小儿扁桃体淋巴细胞Poly（A）—RNA的制备及其cDNA的合成

采用盐酸胍法从经PHA诱导的小儿扁桃体淋巴细胞中提取总RNA,经Oligo(dT)-纤维素柱层析制备了Poly(A)-RNA。经蔗糖线性密度梯度超速离心步骤,富集了含IL-2mRNA的Poly(A)-RNA。经麦胚无细胞体系翻译实验表明,富集后的Poly(A)-RNA具有良好的模板翻译活性,其~3H-亮氨酸参入活性是对照的5.1倍。又以此富集了的Poly(A)-RNA为模板,按照Watson和Jackson的最新方法合成了小儿扁桃体淋巴细胞的双链cDNA。经碱性凝胶电泳检查,用此方法合成的cDNA长度最长的超过了IL-2的cDNA长度。     

利用eIF4E分离纯化非编码RNA的新方法

人翻译起始因子eIF4E是特异性识别并结合mRNA帽结构的蛋白质.该文通过克隆人源基因eIF4E,并利用原核细胞大肠杆菌BL21成功表达了具有帽结合功能的eIF4E蛋白,利用该蛋白亲和纯化分离得到了具有帽子结构的RNA.通过对比用oligo(dT)分离得到的非编码RNA,eIF4E法得到了更多种类的非编码RNA.本研究为非编码RNA的分离与发现提供了一个重要的工具.     

香雪兰花瓣总RNA的提取和cDNA文库的构建

以不同开放时间的红色香雪兰的花瓣为材料,利用CTAB裂解、LiCl沉淀的方法提取出高质量的总RNA,经纯化mRNA后,合成双链cDNA,加上EcoRⅠ和XhoⅠ接头,用胶回收的方法将500 bp以上的cDNA回收并连在载体上,获得了重组率为89%,滴度为4.8×105pfu/mL的香雪兰花瓣质粒cDNA文库,为研究香雪兰花香和花色的相关基因奠定了基础.     

全长cDNA文库构建方法及应用研究

构建全长cDNA文库是获得大量基因全序列信息的有效途径,也是进行功能基因组研究的一条经济、快速的途径,它克服了常规cDNA文库的缺点,极大地推进了功能基因组的研究,尤其是对于那些因基因组庞大而未能进行全基因组序列测定的生物来说更为重要．全长cDNA文库的研究在不断发展,几种文库构建方法已经建立,并得到了较为广泛的应用．本文重点阐述了全长cDNA文库的构建方法,对各种方法进行了分析和比较;同时对全长cDNA文库的应用也作了介绍．     

一种快捷有效的构建cDNA文库的方法

构建cDNA文库是研究基因组功能基因一种有效的手段，传统的建库方法通常需要在双链cDNA两端分别加上带限制性酶切位点的接头序列，通过酶切使之产生与质粒匹配的粘性末端，然后与质粒连接构成文库。本文介绍一种简单而且不需要核酸内切酶的构建cDNA文库的方法。该方法的主要步骤包括：（1）通过反转录合成cDNA第一条链，通过置换底物的方式在cDNA3’末端合成接头序列。（2）利用cDNA两端的接头引物，通过TaqDNA合成酶PER扩增合成cDNA第二条链。（3）将PCR产生的双链cDNA直接与T-载体连接。（4）将连接物转化大肠杆菌，得到cDNA文库。利用本方法，我们成功构建红树植物红海榄的cDNA文库。PCR结果显示插入的片段分布在O．5～3．0kb之间，大部分cDNA的长度在500—1000bp之间，表明cDNA具有较好的完整性。本方法具有操作简单、高效率、低成本、RNA模板需要量少的特点，而且适用于任何高等生物RNA样品。     

一种发现新基因的高效方法—cDNA文库的复性式均一化技术

由复性式均一化技术制作的均一化cDNA库（equailized cDNA library,normalized cDNA library）是近年来发展起来的一种获得EST,发现新基因的高效平台。本就该技术的原理,方法比较,存在问题和展望进行了阐述。     

长非编码RNA以及与疾病发生的研究进展

调节性非编码RNA是指不被翻译为蛋白且具调节作用的功能性RNA分子,常见的具调控作用的非编码RNA(ncRNA)包括si RNA、miRNA、piRNA以及长链非编码RNA(lncRNA).lncRNA是目前调节性非编码RNA研究的热点.lncRNA与物种进化、胚胎发育、物质代谢以及肿瘤发生等有密切的联系,对其功能深入了解可促进细胞内基因表达调控网络的研究,也为临床疾病尤其是肿瘤的诊断和治疗以及新药的研发提供科学依据.本文主要对lncRNA的功能研究以及与疾病的发生研究现状进行探讨.     

一种新的cDNA克隆的分析及可能功能推测

筛选胎儿心脏文库时发现一个新cDNA,Genbank搜索和BLAST表明该断cDNA和蛋白激酶A锚定蛋白AKAP95有71％的蛋白质相似性,且在3′端存在一个锌指结构和AKAP基因特有的RⅡ结合区域,因此初步判定该新cDNA为一种AKAP基因;该cDNA和人类19号染色体的一段区域相同,HGP计划标明在cosmid R33907和cosmid F20900上,而该个粒定位在19号染色体的q13．1处,因此将该新基因定位于人第19号染色体的q13．1处,并且同AKAP95相邻。     

葱蝇非滞育蛹的全长cDNA文库构建

葱蝇具有兼性滞育的特性且与果蝇近缘,是昆虫滞育分子机理和冬滞育和夏滞育专化基因比较研究的理想模式种,本研究目的在于构建葱蝇非滞育蛹的全长cDNA文库,为进一步的滞育专化基因筛选、克隆和表达分析奠定基础。利用RNAiso试剂提取葱蝇非滞育蛹的总RNA,采用SMART技术合成全长cDNA,将限制性内切酶SfiⅠ消化后的cDNA克隆到质粒载体pDNR-LIB,转化入大肠杆菌(DH10B),获得原始文库。经过涂平板测定表明,原始文库的库容量为2.3×107个单克隆;随机挑取15个单克隆,通过PCR快速鉴定,插入片段大小在0.4~1.2 kb之间,平均大小在0.9 kb,重组率达100%。这些结果表明本研究所构建文库的代表性和重组片段的序列完整性达到了用于目的基因的分离筛选和克隆表达的建库要求。     

一种改进的奇数阶幻方构造方法及其并行算法

研究了奇数阶幻方构造算法及其数据依赖性.通过对现有算法内存访问顺序和相关性进行分析,找出了限制现有算法并行性的主要因素,并通过改变内存访问模式和算法重构消除了数据依赖性.新的并行算法可以将原有算法的时间复杂度降为O(n),并且该算法可以达到成本最优.给出了该算法在不同存储系统下的实现方法.     

七鳃鳗(Lampetra japonica)白细胞cDNA文库构建及生物信息学分析

以复合免疫日本七鳃鳗(Lampetra japonica)外周血中分离的单个核白细胞为材料,构建库容量为4.5×106pfu.mL-1的cDNA文库,随机挑选单克隆菌落测序共得到10 500条有效ESTs(expressed sequence tags)序列.经PHRAP软件对序列拼接组装后得到3 382个转录本,其中有1 080个重叠群和2 302个单一序列,有59.08%的转本录在NCBI数据库中搜索到同源序列.运用Blast2GO软件进行Gene Ontology注释,分别有27.47%、25.20%和10.01%的转录本参与细胞生理、代谢和生物调节等生物学途径;分别有48.43%、22.10%和10.69%的转录本起到结合、催化和结构分子活性等分子功能.统计数据显示,与细胞自身基因转录、蛋白质合成及转运等生命过程密切相关的基因如真核转录延长因子、反转录酶、核糖体蛋白、腺苷酸转运体、细胞色素C氧化酶和热休克蛋白等在血液白细胞群中大量表达.另外,与固有免疫密切相关的白细胞衍生趋化因子、抵抗素、颗粒体蛋白等表达量相对较高,说明固有免疫系统在七鳃鳗感染初期的免疫防卫方面起着主要作用.     

An improved Gmapping algorithm based map construction method for indoor mobile robot

With the rapid development in the service,medical,logistics and other industries,and the increasing demand for unmanned mobile devices,mobile robots with the ability of independent mapping,localization and navigation capabilities have become one of the research hotspots.An accurate map construction is a prerequisite for a mobile robot to achieve autonomous localization and navigation.However,the problems of blurring and missing the borders of obstacles and map boundaries are often faced in the Gmapping algorithm when constructing maps in complex indoor environments.In this pursuit,the present work proposes the development of an improved Gmapping algorithm based on the sparse pose adjustment(SPA) optimizations.The improved Gmapping algorithm is then applied to construct the map of a mobile robot based on single-line Lidar.Experiments show that the improved algorithm could build a more accurate and complete map,reduce the number of particles required for Gmapping,and lower the hardware requirements of the platform,thereby saving and minimizing the computing resources.     

一种改进的中值滤波方法

探讨一种改进的中值滤波法进行VSP资料波场分离。从常规中值滤波的数学原理入手,详细探讨了一种改进的中值滤波法,使其在边界(L-1)/2个采样点的滤波效果与常规的中值滤波结果相同,而在对中间的各样点进行滤波时,将常规的中值滤波结果也参与到滤波过程中。通过对理论数据和2个零偏VSP资料进行波场分离,及对比分析分离后的波场,结果表明,改进的中值滤波相对于传统的中值滤波具有很高的稳健性和适应性。     

一种改进的边缘检测方法

对图像进行边缘检测是图像处理中的一项重要内容,为了克服噪声的干扰,人们提出了许多边缘检测的方法,但是都不能达到最理想的效果.基于各项异性扩散方程平滑图像的良好效果,本文将其与传统的边缘检测算法结合,提出了一种新的改进的边缘检测算法,该方法首先用各向异性扩散方程平滑图像,然后利用非极大值抑制机制和区域增长的方法处理图像,提取出细节完好的边缘.本文将提出的新方法用于核磁共振成像的心脏图像中,与传统的方法比较,可以看出该方法明显的优势.     

一种修改的TOPSIS法

目的改进传统多属性决策问题的TOPSIS法。方法对有限方案多目标决策分析法的一种修改方法。结果改进了传统的TOPSIS方法,提出在解决某些实际问题时应放弃全序而采用偏序,即TOPSIS偏序法,能更合理地反映出方案的优劣性。结论修改和补充了有限方案多目标决策分析方法,使其更具合理性,并扩大了传统方法的应用,决策人可由方案的优劣性根据自己的偏好做出最终的理想选择。     

改进的模糊层次分析法

目的 改进传统的层次分析法。方法 将互反型判断矩阵改为模糊一致性判断矩阵，并把和行归一法或方根法与特征向量法结合使用，提出了改进的模糊层次分析法。结果 指出传统的层次分析法往往会导致判断矩阵不满足一致性条件，需要检验和修正，而且计算精度不高。改进后的模糊层次分析法既解决了判断矩阵的一致性问题，又解决了解的收敛速度及精度问题，以此求得与实际相符的排序向量。结论 改进传统的层次分析法较传统的层次分析法更加完善和行之有效，并符合人们的思维逻辑，形式简单，准确，且易建立。另外，由优先判断矩阵改造而成的模糊一致性矩阵满足一致性条件，无需再进行一致性检验，同时也可大大减少叠代次数，提高收敛速度，满足计算精度的要求．从而为多目标决策提供了较为可靠的决策方法。     

一种改进的MCE训练方法

隐马尔可夫模型的参数估计是研究的重点话题,其中一个主要的方法是最小分类错误．从两方面说明一种新的MCE方法．建立一个非平凡的结构,使MCE的目标函数被重新确定为适合多个判断标准训练符的有理函数．采用这种新方法,基于增长转换或扩展Baum—Welch算法得到一个新的优化方法．