论蛋白质分子的构型与构象——(Ⅱ)多肽链构象的一般原则

本文根据立体化学的基本原理和IUPAC——IUB的有关规定,讨论了多肽链构象的一般原则;并给出多肽链构象的描述方法;对典型构象图的真实性和精确化的某些问题作了阐明。     

构型与构象概念的探讨

对立化学中构型和构象两个概念进行了比较，归纳人出两者的异同及联系，对构型异构体和构象异构体的判别做了简单的介绍。     

构型与构象概念的探讨

对立体化学中构型和构象两个概念进行了比较，归纳出两者的异同及联系．对构型异构体和构象异构体的差别做了简单的介绍     

构造、构型与构象辩析

构造、构型和构象都是表征分子结构的，其中构造是在二维平面上的描述分子结构的，而构型和构象是在三维立体空间描述分子结构的。它们是有机立体化学教学中易混淆的三个概念，尤其是构型和构象，两者之间划不出明显的界线。本文是笔者根据自己多年来的教学体会，对构造、...     

1,4-二氟丁二烯3种构型构象内转换过程的DFT研究

采用DensityFunctionalTheory(DFT)理论方法对 1,4 二氟丁二烯 (DFBD) 3种构型分子构象内转换过程的机理进行了研究 .用QST2方法找到构象内转化过程的过渡态 ,并通过内禀反应坐标 (IRC)计算加以论证 .计算结果表明 ,cis ,cis DFBD ,cis ,trans DFBD和trans ,trans DFBD3种构型分子构象内转换过程的势垒分别为 7.5 7,6 .6 0和 5 .86 (× 4 .19J·mol- 1)     

论蛋白质分子的构型与构象——(Ⅲ)多肽链构象转换的数学模型

本文叙述了多肽链构象状态分布的函数表示法;着重讨论了同聚物多肽链的螺旋——无规链转换的Zimm—Bragg统计力学模型以及Zimm—Bragg参数a和s;并将该模型与有关的实验数据作了比较。     

亚甲二醇二硝酸酯构型和电子结构的ab initio研究

采用量子化学中的从头计算（ａｂｉｎｉｔｉｏ）方法，在ＨＦ／３－２１Ｇ和ＨＦ／６－３１Ｇ＊水平上分别计算研究了亚甲二醇二硝酸酯（ＭＧＤＮ）的旋转构象和电子结构，计算所得ＭＧＤＮ绕Ｃ—Ｏ键旋转的能垒较低（约６ｋＪ／ｍｏｌ），其平面构象的能量最高．能量最低的构象（亦即最稳定构型或平衡几何构型）的２个酯基均绕Ｃ—Ｏ键旋转７７．４°．不同构型的电荷分布差异较小．     

确定楔形式手性分子构型的简易方法

在判别手性分子的R,S构型时,对于用楔形式表示的手性分子若最小基位于楔形虚线上,在纸平面上操作所得结果与实际构型一致;若最小基位于楔形实线上则所得结果与实际构型相反．这是因为前者操作者所在位置与IUPAC规定位置一致,而后者操作者与规定位置的观察者相面对．这一方法具有准确,方便和快捷等优点．     

分子构象变换与电磁辐射

讨论了分子构象与电磁场的相互作用,建立了电磁辐射下分子构象变换的量子理论。据此可以解释活体细胞(大肠杆菌酵母菌)生长率对于微波电磁辐射的频率依赖关系。生物体内蛋白质和核酸分子的构象变换对于实现生物功能具有重要意义。已知很多构象变换皆与分子和电磁场的作用有关。例如,视紫红质吸收可见光后,11—顺视黄醛转变成全一反视黄醛,这一构象变换是视觉光化学的基础;生物膜中构成离子通道的蛋白分子在膜电位和离子流的作用下产生构象变换,是通道和闸门开关的物理基础;近年一些实验发现在微波电磁场作用下大肠杆菌、酵母菌等的生长率表现出极有兴趣的频率依赖,有人把这个实验结果和Fr(?)hlich态联系起来,我们认为细胞复制过程中要经过大分子的构象交换,而上述实验则可用电磁辐照下分子构象的跃迁来解释。本文将对分子构象与电磁场的相互作用作一初步讨论,着重于建立电磁辐射下分子构象变换的量子理论。     

一种确定R·S构型的方法

<正> 对于含有手性碳原子化合物的构型命名方法,是基础有机化学教学中的一个重要内容.一九七○年以来,国内外教材中均采用了IUPAC所建议的R/S构型命名体系.一般来说,学生在掌握顺序规则和R/S命名原则方面并无困难.但是当随意写出二个化合物的Fischer投影式以后,如何能快速,准确地标出各个手性碳原子的R/S构型,或根据标明了R/S构型的命名名称,如何快速写出该分子的Fischer投影式,则就有困难了.本文总结出一种快速确定手性碳原子R/S构型命名方法,收到了良好的效果.     

确定手性分子R/S构型的简易方法

针对有机化合物分子楔形式及环状结构式中手性碳原子构型难以快速、准确判断的问题,介绍一种根据最低次序基团所处楔形式中位置的不同,通过在纸平面上直接操作的方法,方便快捷地确定出手性碳原子的构型.并根据IUPAC命名原则,阐明了该方法的可靠性,保证了该类结构式构型判断的准确性.     

视觉光化学过程中的构象电子跃迁

本文应用构象电子跃迁理论讨论了视觉光化学过程中的构象电子跃迁,证明了维生素A从All—Trans构象到11—cis构象的跃迁几率大于到9—cis构象的跃迁几率2.8倍,与实验及自然界前者优于后者较好地符合。     

构象—电子场与生物分子统计力学

本文对构象—电子场的概念和理论做了进一步的讨论,研究了构象—电子场的能谱和配分函数,建立了有限温度下分子构象—电子系统的统计理论,并对生物分子系统的可能应用做了初步讨论,着重分析了合作效应。     

天然产物绝对构型的测定

确定手性分子的绝对构型对了解手性分子在生物体系中的功能有非常重要的意义。手性光学法和核磁共振法为确定天然产物绝对构型和构象的有力工具，本文对近几年来这两种研究方法在天然产物绝对构型研究中的应用进行了综述。     

视黄醛分子光致构象跃迁

本文应用罗辽复提出的构象电子场理论,讨论了视黄醛分子的光致构象跃迁。计算得到的结果表明,视黄醛分子从all-trans构象到1l—cis构象的跃迁几率大于到9—cis构象的跃迁几率,两个几率的比值:10<ω_(11)/ω_9<100。与实验事实和自然界前者优于后者的事实较好地符合。     

邻二氮苯与水复合物构型的理论研究

报道了邻二氮苯与水形成复合物的理论研究结果．把复合物看作一个超分子，运用Gaussian94量子化学程序包．在MP2／6—31G(d)基组水平上进行从头计算．探讨复合物的稳定性，研究施体与受体间的电荷转移及几何参数变化等规律．结果表明．邻二氮苯与水可形成稳定的分子间弱作用复合物，存在4种独立可区分的构象．但无论从稳定性、电荷转移．还是几何构型来说．都是以平面单氢键顺式构象为最好．形成复合物的过程包含着电荷转移。     

人参多肽最低构象能计算分析

本文采用黄金分割法优化初始构象,运行ECEPP/2程序计算得到人参十四肽最低构象能为467.582KJ/mol;根据计算的原子坐标绘制的分子结构图表明最低构象能下的人参十四肽构象由β—折叠肽段及α—螺旋肽段构成.     

用次序规则命名几类有机化合物的绝对构型

为了解决旋光异构体构型命名中的问题,早在1951年,R.S.Cahn和C.K.Ingold就提出了一个可以普遍使用的旋光异构体绝对构型的命名法——次序规则(sequencerule)。次序规则本身是一种按优先次序排列原子或原子团的方法。这个方法提出后,经过修改和补充,1970年已为国际纯化学和应用化学联合会(IUPAC)所正式采用。目前,次序规则     

基于量子化学方法研究杯[4]芳烃4种构象与苯二酚异构体的相互作用

采用量子化学方法,构建了4种构象的杯[4]芳烃(Cx4)分别与邻苯二酚、间苯二酚、对苯二酚的构型,采用DFT-B3LYP/STO-3G*基组对构型进行了优化,得到了最优化的超分子构型,通过频率计算得到了超分子相互作用的稳定化能和吉布斯自由能,并对结果进行了讨论,对杯芳烃固定相的研究有很好的指导意义.     

两种简便易行的手性中心构型命名法——“正反命名法”和“数字命名法”

<正> 立体化学是当代有机化学的一个不可缺少的基本组成部分,命名手性中心的构型则是立体化学教学中一项十分重要的基础训练。命名手性中心的构型是一种用符号(字母)代表化合物立体结构的方法。近年来,国内外普遍采用 IUPAC 推荐的 R/C 命名系统。这种系统