法4种RNA提取技术,经琼脂糖凝胶电泳谱带结果检验和紫外分光光度计检测,发现前2种方法很难提取到理想的RNA,而后2种提取的RNA完整性较好,但用RNA Out试剂盒提取的RNA更加适用于反转录cDNA.     

香蕉不同组织中总RNA提取方法的研究

针对香蕉组织中多糖、多酚等次生物质含量高的特点，以香蕉根、茎、叶、果实为试材，对其总RNA提取进行研究．比较了SDS法、改良SDS法、改良CTAB法和Trizol试剂盒法提取总RNA的效果，结果分析表明：改良SDS法能从香蕉根、茎、叶中获得质量高、完整性较好的总RNA，而改良CTAB法对果实的提取效果较佳，所得A260／A280均高于1．8，A260／A230大于2，0，28 S rRNA带的亮度约是18 S rRNA的2倍．其产率在根、茎、叶中均在400μg·g^-1以上，果实中可达49．34μg·g-^1.以上2种方法所得的总RNA均能满足RTPCR、Northern blot和cDNA文库建立等分子生物学研究，且具有快速、简便易行、成本较低的特点，适合于富含多糖、多酚的植物材料．     

运动员骨骼肌组织提取总RNA的新方法

为了寻求一种从微量组织中高效又简便的提取骨骼肌总RNA方法,实验对常用RNA提取方法Trizol法进行了改进和简化,提取的总RNA质量进行了电泳和光密度值检测.实验结果显示,运动员微量骨骼肌组织提取的总 RNA 28S、18S和5S三条带清晰可见, RT-PCR 扩增的β-actin 参照基因条带具有特异性,说明该方法从微量组织可有效、简便地提取骨骼肌总 RNA,提取总 RNA 的得率和纯度均符合分子生物学进一步实验要求,为运动相关基因的分子生物学调控机制等研究提供了一定的方法参考.     

黑线仓鼠4.5S RNA cDNA的克隆及序列分析

4.5S RNA是一种特异存在于啮齿类细胞中丰富的核小RNA分子（small nuclear RNA,snRNA）.研究以黑线仓鼠（Cricetulus barabensis）为材料,从新鲜肝脏中提取总RNA,以此反转录4.5S RNA cDNA序列,并克隆测序,所得核苷酸序列为88 bp(Genbank登录号:HM1...     

改进TRIzol一步法提取中华绒螯蟹窦腺总RNA

中华绒鳌蟹窦腺组织个体很小,RNA含量较少,利用TRIzol一步法提取其总RNA效果较差,且解剖过程中RNA易降解.本文对TRIzol试剂盒说明书的提取过程进行了适当改进,有效提高了窦腺总RNA的产率,减少了RNA降解量,延长了RNA的储存时间.该方法对于低丰度RNA提取尤为有效.     

两种球形棕囊藻细胞总RNA提取方法的比较

不同植物细胞RNA提取的适宜方法各不相同.本实验分析、比较了QIAGEN试剂盒法和西曲溴铵(CTAB)法用于赤潮藻细胞总RNA提取的情况.结果显示,两种方法均可获得高质量的总RNA.比较而言,CTAB法比QIAGEN试剂盒更可取,适合藻细胞RNA的大量提取.     

逆转录聚合酶链式反应快速检测水稻条叶枯病毒

逆转录聚合酶链式反应（Ｒｅｖｅｒｓｅ Ｔｒａｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ,ＲＴ－ＰＣＲ）具有灵敏度高,准确性好的特点,因而被广泛应用于植物病毒检测。在ＲＴ反应中,ＲＮＡ样品的快速制备尤为重要用异丙醇二步沉淀法获得ＲＮＡ,快速检测水地片中ＲＳｔＶ伯ＲＴ－ＰＣＲ方法,可使测定时间缩短至６ｈ,并可从０．０７８ｍｇ感病叶片中检测出ＲＳｔＶ。     

水稻基因表达谱分析寡核苷酸芯片制备的研究

 首先有目的地搜集了50个水稻花序相关基因,进行了探针的设计、筛选及合成纯化,用点样仪以微阵列的形式将其点于醛基化的玻璃片上;将3个不同生长阶段的水稻花序材料的总RNA经荧光标记反转录后与寡核苷酸芯片进行杂交.用ScanArray3000对获得的表达谱进行扫描分析显示,芯片图像背景均匀,信号清晰.用ImaGene4.0软件对表达谱分析表明,候选基因在水稻花序3个不同发育阶段的材料中,表达水平有显著差异.为进一步进行水稻寡核苷酸芯片的制备及应用奠定了基础.     

水稻颖果总RNA提取方法的研究

利用TRIZOL试剂快速提取法、异硫氰酸胍法和改良的SDS法提取不同发育时期水稻颖果的总RNA,并通过凝胶电泳、紫外分光光度法检测提取获得的RNA样品的品质.研究结果表明,改良的SDS法提取的RNA具有28SrRNA和18S rRNA 2条清晰的条带,且无降解.其D260/D280为1.84～1.97,具有较高的纯度.其他2种方法获得的RNA品质较差,有降解和弥散现象.将改良的SDS法提取的RNA逆转录成cDNA,作为PCR扩增的模板,可获得清晰的约1.7kb的目的条带.该法提取的RNA用于Northern杂交,可产生特异的杂交信号.这些结果进一步证明了改良的SDS法提取的RNA具有很高的品质与纯度,可以满足下一步分子生物学研究的需要.     

总RNA提取方法的比较与分析

用TRIZOL法、CTAB法和改良的热硼酸盐法从水稻叶片中提取总RNA,结果表明用这三种方法提取总RNA的OD260nm／OD280nm值分别为1．896、1．992和1．657。琼脂糖电泳表明,用改良的热硼酸盐法提取的RNA降解严重,用TRIZOL法提取的总RNA有部分降解,而CTAB法提取的总RNA完整、未降解,可用于后续实验。因此CTAB法更适于从水稻叶片中提取总RNA。     

C1 SnoRNA，水稻中一种新的核仁小分子RNA

通过计算机分析国际分子生物学数据库和ｃＤＮＡ序列分析等方法，在水稻（Ｏｒｙｚａｓａｔｉｖａ）中发现了一种新的核仁小分子ＲＮＡ：Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ．该ＲＮＡ具有ｂｏｘＣ，ｂｏｘＤ和末端碱基配对区等典型的核仁小分子ＲＮＡ结构特征；并有１４个核苷酸与水稻１８ｓｒＲＮＡ中一段保守序列互补．推测Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ可能在１８ｓｒＲＮＡ甲基化过程中起重要作用．编码Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ的基因位于水稻Ｈｓｐ７０基因的第一个内含子中．这是在水稻中发现的第一个由基因内含子编码的ＳｎｏＲＮＡ．     

A simple and effective method for total RNA isolation of appressoria in Magnaporthe oryzae

Appressorium formation is an important event in establishing a successful interaction between the rice blast fungus, Magnaporthe oryzae, and its host plant, rice. An understanding of molecular events occurring in appressorium differentiation will give new strategies to control rice blast. A quick and reliable method to extract total RNA from appressorium is essential for studying gene expression during appressorium formation and its mechanism. We found that duplicate film is an efficient substratum for appressorium formation, even when inoculated with high density conidia. When inoculated with conidia at 1 × 106 ml^-1, the percentages of conidium germination and appressorium formation were （97.98±0.67）% and （97.88±0.45）%, respectively. We applied Trizol before appressorium collection for total RNA isolation, and as much as 113.6 lag total RNA was isolated from the mature appressoria at 24 h after inoculation. Functional analysis of two genes, MNH6 and MgATG1, isolated from the cDNA subtractive library, revealed that the quantity of RNA was good enough to construct a cDNA （complementary DNA） library or a cDNA subtractive library. This method may be also applicable for the appressorium RNA isolation of other pathogenic fungi in which conidia differentiate into appressoria in the early stages of host infection.     

An anther-specific chalcone synthase-like geneD5 related to rice pollen development

It was shown in a previous analysis that D5 gene from rice (Oryza sativa L.) was an anther-specific gene encoding a chalcone synthase-related protein. In this study, D5 gene was found specifically expressed in tapetum cells as well as in the peripheral cells of the vascular bundle of rice anthers by RNA in situ hybridization. In order to study its function, D5 was transformed into rice in both sense and antisense directions driven by a rice Actin 1 promoter. It has been observed that the pollen grains from the antisense D5 transgenic rice plants are abnormal, indicating that D5 plays a critical role in rice pollen development.     

UDP-glucose pyrophosphorylase2 (OsUgp2), a pollen-preferential gene in rice, plays a critical role in starch accumulation during pollen maturation

UDP-glucose pyrophosphorylase (UGPase) is predominantly present and plays significant role in carbohydrate metabolism in plants. Two homologous UGPase genes, OsUgp1 and OsUgp2, exist in rice genome. OsUgp1 has recently been reported to be essential for callose deposition during pollen mother cell and meiosis stages as well as for seed carbohydrate metabolism. In this study, a full-length cDNA of OsUgp2 was isolated from rice anther. Northern blot and RNA in situ hybridization indicated that the expression o...