鱼类线粒体DNA控制区的结构和进化:以鳑鱼类为例

以鳑鱼类为例,研究了鱼类线粒体DNA控制区的结构和进化规律.识别了终止序列区、中央保守区和保守序列区3个区域.指出扩展终止相关序列(ETAS)的主体是TACAT和它的反向互补序列ATGTA形成的发夹结构.给出了鱼类中若干重要保守序列的普遍形式.研究结果表明,一般情况下,只有一个行使功能的ETAS,但可能会有多个复制的、不行使功能的ETAS存在.鱼类的保守序列CSB2最为保守.线粒体DNA控制区被认为是由各功能单位形成主体框架,主体框架复制产生重复序列,重复序列产生快速变异,这样造成不同类群间线粒体DNA控制区巨大差异.易突变点和二级结构的存在均可能与变异的发生相关.     

鱼类线粒体DNA控制区的结构和进化：以BangPi鱼类为例

以Bang Pi鱼类为例，研究了鱼类线粒体DNA控制区的结构和进化规律。识别了终止序列区、中央保守区和保守序列区3个区域。指出扩展终止相关序列（ETAS）的主体是TACAT和它的反向互补序列ATGTA形成的发夹结构。给出了鱼类中若干重要保守序列的普遍形式。研究结果表明，一般情况下，只有一个行使功能的ETAS，但可能会有多个复制的、不行使功能的ETAS存在。鱼类的保守序列CSB2最为保守。线粒体DNA控制区被认为是由各功能单位形成主体框架，主体框架复制产生重复序列，重复序列产生快速变异，这样造成不同类群间线粒体DNA控制区巨大差异。易突变点和二级结构的存在均可能与变异的发生相关。     

大口胭脂鱼线粒体DNA控制区序列的研究

采用PCR扩增、直接测序的方法得到了大口胭脂鱼线粒体DNA控制区的序列,经过对比分析,其序列全长为920bp,碱基含量分别为：胸腺嘧啶（T）29．8％,胞嘧啶（C）21．6％,腺嘌吟（A）32．4％,鸟嘌呤(G)16．2％,与其它鲤科鱼类相比,胸腺嘧啶含量略低,鸟嘌呤含量略高,其它则相似,成功地识别了终止序列区（nt,1-235处）、中央守区（nt236－566处）和保守序列区(nt．567－920）处,并找到了终止相关的序列ETAS以及保守D(CSB－D）和保守序列1、2、3（CSB1,CSB2,CSB3）,这以中以为将来进行大口胭脂鱼的种群分化研究和资源保护研究提供基础。     

黑线仓鼠与大仓鼠线粒体DNA控制区全序列SNPs分析

以华北地区大仓鼠和黑线仓鼠为研究对象,运用第三代DNA分子标记SNPs(single nucleotide polymorphisms)技术,研究了其线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)全序列的单核苷酸多态性.结果表明:在黑线仓鼠和大仓鼠种群中共检测到11个单倍型,22个多态位点,其中只有2个是颠换,其余都是转换.不同种群的核苷酸多态性不同,种群内的核苷酸多态性小于种群间的核苷酸多态性.线粒体DNA D-loop全序列适合作黑线仓鼠和大仓鼠的核苷酸多态性和遗传进化关系的分析.     

嘉陵江下游黑线姬鼠（Apodernus agrarius）和四川短尾嗣（Anourosorex squamipes）的形态学初步研究

2008年4—10月对嘉陵江下游的黑线姬鼠和四川短尾嗣作了形态学初步研究．结果显示：黑线姬鼠和四川短尾嗣分别在各样点之间存在明显的种群差异．对外形量度进行多重比较,发现合川东岸的黑线姬鼠种群与江北区的种群之间存在差异;而四川短尾嗣在合川西岸与合川东岸的种群之间、沙区西岸与北碚东岸的种群之间差异显著,以上分析通过SPSS13．0软件进行．研究初步说明嘉陵江对黑线姬鼠和四川短尾嗣的种群分布格局有一定的地理隔离作用．     

灰麝鼩与黑线姬鼠消化道解剖初步比较

灰麝鼩（Crocidura attenuata）和黑线姬鼠（Apodemus agrarius）在四川南充地区有相似的生活环境,但食性迥异．本文对二者的消化道进行了初步的比较解剖研究,发现二者存在显著差别：灰麝鼩无盲肠,消化道总长仅为黑线姬鼠的一半,胃壁薄;黑线姬鼠具盲肠,胃壁厚,从外观上可区分为两部分．同时二者口腔中的牙齿、上腭和舌的形态也有较大的差别．这些差异反映了两物种的消化道形态结构是与其食性相适应的．     

林麝线粒体基因组扩增及其序列结构的初步分析(英文)

林麝是我国一级保护动物,广西是其分布的最南缘,但目前境内资源已相当稀少.为了更好地了解这一物种,我们扩增林麝线粒体基因组并对其序列结构进行初步分析.其全序列长16354bp,包含13个蛋白质编码基因,22个转运RNA(transfer RNA,tRNA)基因,2个核糖体RNA(ribosomal RNA,rRNA)基因和一个控制区,各基因的排列顺序和绝大多数哺乳动物是一致的.林麝线粒体基因绝大部分密码子使用典型的脊椎动物模式,但是我们发现2个稀有的启动密码子,其中一个ATA启动ND2基因和ND3基因,另一个ATT启动ND5基因.控制区位于tRNA-Pro和tRNA-Phe基因之间,由924个碱基组成.在控制区,二个延伸终止序列(ETAS)和二个保守"模块"(CSB)被鉴定.轻链复制的起点(OL)由35个碱基组成,位于一个由5个tRNA基因串联组成的区域(WANCY区)内,形成一个茎环结构.线粒体基因组序列结构分析显示,林麝与鹿科动物有更近的亲缘关系.     

麂属动物小麂线粒体DNA文库的建立和序列分析

通过建立麂属动物小麂线粒体DNA文库，鸟枪法测序，我们获得了小麂线粒体基因组全序列的初步信息，这也是国内有关哺乳动物线粒体基因组全序列的首次报道，与其他哺乳动物线粒体基因组全库列的比较研究发现：全长为16354bp的小麂线粒体基因组同样编码13种蛋白、2种rRNA和22种tRNA，除了用于调控线粒体DNA复制和转录的D-Loop区以外，小麂线粒体基因组各基因长度，位置与其他哺乳动物相似，其编码蛋白质区域的rRNA基因与基因他哺乳动物具有很高的同源性，D－Loop区长度和序列的差异是导致各种哺乳动物线粒体差异的主要原因。     

新疆锡伯族人群线粒体DNA的遗传学分析

分析48个锡伯人线粒体DNA高可变Ⅰ区的遗传多态性, 并与已发表的相关人群线粒体DNA数据进行比较. 结果表明, 在48个序列中共检测出43个突变位点, 界定了35种单倍型, 其线粒体DNA1序列多态性为0.982, 核苷酸多态性为0.018, 而其平均核苷酸差异为5.922. 人群比较分析表明, 锡伯人与古代拓跋鲜卑人有最近的亲缘关系, 同时也表现出与中国北方游牧民族有较近的亲缘关系, 推断锡伯人可能是拓跋鲜卑的后裔.     

长耳鸮冬季的捕鼠特点

长耳号鸟越冬期食物的９１．０％为鼠类。所捕食的农田鼠（黑线仓鼠、黑线姬鼠、大仓鼠和棕色田鼠）占５６．８％,居民区鼠类（大家鼠和小家鼠）占３４．２％,体形较小的鼠类（黑线仓鼠、黑线姬鼠、小家鼠和田鼠）占８２．０％,其中田鼠偶尔出现,较大型鼠类（大仓鼠和大家鼠）仅占９．０％;所捕食鼠的年龄多为亚成体（３８．９％）和成体（３９．２％）;所捕食的主要３种鼠（黑线仓鼠、黑线姬鼠和小家鼠）的年龄组成与野外种群的年龄组成一致。１只长耳号鸟平均１ｄ吃１．７９只或５４．３８ｇ鼠。     

黔西北地区农田害鼠调查及防治探讨

1989年1月至1991年12月,作者在贵州西北部9个县境内的各种农田中选择了50个点,广泛调查了农田害鼠的种类、数量、季节数量变动及优势鼠种的繁殖情况等。全年农田鼠类数量的最高峰在9月份;黑线姬鼠和锡金小家鼠的繁殖高峰均在春季的5月和秋季的9月,高山姬鼠在夏季的6—7月。     

四川姬鼠属分类地位的研究及其种系关系的探讨

采用SPSS10.0软件包对姬鼠标本的30个外型及头骨变量进行多统计分析，并从形态学的角度对姬鼠属的分类及其亲缘关系进行探讨分析结果表明四川省存在6种姬鼠，并分属两个亚属；田姬鼠亚属和林姬鼠亚属；其中黑线姬鼠（Apodemus.agrarius）和高山姬鼠（A.chevieri）的亲缘关系很近而进入前者，而大林姬鼠（A.peninsulae）、大耳姬鼠（A.latronum）、短尾类中华姬鼠（A.draco）和长尾类中华姬鼠（A.orestes）4种的亲缘关系很近而并入后者，且方差分析及T-检验表明这6种姬鼠的主要部分外型头骨变量的均值其差异显著，且部分近缘物种为同域分布，同时聚类分析表明在林姬鼠亚属四种姬鼠中以短尾类中华姬鼠、长尾类及中华姬鼠、长尾类中华姬鼠和大林姬鼠3种之间的亲缘关系较近，而大耳姬鼠与前3种之间的亲缘关系较远。     

嘉陵江下游黑线姬鼠(Apodernus agrarius)和四川短尾鼩(Anourosorex squamipes)的形态学初步研究

2008年4-10月对嘉陵江下游的黑线姬鼠和四川短尾鼩作了形态学初步研究.结果显示:黑线姬鼠和四川短尾鼩分别在各样点之间存在明显的种群差异.对外形量度进行多重比较,发现合川东岸的黑线姬鼠种群与江北区的种群之间存在差异;而四川短尾鼩在合川西岸与合川东岸的种群之间、沙区西岸与北碚东岸的种群之间差异显著,以上分析通过SPSS13.0软件进行.研究初步说明嘉陵江对黑线姬鼠和四川短尾鼩的种群分布格局有一定的地理隔离作用.     

东海野生灰鲳mtDNA D-loop序列遗传变异分析

以东海区野生灰鲳背部肌肉的线粒体DNA为模板,采用PCR技术对7个个体的D-loop序列进行了扩增,通过对PCR产物进行双向测序,最终得到了471 bp的核苷酸片断(除去两端部分序列)。用DNAMAN6.0软件进行了排序比较发现,东海野生灰鲳的D-loop序列同源性高达99.48%;用DNASP4.0软件分析得知,7个序列共有6个单倍型(在GenBank登录号:GU970085-GU970087,GU970089-GU970091),在7个个体中,共检测到14个变异位点,包括13个转换和1个颠换位点。运用MEGA4.0软件计算出了不同个体间的遗传距离,并据此构建了MP和NJ系统树。用DNASP4.0软件计算出的多态位点数为14,核苷酸多样性指数和平均核苷酸差异数分别为0.009 71和4.571。研究结果表明,东海野生灰鲳的D-loop序列个体变异程度并不丰富。     

黑线姬鼠、锡金小家鼠和高山姬鼠洞穴结构研究

１９８９～１９９１年间笔者在黔西北地区调查农田鼠害时，共挖掘剖析黑线姬鼠洞穴４８个，锡金小家鼠洞穴２４个，高山姬鼠洞穴９个．这３种鼠类的洞穴基本结对均主要由巢明、明洞和暗洞组成，但无便食结构，也未发现有储粮仓及所储藏的粮食。区别这３种鼠类洞穴结构的主要特点是洞口和洞道的排列位置。     

北京小龙门林场夏季啮齿类的群落结构及其年变化

根据北京师范大学生命科学学院 1984— 1999年的啮齿类的调查和监测资料 ,对该地区的小型啮齿类群落结构及其年变化进行了分析 .共捕获啮齿类动物 9种 ,大林姬鼠 (Apodemusspeciosus)和社鼠 (Rattusconfucianus)是本地的优势种 ,黑线姬鼠 (A .agrarius)、褐家鼠 (Rattusnorvegicus)、小家鼠 (Musmusculus)、大仓鼠 (Cricetulustriton)和棕背 鼠平(Clethrionomysrufocanus)为常见种 .在不同年份之间啮齿类的种群密度具有明显的波动 ,但年际动态周期性不明显 (s <0 5) .总的相对密度与大林姬鼠 (r =0 795,P <0 0 1)、黑线姬鼠 (r =0 74 1,P <0 0 1)和社鼠 (r =0 935,P <0 0 1)的相对密度呈正相关 .阔叶林、居民点与针叶林群落之间的多样性都有明显的差异 (P <0 0 5) ,而群落之间的均匀性无显著差异 (P >0 0 5) .