核苷酸序列的关联谱

由于中性突变，核酸序列中包含了大量噪声，研究了如何从噪声背景中提取有用信息的问题。定义了关联函数和关联谱，得到了一些关联谱的定理。发现了每一序列的关联谱中存在很多共振峰，类似于原子分子的线状光谱。这些谱线具有标识核苷酸序列的意义。编码序列有强的１／３共振，内含子则没有这条谱线。碱基插入如缺失也会对谱线产生明显影响。     

CpG序列的免疫激活作用研究进展(综述)

CpG序列又名免疫刺激DNA序列(ISS)，可激活多种免疫效应细胞，且无免疫原性，不会引起自身免疫疾病，具有很高的实用价值，在疾病的防治研究中有着广阔的应用前景．本文就CpG序列免疫激活作用的发现、免疫激活机理，以及该序列在疫苗和疾病治疗中的应用作一综述．     

牦牛核苷酸序列资源的调查

目的了解牦牛核苷酸序列的资源状况,为今后的相关选题和研究提供重要参考.方法根据GenBank的序列记录,从登录号、记录名称、序列长度、DNA/mRNA、接受日期、完整/不完整编码区序列、递交机构7个项目进行统计,分析数据量和增长率、数据的递交机构、覆盖的基因和区域、包含完整CDS的记录4个方面的情况.结果从1995年至2005年,共有19个机构递交了相关序列,总碱基数达160321 bp,这些序列覆盖了65种不同基因或区域.     

HDV抗原编码区核苷酸序列的定量分析

目的：定量分析12株HDV抗原编码区核苷酸序列。方法：运用元间理论。结果：σ≡[σ]（σ）。结论：在HDV抗原编码区281~320位点内,1A型的中国大陆株与台湾株比较变异较大;1B型的中国大陆株与美国－1株比较变异较小。     

核苷酸序列的有序片段和分子进化

定义了核苷酸序列的有序片段（Ｘ１，Ｘ２…Ｘｋ）ｎ，Ｘｉ表示碱基的嘌呤嘧啶分类或强弱健分类，ｎ为重复次数，通过统计分析６．８Ｍｂｐ资料找出全部ｋ＝２，３的有序片段，发现若干有序片段的含量具有较好的进化相关性。     

BmNPV半胱氨酸蛋白酶基因的核苷酸序列研究

对家蚕核型多角体病毒苏州株（BmNPVsu）半胺氨酸蛋白酶基因（CP）的序列分析表明，该基因读码框为972个核苷酸，编码323个氨。同源性分析表明，BmNPVsu CP的氨基酸序列与不同来源的木瓜蛋白酶超家庭的CP具有较高的同源性，特别与Trpanosomabrucei的CP具有较高的一致性，达32％。在组织蛋白酶B、H、L、S以及木瓜蛋白酶的36个保守氨基酸残基中有31种出现在BmNPUsu的CP中，BmNPVsuCP同其他杆状病毒CP一样，可看作木瓜蛋白酶超家庭成员。     

一种基于核苷酸二联体的DNA序列编码规则

序列比较的基本任务有:(1)对于两条长度相近的序列相似,找出序列的差别;(2)判断一条序列的前缀与另一条序列的后缀相似;(3)判断一条序列是否是另一条序列的子序列;(4)判断两条序列中是否有非常相似的子序列.对核苷酸二联体给出DNA序列一种编码规则,利用异或操作进行序列比较.     

2株甲型肝炎病毒蛋白酶2A核苷酸序列的测定与比较

从甲型肝炎病毒２个不同株感染的ＫＭＢ１７细胞中提取总ＲＮＡ,经ＲＴ－ＰＣＲ特异性扩增出此２毒株病毒蛋白２Ａ基因,将２个２Ａ基因克隆到ｐＧＥＭ－Ｔ载体上,经ＤＮＡ序列测定,得到２个２Ａ基因的核心苷酸序列,序列比较发现它们及与ＨＡＶ野毒株相对应序列有突变存在,Ｈ２株与ＨＭ１７５相比有一个点突变,同源性为９９．７２％;与ＨＭ１７５比较,Ｈ２株和Ｌ８株第３１９７位核苷酸均由Ａ突变为Ｇ,相应的氨基酸由丝氨酸     

猪瘟病毒HCLV株E2核苷酸序列与结构分析

用ＲＴ－ＰＣＲ技术从ＣＳＦＶ ＨＣＬＶ株Ｆ４８２代感染兔脾的细胞总ＲＮＡ中分段扩增出ＣＳＦＶ Ｅ２基因特异的３个部分重叠的ＤＮＡ片段,并将之分别克隆到ｐＧＥＭ－Ｔ载体上,经核苷酸序列测定和片段重叠完成了包含Ｅ２全长基因的１１４４ｂｐ序列的测定,其ＧＣ含量为４９．０％,核苷酸序列与国外报道的各株病毒的Ｅ２基因同源性分别不８３．５％＿９７．５％．     

CpG ODN增强rHBsAg免疫小鼠抗体产生及淋巴细胞增殖效应

目的：探讨合成含CpG基序的寡核苷酸（CpG ODN）对重组乙型肝炎表面抗原（rHBsAg ）增强小鼠特异性抗体产生及淋巴细胞增殖反应的效应.方法：采用BaIb/c小鼠作为免疫实验动物,经后腿胫骨前肌免疫2次,ELISA法检测血清乙型肝炎表面抗体（抗-HBs）效价;3H-TdR掺入法测定淋巴细胞增殖反应.结果：加CpG ODN组的抗-HBs效价较rHBsAg组明显增高,且维持时间长;淋巴细胞增殖反应显著增强.结论：CpG ODN对小鼠抗-HBs产生具有明显的增强作用,且可以有效刺激小鼠淋巴细胞的增殖反应.     

CpG ODN对初生仔猪外周血CD4+和CD8+T淋巴细胞的影响

以猪伪狂犬病毒为模式病毒,研究了CpG ODN对仔猪外周血中CD4^＋,CD8^＋T淋巴细胞的影响．实验结果表明：疫苗组初生仔猪血液中CD4^＋／CD8^＋T淋巴细胞比例随年龄的增加逐渐降低,而CpG ODN能有效抑制其降低（P〈0．05）;CpG ODN的使用也可以阻止伪狂犬病毒导致的血液中CD4^＋T淋巴细胞比例的降低;联合免疫CpG ODN和猪伪狂犬病毒活疫苗,可以诱导初生仔猪血清中猪伪狂犬病毒特异性抗体迅速产生并达到较高的水平（P〈0．05）;这表明CpG ODN能显著增强动物的免疫应答能力．     

含CpG motifs的乙肝表面抗原载体的构建及表达

构建了编码乙肝表面抗原中蛋白的卡那霉素抗性真核表达质粒pVAX-CpGS2S，其中通过PCR克隆了若干CpG motifs到质粒载体中。经酶切鉴定和测序正确后将重组质粒体外转染COS7细胞，ELISA法检测上清液中的HBsAg呈阳性，说明重组质粒pVAX-CpGS2S在体外能够有效表达HBsAg，为探讨CpG motifs克隆入DNA疫苗载体后对体内免疫反应的影响打下基础。     

交接配线式ODN结构的研究

针对光纤到户（FTTH：Fiber To The Home）网络建设中,在接入用户不确定条件下的配线结构选择问题,通过定性和定量的分析方法,对直接配线式ODN(Optical DistributionNetwork)结构与交接配线式ODN结构进行比较。结果表明,交接配线式ODN结构具有接入稳定、覆盖范围大和扩容灵活的优点,适宜在竞争的电信市场环境中应用,对FTTH的大规模工程建设具有一定的借鉴意义。     

Predicted methylation landscape of all CpG islands on the human genome

CpG island methylation plays important role in various biological processes. To investigate methylation landscape of all CpG islands on the human genome, we develop a model for predicting the CpG island methylation status. This model outperforms other existing methods. We apply the model on the whole human genome and predict the landscape of DNA methylation of all CpG islands. Based on the methylation profile, we find that about 31% of CpG islands are methylation-prone and CpG islands located in promoter regions are seldom methylated. There is no significant difference in the CpG island methylation level between R and G bands among the chromosomes. The occupancy of RNA polymerase II is significantly higher in methylation-resistant promoter CpG islands, indicating that genes with such promoter CpG islands tend to be more active.     

子宫颈癌抑癌基因P16第一外显子CpG岛异常甲基化

利用限制性核酸内切酶-PCR方法分析33例肿瘤组织和15例正常组织抑癌基因p16第一外显子SacⅡ和SmaⅠ酶切位点甲基化,应用SPSS软件进行统计分析。结果显示,18例子宫颈癌在抑癌基因p16第一外显子SacⅡ位点甲基化,8例子宫颈癌在SmaⅠ位点甲基化。正常组织仅有两例在抑癌基因p16第一外显子SacⅡ位点甲基化,正常组织在SmaⅠ位点没有甲基化。另外,抑癌基因p16第一外显子SacⅡ和SmaⅠ酶切位点甲基化易发生在肿瘤的早期。抑癌基因p16第一外显子SacⅡ和SmaⅠ酶切位点甲基化与子宫颈癌相关。     

CpG DNA enhances the immune responses elicited by the DNA vaccine against foot-and-mouth disease virus in guinea pigs

CpG DNA is DNA sequence that has immune stimulatory effects. Several lines of investigation over the past few years indicate that CpG DNA plays an important role in the induction of immune responses to DNA vaccines. In this study, CpG DNA-containing synthetic oligodeoxynucleotide (CpG-ODN) was cloned into the eukaryotic expression plasmid encoding a fusion protein containing b- galactosidase from E. coli and immunogenic epitopes of foot- and-mouth disease virus (FMDV) type O, and the immune responses induced by the plasmid were assayed. The results showed that guinea pigs immunized with the recombinant plasmid containing CpG-ODN generated a higher level of FMDV-neutralizing antibody and a stronger T cell proliferative response and protection against viral challenge than those receiving the plasmid containing no CpG-ODN. Our study demonstrated that it is an effective route to enhance the efficacy of DNA vaccines by inserting exogenous CpG DNA into the plasmids, and the DNA vaccine developed here is a promising candidate to prevent FMDV infection.     

光纤网络哑资源智能检测与清查方法

ODN网络是FTTH网络中的重要组成部分,其质量好坏直接关系到客户使用宽带网络的体验。为了对哑资源进行高效精准管理,改善网络质量,提升宽带业务开通效率,降低维护成本,文中设计优化了哑资源智能检测及清查系统。该系统基于深度学习中的YOLOX算法,设计改进提出SGDMN优化器,该优化器能有效抑制振荡并且在加速训练的同时对梯度进行校正,以此对参数进行更新;同时对数据增强方式进行优化,在不脱离真实场景的前提下选择数据增强方式,以此实现对分光器、尾纤、标签、二维码等关键信息进行目标检测,进行分类标识,维护人员可基于这些关键信息配合资管系统信息完成哑资源清查。通过其他经典目标识别算法进行对比实验,结果表明改进后的YOLOX算法精度更高,满足哑资源智能检测及清查实际工程需求。     

宽间隔跳频伪码序列设计及其性能检验

介绍了跳频伪码序列的产生，进行了非线性变换来增加保密性，宽间隔处理完成后，组建跳频系统，并对此 组网系统进行了一系列的指标验证，性能检测，得出了由RS码与修正的对偶频带法结合的方法产生的宽间隔调频 序列的性能是比较优良的，符合跳频组网的性能指标的结论。     

宽间隔跳频伪码序列设计及其性能检验

介绍了跳频伪码序列的产生，进行了非线性变换来增加保密性，宽间隔处理完成后，组建跳频系统，并对此组网系统进行了一系列的指标验证，性能检测，得出了由RS码与修正的对偶频带法结合的方法产生的宽间隔调频序列的性能是比较优良的，符合跳频组网的性能指标的结论。