大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术,对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究.从30个RAPD引物当中,筛选出11个具有多态性的引物,共扩增出多态性带224条,多态性条带比率为41.18%,从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物,共扩增出多态性带121条,多态性条带比率为50.21%.对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法,计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0.28和0.32.根据这两种标记的结果,采用UPGMA进行聚类分析,得到与生物学分类地位基本一致的结果.结果表明,在实验稳定性上,ISSR优于RAPD,且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异,RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究.     

螽Si总科部分属种RAPD带型变异的比较研究

采用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术,对螽Ｓｉ总科１０种昆虫的ＲＡＰＤ带型变异进行了分析。带型显示出属、种间多态性明显,能够明显区分。利用ＮＵ取得遗传距离与遗传一致性矩阵,并用ＵＰＧＭＡ聚类法进行分析,取得了系统树。     

引物对甘薯品种聚类分析结果的影响

应用RAPD技术对10个供试甘薯品种的遗传关系进行了研究，探讨引物数量，多态性率和所用引物带型丰富度对聚类分析结果的影响。结果表明：聚类分析准确度与引物数量，引物的带型数有关，多态性率不是选用引物的主要标志。因此，在利用RAPD技术研究物种间遗传关系时，有必要保证一定数量的引物，且此物具有较多的带型。     

4种金丝桃属植物基因组DNA提取及RAPD分析

目的探究金丝桃属基因组DNA的提取方法及用RAPD分析的技术体系.方法采用改良的低pH值高盐法获得高质量的金丝桃属植物总DNA,从80个10-mer随机引物中筛选出12个,对4种金丝桃属植物的基因组DNA进行RAPD分析.结果共产生了330条DNA片段,其中218条谱带具有遗传多态性,约占66.1%.结论 RAPD分析揭示4种金丝桃属植物之间的DNA指纹存在明显的种间差异,能为金丝桃属植物的分类鉴定提供遗传学依据.     

大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术．对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究．从30个RAPD引物当中．筛选出11个具有多态性的引物．共扩增出多态性带224条．多态性条带比率为41．18％．从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物．共扩增出多态性带121条．多态性条带比率为50．21％．对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法．计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0．28和0．32．根据这两种标记的结果．采用UPGMA进行聚类分析，得到与生物学分类地位基本一致的结果．结果表明，在实验稳定性上．ISSR优于RAPD．且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异．RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究．     

枯萎病尖孢镰刀菌的RAPD-PCR多态性分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD PCR),对采自我省不同地区、不同寄主和同一寄主不同植株的瓜类枯萎病原菌尖孢镰刀菌进行遗传多样性分析,筛选到6个多态性随机引物,共产生了72条RAPD带,其中86.11%具有多态性;通过聚类分析,将供试菌株分为4个RAPD组,确定了菌株间的亲缘关系,为瓜类枯萎病原菌尖孢镰刀菌的分类提供有利的分子证据.     

24份龙眼种质资源RAPD分析

利用RAPD技术对原产福建20份、广东1份、四川3份,共24份龙眼种质资源进行分析.从100条引物中筛选出14条多态性引物,共扩增出122条谱带,多态性谱带共88条,多态性比例72.1%.对RAPD结果进行聚类分析,根据相似系数0.28的水平可将24份龙眼品种(系)分为3类.供试各品种多态性比例介于0.12和0.28之间,揭示福建本地品种的遗传多样性不太丰富.     

厦门近海横带髭鲷野生群体遗传结构分析

采用RAPD和ISSR分子标记技术对厦门近海横带髭鲷野生群体46个个体进行遗传多样性分析.在RAPD分析中筛选出31个随机引物,共扩增产生235个可统计的条带,其中多态性条带106个,多态位点百分率为45.11%,Shannon's遗传多样性指数为0.243 0;在ISSR分析中筛选出16个ISSR引物,共扩增产生119个可统计的条带,其中多态性条带76个,多态位点百分率为63.78%,Shannon's遗传多样性指数为0.348 9.与其它鱼类横向对比显示,厦门近海横带髭鲷野生群体的遗传变异处于中上水平,具有较高的遗传多样性.     

银木和樟树遗传多样性与亲缘关系的RAPD分析

利用RAPD技术分析银木和樟树的遗传多样性与亲缘关系.用筛选出的12条引物从7株银木和7株樟树中共扩增得到91条DNA带,其中多态性条带48条,多态性条带比率为52.7%.根据Nei-Li方法进行的遗传相似性分析表明,银木植株间的遗传相似性系数在0.457～0.781,平均为0.564;樟树植株间的遗传相似性系数在0.646～0.862,平均为0.777;银木与樟树间的遗传相似性系数在0.318～0.531,平均为0.422.根据RAPD结果进行的聚类分析正确地将银木与樟树各聚为一类.这些数据说明银木植株间的遗传多样性大于樟树植株间的遗传多样性,银木与樟树之间的亲缘关系小于两种植物内部个体间的亲缘关系.     

怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析

采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.     

斜带石斑鱼、赤点石斑鱼RAPD和线粒体Cyt b基因序列变异分析

斜带石斑鱼和赤点石斑鱼为具有重要经济价值的海水鱼类。对这两种石斑鱼进行了随机扩增多态DNA(RAPD)和线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列变异分析。计算多态位点百分率、基因多样性和香农信息指数等遗传参数,以此评估种内遗传变异水平;通过统计变异位点、平均核苷酸差异数、核苷酸多样性以及种间平均每位点核苷酸替代数进行基因序列变异分析,并构建UPGMA系统树。结果表明:斜带石斑鱼的遗传多样性水平高于赤点石斑鱼,这可能与它们在种内特定遗传结构、分布范围大小、自然资源状况的差异有关;斜带石斑鱼和赤点石斑鱼之间检测到的种特异RAPD条带以及基因序列的变异,可作为种间分子鉴定标记。     

Analysis of RAPD and mitochondrial 16S rRNA gene sequences from Trichiurus lepturus and Eupleurogrammus muticus in the Yellow Sea

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique is applied to 12 individuals from each species of the hairtail fishes Trichiurus lepturus and Eupleurogrammus muticus in the Yellow Sea. The percentage of polymorphic sites, degree of genetic polymorphism and genetic distance are compared and the phylogenetic tree is constructed by Neighbor-joining method. The partial mitochondrial 16S rRNA gene is amplified by polymerase chain reaction (PCR) and the PCR products are directly sequenced after being purified. These sequences, together with the homologous sequences of another Trichiuridae species Lepidopus caudatus obtained from GenBank, are used to analyze nucleotide difference and to construct a UPGMA phylogenetic tree by means of biological informatics. Analysis shows: (1) the RAPD technique is a highly sensitive method for investigating genetic diversity in T. lepturus, and E. muticus. T. lepturus exhibits a lower polymorphism and genetic diversity than E. muticus; (2) according to the analysis of the partial mitochondrial 16S rRNA gene sequences, a very low intraspecific variation and considerably high divergence among species were found, which reveals a dual nature of conservatism and variability in mitochondrial 16S rRNA gene; (3) five primers generate the species-specific RAPD sites and these sites can be served as the molecular markers for species identification and (4) it can be proved at DNA variation level that T. lepturus and E. muticus are of two species respectively pertaining to different genera, which supports the Nelson taxonomic conclusion.     

5种菊头蝠的随机扩增DNA多态(RAPD)的分析

以5种菊头蝠为材料,用随机扩增DNA多态(RAPD)方法分析它们的亲缘关系。结果显示:5种菊头蝠均表现出各自不同的多态性RAPD标记,6条单个引物分别扩增出2~10条的RAPD条带,其分子量约在700~2 600bp之间。依据这些多态性标记计算其种间遗传相似性,建立亲缘关系树形图。     

浙江有尾两栖动物分类与演化的RAPD研究

选用２０个随机短引物和６个随机长引物对来自３个科５个属７个种的有尾两栖动物进行ＲＡＰＤ分析，１２个引物得到清晰的ＤＮＡ扩增图谱，共计２０７条多态性片段。     

白杨派,青杨派和黑杨派的DNA多态性及系统进化研究

收集了杨属三个派内２０个种的２８个无性系，筛选７个引物进行ＲＡＰＤ分析。共产生５４条有效谱带，其中４３条（７９．６３％）表现多态性。任意两无性系间的遗传距离（Ｄ）为０．９３０￣０．０３１，相应其相似性为０．５１８￣０．９７０。以Ｄ值为基础研究三个派的系统进化关系，聚类结果表明三个派明显独立，且青杨派与黑杨派关系较近，而与白杨派则相对较远，结合其它研究成果推测白杨派较早从杨属中分离出来，而青杨派和黑     

斑翅蝗科六种蝗虫雄性外生殖器的形态研究

利用显微观察并描述了斑翅蝗科六种蝗虫雄性外生殖器的形态特征。结果表明：六种蝗虫雄性外生殖器发生变化最为明显的部位是冠突、前突、后突、桥及色带基支和色带拱，在种问存在明显差异。通过对雄性外生殖器的形态结构比较。在探讨蝗总科分类和系统发育上均具有重要意义。     

Evolutionary relationship and species separation of four morphologically similar stichotrichous ciliates （Protozoa, Ciliophora）

Phylogenetic and taxonomic studies on ciliate protists using molecular approaches have been demonstrated to be very reliable to form strong conclusions and results. In the present work, species separation of some morphologically similar stichotrichous ciliates, two species of Pseudokeronopsis and two species of Apokeronopsis, was reexamined using amplified ribosomal DNA restriction analysis (PCRRFLP). Five of 10 restriction enzymes revealed species-specific polymorphic patterns, of which four similar stichotrichs could be significantly separated and identified. Among them, EcoR I offered almost no significantly different restriction fragment patterns, but the four species could be separated from one another and identified with Hae III. Distinctly different restriction digestion haplotypes and similarity indices separated the species, and were used to construct a phylogeny. Phylogenies based on ITS2 nucleotide sequences and ITS2 secondary structures supported the separation of Pseudokeronopsis and Apokeronopsis using RFLP analysis, although three Pseudokeronopsis carnea populations did not cluster together. In addition, phylogenetic analyses using multiple algorithms confirmed that these two genera formed two distinct groups within the urostylids.     

基于Cyt b基因全序列分析河南7种菊头蝠系统发育关系

采用分子系统发育分析方法对菊头蝠科蝙蝠的系统发育关系和分类地位进行研究,以7种127个蝙蝠为研究对象,测定了mtDNA Cytb基因全序列(1140kb),用最大简约法(maximum parsimony,MP)和最大似然法(maximum likelihood,ML)建系统发育树,对菊头蝠种间亲缘关系及分类地位进行分析,角菊头蝠、菲菊头蝠和大耳菊头蝠属于较原始的种类,且彼此间有较近的亲缘关系;大菊头蝠、皮氏菊头蝠关系较近,为较原始的类群;马铁和中菊头蝠关系较近,为后分化的类群.     

滩羊体大品系遗传标记的研究

采用RAPD(Rondom Amplified Polymorphic DNA)技术,利用混合基因池(DNA pool)法,对滩羊体大品系、普通品系进行了DNA多态性分析,从100种具有10个碱基的随机引物中,筛选出84种引物在滩羊群体基因组中共扩增出358条带,其中22种引物的扩增产物表现为多态(占22％),且扩增出32条有差异的条带,占总带数的8.94％;62种引物的扩增产物表现为单态(占62％)。滩羊体大品系的特异性条带有5条,而普通品系的特异性条带有7条,这些特异标记可以用来鉴定滩羊的两个品系;滩羊体大品系与普通品系间的遗传距离为0.136±0.087,表明两品系之间的亲缘关系很近。     

从RAPD看肿节少穗竹的分类地位问题初探

采用ＲＡＰＤ的实验方法，研究了肿节少穗竹（Ｏｌｉｇｏｓｔａｃｈｙｕｍｏｅｄｏｇｏｎａｔｕｍ）与４个近缘竹种的关系。通过对ＲＡＰＤ数据的转换统计和数量分类运算，得到了有关的相似系数表，再根据相似系数表用ＵＰＧＭＡ聚类法构建了亲缘关系树状图。初步结果显示：肿节少穗竹在ＤＮＡ水平上，与本研究所用的同属及其邻属——酸竹属（Ａｃｉｄｏｓａｓａ）的其它物种存在明显差异。此外，文中还对肿节少穗竹的分类地位、少穗竹属（Ｏｌｉｇｏｓｔａｃｈｙｕｍ）和酸竹属的关系作一定的讨论