鸟类分子系统学新进展

由于鸟类经历了一个古老而快速的分化,且以往的分类学研究多以形态学和化石记录为基础,分类学家对其系统发育了解很少.最近的分子系统发育研究表明:鸟类进化树上只有古颚总目和今颚总目之间的分化、鸡雁小纲和新鸟下纲的分化2个节点始终得到分子和形态证据的一致支持;分子研究支持新鸟下纲的白垩纪起源,反对化石记录支持新生代起源.但在最新的系统发育树中,大部分鸟类目之间的亲缘关系仍有待确定.今后应该增强鸟类分子进化的研究,并与形态学、古生物学研究相整合,以期完善鸟类的系统学.     

关于将脊椎动物形态解剖与分类学实验合并的思考与探索

动物形态解剖特征是分类的重要依据,与动物的进化和生态适应密不可分.但现有的动物学实验教材却将脊椎动物各纲的形态解剖与分类设置为不同的实验,这样就造成了形态解剖与分类学实验在时间、材料和内容上的脱节,影响学习效果.笔者建议在今后的实验教材编制、实验大纲设置和实验操作过程中,将这两类分别独立开设的实验合并为一个大实验.在学生系统学完一章的理论知识后,通过这一综合性实验,使学生能将动物的结构与分类鉴别特征及其生态功能的适应性有机地结合,以增强学习内容之间的内在联系,减少资源浪费,提高学生学习的兴趣和效率.     

石斑鱼类的分子系统学研究进展

石斑鱼类是世界上最重要的海洋经济鱼类之一,其种类繁多,大部分营定居性生活.由于种间缺乏明显的外部形态区别特征,石斑鱼的分类一直是鱼类系统分类学中的一个难题,存在着很多争议和混淆.通过DNA序列分析在分子水平重建物种的系统进化关系是当前系统学研究的一个新热点,是传统系统学研究的重要补充和佐证.本文简要综述了石斑鱼类传统分类研究状况、存在问题及当前石斑鱼类的分子系统学研究进展,并对石斑鱼类的系统学研究发展作了展望.     

圆口纲进化中的模糊问题思考

圆口纲进化是动物进化的重要组成部分之一,是生物进化论、动物学研究的重要内容之一。根据古生物学、现代生物学、生物进化论研究成就,就圆口纲生活方式、甲胄鱼、圆口纲与甲胄鱼的关系、圆口纲起源地点进化中的模糊问题进行了思考。     

广西5种常见星虫动物的线粒体基因组特征和系统进化分析

为探明广西北部湾星虫动物的线粒体基因组遗传变异和基因序列特征,采用高通量测序测定广西北部湾5种常见星虫动物的线粒体基因组,并对其基因序列特征、遗传变异、系统进化进行分析。结果显示,星虫动物线粒体基因组具有典型的无脊椎动物线粒体基因组的特征,基因排列高度保守,特别是其13个蛋白质编码基因（PCGs）。此外,星虫动物线粒体基因组的基因均编码在H链上,并存在3个高度保守的基因排列区块,与环节动物和螠虫动物线粒体基因组特征较为相似。cox1、cox2和cob等3个基因进化速率最慢、遗传变异水平最低,适合作为星虫动物种属系统进化研究以及不同种间生物条形码构建的分子标记。nad6、nad4、nad5和nad2等4个基因的遗传变异水平较高（大于60%）,变异位点数量较多,适合作为星虫动物种群遗传多样性研究的分子标记。星虫动物线粒体13个蛋白质编码基因的Ka/Ks比值均低于1（0.058 2-0.726 6）,其中cox1、cox3和cob等3个基因的Ka/Ks比值最低（小于0.1）,表明在星虫动物线粒体遗传进化过程中,这3个蛋白质编码基因承受强烈的自然选择压力和功能束缚。基于线粒体基因组蛋白质编码基因系统进化树的研究结果表明,星虫动物可分为方格星虫纲和革囊星虫纲两个进化分支,星虫动物与环节动物的进化地位、亲缘关系较近,而与软体动物的亲缘关系较远。本研究结果不仅为广西北部湾特色星虫动物渔业资源多样性调查和保护提供分子遗传数据,也为星虫动物系统进化研究提供了科学参考。     

基于叶绿体基因组序列对50种菊科植物亲缘关系分析

菊科为双子叶植物纲的第一大科,其科内等级划分和系统学研究存在巨大挑战.叶绿体基因组具有高度的保守性和较慢的进化速率,其在植物系统发育和物种进化研究中应用广泛.对菊科20个属50种植物叶绿体基因组序列进行亲缘关系分析,基于叶绿体基因组编码序列(coding sequence,CDS)、rbcL基因序列、rbcL+matK...     

成熟年龄与大小进化的数学模型

生活史进化是理论生态学研究的主要内容之一 .在生活史理论中 ,成熟年龄和大小的进化研究占有很重要的地位 .以适应性是形成物种表型性状为前提 ,探讨物种成熟年龄和大小的进化问题 ,进行定性和定量分析 ,并对该领域一些卓有成效的研究成果给予总结 .而成熟年龄与大小进化的重点是分析表型优化的成熟年龄和成熟大小的进化模型     

实验动物兔子心电图奇异性检测:进化谱方法

基于小波变换的进化谱分析能够揭示非平稳信号特定时刻的时一频域特性.实验动物兔子左冠状动脉前降支结扎实验,可以模拟早期心肌缺血症状的不同生理变化过程.左冠状动脉病变引发心肌缺血是急性心肌梗死等冠心病的早期主要征兆.文中提出了基于连续复小波变换的进化谱估计算法,在满足时一频域不确定性原理条件下,为获得非平稳信号的瞬时频谱提供了一种有效的新方法,它能够识别生命系统数据中的局部奇异性.应用这种算法对实验动物兔子的多种心电图数据的进化谱分析结果表明,QRS波群进化谱特性的变化与早期心肌缺血有内在关联.QRs波群进化谱品质因数Q是心电图在时一频域的一个特征参数,Q数值变异可能为识别早期心肌缺血提供一种新的医学诊断参考特征.     

蓝藻分子系统学研究进展

综述蓝藻分子系统学的研究成果及进展,包括①目前用于蓝藻分子系统学研究的基因种类以及这些基因进化的结构规律,ＰＣＩＧＳ,１６ＳｒＲＮＡ和ＩＳＲ序列分析在蓝藻系统发育研究中取得的重要结果;②用于蓝藻分子系统学研究的方法及其应用;③有毒微囊藻属的分子系统学研究进展．     

DNA测序在苔藓植物系统学研究中的应用

DNA序列分析技术是近年来兴起的研究植物系统发生的常用方法,由于其快速、高效、准确等优点,因而近年来在苔藓植物系统发育与进化研究中应用的越来越广泛。简要介绍了苔藓植物形态分类学所面临的一些问题和分子系统学研究常用的DNA序列分析方法,并将近年来该方法在苔藓植物分子系统学研究中的应用做了概述。     

双翅目蝇类的分子系统学研究进展

从研究种类和研究内容综述了双翅目蝇类的分子系统学研究进展,包括种群遗传变异及进化、种上阶元的系统发育分析、种及种下阶元的分类鉴定及分子进化4个方面内容.     

核酸序列测定法在侧蒴藓类系统发育中的应用进展

概述了苔藓分子系统学发展的现状及核酸序列测定法在研究侧蒴藓类系统发育中的应用 ,并提出了苔藓分子系统学发展的前景 .     

核糖体RNA基因在丝核菌分子系统学研究中的应用

随着分子标记技术的应用与发展,核糖体RNA基因(rDNA)因其特殊的组成结构和演化方式被广泛应用于真菌分子系统学研究中,系统介绍了真核生物核糖体RNA基因的组成特点、特定区域的通用性扩增引物,及近年来在丝核菌不同融合群的鉴定、系统进化关系、遗传分化等研究中的应用.     

Phylogeny reconstruction based on protein phylogenetic profiles of organisms

With the coming of the Post Genomic Era, more and more genomes have been sequenced and it has become possible to study phylogeny reconstruction at genome level. The concept of protein phylogenetic profiles of organisms is defined in this work which is used in phylogeny reconstruction by proteome comparisons. This method is more stable than the prevailing molecular systematics methods and can be used widely. It will develop very fast with the rapid progress in genome sequencing.     

Phylogenomic analyses unravel annelid evolution

Annelida, the ringed worms, is a highly diverse animal phylum that includes more than 15,000 described species and constitutes the dominant benthic macrofauna from the intertidal zone down to the deep sea. A robust annelid phylogeny would shape our understanding of animal body-plan evolution and shed light on the bilaterian ground pattern. Traditionally, Annelida has been split into two major groups: Clitellata (earthworms and leeches) and polychaetes (bristle worms), but recent evidence suggests that other taxa that were once considered to be separate phyla (Sipuncula, Echiura and Siboglinidae (also known as Pogonophora)) should be included in Annelida. However, the deep-level evolutionary relationships of Annelida are still poorly understood, and a robust reconstruction of annelid evolutionary history is needed. Here we show that phylogenomic analyses of 34 annelid taxa, using 47,953 amino acid positions, recovered a well-supported phylogeny with strong support for major splits. Our results recover chaetopterids, myzostomids and sipunculids in the basal part of the tree, although the position of Myzostomida remains uncertain owing to its long branch. The remaining taxa are split into two clades: Errantia (which includes the model annelid Platynereis), and Sedentaria (which includes Clitellata). Ancestral character trait reconstructions indicate that these clades show adaptation to either an errant or a sedentary lifestyle, with alteration of accompanying morphological traits such as peristaltic movement, parapodia and sensory perception. Finally, life history characters in Annelida seem to be phylogenetically informative.     

腹足类系统发育及分类学研究现状

现已证实腹足类是系统进化研究很好的材料,其优越性是其他动物类群难以取代的,但腹足类仍然没有被很好地用来进行系统进化研究。腹足类单源说得到多数研究人员的认同,但还需进一步考证。虽腹足类系统发育及其分类学研究有了很大的进展,但目前对腹足类的自然分类系统尚有不同的见解和看法,诸多研究工作还有待开展,其较长的进化历史、快速辐射演化、趋同进化、趋异进化等因素使腹足类的系统分类学面临挑战。通过回顾腹足类系统发育、分类学研究现状和其中较有影响的分类过程,并对肺螺类系统发育及分类现状进行了综述。     

石斑鱼类的分子系统学研究进展

石斑鱼类是世界上最重要的海洋经济鱼类之一，其种类繁多，大部分营定居性生活．由于种间缺乏明显的外部形态区别特征．石斑鱼的分类一直是鱼类系统分类学中的一个难题，存在着很多争议和混淆．通过DNA序列分析在分子水平重建物种的系统进化关系是当前系统学研究的一个新热点，是传统系统学研究的重要补充和佐证．本文简要综述了石斑鱼类传统分类研究状况、存在问题及当前石斑鱼类的分子系统学研究进展，并对石斑鱼类的系统学研究发展作了展望．     

蜱类系统分类学研究技术与进展

对蜱类系统分类学中所涉及到的研究方法进行了总结.分子数据和形态学特征相结合的全证据研究方法,使蜱的分类鉴定更加客观,系统发生更能反映其亲缘关系,极大地提高了系统分类学的研究水平.随着现代生物学技术和现代统计学方法的广泛应用,蜱类系统分类学的研究方法必将日益完善.