水稻早熟基因显性抑制基因的遗传分析和分子标记定位

将明恢63，9311，IR68，献国和BG1639等5个迟热水稻品种与早籼核不育系6442S—7杂交，对F1，F2代以及三交F1群体进行抽穗期遗传分析．结果表明，9311，IR68，献国和BG1639等4个迟熟品种含有1对等位的显性抑制基因，可部分地抑制6442S—7显性早熟基因的表达．以6442S—7∥明恢63／9311三交F1群体为定位群体，利用微卫星标记将该抑制基因定位于水稻第8染色体短臂上．该抑制基因命名为Su—Ef-cd(t)，并认为该基因对于利用6442S—7早熟基因来培育不同熟期的早熟和中早熟品种具有重要意义．     

应用地高辛标记的PCR-ELISA技术快速检测转基因水稻

应用地高辛标记的PcR—ELISA(Dig-PcR—ELISA)技术进行转基因水稻检测研究。针对转基因水稻中普遍存在的花椰菜花叶病毒(CaMV)35S启动子(p35S)、胭脂碱合成酶(NOS)终止子(Thos)，筛选标记潮霉素磷酸转移酶基因(hpt,hph)、β—葡萄糖苷酸酶基因(gus)、抗草丁膦除草剂基因(bar)，建立Dig—PcR—ELISA检测方法；能进行半定量检测，敏感性试验表明，Dig—ELISA检测比常规电泳检测可提高敏感性达1000倍，可检测含量达0．1％的GM0样品。全过程可在24h内完成。     

地衣中共生念珠藻多拷贝序列的初步分析

地衣是一类菌和藻的共生植物．本文选用共生念珠藻为研究材料，测定了其ITS（16S rDNA至23S rDNA基因间隔区）序列，结果表明地衣中共生念珠藻ITS基因存在着多拷贝现象，在所得的四条谱带中，前三条和自由生长的念珠藻一样，另一条约为920bp，是最长的谱带．序列分析结果显示，在共生念珠藻中，各拷贝之间的ITS序列在结构和碱基组成上都存在着差异，其中ITS—S中仅包含tRNA^-Ala基因，在ITS—L中包含tRNA^-Ala和tRNA^-Iie，这一现象说明各拷贝之间在分子进化上存在着不同步现象．虽然许多工作还在进一步的探讨中，我们初步认为这种多拷贝的形成是由于不等交换产生的．     

水稻白叶枯抗性基因Xα-min（t）的抗谱鉴定及其分子标记的筛选

利用来自11个国家的34个水稻白叶枯病菌菌株，以高感品种IR24、含有已克隆的抗白叶枯病基因Xα2的品系C64(IRBB21)、中花11和日本晴4个水稻品种作为参照，对一个含有来自小粒野生稻(0ryza minuta)的抗白叶枯病基因Xα—min(t)的渐渗品系(introgression line)78-15进行了抗谱鉴定。结果表明，Xα—min(t)是一个广谱、高抗的白叶枯病抗性基因。同时，以IR24和78—15为亲本进行杂交，并采用分离群体分组分析法(BSA)、随机引物扩增多态性DNA(RAPD)和序列特异性扩增区(SCAR)筛选与Xα—min(t)连锁的分子标记。共筛选了800个购自Operon公司的随机引物，其中有2个引物，BE05和BE06，可扩增出与Xα—min(t)连锁的RAPD标记BE05 300和BE06 1400。对这两个DNA片段克隆并测序，根据两端序列设计了两对长度为21～24bp的特异引物扩增供试材料，其中一个RAPD标记可转化成稳定、重复性好的SCAR标记ScBE05 300。用ScBE05 300和BE06 1400标记分别对IR24和78—15的杂交F2代948和719个单株进行的连锁分析表明，这两个标记与Xα—min(t)的连锁距离分别为2．2和3．7cM，并位于Xα—min(t)的同一侧。这些结果为Xα—min(t)的精细物理图谱的构建奠定了基础。     

转人Cu,Zn-SOD基因马铃薯的研究

采用RT—PCR技术从人肝总RNA中分离扩增了490bp的人铜锌超氧化物歧化酶(hCM，Zn—SOD)基因的cDNA序列，进行了序列测定，结果和文献报道的一致；构建了CaMv35S启动子驱动hCu，Zn—SOD基因的植物表达载体PBICuSOD；用三亲交配法将重组质粒PBICuSOD转化到农杆菌LBA4404，转化马铃薯得到转基因植株。PCR和Southern—blot分析证明，hCu，Zn—SOD基因巳整合到马铃薯基因组中。Western blot分析表明，hCu，Zn—SOD基因在转基因马铃薯植株中得到表达。用NBT光还原法测定转基因马铃薯植株中的SOD酶活力，叶的总酶活为1066．6U／g(湿重，下同)，块茎的总酶活为10llU／g。     

水稻OsICK1基因克隆及其序列分析

细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂（ICK）是一种能够影响细胞生长和发育的重要调控蛋白．以水稻（9311）为材料，利用RT-PCR技术，扩增获得了1个新的可能为水稻细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂的基因，命名为OsICK1．核苷酸序列分析表明，该基因的开放阅读框为585bp，编码194个氨基酸．与Genbank中预测的水稻ICK基因序列（NM_196964）比对，两者同源性为79．84％；氨基酸序列分析表明，该基因氨基酸序列3＇端附近存在植物ICK所固有的保守序列，与玉米ICK1保守序列的同源性高达95．5％．     

中国明对虾与5种虾类线粒体16S rRNA和COI基因片段的序列比较及其系统学初步研究

采用PCR扩增和序列测定等技术,对中国明对虾（Fennerpenaeus chinem如）线粒体DNA16S rRNA和细胞色素氧化酶I（COI）基因片段进行了初步研究,分别得到16S rRNA和COI 2个基因片段的碱基序列,其中16S rRNA基因片段的大小为515bp,碱基A＋T,G＋C的组成分别为66．47％和33．53％;COI基因片段的大小为472bp,碱基A＋T,G＋C的组成分别为62．50％和37．29％．在2种基因片段中,AT的组成明显高于GC的组成,这与果蝇、虾类、蟹类等无脊椎动物的16S rRNA和COI基因片段的研究结果相似．通过对中国明对虾16S rRNA和COI 2个基因片段遗传特征的研究,16S rRNA只有8处核苷酸的碱基在4个群体间表现出差异,COI基因片段中共检测出24个多态性核苷酸位点,其种内变异较低。另外,将本研究所得序列与GenBank中对虾科5个种的16S rRNA基因片段序列进行比较后,发现其聚类关系与传统分类相一致．     

浮萍植物中一个衰老下调基因的初步鉴定

本报道对一个衰老下调基因的鉴定．从绿色和正在衰老的紫萍叶状体组织中分别提取总RNA，然后使用一个oligo—dT引物进行逆转录合成cDNA.cDNA用oligo—dT和简并引物进行PCR扩增，然后进行琼脂糖凝胶电泳．电泳后发现，一条cDNA带存在于由绿色组织而不存在于由正在衰老的组织所得到的样品中．将这一cDNA回收，克隆进T—vector并且进行了测序．Northern blot分析表明，该cDNA对应基因的表达受衰老调节而减少．根据第一个cDNA序列设计了一个特异性引物，进行RT-PCR扩增，并且克隆到另外一个部分cDNA．测序结果表明，第二个克隆具有与第一个cDNA相重叠的40bp的片段．将第一个cDNA序列与删去40bp重叠区的第二个cDNA序列连接，我们得到一个322个核苷酸的cDNA3'端部分序列．用BLASTN程序将该序列翻译后与NCBI non—redundant database中已知的蛋白进行比较，结果表明所克隆的cDNA代表的基因与光呼吸途径的丝氨酸-乙醛酸氨基转移酶编码基因有很高的相似性．     

水稻nmads 1基因的序列测定与结构分析

用PCR对6个水稻基因组BAC克隆进行了筛选，得到了水稻nmads1基因2933bp的序列，通过与mmads1基因的cDNA序列比较，发现nmads1基因含6个内含子和6个外显子，5′非编码区有2个TATA盒及1个Car G类似序列。     

水稻RSSG8基因启动子与GUS融合基因的构建及在烟草中的瞬间表达

使用染色体步移(Genome walking)法，从籼稻(Oryza sativa subsp．indica)桂朝2号基因组中克隆到长度为471bp的水稻精细胞优势表达基因RSSG8的启动子片段R8PN，并进行了全序列测定和分析．该段序列中含有3个CAAT-box，6个Gobox和多种植物顺式作用元件，但没有发现典型的TATA-box，推测为一种特殊的启动子结构，为了鉴定RSSG8基因的基本启动子元件，将二条长度不同的5’端侧翼区缺失体(分别长471bp，260bp)定向插入载体pBI121中，取代原有的CaMV 35S启动子，构了驱动报告基因GUS的植物表达载体pRGUS1，pRGUS2，通过农杆菌介导的瞬时表达法转化烟草叶片和花粉，快速鉴定启动子片段中起关键作用的区域，结果显示两个缺失片段都能启动GUS的表达，可以初步判定这两个片段具有启动子功能。     

水稻光温敏雄性不育基因连锁标记的分离与鉴定

两系法杂交稻是一种利用水稻杂种优势的重要途径，主要依据水稻光温敏雄性不育系在不同条件下的育性转换用于配制杂交种．以培矮64S(PTGMS)与明恢63杂种自交的F2代为供试材料，采用随机放大多态性DNA(RAPD)技术分离与培矮64S的PTGMS基因连锁的分子标记．在F2代2个分别代表可育和不育的群体以及亲本株系中，采用100个RAPD引物扩放基因组DNA筛选多态性DNA片段．RAPD引物S8产生的DNA片段中，除重复顺序外，有一个长度为0．85kb片段为单拷贝．分子杂交表明，这一单拷贝标记与培矮64S的PTGMS基因连锁．     

黄瓜全雌性状相关的RAPD分子标记筛选

用CTAB法提取黄瓜总基因组DNA，采用RAPD技术探寻与黄瓜全雌性相关的分子标记.共筛选39条随机引物，其中有12条引物显示多态性.进一步筛选表明：S10引物能在全雌系黄瓜中扩增出一条约2000 bp的稳定、清晰的特异条带，而在雌雄同株的单株中不存在.经回收、克隆并测序，获得全长2003 bp的序列.在NCBI上进行Blast分析，表明为新发现序列，含有编码62个氨基酸的开放阅读框.其编码短肽的功能尚不确定.     

白菜型油菜核育性相关基因片段的克隆与序列分析

通过ＲＡＰＤ标记,所获得的与育性基因紧密连锁的基因片段进行克隆与序列分析,结果表明,该育性基因片段为与油菜小孢子发育早期ＢＰ４调控基因５８％同源,并含有一ＭＡＰＤＳ盒高度同源的保邓列。Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交结果表明该基因为单拷贝基因。     

利用RAPD技术筛选家蚕抗核型多角体病分子标记

在含有抗核型多角体病毒(NPV)病主效基因的家蚕品种NB和高敏感品种306及其近等基因系BC9中，采用500个RAPD随机引物分别在各个品系的13NA混合物中进行扩增以筛选分子标记，获得与家蚕抗NPV病有关的3个分子标记：OPF-072023、OPJ-131300、OPM-161200．其中OPF-072023标记通过各回交代检测，证明获得的标记真实、可靠．又对该分子标记的片段进行克隆、测序．通过该片段的生物信息学分析，意外地在家蚕Z染色体上发现一个逆转位子的编码序列．     

Characterization and molecular marker screening of a rice bacteria-resistant gene Xa-min(t)

To test the resistant spectrum of the Xa-min(t) gene introgressed from Oryza minuta, thirty-four isolates of different bacterial blight pathogen, Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo), from 11 countries were used to inoculate the Xa-min(t) introgression line 78-15. Four rice cultivars, IR24, C64 (IRBB21), Nipponbare and Zhonghua 11 were used as controls. The results showed that the Xa-min(t) gene was broad-spectrum and highly resistant to diverse Xoo isolates. The methods of bulk segregant analysis (BSA), randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) and sequence characterized amplified regions (SCAR) were used to analyze F2 individuals of the hybrid IR24×78-15 and molecular genetic markers linked to Xa-min(t) gene were identified. A total of 800 arbitrary decamer oligonucleotide primers were used for RAPD analysis. Two RAPD markers, BE05300 and BE061400, produced by primers BE05 and BE06 respectively, were closely linked to the Xa-min(t) gene. Based on the sequences of these two markers, sequence specific primers were designed and used to screen all F2 plants. One RAPD marker, BE05300, was converted into a stable SCAR marker (ScBE05300). Linkage analysis was carried out using markers ScBE05300 and BE061400 on 948 and 719 F2 individuals of the hybrid IR24×78-15. Our results indicate that the genetic distances from Xa-min(t) to ScBE05300 and BE061400 are 2.2 cM and 3.7 cM respectively on the same side. This study may facilitate the construction of the fine physical map of the Xa-min(t) gene.     

山羊与岩羊间特异RAPD片段分析

在两组40个随机引物中，筛选出16个重复性好的多态引物，对山羊与岩羊闻RAPD片段分析表明，16个引物扩增出67条带，其中54条带表现多态，多态率80．60％，山羊各群体共有条带为23条，山羊和岩羊共有条带为13条，岩羊有4条特异带，不同引物所扩增出的片段在各群体中分布频率不同．岩羊特异RAPD片段，OPA-10724的序列与人类全基因组比较，同源的短序列较多，最太长度为86bp，唯有30bp的长度与绵羊ZFZ基因和牛ZFY基因内含子同源。     

籼型光敏核不育水稻的RAPD分析

以籼型光敏核不育水稻８９０２ｓ及其可育近等基因系材料８９０２的核ＤＮＡ为模板，进行ＲＡＰＤ分析，从检测过的１５个引物中发现引物ＯＰＡ－０４在可育品系和不育品系中扩增出１个１０００ｂｐ的差异带，并初步认为此差异与育性相关     

5种菊头蝠的随机扩增DNA多态(RAPD)的分析

以5种菊头蝠为材料,用随机扩增DNA多态(RAPD)方法分析它们的亲缘关系。结果显示:5种菊头蝠均表现出各自不同的多态性RAPD标记,6条单个引物分别扩增出2~10条的RAPD条带,其分子量约在700~2 600bp之间。依据这些多态性标记计算其种间遗传相似性,建立亲缘关系树形图。     

应用Bulked-DNA寻找白菜型油菜核雄性不育基因的RAPD标记

采用随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）标记方法从白菜型油菜核不育两用系中筛选出了一个与白菜型 油菜育性基因连锁的ＲＡＰＤ标记。该ＤＮＡ片段大小约０．７２ｋｂ,与育性基因之间的遗传连锁距离为６．０８ｃＭ,ＬＯＤ值为９．１０。     

Fine mapping of the rice bacterial blight resistance gene Xa-4 and its co-segregation marker

An F₂ population developed from theXa-4 near isogenic lines, IR24 and IRBB4, was used for fine mapping of the rice bacterial blight resistance gene,Xa-4. Some restriction fragment length polymorphism (RFLP) markers on the high-density map constructed by Harushima et al. and the amplified DNA fragments homologous to the conserved domains of plant disease resistance (R) genes were used to construct the genetic linkage map around the geneXa-4 by scoring susceptible individuals in the population.Xa-4 was mapped between the RFLP marker G181 and the polymerase chain reaction (PCR) marker M55. The R gene homologous fragment marker RS13 was found co-segregating withXa-4 by analyzing all the plants in the population. This result opened an approach to map-based cloning of this gene, and marker RS13 can be applied to molecular marker-assisted selection ofXa-4 in rice breeding programs.