应用RAPD标记构建马尾松单株树遗传连锁图谱

利用马尾松（Ｐｉｎｕｓｍａｓｓｏｎｉａｎａ）崇义群体Ｃ－１６号单株上４０粒种子的胚乳为作图群体材料，用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）方法构建马尾松单株遗传连锁图谱，从被步筛选的８０个引物中，得到１６个具有多态性产物的引物，对这１６种引物进行Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ１：１分离检测（卡方检验，Ｐ＜０．０５），我们得到符合Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ１：１分离比例的ＲＡＰＤｓ标记４９个．通过对４９个标记的连锁关系进行分析，其中２９个标记分布在１２个连锁群上，总图距为４８３．３ｃＭ，平均图距为２８．４２ｃＭ，２０个标记没有连锁到任何连锁群上，需要继续进行大量标记的连续分析，构建完善的高密度的遗传图谱，使之能够对数量性状位点ＱＴＬｓ进行定位，从而进行分子标记辅助选择育种（ＭＡＳ）．     

猕猴属种间及亚种间RAPD分析

应用ＲＡＰＤ技术分析了猕猴属（Ｍａｃａｃａ）种间和亚种间６个分类群之间的遗传多态性,共筛选出１６个随机引物每个分类群平均获得７７个遗传标记,根据遗传距离构建了系统发育进化树,结果显示从ＲＡＰＤ数据分析得到的６个分类群的相互关系与形态、同功酶、ｍｔＤＮＡ的研究结果基本一致．表明ＲＡＰＤ技术适用于猕猴属中近缘种间和亚种间的分类分析．     

人工繁殖恒河猴血清酯酶、乳酸脱氢酶、淀粉酶、碱性磷酸酶生化位点遗传多态性研究

本文采用聚丙烯酰胺不连续垂直凝胶电泳方法研究了人工饲养恒河猴（Ｍａｃａｃａｍｕｌａｔｔａ）的血清乳酸脱氢酶（ＬＤＨ），醋酶（Ｅｓ），碱性磷酸酶（ＡＫＰ），淀粉酶（Ａｍｙ）等生化位点多态性的分布，结果表明，四种同工酶生化基因位点均具有遗传多态性。ＬＤＨ多态性表现在ＬＤＨ４和ＬＤＨ５有差异，醋酶图谱发现五种酯酶带，其中Ｅｓ－１，Ｅｓ－３、Ｅｓ－５无差异，而Ｅｓ－２和Ｅｓ－４具多态性。     

荷木种群在不同群落中的分子生态研究

用扩增片段长度多态性（ＡＦＬＰ,ａｍｐｌｉｆｉｅｄ ｆｒａｇｍｅｎｔ ｌｅｎｇｔｈ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）方法对荷木（Ｓｃｈｉｍａ ｓｕｐｅｒｂａ）在３个不同群落中的遗传变异进行了研究。ＡＦＬＰ分析结果表明其遗传多样性较高。用ＡＭＯＶＡ（ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｖａｒｉａｎｃｅ）分析表明,９５．９９％的遗传变化表现在种群内,４．０１％的遗传分化表现在种群间（Ｐ〈０．００１）     

螽Si总科部分属种RAPD带型变异的比较研究

采用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术,对螽Ｓｉ总科１０种昆虫的ＲＡＰＤ带型变异进行了分析。带型显示出属、种间多态性明显,能够明显区分。利用ＮＵ取得遗传距离与遗传一致性矩阵,并用ＵＰＧＭＡ聚类法进行分析,取得了系统树。     

应用RAPD标记对杉木属两个种遗传多态性的研究

选用４０个随机引物对杉木属的两个种杉木（ＣｕｎｎｉｎｇｈａｍｉａｌａｎｃｅｏｌａｔａＨｏｏｋ）和德昌杉木（ＣｕｎｎｉｎｇｈａｍｉａｕｎｉｃａｎａｌｉｃｕｌａｔａＤ．Ｙ．ＷａｎｇｅｔＨ．Ｌ．Ｌｉｕ）进行了ＲＡＰＤ分析,在两个杉木种中共获得了１８２个ＲＡＰＤ位点,其中９８个为多态位点．多态位点达到５３．８４％．两个杉木种的遗传相似度Ｓ＝０．６４４１８,它们的遗传距离为０．３５５８０２．杉木与德昌杉木的遗传相似度略低于我们所作的大陆其它杉木种源区间的平均遗传相似度．从两个种间的遗传相似度和遗传距离来看,将德昌杉木单独定为一个新种是不确切的,作者赞成将德昌杉木认定为一个地方居群的观点．     

中国鹅5个品种随机扩增多态DNA(RAPD)分析

目的 用随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术分析中国鹅的５个品种一皖西白鹅、太湖鹅、浙江白鹅、四川白鹅和狮头鹅的随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）。方法 从３４个１０－寡核苷酸随机引物中筛选出的１４个引物对每一品种的总基因组ＤＮＡ进行了单引物ＰＣＲ扩增,结果 ５个品种共扩增出１７４个ＤＮＡ片段,其中４８个（占２７．６％）在５个品种间表现多态性,根据扩增ＤＮＡ片段的异同计算了各品种间的遗传距离指皖西白鹅和     

EXPERIMENTSTUDYONTHERELATIONSHIPBETWEENKINKANDMYLONITE

ＥＸＰＥＲＩＭＥＮＴＳＴＵＤＹＯＮＴＨＥＲＥＬＡＴＩＯＮＳＨＩＰＢＥＴＷＥＥＮＫＩＮＫＡＮＤＭＹＬＯＮＩＴＥＬｕｈｕａｆｕ１）ＳｈｉＨｕｏｓｈｅｎｇ１）Ｃ．Ｊ．Ｌ．ＷＩＬＳＯＮ２）（１）ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＥａｒｔｈＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｎａｎｊｉ...     

果蝇姊妹种间亲缘关系的聚类分析

本文以聚丙烯酰胺凝胶电泳（ＰＡＧＥ）技术分析了金色果蝇复合种（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａａｕｒａｒｉａｓｐｅｃｉｅｓｃｏｍｐｌｅｘ）的５个姊妹种共１７个地理种群及其它种类的５个地理种群的８种同工酶酶谱，根据其中７种酶（Ａｍｙ、Ａｏ、Ｅｓｔ、α－Ｇｐｄｈ、Ｍｄｈ、Ｍｅ、Ｔｙｒ、Ｔｏ）的条带特征按Ｆｏｒｇｕｓｏｎ及Ａｑｕａｄｏ　＆Ａｖｉｓｅ的公式分别计算遗传相似系数及遗传距离，以类平均法（ＵＰＧＭＡ）进行了聚类分析，绘制出８个种类共２２个地理种群的生化系统树，结合姊妹种间无选择杂交可能组合的结果讨论了ａｕｒａｒｉａｓｐｅｃｉｅｓｃｏｒｎｐｌｅｘ各姊妹种间的亲缘关系、种化模式及分布在日本Ｋａｍｅｔｏｋｕ岛上的Ｄ．ｔｒｉａｕｒａｒｉａ发生分化的可能性。     

缙云卫矛的遗传多样性研究

通过对特产于重庆地区的濒危物种缙云卫矛（Ｅｕｏｎｙｍｕｓ ｃｈｌｏｒａｎｔｈｏｉｄｅｓ Ｙａｎｇ）７个居群９１个个体其功能叶片的过氧化物酶（ＰＯＤ）、细胞色素氧化酶（ＣＹＴ）、超氧化物歧化酶（ＳＯＤ）、酯酶（ＥＳ）、淀粉酶（ＡＭＹ）同工酶谱带的分析,研究了该植物的遗传多样性水平．结呆显示：缙云卫矛的所有居群都存在着一定数量的迁移率相同的主要酶谱带（４条）,占酶谱带总数的１０．８１％;５个酶系统共检测出酶谱带３７条,等位基因位点数１８个,其中多态位点数８个,单态位点数１０个,乡态位点百分数Ｐ＝４４、４４％,平均每个位点的等位基因素Ａ＝ｌ,５,平均期望杂合度Ｈｅ＝１８．８２％,平均实际杂合度Ｈ０＝２４．２３％．     

墨西哥落羽杉无性系RAPD指纹图谱的构建

利用随机多态扩增DNA(RAPD)分子标记对53个墨西哥落羽杉无性系的研究表明:31个随机引物共扩增出了241条谱带,其中118条谱带在无性系间呈现多态性,多态位点占48.96%;用POPGENE软件对无性系进行遗传分析,得出无性系间的遗传距离为0.271~0.537,说明无性系间的遗传差异相对较大。通过聚类分析将53个优良无性系分为两大类,同时利用RAPD分子标记构建了53个无性系的指纹图谱,可对墨西哥落羽杉优良无性系进行区分和鉴定。     

东北三省汉族人群的遗传特征及族源推断研究

为研究东北三省汉族人群17个常染色体STR基因座的遗传多态性,在获得书面知情同意的基础上,研究抽取了东北三省汉族人群中无直接亲缘关系的326份血样卡,其中,辽宁省63份,吉林省107份,黑龙江省156份。使用PowerPlex@21 System荧光扩增试剂盒对17个STR基因座进行基因分型,再利用Modified-Powerstates软件计算其法医学参数。经分析得出,在17个基因座中,13个基因座的个体识别能力及遗传多态性较高,其中D18S51、FGA和PENTA_E 3个基因座尤为突出;剩余4个基因座中,D3S1358和CSF1PO中等,TH01和TPOX较低。同时对东北三省汉族人群和其他14个人群进行族源推断,通过对等位基因频率进行主成分分析、遗传距离计算、多维尺度分析,研究发现14个人群中的所有汉族、云南白族、云南彝族、云南纳西族和韩国均与东北三省汉族的人群之间具有较近的遗传距离,而剩余人群则与目标人群距离较远。     

乌金猪mtDNA D-Loop区的遗传多样性

为揭示乌金猪3个地方类群遗传多样性及其分布情况.以乌金猪的3个地方类群凉山猪、大河猪和柯乐猪为对象,研究了线粒体DNA Ｄ环高变区（mtDNA D-loop HVI）的序列多态性.研究表明,在全长290 bp的核苷酸序列中共检测到46个突变位点,其中简约信息位点为5个,单一多态位点为37个,其中以A/G突变为主.凉山猪的3个类群（昭觉、美姑、西昌）首先聚为一类,然后凉山猪与大河猪聚为一类,最后凉山猪与柯乐猪聚类.3个地区的乌金猪有2个母系起源,大河猪与凉山猪为一个母系起源,柯乐猪为另一个母系起源.就总体而言,乌金猪的各地方类群凉山猪与大河猪遗传亲缘关系最近,其次是柯乐猪,有2个母系起源.     

青藏高原栽培青稞SSR标记遗传多样性研究

利用SSR标记评估了64份青藏高原栽培青稞的遗传多样性。选择的30个SSR标记中,22个标记扩增良好且具有多态性,每位点检测出的等位基因数为2~15个,共检测出等位基因132个,平均6.0个;各多态位点检测出基因型为2~11种,多态信息指数为0.16~0.91,平均为0.65。这些表明青藏高原栽培青稞具有丰富的遗传多样性。同时发现,青藏高原栽培青稞在麦芽性状、淀粉性状、病虫及裸粒等重要农艺性状存在丰富的变异,是遗传育种的宝贵资源库。不同来源的群体材料的遗传多样性不同,具有区域特异稀有基因。聚类分析将材料分为四组,材料聚类与材料来源地和生长习性无相关性。聚类图显示了不同材料间的遗传距离或遗传相似程度,可为材料选择提供参考。     

Development of simple sequence repeats (SSR) markers of ramie and comparison of SSR and inter-SSR marker systems

Ramie (Boehmeria nivea L. ) is an important bast fiber crop. To study genetic background of this species, we isolated and characterized microsatellite markers of ramie. A genomic library containing inserts of rapid amplification of polymorphic DNA (RAPD)fragments was constructed, and screened by PCR amplification using anchored simple sequence repeats as primers. A total of 26 clones were identified as positives, and 13 microsatellite loci were found after sequencing. The polymorphism of these 13 microsatellite loci was examined and the utility of simple sequence repeats (SSR) and inter-SSR (ISSR) marker systems for genetic characterization compared using 19 selected ramie cultivars. Both approaches successfully discriminated the 19 cultivars which differed in the amount of polymorphism detected. The level of polymorphism detected by SSR was 95.0 %, higher than that by ISSR (72.3 % ), but the average polymorphism information content (PIC) of ISSR (0. 651) was higher than that of SSR (0. 441). The higher PIC value of ISSR suggests that ISSR is more efficient for fingerprinting ramie cultivars than SSR markers. However, because the SSR loci are codominant, they are more suitable for determining the homozygosity levels of ramie, constructing linkage map, quantitative trait loci study of complex traits and marker-as-sisted selection.     

Clones identification of Sequoia sempervirens (D. Don) Endl. in Chile by using PCR-RAPDs technique

A protocol of polymerase chain reaction-random amplified polymorphic DNAs (PCR-RAPDs) was established to analyse the gene diversity and genotype identification for clones of Sequoia sempervirens (D. Don) Endl. in Chile. Ten (out of 34) clones from introduction trial located in Voipir-Villarrica, Chile, were studied. The PCR-RAPDs technique and a modified hexadecyltrimethylammonium bromide (CTAB) protocol were used for genomic DNA extraction. The PCR tests were carried out employing 10-mer random primers. The amplification products were detected by electrophoresis in agarose gels. Forty nine polymorphic bands were obtained with the selected primers (BG04, BF07, BF12, BF13, and BF14) and were ordered according to their molecular size. The genetic similarity between samples was calculated by the Jaccard index and a dendrogram was constructed using a cluster analysis of unweighted pair group method using arithmetic averages (UPGMA). Of the primers tested, 5 (out of 60) RAPD primers were selected for their reproducibility and high polymorphism. A total of 49 polymorphic RAPD bands were detected out of 252 bands. The genetic similarity analysis demonstrates an extensive genetic variability between the tested clones and the dendrogram depicts the genetic relationships among the clones, suggesting a geographic relationship. The results indicate that the RAPD markers permitted the identification of the assayed clones, although they are derived from the same geographic origin.     

美洲黑杨南方种源的遗传变异

本文对美洲黑杨15个南方地理种源进行了种源—子代测定。5年试验结果表明,不同地理种源对树高、胸径和树干通直度的总变异分别占64％、21％。同一种源的不同林分对树高、胸径和通直度总变异无显著影响。树高、胸径和通直度随着种源经度由东向西而增大,但随着种源纬度由北向南,只有树高生长相应增大。各性状的狭义遗传力较低,由于非加性方差很小,广义遗传力仅略大于狭义遗传力。通过种源—子代测定而建立的插穗生产区,树高和胸径的遗传增益比实生种子园高6～7％;树于通直度的遗传增益比实生种子园高2％。树高与胸径之间的遗传相关高达0.9以上,而树干通直度与树高或胸径的相关性很小(0.01～0.31)。     

马尾松松材线虫病抗性无性系的筛选和遗传多样性分析

【目的】 松材线虫病是松属致命性的世界检疫性森林病害。筛选和创新抗性遗传资源是马尾松抗松材线虫病育种的重要基础。松材线虫病重灾疫区自然淘汰存留下来的马尾松资源,可能是开展马尾松抗松材线虫病育种潜在的重要遗传基础,值得进一步深入挖掘、系统评价和开发利用。本研究通过对110个对松材线虫病具有抗性表型的无性系进行遗传多样性、生长性状测定和保存率调查,综合评价其在抗性育种中的潜在价值。【方法】 通过接种松材线虫对马尾松的1 201个初选无性系进行筛选,并对110个具有抗线虫表型的重选无性系进行遗传多样性RAPD和生长性状评价。从14对SCAR分子标记引物中筛选通用性强、多态性位点高的两组引物,用于MuPS(Multiplex-PCR of SCAR markers) 反应扩增和遗传多态性位点检测。基于79个MuPS唯一型无性系群体,采用Popgene 32软件估算的遗传多样性,结合生长量和存活率指标,评估该批遗传资源在马尾松抗性育种中的潜在价值。【结果】 初选的1 201个无性系(来自251个马尾松初选家系),经松材线虫接种筛选后,获得110个无性系(来自初选家系中的81个),由两组引物扩增得到92种MuPS分型。其中,有79个无性系为单一的MuPS分型所完全准确识别(占71.81%)。基于79个具单一MuPS分型的无性系群体遗传多样性分析表明,群体所有位点的平均有效等位基因数(N_e)为1.508 1个,Nei’s基因多样度(H)为0.302 3,Shannon多样性指数(I)为0.459 1。无性系体间遗传参数差异明显,N_e变幅为1.012 8~1.998 1,H变幅为0.012 6~0.499 5,I变幅为0.038 5~0.692 7。具有抗松材线虫病表型的110个马尾松无性系存活83个。保存无性系间其生长性状存在显著差异,树高、胸径和单株材积生长量变幅分别为4.6~10.7 m,6.7~21.7 cm和0.012 3~0.189 4 m³,生长量最大的休3-3号无性系立木材积(0.189 4m³)为最小的无性系广27-2的(0.012 3 m³)15倍以上。【结论】 马尾松1 201个初选无性系,经野外人工接种松材线虫的抗性筛选后,110个无性系表现出对松材线虫病有显著的抗性表型,占初选无性系的9.09%。这些经过抗性筛选的无性系在材积生长性状上达到了极显著差异水平。这意味着在抗性改良基础上,进行生长量改良的策略是可行的。与已有的天然和人工育种群体的遗传多样性参数相比,本研究虽然经初选和抗性复选淘汰了90%以上的无性系,仍保留了群体中较高的遗传多样性。综上,笔者认为这批初选资源经抗性筛选存留的遗传资源,在马尾松抗松材线虫病育种研究中具有明显的潜在价值。     

应用微卫星标记对海南和广西恒河猴遗传多样性的研究

目的研究微卫星DNA多态性在海南和广西恒河猴遗传多样性中的应用。方法利用11个微卫星位点,对来自这两个地区的恒河猴进行了遗传检测,并通过POPGEN32软件计算各个微卫星座位的等位基因频率、有效等位基因数目(Ne)、多态信息含量(PIC)和遗传杂合度(H)。结果所选择的11个微卫星位点均存在高度的遗传多态性,H为0.6848~0.8785;PIC为0.5826~0.8345;Ne为3.0000~7.1553。以11个微卫星标记为测度,广西恒河猴的Ne、PIC和H的平均值均高于海南猴,分别为4.2583、0.7090、0.7706(广西恒河猴)和4.2054、0.7025、0.7656(海南恒河猴)。结论这种差别可能与地域来源有关。这些研究为微卫星标记分析恒河猴遗传多样性提供理论基础。     

Continuum of overlapping clones spanning the entire human chromosome 21q.

A continuous array of overlapping clones covering the entire human chromosome 21q was constructed from human yeast artificial chromosome libraries using sequence-tagged sites as landmarks specifically detected by polymerase chain reaction. The yeast artificial chromosome contiguous unit starts with pericentromeric and ends with subtelomeric loci of 21q. The resulting order of sequence-tagged sites is consistent with other physical and genetic mapping data. This set of overlapping clones will promote our knowledge of the structure of this chromosome and the function of its genes.