宿州辣椒地方品种分子遗传多样性分析

利用优化的辣椒SRAP—PCR反应体系,研究宿州辣椒地方品种的遗传多样性．从30个引物组合中筛选出条带清晰、多态性好的15个引物组合,共扩增出62条谱带．其中,多态性谱带有40条,多态率为64．5％;不同引物扩增的条带为3～7条,谱带大小范围为100～1000bp．供试品种的遗传相似系数为0．52～1．00之间,当遗传距离D=0．52时,可将27份材料分为两大类．结果表明,宿州辣椒种质资源遗传多样性丰富．     

夏蜡梅SSR引物适用性分析及其在遗传多样性研究中的应用

【目的】筛选适合夏蜡梅(Sinocalycanthus chinensis)遗传多样性分析的SSR(simple sequence repeats)引物并进行遗传多样性分析。【方法】从夏蜡梅转录组数据库组装的125 014条unigene序列中,随机选取了344对SSR引物,以夏蜡梅6个不同种群的DNA为模板,运用聚丙烯酰胺凝胶电泳法进行引物筛选,根据扩增产物带型的丰富度,筛选出具有多态性的SSR引物;挑选扩增带型数在4以上的SSR引物,进一步验证这些引物在夏蜡梅种群间和种群内的适用性;利用已验证的引物对6个夏蜡梅种群的遗传多样性和遗传结构进行分析。【结果】共有148对引物能够扩增出清晰条带,占选取引物总数的43.02%,其中29对引物具有多态性,占扩增总数的19.60%;有15对引物扩增带型数在4以上,这些引物具有更高的多态性。对这15对高多态性引物进一步分析发现,根据扩增的带型数和遗传参数,这些引物均可用于种群间遗传多样性分析;同时,这15对引物可进一步分为3类,所揭示的遗传多样性程度依次降低。在种群内遗传多样性分析时,根据带型数及其分布和遗传参数,第1类、第2类及第3类中的P004和P061在各个种群内扩增的带型数较多且分布较为均匀,具有更高的多态性;而P021、P075、P095、P098、P018等5对引物在部分种群内扩增的带型数相对较少且分布较为集中,多态性相对较低。利用15对引物分析6个种群的遗传多样性得知,夏蜡梅的总基因多样性指数(Ht)为0.625 0,各种群的基因多样性指数为0.251 8~0.400 2,Shannon’s指数(I)为0.419 7~0.668 1,平均基因多样性指数(Hs)为0.3230。【结论】此次实验结果说明夏蜡梅物种水平具有较高的遗传多样性,但各种群内遗传多样性较低。聚类分析将6个种群分为3个分支,且各分支之间遗传距离较远,种群间遗传分化系数(Gst)为0.437,种群内近交系数(Fis)为0.430,种群间基因流(Nm)为0.309 4,基于AMOVA分子方差分析,56%的变异来自种群间,44%的变异来自种群内,这说明夏蜡梅种群间遗传分化显著,种群内存在显著的近交现象,各种群间基因交流受阻。     

SRAP分子标记分析芫花遗传多样性

采用SRAP分子标记对芫花的遗传多样性进行了分析.结果每对引物组合产生8～20条比较清晰的扩增带.10对引物组合共产生473条扩增带.平均每对引物组合产生47.3条.10对引物组合共产生多态性带92条,每对引物组合产生7～14条,平均为9.2条.每对引物组合产生的多态性带的比例为10.9%～29.1%,平均为19.44%.结果表明,SRAP标记多态性还是较高的,可以用于分析芫花的遗传多样性.     

胡卢巴种质资源RAPD遗传多样性分析

在优化随机引物扩增多态性DNA标记（RAPD）反应体系和条件的基础上,利用筛选的多态性引物分析了胡卢巴种质资源的遗传多样性．结果表明,19条RAPD引物显示了40份胡卢巴种质资源的遗传距离为0．02～0．70,来源上变幅从大到小为：宁夏和国外种质间、国外种质间、宁夏种质间、国内其他省份种质间．40份胡卢巴种质资源分为两类,即Ⅰ类包括3份国外种质;Ⅱ类包括37份种质,可大体上分为宁夏、国内其他省份和国外种质3个亚类．     

豇豆SSR标记在豌豆中的可转移性与应用初探

利用豇豆SSR引物筛选在豌豆具通用性的SSR引物。13对豇豆SSR引物中检测出8对引物在豌豆中可扩增,其中5对SSR引物表现出多态性,进而分析11个豌豆品种和5个豇豆品种的遗传多样性与遗传关系。结果表明:平均等位基因数、平均有效等位基因数、平均Shannon指数,在豌豆品种群中分别为2.00、1.64、0.55,豇豆品种群中分别为2.00、1.80、0.53,上述遗传参数反映出供试豌豆品种和豇豆品种具有中等水平的遗传多样性;利用UPGMA聚类分析,能将豌豆品种群和豇豆品种群分为两类,且每个品种群内的各个体之间能进行区分,尤其是两个豌豆品种亚群的聚类结果与其地理来源基本一致。     

利用SRAP分子标记分析栽培稻的遗传多样性

试验在建立优化SRAP-PCR的基础上,分析了9份栽培稻样本的遗传多样性,旨在从基因组编码区水平上更深入了解栽培稻的遗传背景．结果表明：参试的栽培稻材料在110对引物组合中均能得到PCR扩增电泳图谱,共扩增出748种类型的谱带,多态性谱带423种,多态率为56．55％,平均每时引物可以检测到3．8条多态性谱带．遗传多样性分析表明,栽培稻Shannon-weaver多样性指数为0．62,其中籼稻材料多样性指数为0．61,粳稻多样性指数为0．60．聚类分析结果表明,籼粳稻群体问遗传分化较大,遗传差异明显．     

水杉自然居群遗传多样性的RAPD研究

用随机扩增多态性方法对四川、湖南、湖北交界处的２７个水杉样本进行了基因组ＤＮＡ多态性分析．１１个随机引物共获得ＲＡＰＤ谱带１２１条,多态性谱带占５３％．聚类分析结果表明：水杉个体间的遗传距离与这些个体的地理分布相关,即相同产地个体间的遗传距离较小,不同产地个体间的遗传距离较大．与松柏目其它类群相比,水杉居群的遗传多样性程度高于银杉（３２％）,而在所处的大类群中则处于中等水平．初步结果表明,尽管孑遗物种水杉的自然种群的目前分布范围和个体数目非常有限,但是它仍然保持着中度的遗传多样性水平．可推测,孑遗植物的遗传多样性水平具有一定的变异范围     

深圳塘朗山桫椤孑遗种群的遗传分化研究

应用RRPD标记分析了深圳塘朗山桫椤孑遗种群全部57个个体的遗传变异和进化关系。50个引物共检测到171个位点，其中多态位点10个，多态位点比率5．85％。基于基因频率的Shannon多样性指数平均值为0.0165，Nei基因多样度指数平均值为0．0094，表明该种群的遗传多样性水平极低。对Jaccard相似性系数矩阵用UPGMA法进行聚类分析显示，57个个体可分为4个亚群。RAPD谱带表型的主成分分析(PCA)支持聚类分析结果。根据研究结果讨论了种群的管理和保护策略。     

甘薯种质资源亲缘关系SRAP标记分析

利用SRAP标记技术对86份甘薯品种亲缘关系进行了分析,实验选用了30对SRAP引物组合,每个引物组合分别产生10～40个扩增带,30对引物共产生了87个多态性条带,平均每对引物组合产生2.9个多态性条带.在遗传距离（GD）为0.81处,可将86个甘薯品种分为A、B、C、D四类.A类包含77个品种,占全部实验材料的89%.结合材料来源的分析结果表明,四川省育成的甘薯种质资源大多聚在一类,表明我省育成的甘薯品种资源的遗传范围还较为狭窄.     

世界大麦种质资源遗传多样性分析

以来自亚洲、欧洲、北美洲和非洲33个国家和地区的115份大麦微核心种质资源为材料,采用SRAP分子标记技术,通过SRAP引物的筛选扩增、Shannon指数分析、遗传结构分析和聚类分析等进行遗传多样性研究.结果从72个标记中筛选到17对多态性良好的SRAP引物,共产生114个扩增条带.品种间的遗传多态性差异为0.230(em8-me6)～0.581(em7-me2),平均0.430 6.Shannon指数分析显示,来自亚洲和欧洲的大麦品种含有的多态性位点比例最高,具有丰富的多样性.聚类分析将115份大麦种质材料分为A—G共7组,划分结果与材料的地理来源一致,其中A组和G组占总资源量的64.71%.AMOVA分析显示115份材料的遗传差异来自群体内,混合模型分析进一步显示供试样品可分为4类,分别对应亚洲、欧洲等四大洲.