分子进化的几个普适性质

第２至第６节为全国理论生物物理研讨会上的报告,论述了分子进化中的５个普适性质：分子手性,遗传密码,核苷关联的短程为主性及其进化相关性,以最大信息原理概括突变和选择的进化机制,由二结构序列决定的蛋白质框架结构,第一节为作在开幕式上致词的一部分,讨论了理论生物学在生命科学中的地位与作用,特应听众要求,发表于此。     

点突变积累与分子地化

认为木村资生等人用分子进化的中性谱向综合达尔进化说提出了挑战，但在许多方面他们又未能摆脱综合进化谱的概念框架和理论范。革而从对分子进化有更深层意义的复制群体中的基因点突特征入手，实手提出了一个分子进化的点空变积累模型，并以解释了分子进化钟的成因，指出了现存物种高低分布与物种历史是化之间在分子水平上的渊源关系。     

点突变积累与分子进化

认为木村资生等人用分子进化的中性说向综合达尔文进化说提出了挑战，但在许多方面他们又未能摆脱综合进化说的概念框架和理论范式。进而从对分子进化有更深层意义的复制群体中的基因点突变特征入手，初步提出了一个分子进化的点突变积累模型，并以此解释了分子进化钟的成因，指出了现存物种高低分布与物种历史进化之间在分子水平上的渊源关系。     

关于生物分子进化和分子适应策略的研究

从生物的C值矛盾、基因表达调控、基因表达产物的准确性以及DNA的复制方向等分子水平的相关研究来解读生物分子进化和分子适应的策略问题，同时从比较基因组学和分子生态学的角度深入探讨了分子进化和分子适应的研究方向和特点，为进一步研究相关问题提供文献和理论支持．     

当代生物进化论研究新进展

分子进化学说着眼于分子层次的进化机制，自然选择学说着眼于群体水平的进化机制，两者结合把生物进化理论提高到一个新的水平。另外，基因调控下的细胞分化、分子驱动机制均从不同侧面揭示了生物进化原理。     

动物分子流行病学的研究及其应用概况

动物分子流行病学是近年来流行病学研究中一个崭新、活跃的领域，得到了迅猛的发展．它采用分子生物学技术和理论，从分子水平上阐明疫病在畜群中分布规律和影响因素，并广泛应用于病原体的起源和进化，病原体的分型，强毒与弱毒株、疫苗免疫动物和自然感染动物的鉴别，耐药性传播扩散等方面的研究．本文拟对此作一简要概述，以展示动物分子流行病学研究中的最新进展和光辉前景     

DNA分子标记在猫科动物系统发生关系研究中的应用

DNA分子标记的广泛应用,使得系统进化、生物地理、群体遗传及人类学等领域的研究得到前所未有的发展.猫科动物分子系统发育关系的重建是目前猫科动物DNA研究的主要方向,进而可以从DNA分子水平上研究猫科动物的进化过程及系统发育关系的本质.本文对DNA分子标记在猫科动物分子系统学中的部分研究成果做了概括.     

可溶解聚氨酯交联大分子的成长过程

进行了可控的交联聚合，对不同时间形成的分子拍摄的透射电镜照片显示了可溶解的交联大分子的形成过程中有三个明显的不同阶段．第一个阶段是预聚物分子反应形成比较小的线团，在照片上显示为一个黑点，称为点分子．第二个阶段是点分子通过表面官能团反应形成前交联大分子．第三阶段是前交联大分子反应形成可溶性交联大分子．     

石斑鱼类的分子系统学研究进展

石斑鱼类是世界上最重要的海洋经济鱼类之一，其种类繁多，大部分营定居性生活．由于种间缺乏明显的外部形态区别特征．石斑鱼的分类一直是鱼类系统分类学中的一个难题，存在着很多争议和混淆．通过DNA序列分析在分子水平重建物种的系统进化关系是当前系统学研究的一个新热点，是传统系统学研究的重要补充和佐证．本文简要综述了石斑鱼类传统分类研究状况、存在问题及当前石斑鱼类的分子系统学研究进展，并对石斑鱼类的系统学研究发展作了展望．     

苔藓植物分子生态学研究进展

苔藓植物是高等植物中的一个重要类群．植物分子生态学是分子生物学一个新兴的分支学科,是当今被关注的热点之一．在查阅国内外相关文献的基础上,分别从遗传多样性、分子系统与进化和分子生物地理学方面综述苔藓植物的分子生态学研究进展．     

A new method of research on molecular evolution of proteinase superfamily

The molecular evolutionary tree, also known as a phylogenetic tree, of the serine proteinase superfamily was constructed by means of structural alignment. Three-dimensional structures of proteins were aligned by the SSAP program of Orengo and Taylor to obtain evolutionary distances. The resulting evolutionary tree provides a topology graph that can reflect the evolution of structure and function of homology proteinase. Moreover, study on evolution of the serine proteinase superfamily can lead to better understanding of the relationship and evolutionary difference among proteins of the superfamily, and is of significance to protein engineering, molecular design and protein structure prediction. Structure alignment is one of the useful methods of research on molecular evolution of protein.     

金牛座、蛇夫座中分子云的热性质和年轻星体的演化状态

运用CO分子谱线及红外天文卫星资料,求出了金牛座、蛇夫座核心2个恒星形成区的气体运动温度T_k和尘埃温度T_d,验证了尘埃加热分子云的基本条件;着重探讨了用T_d参量比较年轻星体演化状态的方法,得出蛇夫座核心区恒星比金牛座恒星年轻的初步结论。     

黑腹果蝇种组组蛋白基因间内含子区的分子进化

通过分析黑腹果蝇种组(Drosophila melanogasterspecies group)9个种亚组代表种和D.pseudoobscura的组蛋白基因H2A和H2B的内含子的碱基组成、替换速率、转换/颠换比、二级结构和系统发育关系等发现:整个序列长度变异范围在201 bp(ficusphila)到232 bp(takahashii)之间,替换速率为0.82,转换明显高于颠换,内含子和外显子结合区不遵循“GT-AG”和“AT-AC”模式,而是“TT-AG”模式,二级结构与系统分化关系具有相关性.我们认为组蛋白基因H2A和H2B的内含子是先起源的,在进化过程中由于承受的选择压力不同而发生了变异.     

The Statistical Correlation of Nucleotides in DNA Sequence and Its Biological Meaning

评述了ＤＮＡ序列碱基关联的统计研究，着重分析了编码区关联的短程为主性及有关信息参数的进化相关性，讨论了碱基关联的生物学应用．     

The evolutionary computation techniques for protein structure prediction: A survey

In this paper, the applications of evolutionary al gorithm in prediction of protein secondary structure and tertiary structures are introduced, and recent studies on solving protein structure prediction problems using evolutionary algorithms are reviewed, and the challenges and prospects of EAs applied to protein structure modeling are analyzed and discussed. Foundation item: Supported by the National Natural Science Foundation of China( 60133010,70071042,60073043) Biography: Zou Xiu-fen ( 1966-), female, Associate professor, research direction:evolutionary computing, parallel computing, bioinformatics.     

进化图论在知识型企业组织结构设计中的应用

 在进化图论的框架下,运用命名为“动态链接”的更新规则来计算空间结构为环路的种群中某突变个体的固定概率,并结合相关理论来分析知识型企业组织结构的合理设计。对不同类型的组织结构模式作进化图进行仿真并做了比较分析,得出的结论是具有环路性质的无边界组织结构是更合理的知识型企业组织结构。这使得进化图论的应用扩展到了经济学。     

基于EF1-a基因对常见禾本科作物的聚类分析

基于EF1-a基因核苷酸序列和氨基酸序列,利用分子进化遗传分析软件MEGA 5.0构建常见禾本科植物的最小进化法（ME）、邻接法（NJ）和算术平均数的非加权成组配对法（UPGMA）分子系统进化树.研究结果表明,EF1-a cDNA序列和氨基酸序列的聚类分析都能够反映所列禾本科植物的属间关系,3种进化树的聚类分析分支情况基本一致.基于EF1-a基因的cDNA序列和氨基酸序列构建的ME、NJ树适合用来研究禾本科作物种间或种内的遗传关系,而构建的氨基酸序列UPGMA树有待更多的数据研究.     

分子进化中性理论的进展

中性理论与达尔文的自然选择进化论有明显的差别。中性论认为在分子水平上覆盖着多数的进化改变，是在连续产生突变时，由于选择中性（即选择相等），使突变得到随机的固定（即小群体内，样本的随机漂变）。还认为在分子水平上，大多数的种内变异（如蛋白质和ＤＮＡ多态）是选择中性或近于中性，它们能够保持在种内是由于突变的产生和随机消失之间的平衡引起的。近年来，ＤＮＡ顺序的研究资料，都有力地支持中性论，如鼠的拟球蛋白基因、鼹鼠的αＡ－晶状体蛋白、流行性感冒Ａ病毒基因，果蝇的核和线粒体基因等。所以，从地球上生命的历史来看，中性进化的改变至少在数量上已超过达尔文自然选择进化的改变。     

剪刀型双锌卟啉的合成、表征及组装性能

利用"bottom-up"合成策略设计和构筑了一个剪刀型锌双卟啉1,即先合成它的两类构件化合物:1,8-二[3-(氯羰基)苄氧基]蒽醌6和5-(3-氨基苯基)-10,15,20-三苯基卟啉7,然后通过酰氯和氨基的缩合得到目标化合物.详细报导了化合物1、4、5、8、9的合成和表征,并讨论了目标化合物1的结构特点和与双功能客体(Bpy)的组装性能.     

B2X4（X=F,Cl,Br,I）分子结构稳定性的密度泛函理论研究

用ＬＤＳＡ密度泛函理论系统研究了Ｂ２Ｘ４（Ｘ＝Ｆ,Ｃｌ,Ｂｒ,Ｉ）的分子结构及其稳定性,结果表明Ｂ２Ｅ４的Ｄ２ｈ对称性的构型较Ｄ２ｄ构型略为稳定,而Ｂ２Ｘ４则是Ｄ２ｄ对称性的构型较为稳定,从理论上２解释并预测了实验结果。