荞麦RAPD指纹图谱的建立及在品种鉴定中的应用

从9个荞麦品种的幼苗叶片提取DNA,使用CTAB和PVP并结合纯化过程中在高盐(N aC l)下沉淀DNA,可除去样品中影响DNA纯度的多酚类化合物和多糖.共使用13个随机引物,扩增的DNA片段大小为3.0K b~0.8 K b.从9个材料的13组RAPD指纹图谱上可以看出甜荞和苦荞的图谱差异很大(相同条带数占总条带数的比例为21%).在13个引物中有10个引物(占全部引物的77%)在甜荞的RAPD图谱上显示了品种间的DNA多态性,而苦荞只有6个引物(占全部引物的46%)产生了这种多态性.从荞麦RAPD指纹图谱上得到的特异带可以作为品种鉴定的分子标记.     

福建6种柚RAPD鉴定分析

以福建省栽培面积较广,果实成熟期不同的渡尾文旦柚、琯溪蜜柚、坪山柚、长泰文旦柚、龙柚、下河蜜柚6种柚为研究对象,用100个10bp的随机引物对6种柚的基因组DNA进行RAPD分析,筛选出能扩增出稳定多态性片段的引物31个,一共扩增出174条片段,其中多态性片段有137个,占78.74%.聚类分析的结果,RAPD标记所反映的6个品种之间的遗传相互关系与传统的分类结果是一致的.     

蜡梅品种的RAPD分析

从200个随机引物中筛选出16个多态性稳定的引物,对38个蜡梅品种进行遗传多样性和亲缘关系RAPD分析.共扩增出154条DNA片段,其中,多态性DNA带98条,占总扩增片段的63.6%.应用Popgene32软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算,并利用UPGMA法构建聚类树状图,把供试的38个蜡梅品种分为7个大类,聚类结果与形态分类结果基本一致.结果表明,RAPD标记可用于蜡梅品种鉴定和亲缘关系探讨.     

基于RAPD的藏马鸡亲缘关系的研究

为了测定7只笼养藏马鸡的亲缘关系,利用随机扩增多态DNA技术对7个个体进行了分析.选用53个10bp的随机引物对每只藏马鸡的基因组DNA进行扩增,获得14个有效引物,并得到226个扩增片段.根据聚类分析所得到的树状图,确定了7只藏马鸡的亲缘关系,证明RAPD可以用来鉴定亲缘关系.     

木通属植物的RAPD研究

以木通属4个种的12个材料为研究对象,用RAPD技术对其进行亲缘关系分析,建立适合木通属植物的RAPD-PCR反应体系,从40个随机引物(10mer)中筛选出5个,对所有供试材料进行扩增,共获得5张DNA指纹图谱,共在52个位点上扩增出条带,平均每个引物扩增10.4个,多态位点43个,占总带数的82.7%. 指纹图谱的直观分析结果表明,1.七叶木通与三叶木通,白木通,五叶木通亲缘关系较远;2.白木通是三叶木通的一个变种, 与其有较近的亲缘关系;3.三叶木通的遗传多样性在湖南、湖北两省的分布上存在的差异很小.     

怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析

采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.     

丁鱼岁遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析

利用RAPD分子标记技术对15个丁鱼岁养殖个体的遗传多样性进行分析.选用20个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增,有16个引物可以扩增出稳定且清晰的条带,其中S103、S104和S105为多态引物.16个引物共扩增出65个DNA位点,片段大小在200~3 000 bp之间,其中多态性位点6个,多态位点比例为9.23%.个体间遗传距离在0~0.067 4之间,平均遗传距离为0.028 6.结果显示,丁鱼岁养殖群体的遗传多样性水平较低.     

不同巢穴尼科巴弓背蚁的RAPD分析

用RAPD技术对尼科巴弓背蚁5个巢穴的DNA样品进行分析,15个RAPD引物共检测到61个位点,每个引物产生2~7个位点,其中23个为多态位点,占37.70%,Nei's基因多样性指数H为0.1220,Shannon多态性信息指数I为0.1858。地域之间遗传相似性系数S的变化在0.8515~0.9485,遗传距离指数D的变化为0.0516~0.1603,用NTSYSpc 2.10软件包中的UPGMA法进行聚类分析。结果表明,5个不同巢穴间的尼科巴弓背蚁亲缘关系与地理距离相吻合。     

不同来源苦楝种质资源遗传多样性的RAPD分析

对来自不同地区的15份苦楝个体用RAPD技术分析其遗传多样性,20个随机引物共扩增出193条重复性好、清晰的位点,其中多态位点共计189个,占97.9%.聚类分析表明:云南保山与四川绵阳种源间的遗传距离最大(0.936),福建永泰与福建建瓯之间的遗传距离最小(0.186).应用UPGMA聚类分析法构建了DNA分子系统树图,为基于DNA分子水平深入探讨苦楝不同种源间的亲缘关系和系统位置奠定了良好的基础,在散生乡土树种遗传多样性研究方面进行了开拓性和有意义的探索.     

中国水仙种质资源的遗传多样性分析

用随机扩增多态DNA（RAPD）标记方法对中国水仙主要栽培品种及不同的生态类型进行了遗传多样性检测。从98个随机引物中筛选出16个有效引物，共扩增出120条DNA带，其中多态位点39个，占32．5％。相对其他作物，中国水仙遗传多样性水平偏低。中国水仙遗传多样性贫乏可能是现有中国水仙品种稀少的重要原因。用UPGMA法对各样品间的Nei氏相似性系数进行聚类分析。结果显示，崇明水仙与漳州水仙亲缘关系十分密切，平潭水仙与漳州水仙亲缘关系相对较远。平潭水仙和崇明水仙各居群内的遗传分化很小，而漳州水仙居群内遗传多样性较为丰富。以栽培品种看，单瓣水仙与重瓣水仙亲缘关系密切，“金三角”与单瓣水仙、重瓣水仙两者的亲缘关系较远。基于研究结果，提出采用新技术引进新种质选育水仙新品种的思路和保护中国水仙资源的重要性。