基于样本科学的生物样本库建设

生物样本库在现代临床与基础医学研究中的作用日趋重要,基于临床生物样本资源的研究日益增多,这极大推动了转化医学研究前进的步伐.当前国内外样本库建设更关注生物样本的标准化、规范化、信息化管理,但临床生物样本的精度、活性及多维度利用对于临床诊疗及后续科学研究具有重要意义.换言之,未来生物样本库的"内涵"建设更需要聚焦于样本本身的科学研究,即样本科学.因此,在精准医学时代背景下基于精准样本科学的生物样本库建设变得更加迫切.目前,基于样本本身的科学研究正处于探索阶段,本文从精准样本科学角度入手,以动静脉中样本组分以及肿瘤不同部位之间的差异为例,归纳了目前针对不同样本来源部位的样本科学研究进展;同时针对生物样本活性,阐述了样本采集及后续处理环节对于保持其样本活性及发挥后续治疗与科研作用的重要性.本文旨在倡导基于临床样本的精准度与活性的样本科学研究,提出"一样多用"以及"多样一用"的多维度利用模式,倡导一种基于精准样本科学带动下的新型生物样本库建设模式.     

生物样本库

生物样本库作为医学研究的重要资源,是转化医学研究的基石。建立高质量的生物样本库对于探索新的治疗途径,开拓新的诊治手段,优化医药研发的资源配置都有极其重要的意义。     

动态点击

正中国首个国家基因库开始运营日前,我国唯一一个获批筹建的国家基因库,也是目前全世界最大的综合基因库——深圳国家基因库正式启动运行。不同于美国、欧盟和日本的三大世界级基因库,中国国家基因库不仅仅是数据库,而且还是国际上现有的各类生物样本库、数据库、生物多样性库、疾病库等的综合升级版。除了"干库"(即基因、蛋白、分子等多组学生物信息数据库)、"湿库"(多样性生物样本和物种遗传资源库)外,国家基因库还引入了"活库",即生物活体库,包括动物资源、植物     

人工智能助力生物分类

正随着全球生物多样性的减少,研究人员正急切地将所有新发现的昆虫和其他无脊椎动物编入目录,它们涵盖了尚未命名的900万个物种的90%。为此,科学家通常要花很长时间在实验室里对收集到的标本进行分类。现在,一种名为"多样性扫描"的新方法可能会帮上忙。这种方法包括一个机器人,它可以每次从托盘中取出一个昆虫或其他小生物,并对它们拍摄;然后,一台计算机使用名为"机器学习"的人工智能,将每个样本的腿、触角和其他特征与已知样本进行比较;最后,     

中国荒漠与沙地生物土壤结皮研究

生物土壤结皮广泛分布于干旱半干旱区,其盖度占该区域地表活体覆盖的40%以上,是联结荒漠地表生物与非生物成分的"生态系统工程师"和荒漠/沙地生态系统健康的重要标志,也是干旱区地球表面过程研究中生物学与地球科学交叉研究的热点科学问题.21世纪初,相关研究绝大多数来自国外,且集中在热带荒漠、寒漠和欧洲草原,很少有来自中国和温性荒漠的报道.本文评述了2000年以来中国学者在这一研究领域开展的系列创新性研究,涉及生物土壤结皮组成、分布和演替,对环境胁迫及全球变化的生理生态学响应,与土壤生态、水文过程,与维管植物和土壤动物关系,对干扰响应和人工培养及在生态恢复实践中的应用等,介绍了中国学者对国际生物土壤结皮研究所做的贡献.     

英国生物银行介绍

在过去的几年里,50万以上的英国人为英国生物银行贡献了他们的尿液、唾液和血液,他们还花很多时间测量并记录下自己的体重、血压、记忆力、肺容量等,并接受关于他们生活方式的问卷调查。保罗·唐尼(Paul Downey)是英国生物银行计划的运营总监,他于2004年就已经介入了英国生物银行项目。他说:"1400万装在小小试管里的生物样本,有的可追踪到30年前。"在财政预算允许范围内,并以自愿者可以接受的方式,生物银行的一     

“克隆羊之父”呼吁建立“生物银行”

正伊恩·维尔穆特爵士说,有必要建起现代的"诺亚方舟",储存濒危物种的生物材料。多利羊的创造者、伊恩·维尔穆特(Ian Wilmut)爵士表示,应该建立现代版的"诺亚方舟",这是保存濒危动物生物物种的一项保险措施。这位来自爱丁堡的研究人员说,生物银行中应该保存濒危动物的精子、卵子和其他生物材料,以便科学家在未来技术成熟时能复活灭绝的生物。生物银行就是细胞和生物组织的仓库,就像斯瓦尔巴全球种子库一样,是生物多     

生物燃料有那么绿色吗?

全球变暖和不断攀升的石油价格正在不断催生着生物燃料的出现--诸如来自玉米和甘蔗的乙醇燃料一直以"拯救者"的身份自居.不过持反对意见的人士则强调,生物燃料的推广将消耗大片农田和野生动物自然栖息地,助长食品价格上涨以及并不因此减少温室气体排放.     

生物中的长矛和坚盾

自然界中有一场从未休止过的战争,那就是生物之间严酷而无止静的生存竞争。物种为了生存必须具备一系列结构上或行为上的特点——要么进攻,要么防御。在动物进攻性武器库中,牙齿是最引人注目的了。一些食肉动物,像狼、虎、狮、海豹等,都有四个大而犀利的犬齿,极适于捕捉和撕碎猎物,犬     

生物技术的未来

<正>你有可能直接或间接地受到某种生物病症的影响。饥饿、营养不良、癌症、糖尿病以及无数其他疾病,会影响你、你的家人以及你所生活的社区。每天有超过十亿人都面临着各种"生物病症",虽然我们自身"生物程序"的不完善是问题的根源,但生物学依然可以成为一种解决问题的途径。生物学随着从发现生物的学科转变为发明和"制造"生物的平台,它对     

旨在记录生物多样性及促进植物基因组研究 美国史密森学会建立植物冷冻库

<正>美国史密森学会其所属的美国国家自然历史博物馆(NMNH)于7月8日发起了一项倡议,即计划采集并冷冻来自全世界一半植物科的植物组织(将装有新鲜植物组织样本的试管保存在液氮中),为植物基因组学和生物多样性研究提供样本。参与该项目的研究人员称:随着该计划的进展,未来两年有望采集全部的植物科以及一半的植物属。     

模式生物与人类疾病

模式生物是一类能方便地在实验室进行繁殖和饲养,个体生命周期较短的生物,用于研究人类生命现象或健康问题,其中有人们熟悉的小鼠和果蝇,也有人们不太熟悉的线虫和斑马鱼.尽管模式生物不像时装模特儿那样引人注目,但由于它们繁殖力强,基因组一般较小、较简单,易于遗传操作等特点,而备受生物学家和医学家的青睐.     

第二届全国生物数学学术会议召开

由中国数学会生物数学专业委员会、中国生物物理学会生物数学专业委员会和华中师范大学联合主办的第二届全国生物数学学术会议于1990年5月8日至12日在武汉市华中师范大学举行。参加会议的有来自     

探索生物第四域

有证据表明,生物学家对地球生物多样性的认识存在严重不足生物,如凯撒当年征服的高卢,被一分为三。地球上有生命的万物都归于目前已知被统称为"域"的三大群组。"域"之下则沿用生物学家林奈的动植物分类法,将生物逐级分类为界,门,纲,目,科,属和种。我们最熟悉的域是真核生物,尽管有人认为这并非整个地球生物圈中最重要的部分。真核生物域     

生物探矿

在非洲广漠的喀拉哈里沙漠的黄沙底下,有些地方可能沉睡了大块的金矿。问题是在这块与美国科罗拉多州同等大的地区内正确地定出方位,以保证在离地面三百多英尺的地层内埋有富含矿质的矿脉。地质学家在搜寻稀有金属中征用了非凡的助手:他们让白蚁担任勘探工作。来自地质化学、细菌学、动物学和植物学的不同学科的科学家已经着手利用了生物勘探及动物探矿,由生物来引导人们发现丰富的矿藏。某些白蚁就是天然的探矿者。在喀拉哈里沙漠,它们就以能深掘沙地五百英尺寻找地下水而闻名。     

生物序列分析

这次演讲将回顾近 1 0多年来应用某些随机模型于生物序列分析的研究工作 .这些模型本身有很长的历史 ,可追溯到 3 0多年以前 ,尽管从那时起 ,这些模型已经产生了很多新的变种 .在生物序列分析中模型的作用是归总那些涉及到在生物信息学中已知的模体 (motif)或域 (domain)的信息 ,并且提供一种工具在另一序列片段中寻找模体或域的实例 (instance) .我们将逐步介绍模体模型 ,从非常简单的 ,非随机情况开始 ,进而是更复杂的情况 ,直至近来的关于模体的剖面隐马氏模型 .第二个例子是来自利用一个或两个物种的序列数据进行基因发现 ,其中广义隐马氏模型或广义成对 (pair)隐马氏模型已被证实非常有效     

野生生物之美

<正>在广袤的自然界中,动植物所展示出的勃勃生机和恬静之美,时时吸引着众多摄影爱好者流连忘返于其中。在2013年由英国自然历史博物馆举办的国际野生生物摄影大赛上,来自96个国家的摄影爱好者递交了4.3万幅参赛作品角逐18个奖项,最终100幅作品获奖。以下是部分入围的获奖作品,以飨读者。     

地球极端生物

"极端生物"可以在一些人类惟恐避之不及的环境中茁壮成长,例如沸水、冰水、高浓度的盐水等,它们的栖息地可能在阿尔卑斯山的山麓冰川中,在北极冰冷的海水中,在深海的沉积物中,或在碱水湖泊中,它们是如何适应这样的恶劣环境以维持身体所需的呢?这些问题至今让人百思不得其解。     

镜头下的生活——2008年度世界野生生物摄影大赛获奖作品

前不久,英国自然历史博物馆展出了"2008年度世界野生生物摄影大赛"的获奖作品。这次大赛评选了来自82个国家的32000多部作品。本次大赛分为成人组和少儿组,分别评选出一名年度总冠军。成人组的参赛项目分为"水下     

新生物相容性胶水可在15秒内止血

<正>近日,美国研究人员开发出一种生物相容性"胶水"。这种糊状的黏性膏体可密封受伤的组织或器官,并在凝血之前15秒内止血。发明这种"胶水"的灵感来自藤壶。研究小组通过改进他们之前开发的一种黏合剂来模仿藤壶的"胶水"。这种黏性材料由一种名为聚丙烯酸的聚合物和一种名为NHS酯的有机化合物(提供黏附性),以及壳聚糖(一种增强材料吸附性能的糖)组成。研究人员将这种材料的薄片冷冻,将其研磨成微粒,然后将这些微粒悬浮在医用级硅油中。