固城湖沉积物中的结合态有机类脂化合物

生物专属性与在早期成岩作用过程中的稳定性是反映古气候古环境变化的生物标志化合物的重要属性。内陆湖泊沉积物中的沉积有机质来源广泛,大量陆源碎屑有机质的输入,以及有机质在早期成岩作用过程中发生的变化,使其组成趋于复杂化,一些生物标志化合物的生源指征意义也变得模糊起来。除游离有机类脂质外,在沉积物中尚可分离出以化学键（酯键、酰胺键、醚键等）结合于有机大分子中的结合态有机类脂质,其组成、来源及早期成岩变化与游离有机类脂质有所不同。本文对固城湖沉积物中呈酯键和呈酰胺键结合的有机类脂     

生物大分子相分离研究进展和发展建议

生物大分子相分离(phase separation)或相变(phase transition)是近年来生物学研究中一个新兴的交叉研究领域.生物大分子液-液相分离驱使细胞内形成多种无膜区室,如核仁、核孔复合物、有丝分裂纺锤体、着丝粒、中心体、应激颗粒和一些信号传导复合物等,这些无膜区室被统称为生物分子凝集体.生物大分子相分离具有广泛的生物学功能,例如调控生化反应、感知与响应应激条件、缓冲生物大分子的细胞内浓度和介导与有膜细胞器的直接通讯等.异常的生物大分子相分离与许多人类疾病密切相关,例如神经退行性疾病、癌症以及传染性疾病等.本文介绍了生物大分子相分离的生物学功能及其在人类疾病发生发展中的作用,总结了国内外生物大分子相分离研究所取得的重要进展,并提出了我国相分离研究的发展建议.     

核酸的分子静电势[Ⅱ]——生物反应性和化学致癌作用探讨

在生物大分子的研究中,大分子整体结构对其反应活性的作用是一个基本问题。例如,对于核酸,人们自然会问:大分子的整体结构,如DNA,对它的不同位置,如嘌呤和嘧啶碱基等的性质究竟有怎么样的影响。近年来,已经可以用分子静电势这个概念对上述问题,至少是问题的某些重要方面,作出量子力学计算的解释。本文主要讨论分子静电势是如何影响各种亲电的、亲核的试剂跟DNA及其组分的相互作用的。     

蛤蚧的游离视杆细胞外段的吸收光谱

蛤蚧(Gekko gekko)属于爬行类动物,是一种夜行性的大壁虎。它的视网膜感受细胞层由纯视杆细胞构成,但其视杆细胞又具有视锥细胞的某些特征。Underwood把壁虎类的视杆细胞分为如下几种:A型单细胞(体积较大)、B型双细胞(由两个粗细不等的细胞成对构     

离子晶体中慢电子-声子相互作用的理論电子的有效質量和基态能量

在离子晶体导带中,一个电子与周围离子振动光譜支的声子互作用的体系是一个極化子(Polaron)。近年来在極化子問題中,对电子有效質量和基态能量的研究工作是較多的。它們可按电子-声子互作用参数α~((*))的大小分为两类:一类以弗留里希的工作为代表,利用微扰方法研究極化子。他們的理論适用于互作用很微弱(a《1)的情况。繼之,李政道用变分法求得了适用于a<6的理論。另一类是以朗道与彼卡     

甲基转移酶修复蛋白质损伤而延长生命

多年来有一个理论述及衰老的原因之一是体内大分子 ,例如蛋白质 ,受损伤的缘故 .研究者也发现甲基转移酶可修复大分子损伤 .1 997年有人创建了缺乏甲基转移酶的小鼠 ,该酶使蛋白质中两个成分 ,即天冬酰胺和天冬氨酸的降解减缓 ,这种小鼠在两个月内会因为疾病发作而死亡 .现在研     

一种基于配体-受体相互作用的活性构象搜寻方法

配体-受体生物大分子相互作用的理论计算研究在生命科学的许多领域中发挥着重要的作用,特别是在设计一个新的药物时,要在合成和药理测试前对其活性进行预测,配体-受体相互作用的理论研究尤为重要.从能量的角度来看,如要寻找到配体-受体结合时     

2000年科技的重大突破

美国《科学》杂志编辑部从浩瀚的宇宙到微小的量子这么庞大的范围内选出九项被科学界公认的重大突破，其中三项属于生命科学，两项属于天文学，两项属于物理学与宇宙学，一项属于化学，一项属于古人类学。这一布局大体反映了当今科学研究的主流趋势。 揭示核糖体的秘密 研究人员在２０００年对细胞中最重要的角色之一──蛋白质工厂（即核糖体），有了更深的认识。每个细胞必须将其２个蛋白质──ＲＮＡ（核糖核酸）亚基精确匹配起来，才能使核糖体这个大分子具备生产蛋白质的能力。面对核糖体如何能以如此惊人的精确性来制造蛋白质，生物学…     

W.V.奎因论分析与综合的区别

W.V.奎因教授在其名著《经验论的两个教条》中所作的论述的目的在于澄清有关逻辑真理的误解。如所周知,奎因教授在这篇文章中的主要论点是否认存在所谓的分析-综合区别。他为此所作的论证是,我们可以把哲学家心目中的所谓分析陈述分为两类,第一类是逻辑真理,例如: 没有一个未婚男子是已婚的。第二类则以下列陈述为范例: 没有一个单身汉是已婚的。这类陈述的特征是能够通过同义词的替换变为逻辑真     

两个东亚钳蝎抑制型昆虫毒素cDNA的克隆及序列分析

蝎在长期的进化过程中逐步形成了一套为生存所需的毒素成分。蝎毒贮存于蝎子尾刺的毒囊内,它不仅是蝎子捕食御敌的必要武器,也是人类用来治疗某些疾病的良药。蝎毒按其作用的对象可分为3类:作用于哺乳动物的神经毒素、作用于甲壳纲类动物的神经毒素和作用于昆虫的神经毒素。这些毒素现已作为有效工具物被广泛地应用于相关离子通道的研究中。     

生物体遗传物质主体的演化现象

长期以来,人们认为RNA只是遗传信息表达过程的中间环节,它主要担负着把遗传信息由DNA传递给蛋白质的使命。由1970年F.H.C.克里克修正的中心法则也可明显地看出在细胞的生命活动中两类生物大分子核酸和蛋白质的联系和分工:核酸的功能是储存和转移遗传信息,指导和控制蛋白质的合成;而蛋白质的主要功能是进行新陈代谢活动和作为细胞     

浙江常山宁国页岩中的新笔石

本文所讨论的笔石材料采自浙江常山城南大坞附近的宁国页岩中。共有7个属23个利和变种,它们在地层上的分布以及其间的演化关系,见表1。这些笔石包括两类:正分枝的多枝笔石,属于均分笔石科(Dichograptidae);少枝的胞管变形的笔石,属于一个新科——中国笔石科(Sinograptidae)。     

封面说明

<正>随着人工化学品的大量生产及广泛使用,相当一部分化学品在多种环境介质中残留,其暴露对人体健康和生态环境造成潜在危害,因此亟需快速有效评估其风险并诠释毒性作用机理.采用分子动力学模拟可快速研究环境污染物与生物大分子受体的相互作用,分析其结合模式、结合自由能,并研究生物大分子在一定时间尺度内的构象变化,能弥补常规实验     

关子Eigen进化方程的注记

Eigen认为在生命起源的化学进化阶段和生物学进化阶段之间有一个生物大分子的自组织阶段。他提出一组唯象方程来描述这个过程中分子的选择和进化:     

CREST:高通量单细胞谱系示踪新工具

<正>细胞谱系是指发育过程中产生的细胞类型及其先后代关系.高等动物的细胞类型多样,在发育、再生、癌变等不同的生命过程中,细胞谱系有不同的组成和变化^[1].研究发育谱系能帮助我们厘清各类细胞所处的发育阶段与功能,对理解相关的发育疾病机制、再生修复机理有着重要的作用.目前的谱系示踪主要可以分为两类:一类是前瞻性示踪,即利用特定的方法,如染料、荧光蛋白、DNA条形码等事先标记某一细胞类群,在一定的时间内追踪标记细胞产生的后代;     

分子动力学模拟在有机污染物毒性作用机制中的应用

分子动力学模拟(molecular dynamics simulations,MD)是一种基于经典牛顿力学方程的分子模拟方法,常用于研究有机化合物、材料及生物大分子体系,可计算各类体系的宏观性质及各种动力学性质.目前MD模拟逐渐用于研究各类环境污染物与生物大分子的相互作用.通过热力学统计分析污染物与生物大分子的结合模式以及配体结合引起的生物大分子构象变化,能在分子水平上探究污染物的毒性作用机理.基于MD模拟的轨迹文件,采用自由能打分方法可评估污染物与各类受体的结合能力,能够筛选具有特定毒性终点的潜在污染物,从而快速、高通量地进行有机污染物的毒性预测和风险评价.本文介绍了MD模拟的基本原理、常用软件,简述了MD模拟的数据准备和模拟过程,强调了MD模拟的重要细节,进而从污染物与受体生物分子作用角度,重点陈述了MD模拟在研究有机污染物与各类转运蛋白、核受体、代谢酶相互作用中的应用,展望了MD模拟在污染物毒性筛选方面的潜在应用,以期该类方法能更好地服务于污染物的毒性风险评估.     

中国人von Willebrand因子基因RFLPs分析

von Willebrand因子(vWF)是一个血浆大分子粘附糖蛋白,在血小板粘附于受损血管壁过程中起重要作用。另外,vWF还作为血浆凝血因子Ⅷ(FⅧ)的载体,防止FⅧ活性降解.vWF基因定位于12 p12—pter,全长约178kb,包含52个外显子。vWF mRNA编码一条由2813氨基酸组成的多肽,其中包含一个信号肽,一个741AA多肽和一个2050AA     

MALDI/MS法研究蛇毒蛋白的分离及分子量测定

基体辅助激光解吸电离质谱法(Matrix assisted laser desorption ionization/Massspectrometry,MALDI/MS)是近年来发展起来的一个最新的质谱学分支,目前已在肽、蛋白质、寡核苷酸、多糖等生物大分子的研究方面取得较大进展.这种方法首先由德国科学家Karas和Hillenkamp建立起来.它的出现对于生物大分子的研究具有重要意义.这种方法具有以下一些特点:(1)使用脉冲激光作为电离手段,由于激光和生物样品分子之间作用的     

"海洋杀手"水母

水母,一种低等腔肠动物,在分类学上属于腔肠动物门钵水母纲.水母和珊瑚虫是近亲,其身体结构十分简单:主要成分是水,有内外两层,两层之间还有一个很厚的中胶层,不但透明,而且有漂浮作用.水母在运动时,利用体内喷水的反作用力前进,远远望去,就像一顶圆伞在水中迅速漂游.水母没有专门的消化器官,只有消化腔,其中轮辐状的导管是运输养料的器官;触手上有刺细胞,里面充满毒液.有些种类水母的触手总长超过了蓝鲸的体长.     

细胞色素b5与细胞色素c的结合

生物大分子之间的结合和识别是生命活动中最基本的过程,研究细胞色素b_5和细胞色素c的结合,有助于认识生物大分子之间的相互作用和生物体中的长程电子转移反应.Mauk等人利用紫外可见差谱研究了细胞色素b_5和细胞色素c之间的相互作用,发现两者形成1:1的蛋白络络合物.计算机模拟结果表明牛肝细胞色素b_5和酵母iso-1-细胞色素c有两种主要的结合方式:一种是细胞色素b_5上的Glu44,Glu48,Asp60和血红素b上的丙酸根依次与细胞色素c上的Lys27,Arg13,Tml 72(trimethyllysine)和Lys79形成盐键;另外一种结合方式是细胞色素b_5上的Glu48,Glu56,Asp60和血红素b丙酸根与细胞色素c上的Arg13(或者Lys 13),Lys 87,Lys 86和Tml 72形成盐键.Rodgers和Sligar用高压法结合定点突变技术研究了牛肝细胞色素b_5和马心细胞色素c之间的结合,证明细胞色素b_5是通过第一种方式与细胞色素c结合,而Glu56并没有参与蛋白间的结合.