黑腹果蝇热激蛋白基因家族的生物信息学分析

热激蛋白是细胞或生物体受到热激后新合成的一类遗传上高度保守的蛋白,在生物体中普遍存在,在细胞生长、发育、分化、基因转录等功能方面发挥重要的作用.本研究利用生物信息学方法首次对黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)全部热激蛋白进行分析.结果表明,黑腹果蝇热激蛋白共有HSPC(HSP90)、HSPA(H...     

一种黑腹果蝇原种的培养方法

黑腹果蝇是高等院校遗传学实验教学中的一个重要材料,培养出健康适龄的果蝇对实验结果的重要性显得十分重要。因此,本文较为详细地介绍了一种从培养基的制备到培养全过程的黑腹果蝇培养方法,以期为培养健康适龄果蝇,并用于遗传学实验教学提供一定的参考。     

Flotilin-1在黑腹果蝇不同发育阶段的表达

脂筏(Lipid raft)是质膜上富含胆固醇和鞘磷脂以及特定蛋白的微结构域,浮舰蛋白-1(Flotillin-1)是脂筏标记蛋白,与轴突再生、学习记忆和肿瘤形成等过程相关.近年发现,从无脊椎动物到脊椎动物的很多种类都有Flotillin-1的表达,且在进化上高度保守.果蝇属于完全变态昆虫,是一种重要的模式生物,含有人类疾病相关基因中65%同源基因.因此,研究这些基因在果蝇不同发育阶段的表达分布特征,对深入阐明人体病理机制具有重要意义.以黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)为研究对象,通过Western blot和免疫荧光方法检测Flotillin-1在果蝇不同发育阶段的表达.结果如下:Flotillin-1在果蝇不同发育阶段的表达水平和分布不同:幼虫期仅脂肪体中少量表达;蛹期消化道和脂肪体中有少量表达;成虫期主要在脑、复眼、消化道、生殖腺中表达,肌肉中也有少量表达;该蛋白在成虫中的表达量显著高于幼虫和蛹.     

本地黑腹果蝇新品系的发现,选育和利用

在本地黑腹果蝇中,先后发现了黑条体和展翅两个自发突变新品系,展翅品系了带有致死基因的品系;把黑条体和展翅两个新突变品系与遗传实验常用的残翅和白眼品系杂交,选育出了黑条体残翅、黑条体残翅白眼、黑条体长翅白眼、黑条体展翅等４个新组合品系,这些新品纱的发现、选育和利用,改变了国内遗传学果蝇实验中,果蝇杂交品系长期完全依赖从国外引进的状况,为遗传学教学和科研提供了较邹的实验材料。     

不同基因型黑腹果蝇的寿命比较

为了研究遗传因素对黑腹果蝇寿命的影响，本文用三角瓶液体饲养法饲养了４个基因型不同的果蝇品系（＃１、＃２、＃３和＃４的基因型分别为ＷＷＶｇＶｇＳｍＳｍＣｈＣｈ，ｗｗＶｇＶｇＳｍＳｍＣｈＣｈ，ＷＷｖｇｖｇＳｍＳｍＣｈＣｈ和ｗｗＶｇＶｇｓｍｓｍｃｈｃｈ），并记录和比较了它们的寿命。结果显示，群体的半数死亡期，平均寿命和最高寿命三项指标均呈现＃１＞＃２和＃３，＃２和＃３＞＃４的规律。提示显性基因多的果蝇品系寿命更长，从而支持了作者先前提出的“多显性基因决定长寿”的假说。     

生地对黑腹果蝇寿命的影响

观察了生地对黑腹果蝇寿命的影响。实验组培养基药物浓度分别为０．３５％、０．７０％和１．４０％,对照组培养基不加药物。实验结果表明,与对照组相比,三种浓度的生地都能延长雌雄果蝇的平均寿命和最高寿命;在半数死亡期方面,０．３５％生地对雌雄果蝇都能延长,０．７０％生地仅能延长雌性果蝇,而１．４０％生地对雌雄果蝇均无延长作用。提示生地有延缓衰老的作用 。     

黑腹果蝇种组组蛋白基因间内含子区的分子进化

通过分析黑腹果蝇种组(Drosophila melanogasterspecies group)9个种亚组代表种和D.pseudoobscura的组蛋白基因H2A和H2B的内含子的碱基组成、替换速率、转换/颠换比、二级结构和系统发育关系等发现:整个序列长度变异范围在201 bp(ficusphila)到232 bp(takahashii)之间,替换速率为0.82,转换明显高于颠换,内含子和外显子结合区不遵循“GT-AG”和“AT-AC”模式,而是“TT-AG”模式,二级结构与系统分化关系具有相关性.我们认为组蛋白基因H2A和H2B的内含子是先起源的,在进化过程中由于承受的选择压力不同而发生了变异.     

蛋白质结构预测的生物信息学方法研究

生物信息学是一门数学、统计、计算机与生物交叉结合的新兴学科。随着人类基因组计划的完成与深入,应用生物信息学方法进行蛋白质结构的预测成为了后基因组时代的一项重要任务。本文重点介绍了生物信息学在蛋白质结构预测中的方法研究,简述了蛋白质结构预测的方法,介绍了蛋白质预测技术的新技术的应用与未来前景。     

黄芪复方对黑腹果蝇寿命的影响

长寿和衰老是寿命的两种不同表现形式，统受许多对等位基因控制【“」，其中，每对等位基因都有完全显隐性之分，显性基因控制长寿，故称长寿基因，隐性基因控制衰老，故称衰老基因。由于父母携带长寿基因和衰老基因的数目不同，每个人携带该两类基因的数量也不同，但是，无论是携带的长寿基因多，还是衰老基因多，人们均无法对其进行任何修改。不过，在体内外环境优越的条件下，长寿基因可充分表现，因而携带长寿基因多者，可表现为长寿。相反，在环境不良的条件下，长寿基因不能充分表现，结果其作用可能几乎近似于衰老基因，因而一个人即…     

氯化钇对黑腹果蝇生育率的影响

探讨稀土元素钇（Y）对黑腹果蝇生育率的影响。在不同浓度（1、4、16 mg/L）氯化钇（YCl₃）培养基中饲养野生型黑腹果蝇（红眼Canton-S）。并设置普通培养基作为对照,收集8 h内羽化的果蝇,雌雄果蝇分别放置在0、1、4、16 mg/L的YCl₃培养基中喂养10 d,后分别与异性果蝇按照1:3的比例在普通培养基中进行杂交,7 d后去除异性果蝇,第10 d开始统计羽化的果蝇总数量（F1）,连续统计5 d后,计算新生成果蝇的数目。结果表明YCl₃浓度为1 mg/L时,雄性果蝇繁殖能力未见明显异常;浓度增加到4 mg/L时,实验组雄果蝇的生育率与对照组相比有所下降;随着浓度的不断增加,雄性果蝇的生育率下降80%。然而以雌性果蝇作为实验对象,无论是在低浓度还是高浓度的YCl₃喂养,其生育率与对照组相比没有明显下降,统计学没有显著差异（P＞0.05）。YCl₃超过一定浓度会降低黑腹果蝇的繁殖能力,对果蝇的生殖系统产生不利影响。并且我们此次实验发现,随着YCl₃浓度的升高,对雄性果蝇生殖系统的危害要远大于对雌性果蝇的影响,存在显著的性别差异且呈现明显的剂量效应关系。     

微管剪切蛋白Fidgetin在黑腹果蝇 神经发育过程中的功能初探

微管(microtubule,MT)是一种具有极性的细胞骨架.在微管动态变化过程中,有两类蛋白参与微管组装和解聚的动态调节.Fidgetin(Fign)的编码基因为CG3326,它是其中的去组装因子之一,参与微管剪切和末端解聚.本实验使用CRISPR/Cas9系统,构建fidgetin无功能突变体果蝇品系(fidgetin~(null)),观察fidgetin功能缺失对果蝇的神经发育的影响.结果表明fidgetin~(M14-2)会导致神经肌肉突触(neuromuscular junction,NMJ)的扣结数增多.通过观察fidgetin~(M14-2)的表型从而初步判断fidgetin基因对神经系统发育的影响,为fidgetin基因功能与致病机制的进一步研究提供基础.     

Neuritin结构组成分析及其相互作用蛋白生物信息学预测

目的 对Neuritin的理化性质及结构组成,蛋白质相互作用网络进行生物信息学预测分析,为进一步研究Neuritin的功能和作用机制提供新的思路与方向。方法 应用Protscale和ProtParam、TMHMM、SignalP、PSORTⅡ、NetNGlyc、NetOGlyc和Netphos等软件,分析Neuritin的理化性质、跨膜结构、信号肽结构、亚细胞定位以及翻译后修饰位点;利用Protean、tFold以及AlaphFold等软件和数据库,分析Neuritin的二级和三级结构;同时,利用STRING数据库构建Neuritin蛋白质相互作用网络。结果 Neuritin的相对分子质量为15 332.77,理论等电点(PI)为6.54。不稳定系数27.26,属于较稳定蛋白;脂肪系数98.31;总平均亲水性0.208,属于疏水性蛋白;Neuritin表达产物N端27个氨基酸为信号肽,C端27个氨基酸为GPI锚定序列,为跨膜区;其亚细胞定位及可能性分别为胞外(34.8%)、细胞膜(34.8%)、内质网(17.4%)及高尔基体(13.0%);无N糖基化及O糖基化位点,存在11个磷酸化位点...     

中国黑腹果蝇种组的组成与分布

1999~2004年,对全国27个省市的果蝇进行调查的结果表明:中国黑腹果蝇种组由10个种亚组组成,共67种.其中包括6个新种(D.sp.likeelegans,D.sp.likeauraria,D.sp.liketrapezifrons1,D.sp.liketrapezifrons2,D.sp.liketakahashii,D.chayusp nov);4个新记录种(D.giriensis,D.ogumai,D.ohnishii,D.pseudobaimaii);6个广布种(D.auraria,D.kikkawai,D.melanogaster,D.simulans,D.suzukii和D.takahashii).分布于全国33个省市,垂直分布的海拔高度在3 000 m以下.     

山苦茶对黑腹果蝇寿命影响的研究

本研究观察了山苦奈的醇提取物对黑腹果蝇Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａｍｅｌａｎｏｇａｓｔｅｒ（ＣａｎｔｏｎＳ）品系寿命的影响，实验系统设置了培养基含山苦茶１：１乙醇提取物为０．５、１．０、２．０、３．０、４．０、５．０％的六个实验组和纯培养基为对照的对照组，实验结果显示各剂量与对照组之间平均寿命无显著性差别．     

人WDR70蛋白结构与功能的生物信息学预测

人WDR70蛋白作为一个衔接蛋白,可介导多蛋白相互作用,参与DNA损伤修复、胚胎发育等生物过程。采用生物信息学软件对人WDR70蛋白的结构和功能进行分析,发现WDR70蛋白的相对分子质量约为73 kD,pI为5.94,半衰期为30h,不含有信号肽和跨膜区结构;同源蛋白的多重序列比对和进化分析显示,人WDR70蛋白与黑猩猩、白枕白眉猴、食蟹猕猴的WDR70蛋白具有高度的同源性,并且在系统发育树上聚为一类;无规则卷曲是WDR70蛋白二级结构主要的结构形式,三级结构的预测结果与之吻合;功能分类预测其为结合蛋白,参与蛋白的泛素化和转运过程。开展WDR70蛋白的生物信息学分析,为了解该蛋白的结构和功能提供信息依据,为后续WDR70功能研究提供新思路。     

野生黑腹果蝇引种培养与唾腺染色体观察

对佳木斯地区的野生黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)进行采集,并在实验室内进行培养训化,用常规果蝇培养基进行培养.选用卡宝品红染色法进行唾腺染色体临时装片的制备,观察其染色效果,与常规方法进行比较,效果比较好,并应用于遗传学教学.     

Ran对黑腹果蝇Kc细胞耐受DDT的影响

通过DDT刺激黑腹果蝇Kc细胞,着重讨论基因Ran的表达量变化情况.应用实时荧光定量PCR,检测不同浓度DDT诱导刺激条件下,Kc细胞内基因Ran表达量变化.利用流式细胞仪,检测不同浓度DDT诱导下细胞的凋亡率.结果表明,20 mg/L DDT处理的细胞,Ran表达水平最高.同时,在该浓度下,细胞凋亡率明显减弱,其变化趋势与Ran表达变化趋势基本一致.DDT可以显著提高Kc细胞Ran基因表达,降低细胞凋亡率.为了进一步验证Ran的功能,进行了Ran的过表达和干扰,并检测细胞凋亡情况.结果显示Ran的干扰能够明显提高细胞凋亡率.实验表明,Ran对细胞具有一定保护作用,Ran有可能是一个与杀虫剂耐受性相关的基因之一,并为进一步分析害虫应激反应及分子毒理提供研究依据.