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相似文献
 共查询到10条相似文献,搜索用时 31 毫秒
1.
由于RNA二级结构表示方法对其功能和相似性的研究具有关键性作用,通过对现有RNA二级结构的各种表示方法进行讨论,重点介绍了点括号图表示法和二级结构平面图文本(CT文件)表示法,给出二者之间的相互转换算法,并通过实例验证了该转换算法准确、有效,可为研究RNA二级结构的相似性提供有效的数据支持.  相似文献   

2.
【目的】细胞类型鉴定是单细胞RNA测序的关键步骤之一,存在单细胞RNA测序数据分类准确率较低及各细胞类型距离特征度量不足的问题。【方法】提出一种基于多相似性损失函数(Multi Similarity Loss, MSL)的大间隔最近邻(Large Margin Nearest Neighbor, LMNN)单细胞分类方法。多相似性损失从多个角度衡量相似性,解决了LMNN算法的三元组损失函数训练样本较小时样本对之间关系利用率不高的问题,从而提升单细胞分类效果。【结果】在胰腺单细胞数据集baron_human和segerstolpe上的实验表明,基于MSL-LMNN的分类准确率高于主要度量学习方法,而且与随机森林结合的准确率达到0.96,较现有单细胞分类方法有所提升。【结论】提出的MSL-LMNN能够准确有效地识别胰腺单细胞测序数据细胞类型,具有一定的应用价值。  相似文献   

3.
针对传统K均值算法中采取的欧氏距离计算相似性的不足,提出一种新的相似性计算方法,并将这种方法与欧氏距离的度量方法进行了比较。在UC I基准数据集上的实验表明,该方法有更稳定的聚类结果,是一种比较有效的聚类度量方法。  相似文献   

4.
针对酵母具有细胞壁的特点,建立了一种简便、快速、有效分离鉴定酵母细胞总RNA的方法,并对三种便于提取酵母细胞总RNA的方法进行比较,所提取的总RNA质量高,可用于进一步分离mRNA,PCR扩增以及do或Northern杂交。  相似文献   

5.
提出了一种将距离和方向因素集成在一起的相似性测度方法。这种集成方法将传统的基于距离的相似性测度法和基于方向的相似性测度法的优点融为一体,使其能够弥补单独采用某一种传统方法可能造成的缺陷。分析比较了新的集成方法与传统的方法的特点和同位相似曲线,以及各种参数、变量对集成相似性测度的影响。最后给出了该领域未来的研究课题。  相似文献   

6.
生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析,也就是研究新的计算机方法,从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识,并将其存储于基因数据库中.而在序列分析中,将未知序列同基因数据库中已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,包括序列的片段测定、拼接,基因的表达分析,以及RNA和蛋白质的结构功能预测.  相似文献   

7.
本文使用属相似性指标和种相似性系数比较分析了鸡足山与国内七个山体苔藓植物区系的亲缘关系,通过比较说明,在苔藓植物区系的比较分析研究中,应用施姆凯维的属相似性指标是合适的,应用它进行区系比较研究比用种相似性系数更为客观。  相似文献   

8.
提供了一种通过声学的相似性来检索音频文件的方法。该方法对于相似性的度量是基于出自一个矢量量化器的统计表,而不是匹配简单的基音或谱特点,因而具有比较高的检索效率。  相似文献   

9.
日本沼虾血淋巴RNA提取方法的改进   总被引:1,自引:0,他引:1  
介绍了一种提取日本沼虾(Macrobrachium nipponensis)血淋巴RNA的改进方法.针对日本沼虾血淋巴中RNA含量较少,易被降解的问题,比较了常规的血淋巴RNA提取方法和改进后的RNA血淋巴提取方法,并进行了血淋巴酚氧化酶的扩增.结果表明,用改进的方法提取的RNA降解少,含量多,纯度高,可用于进一步分子生物学的操作,有着重要的实际意义.  相似文献   

10.
不同植物细胞RNA提取的适宜方法各不相同.本实验分析、比较了QIAGEN试剂盒法和西曲溴铵(CTAB)法用于赤潮藻细胞总RNA提取的情况.结果显示,两种方法均可获得高质量的总RNA.比较而言,CTAB法比QIAGEN试剂盒更可取,适合藻细胞RNA的大量提取.  相似文献   

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