丝状真菌基因组学研究进展

介绍了真菌,尤其是丝状真菌在基因组学(包括比较基因组学)和功能基因组学(包括转录组学、蛋白质组学、代谢物组学)等研究领域的进展情况。     

医蛭形亚目常见物种系统发育基因组学研究

本研究基于GenBank中10个医蛭形亚目物种及2个近缘外类群的基因组或转录组数据,提取COI、18 S和蛋白编码核基因的直系同源序列（Orthologs）,开展系统发育分析。比对后的COI、18 S和Orthologs序列长度分别为1533、1832、220095 bp。最大似然法和贝叶斯推断法分析显示,基于Orthologs序列构建的系统发育树在几乎所有节点上的支持率都达到100%,明显优于COI和18 S序列得到的结果。研究表明,医蛭科的欧洲医蛭、东方医蛭和侧纹医蛭组成一个单系群,医蛭科的日本医蛭与黄蛭科的宽体金线蛭和尖细金线蛭组成另一单系群,而黄蛭科的马蛭与上述6个物种形成姐妹群。医蛭科的两种牛蛭（菲牛蛭和棒纹牛蛭）组成一个单系群,此单系群与医蛭科的其他物种的遗传关系比马蛭更疏远;山蛭科的洞穴山蛭在10个医蛭形亚目种类中处于最基部位置。本研究阐明了医蛭形亚目常见物种的系统发育关系,为这些物种的资源开发利用和保护提供科学依据。     

酿酒酵母功能基因组学研究进展

随着各种微生物基因组序列信息的积累和测序工作的不断完成,酿酒酵母基因组学研究的重点已由传统的结构基因组学发展到了功能基因组学,并从单一的基因功能研究转向多个或整个基因组系统地去了解真核生物生命活动的本能。对基因组学水平上酿酒酵母功能基因的生物芯片分析,代谢通路和功能图谱,以及比较基因组学研究进行综述。     

基于智能影像基因组学技术的阿尔茨海默病预测进展

 阿尔茨海默病（AD）起病隐匿,目前尚无有效控制病情进展以及治疗的药物或方法。在其发病轻度认知功能障碍阶段早期预测进行干预,则能有效控制其病程。从基于脑影像组学特征的AD早期临床诊断、基于人工智能影像组学技术的AD早期预测两个方面综述了AD的早期诊断与预测研究进展,提出结合多模脑核磁共振影像特征和组学特征,在深度学习的框架下,将影像学和基因组学联系在一起,构造高分类与预测性能的深度学习模型,可为AD早期筛查并干预提供支持。     

药用植物基因组测序及功能基因组学研究进展

由于野生资源缺乏,药用植物主要通过人工种植培育获得.而高通量测序的到来大大加快了该领域研究的进展.通过组学技术研究药用植物的遗传信息及其调控网络,能够完善药用植物繁殖和栽培的技术体系,并更好地阐明药用植物预防、治疗人类疾病的分子机制.综述了药用植物基因组测序以及功能基因挖掘等研究进展,内容涉及基因组结构、非生物胁迫、活...     

海草分子生物学研究进展

分子生物学技术已从模式生物的研究逐渐扩展到海草的研究,为解决海草床衰退问题提供了一种新的思路,有助于阐明海草适应气候变化的分子机制。与模式生物相比,海草的分子生物学研究起步较晚,目前已经进行全基因组测序的海草有两种,分别为大叶藻(Zostera marina)及Zostera muelleri。本文综述海草分子生物学的主要研究进展,并展望了该领域未来的发展方向。     

高通量测序在蜜蜂基因组中的应用及研究进展

[目的]回顾近些年来在蜜蜂基因组研究领域取得的进展,为后续进一步研究提供参考.[方法]检索蜜蜂高通量测序相关文献并归纳总结,获得高通量测序在蜜蜂基因组中的应用和研究进展.[结果]高通量测序主要应用于蜜蜂线粒体基因组、核基因组和转录组3个方面.目前,蜜蜂属(Apis)下所有9个种的线粒体基因组以及6个种的全基因组已被获得...     

单细胞测序技术在植物中的应用研究进展

为了探究单细胞测序技术在植物中的应用,综述了单细胞测序技术发展概况、原理、测序技术流程及其在植物中的应用研究,为今后系统全面地开展植物单细胞测序提供理论依据。     

阿尔茨海默病胰岛素信号通路的研究进展

胰岛素受体高度表达于海马,在大脑正常功能中发挥重要作用。提高脑内胰岛素作用可以增强与海马相关的学习和记忆过程。阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)与脑脊液胰岛素水平降低及脑胰岛素抵抗密切相关,并伴有胰岛素及胰岛素样生长因子受体表达降低,胰岛素受体底物-1的丝氨酸磷酸化增强等。因此,胰岛素信号通路受损可能是导致AD的重要原因。     

基于高通量测序技术的松材线虫研究进展

松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)是松树萎蔫病的病原,严重威胁欧亚等国的松林资源和生态安全。自2011年松材线虫基因组首次公布以来,高通量测序技术成为该病害的重要研究手段之一。笔者从松材线虫的功能基因、非编码RNA、转录表达差异和基因组学等方面综述其致病机理,认为随着高通量测序技术的快速发展,在转录组相关研究方面,可尝试开展空间转录组、单细胞测序等新技术,在染色体基因组的支持下寻找松材线虫中具有潜在调控功能的长链非编码RNA、融合基因和环状RNA等罕见核酸分子,挖掘可能存在的甲基化、RNA编辑、结构变异等未知现象;在基因组学研究方面,可以开展基因家族扩增、大样本全基因组关联分析和数量性状定位等研究,以挖掘与松材线虫致病力和繁殖力等重要性状紧密关联的基因或位点,阐明松材线虫不同种群在进化过程中发生的适应性变化。     

植物功能基因组研究进展

基因组学研究已开始从结构基因组学转向功能基因组学。对功能基因组学研究的重要意义及内容、方法进行了综述，并对植物功能基因的研究进展及应用前景作了介绍。     

阿尔茨海默氏症分子病理学及治疗方法的研究进展

阿尔茨海默氏症是一种神经退行性疾病,是老年人的常见病、多发病,严重危害老年人的身心健康．近10年来,人们对其病因、病理进行了广泛的研究,认为自由基氧化胁迫和蛋白质的错误折叠是最基本的分子病理学机制,Aβ淀粉样沉积和tau蛋白引起的神经元纤维缠结是后的具体表现．综述了近10年对阿尔茨海默氏症的分子病理学研究进展及目前对其进行治疗的中西医方法．     

ApoE4干扰大脑代谢诱发阿尔茨海默病

 阿尔茨海默病（AD）是导致老年人认知障碍的最主要疾病。AD也是主要的一种神经退行性疾病,其中约95%是晚发型AD（LOAD）。目前,LOAD的发病机制仍不清楚,但是,4型载脂蛋白E （ApoE ε4,ApoE4）是已知的最大风险基因。以临床及基础实验结果为证据,探讨了ApoE4导致大脑出现糖脂代谢异常及相关机制。AD患者早期脑内也有糖脂代谢的紊乱,且代谢紊乱进一步加重认知障碍。因此,ApoE导致大脑代谢紊乱,可能促进AD的发生发展。靶向ApoE4改善大脑代谢,可能是AD药物研发的新方向。     

代谢工程和作物改良

基因组学和植物生理生化是通过基因工程改良作物的基础 .借助于这些基础研究 ,通过基因工程调控代谢途径 ,提高了油菜籽粒中的油脂含量和拟南芥种子中的维生素 E活性 ,使水稻的胚乳中能合成维生素A原 ,增加了水稻在碱性土壤中吸收铁的能力 ,展示了代谢工程在定向改良作物中的应用前景