利用ABEEM模型在分子形貌轮廓上计算几个五元环配合物的分子静电势

分子的许多物理和化学性质都与其静电势密切相关.分子静电势是指分子在空间某一位置产生的分子静电作用势能,分子之间的相互作用可以通过静电势这个物理量来表述.利用ABEEMσπ模型计算出回归到各原子位点的电荷分布,结合自编Fortran程序可快速计算得到分子的静电势,将其投影到分子形貌轮廓上,即可得到在分子形貌上的静电势分布图.笔者选取咪唑、吡唑、噻吩、噻唑和异噻唑等五元环配合物作为模型分子,分别采用从头计算方法和ABEEM模型方法计算它们的分子静电势,并将其投影到分子形貌上.通过比较,ABEEM模型方法不仅可以快速计算分子的静电势,且与从头计算所得结果一致.     

有机分子疏水性参数库及常见活性碎片参数库的建…

计算机辅助分子设计软件中的一个重要工作是各种结构参数的获取，本文主要介绍有机分子疏水参数库以及常见的结构碎片各理化参数库的设计和建立，针对库中所包含的信息，设计了各种信息参数获取的检索功能，它作为ＮＫ－ＣＡＭＤ软件的一个组成部分，整个软件运行在Ｗｉｎｄｏｗｓ系统下，以ＶｉｓｕａｌＣ＋＋作为开发工具，人机界面非常友好。     

磷酸三酯酶的同源模建及分子对接理论

利用同源模建和分子动力学模拟方法模建了来源于Thermaerobacter marianensis的磷酸三酯酶样内酯酶（PLLs）三维结构. 通过与不同底
物的对接可知, Arg44与两种底物（磷酸三酯和内酯）均形成氢键, 从而Arg44是两种底物与酶结合时重要的氨基酸残基.     

江蓠属藻胆蛋白的研究：Ⅰ诱变,突变体筛选及藻胆蛋白的光…

用Ｎ－甲基－Ｎ＇－硝基－Ｎ－亚硝基胍对龙须菜配子体进行诱变处理，并筛选出色素突变体。又以真江蓠、细基江蓠繁枝变型、龙须菜及其突变体为材料进行了藻胆蛋白的提取、纯化及藻胆蛋白光谱特性的研究。     

一株具抗肿瘤活性的北极细菌的筛选及分子鉴定

在中国首次北极科学考察期间，从北极海域采集了水体，沉积物等样品，从中分离得到一批嗜冷细菌，采用MTT法对这些北极海洋细菌进行了细胞毒活性物质的筛选，得到一株具有细胞毒活性的菌株。采用16SrDNA序列分析及系统发育分析方法对该株菌株进行了分子鉴定。     

嗜热酯酶EstTs1的远源三维结构模建及分子对接

利用Phyre网络服务器,构建嗜热酯酶EstTs1的三维结构,并通过分子动力学优化构型,得到了可靠的构型.分子对接研究表明,p-硝基苯基丁酸酯是EstTs1的最适底物,其大小正适合EstTs1的活性口袋.Thr111是底物与酶结合的重要残基,与底物形成了氢键; Ser85是重要的催化残基.     

细菌JK JS3对松树线虫的杀线活性及菌种的分子鉴定

分离自马尾松的细菌JK JS3是对松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)具有较高杀线活性的拮抗细菌,为了解该菌株对松树体内其他植物线虫的杀线活性并验证经形态学和Biolog方法得到的菌种鉴定结果,笔者测定了该细菌培养滤液对大核滑刃线虫(Aphelenchoides macronucleatus)等7种松树体内植物线虫的杀线活性,并对该菌株的16SrDNA基因进行了扩增测序和比对分析。结果表明：该菌株培养液原滤液对测试线虫24h的杀线率均达到了100%,说明该细菌的杀线谱较广,但培养滤液的不同倍数稀释液对不同种线虫的杀线活性有显著差异,10倍稀释液对霍夫曼尼伞滑刃线虫(B.hofmanni)的杀线活性最高,杀死率为96.9%;其次对李氏长尾线虫(Seinura lii),杀死率为73.7%;再次对松材线虫和拟松材线虫(B.mucronatus),杀死率分别为48.7%和39.0%。而对大核滑刃线虫、吴氏长尾线虫(S.wuae)和外滑刃科线虫(Ektaphelenchidae sp.)的杀死率较低,分别为15%、1.5%和0;该菌株的16SrDNA基因序列BLAST比对结果表明,该菌株与菌株Bacillus amyloliquefaciens FZB42最为接近,相似性为99.86%,处于系统发育树的同一分支,进一步验证了其形态学和Biolog细菌鉴定仪的鉴定结果,确定该菌株的分类地位为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。     

应用分子图形学、分子力学、量子化学及静电势研究农药分子结构与性能关系(Ⅶ)──磺酰脲分子构象差异对活性影响的ANN研究

应用人工神经网络方法（ANN）研究磺酰脲类除草剂构象差异对其活性的影响．主要考虑对碘酰脲类除草剂与受体相互作用有所影响的两类因素，即电荷因素和几何因素．当两者都考虑时得均方误差msc＝0．078，而仅考虑前者时得msc＝0．118，这表明构象差异确实对此类除草剂活性有较显著影响，必须加以考虑．本文首次用RMS来定量表征构象差异．     

液体聚丁二烯原位涂层研究：Ⅱ.电活性名离子的形成及…

采用电量法和失重法，测定了裸洁Ａｌ电极在不同浓度、温度和ＰＨ值的聚下二烯酸溶液中阳极溶解速度，确定了电活性Ａｌ（Ⅲ）离子的最佳形成条件及其对ＰＢＡ的凝聚作用规律。     

基于高通量分子对接技术筛选干预COVID-19的潜在活性分子及中药

2019年12月以来,由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus-2,SARS-CoV-2)感染引起的新型冠状病毒肺炎(novel coronavirus disease 2019,COVID-19)在全球范围内流行和传播,具有较高的传染性、发病率和死亡率.目前,国内外仍缺乏特效且无明显副作用的治疗药物.基于COVID-19的特异性靶点(AXL、3CL pro、ACE2),利用高通量分子对接技术在TCMSP数据库中虚拟筛选潜在活性小分子,并从TCMSP、TCMIP和TCMID数据库中预测相应的潜在中药.结果显示,作用于AXL、3CL pro和ACE2的共靶点小分子有47个,包括萜类、生物碱类、黄酮类、醌类和苷类等,其中萜类所占比例最高.其中Chelidimerine与AXL和3CL pro的结合能力最强,可能是一种治疗COVID-19的潜在化合物.基于ADME和Lipinski规则,得到10个具有良好药代动力学特征的化合物.此外,预测获得了13味治疗COVID-19的高频中药.本实验获得的针对COVID-19的潜在活性分子(PAM)和潜在中药,可为后续的抗病毒活性研究、新药开发和临床应用提供有意义的参考.     

IDNO级别下的最大重迭对称性分子轨道：Ⅱ.在核自旋偶合常数研究 …

采用我们已建立ＩＮＤＯ级别下的最大重迭对称性分子轨道方法计算得到的密度矩阵和电荷，分子的最大键级和最大键级杂化轨道被求解，而进研究了Ｃ－Ｈ、Ｃ－Ｃ等核自旋偶合常数，所得结果与实验数据以及其它研究方法结果相一致性是进一步说明我们提出的理论方法是可行的。     

纳米磁性体系的增强磁热熵效应：Ⅱ.基于实验测量及分子？…

通过实验测量不同团簇尺寸下的纳米Ｇｄ材料的磁热熵效应，结果表明在纳米尺度下，Ｇｄ材料具有增强和磁热熵效应并尖于最佳纳米尺寸，实验结果直接证实了用统计力学理论及Ｍｏｎｔｅ Ｃａｒｌｏ方法处理模拟结果，当纳米团簇尺寸减小时，伴随着磁热熵变△Ｓ的增加，超铁磁－超顺磁转变温度ｔｓｃ发生下降偏移，采用分子场理论，导出了增强磁热熵变△Ｓ与温度偏移因子（１－ｔ）＾－１／２满足很好的标度关系△Ｓ～（ｔ）＾－１／２