用AUG的三联数字推导氨基酸的遗传密码

遗传密码是三个碱基组成不重叠的三联密码子,并且一个三联密码子决定一种氨基酸。现已知道组成蛋白质的氨基酸只有20种,而由四种碱基组成的三联密码子有64种之多。本文用起始密码子AUG的三联数字来推导20种氨基酸一一对应的遗传密码。     

遗传密码表与《易经》

首幅大型人类基因图谱的发表绘出了1.6万个基因染色体所在的位置,它说明人的一生的确定性和它们的遗传性程序,是由4个碱基中任取3个,构成64个密码子的基因所控制。《易经》(周易),它也有一个由64个符号组成的系统,每个符号也是由4个可能的“字母”中的3个组成,它依赖于阴阳极性的基本规律,揭示人的生命和发展受控于一个包含64种可能的状态,每一种状态又有6种可能的变化,使之成为另一个状态的系统所确定的程序。本文介绍如何由二进制表示“卦”的顺序,并以太阴、少阴、少阳、太阳分别表示尿嘧啶(U)、胞嘧啶(C)、鸟嘌呤(G)、腺嘌呤(A)4个碱基的遗传密码表,发现竟似同一个密码系统。提出是否存在一种规律,它的特征(信息)一方面通过遗传密码表的64种三联体密码显示,另一方面又通过64种可能的状态及发展显示。     

斜带石斑鱼神经坏死病毒基因组RNA1和RNA2序列测定及分析

根据GenBank数据库公布的鱼类神经坏死病毒(nervous necrosis virus,NNV)同源序列设计了7对特异性引物,采用RT-PCR方法扩增出目的片断,将PCR产物测序和分析.斜带石斑鱼Epinephelus coioides神经坏死病毒(orange-spotted NNV,OGNNV)基因组由两个片断(RNA1和RNA2)组成,RNA1由3 103个核苷酸组成,含有一个开放阅读框,编码982个氨基酸;RNA2由1 433个核苷酸组成,含有一个开放阅读框,编码338个氨基酸.OGNNV基因组与新加坡GGNNV(greasy grouper NNV)的基因组有高度的相似性.分析病毒的RNA2序列发现:OGNNV与DGNNV(dragon grouper NNV)、RGNNV(redspotted NNV)和GGNNV的亲缘关系很近,并且具有相同的中和位点;分析病毒的RNA1序列,发现在OGNNV的RNA1序列中同样可以找到依赖RNA的RNA聚合酶的6个模序(motif).根据同源性比较和系统进化分析,OGNNV属于RGNNV血清型的成员.     

蛋白质多样性的数学分析

瞬息万变的生命现象，给数学提出了大量复杂运算与许多用数值不易表示的变化，推进了数学打破传统结构。开拓新的数学领域和方法，运用到生命科学研究和发展过程．以mRNA长链为模板，合成翻译蛋白质肽链的过程中，其三联密码符号，即核苷酸的4种信息符号U、C、A、G，决定了氨基酸的排序变化，同时传输遗传信息．这里用数学理论和方法，例证20种氨基酸排序变化的多样性，致使蛋白质肽链结构的多样性，以至生物性状、生物种类多样性．     

印鼠客蚤线粒体COⅡ基因的克隆、序列测定和分子系统学分析

本文报道了印鼠客蚤云南株线粒体DNA中长为901bp的片段,包括完整的COⅡ基因和3个氨基酸tRNA基因及ATPase8基因片段。COⅡ基因全长684bp,编码227个氨基酸,起始密码为ATC,终止密码为TAA。印鼠客蚤mtDNACOⅡ基因中富含AT,含量为77%,GC含量为23%。根据COⅡ基因核苷酸和氨基酸序列,对蚤目蚤科部分种类及外群进行了分子系统学分析。     

不同区域日本稻蝗Cyt b基因序列及相互关系

对中国 7个不同地理区域的日本稻蝗共 19个个体的线粒体 DNA细胞色素 b基因中间部分序列进行测定 ,比较其同源性 ,计算碱基组成 ,并用中华稻蝗和景泰突颜蝗为外群构建不同单倍型的 NJ分子系统树。在获得的432 bp的序列中 ,A T约占 70 .5 % ,其中 13个核苷酸位点存在变异 (约占 3.0 % ) ,4个位点引起了氨基酸的变异。就每个氨基酸密码子来看 ,第三位点的 A T含量较高 ,达 87.4%。由系统树显示 ,6个单倍型共形成 3个聚类簇 ,其分枝与地理分布没有直接的关系     

苦荞AGPase编码基因FtAGPL和FtAGPS全基因组鉴定和表达分析

AGPase是植物淀粉合成的第一个限速酶,直接决定淀粉的合成速率和积累量,是由2个大亚基(AGPL)和2个小亚基(AGPS)构成的异源四聚体.研究从苦荞全基因组水平鉴定到4个AGPL编码基因(命名为FtAGPL1～4)和2个AGPS编码基因(命名为FtAGPS1～2).这6个基因编码蛋白质的长度在515～532个氨基酸...     

啤酒花潜隐病毒新疆分离物的全基因组序列分析

对新疆啤酒花上获得的HpLV分离物HpLV-XJ进行了全长克隆和基因组序列分析。结果显示:HpLV-XJ的全基因组序列为8612个核苷酸(nt)(不包括poly A),含有6个开放阅读框(ORF),分别编码224 kDa(ORF1)、25kDa(ORF2)、11 kDa(ORF3)、7 kDa(ORF4)、34 kDa(ORF5)、和12 kDa(ORF6)蛋白。序列相似性分析结果表明,HpLV-XJ与HpLV(GenBank:AB032469)序列相似性达98.5%,6个开放阅读框的核苷酸序列相似性分别为98.3%、99.0%、97.6%、96.7%、99.5%和98.4%;由此推导的氨基酸序列相似性分别为98.6%、98.7%、97.2%、95.0%、99.4%和98.1%,各个基因的核苷酸序列和蛋白的氨基酸之间存在着一定的差异。     

用相似性方法研究三叶草家族蛋白质序列-结构关系

Anfisen因提出蛋白质的氨基酸序列包含有足够的信息去决定它的空间结构的假说而获诺贝尔奖,这使得蛋白质的三级结构唯一地由其氨基酸序列决定的说法广为人所接受的。然而,很多具有规则三级结构的蛋白质其氨基酸序列接近随机,这使得人们感到很困惑。本文将以三叶草家族蛋白质为例,根据相似性方法把序列中的隐含对称性显示出来。结果表明氨基酸序列中的隐含对称性与三级结构的三重准对称性一致。     

五种蓝舌病毒的分子系统(英文)

对蓝舌病毒(BTV)血清型2、11和13的双链RNA中L3基因的全序列进行了测定,该基因编码这种病毒的重要内壳蛋白质(VP3),应用前人测定的血清型10和17的BTV的L3基因序列,共5种美国存在的BTV的L3基因。该病毒的每种L3基因片断都有2772个核苷酸,包含一个开放读框(ORF)。这个开放读框(ORF)编码由901个氨基酸组成的蛋白质,VP3(分子量103kD),其等电点为6 0。用这5种蓝舌病毒血清型的核苷酸和氨基酸序列进行分子系统学分析发现,BTV-2血清型与BTV-10、11、13和17的距离较远,美国的五种血清型BTV可分为两个不同的类群。     

蚕豆萎蔫病毒中国分离物RNA2全序列及多聚蛋白切割位点

对蚕豆萎蔫病毒2(BBWV2)分离物B935 RNA2全序列进行了测定,全长由3 601个核苷酸组成(不包括3'端Poly(A)).RNA2包含一个长的开读框,该开读框起始于231位,终止于3 428位,编码一个分子量为119 ku的多聚蛋白.对外壳蛋白亚基N端氨基酸序列测定表明外壳蛋白大亚基(LCP)和小亚基(SCP)是由119 ku多聚蛋白中谷酰胺与甘氨酸及谷酰胺与丙氨酸之间的切割产生的,LCP含有402个氨基酸,SCP含有197个氨基酸.与蚕豆病毒属(Fabavirus)病毒基因组核苷酸及编码的蛋白质氨基酸序列比较表明,B935与BBWV2分离物及广藿香轻花叶病毒具有很高的同源性,而与BBWV1分离物的同源性较低.B935与豇豆花叶病毒属(Comovirus)和线虫传多面体病毒属(Nepovirus)的基因组结构相似,但序列同源性很低.B935与豇豆病毒属病毒的LCP和SCP氨基酸具有共同的保守序列.用4株单克隆抗体进行TAS-ELISA测定表明B935与BBWV1分离物(NRS和PH3)抗原上有差异.     

抗CTLA-4的人单克隆抗体

根据该发明,提供了抗人细胞毒性T-淋巴细胞抗原4(CTLA-4)的全人单克隆抗体。且提供了编码包含重链和轻链免疫球蛋白分子之氨基酸序列的核苷酸序列,特别是跨越互补性决定区(CDR)的连续重链和轻链序列,特别是从FR1内和/或CDR1到CDR3和/或FR4内。还提供了与该文揭示的抗体具有相似结合特性的抗体及具有相似功能的抗体(或其他拮抗物)。     

2个海域野生三疣梭子蟹肌肉中营养成分比较

通过分析比较2个不同海域野生三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)肌肉的营养成分,对其营养价值进行综合评价。采用国家标准方法测定肌肉中的水分、灰分、粗蛋白、粗脂肪、脂肪酸、氨基酸、矿物质元素、核苷酸、甜菜碱和胆固醇,根据联合国粮农组织(FAO)标准进行营养品质评价,并针对营养组成、风味物质含量同产地之间的关联进行对比分析。结果表明:2个不同海域的三疣梭子蟹在蛋白质、氨基酸、核苷酸、甜菜碱等营养组成上差异显著。浙江台州海域野生雄蟹肌肉蛋白质含量、必需氨基酸含量和总氨基酸含量均高于山东日照海域野生雄蟹,差异显著(P＜0.05);浙江台州海域野生三疣梭子蟹肌肉中肌苷酸含量、甜菜碱含量均显著高于山东日照海域(P＜0.05)。研究发现,2个海域野生三疣梭子蟹肌肉中营养成分含量存在一定差异,并对其风味及营养价值产生影响,可能与环境因素、遗传基因、摄食饵料等因素有关。     

基因组DNA编码的蛋白质中氨基酸分布的分析

各种蛋白质中氨基酸残基的组成是由编码该蛋白质的结构基因的序列决定的,分析这些序列中有义密码子使用频率,就可以看出蛋白质的氨基酸组成情况。我们利用文献中90种生物的11415个基因中有义密码子使用频率,统计出了每种氨基酸在该种生物基因组DNA编码的蛋白质中的相对丰度。把这些丰度值按(1)90种生物,(2)真核生物33种,(3)原核生物27种(包括F质粒、Ti质粒、转座子各1种),(4)病毒类24种(含噬菌体6种),(5)细胞器(叶绿体5种和线粒体1     

时空混沌自同步流密码系统

提出了由单向二维耦合的映象格点组成新的时空混沌自同步流密码系统,它能够产生并输出N2个平行混沌流密码.研究表明,该系统具有高安全性、快加密(解密)速度和强抗信道噪声能力,它的密码性质优于所有已知的混沌密码系统.     

真菌菌丝体和发酵液的氨基酸分析比较

对云芝等7种真菌的菌丝体和发酵液分别测定17种氨基酸的含量,测定结果表明这些菌丝体和发酵液中含有丰富的人体8种必需氨基酸,支链氨基酸及精氨酸,而芳香族氨基酸和含硫氨基酸量却很低。7种真菌的菌丝体和它们的子实体,三种食用蛋白(α—酪蛋白,卵白蛋白,大豆球蛋白)及4种粮食产品(大米,小麦,小麦精粉,玉米)的氨基酸进行了比较,其结果是菌丝体的必需氨基氨含量,支链氨基酸及精氨酸含量一般都高于子实体。菌丝体必需氨基酸相对百分含量高于或接近于三种食用蛋白,菌丝体支链氨基酸和精氨酸相对百分含量均高于三种食用蛋白,菌丝体芳香族氨基酸相对百分含量全低于三种食用蛋白。令人注目的是7种真菌菌丝的支链氨基酸与芳香族氨基酸的比值全大于3种食用蛋白和4种粮食产品。这些数据为发酵培养开发利用真菌资源提供了新资料。     

电脑迷老爸

正老爸是个电脑迷,电脑在他的生活中真是与他形影不离。老爸每天一下班回到家的第一件事就是打开电脑上网,家务由妈妈一个人干,妈妈可不高兴啦。有一次,妈妈决定要治治老爸的"懒病"。于是,妈妈在电脑上设置了一个密码,让老爸玩不成电脑。老爸下班回来后,照例打开电脑准备大干一番。他刚抽出键盘想坐下来玩时发现电脑上出现了"请输入密码"五个字,老爸满脸疑惑,自言自语道:"啥时有了个密码?"他一边说一边试密码,可试了好几次都是错误的,这可把他给急坏了。老爸只好跑去问妈妈,妈妈板着脸说:"不知道。"     

玉米雄性不育系“双26A”

(一)选育过程1961年春由内蒙物理研究所协助用钴60(γ射线)处理品种间杂交种“赤交26号”(斯吐吉娜×白穰铁岭黄)第一代种子。剂量:2千、4千、6千、8千、1万、2万仑琴共6个处理。1961年及1962年同剂量内进行选株采粉混交繁殖。1963年在2千仑琴剂量的一个穗行小区里抽雄期发现有4株不孕,即:—29、—9、—33、—17株,当即选择本小区内可孕株—30、—35、—32     

云南3个不同地区水稻矮缩病毒S8片段的序列分析

用RT-PCR方法从云南昆明、玉溪和陆良3个地区的水稻样品中扩增到水稻矮缩病毒S8全长片段,核苷酸测定及序列分析表明,水稻矮缩病毒云南昆明、玉溪及陆良分离物S8片段全长均为1356 bp,含一个1266 bp的ORF,编码421个氨基酸.核苷酸和氨基酸同源性分析表明,4个中国分离物S8片段之间的核苷酸同源性为97.9%,其编码的氨基酸同源性为98.6%;4个中国分离物与日本分离物的S8片段核苷酸同源性和氨基酸相似性分别为94.7%和98.1%.昆明、陆良、玉溪和福建分离物应属同一株系,而日本分离物应属另一株系.     

百合无症病毒衣壳蛋白基因克隆和蛋白分析

根据已报道的LSV CP基因序列合成两条寡聚核苷酸引物,模板为感染LSV的百合叶片的总RNA,通过反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增出大小为876bp的LSV CP基因,经测序后,对该基因编码区全长序列及相应的氨基酸序列用生物信息学软件系统进行序列分析及结构功能预测.结果表明:该基因由876个核苷酸组成,编码291个氨基酸;与GeneBank公布的其他LSV分离物的基因序列同源性为93.4%～99.0%,氨基酸同源性为84.8%～99.5%;它含有一个卷曲螺旋结构和多个磷酸化位点,平均疏水值为-0.432;含有Carlaviruses完整的衣壳蛋白保守结构域,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.