SARS的研究进展

2003年3月,发现SARS病原是一种从未在人类或动物中发现过的新的冠状病毒.其基因组结构与其他的冠状病毒相似,由29727核苷酸组成,有11个开放阅读框.通过多基因分析序列比较说明,SARS冠状病毒与已知的冠状病毒无关.针对SARS冠状病毒的各种特征及研究进展进行了综述.     

SARS冠状病毒及相关病毒的分子系统学分析

根据SARS冠状病毒及其相关病毒的基因组核酸序列和3种不同蛋白质序列，应用最大简约法和最小进化法重建系统发育树；并对SARS冠状病毒的11个推测蛋白质(ORF)做BLAST分析。结果表明，SARS冠状病毒和鼠肝炎病毒——牛冠状病毒分支构成姊妹群。其单系群性质得到强有力的统计学支持。这暗示了SARS的爆发可能源自种间屏障的突破事件，该病毒天然宿主可能为猪、牛或鼠。SARS冠状病毒与已知的人冠状病毒分属冠状病毒科的不同分支，因此致病机制可能有很大不同。3个基因的系统树分支格局的一致性表明：SARS冠状病毒这3个主要基因与其他冠状病毒间不存在重组，但全部11个ORF的BLAST分析却认为其基因组上一些小的区段可能与其他病毒存在重组。     

SARS冠状病毒核蛋白的质谱鉴定

利用质谱技术,对纯化的SARS冠状病毒的核蛋白进行初步鉴定与分析.所获得的质谱分析数据中,分子量为2881.19Da的酶切肽段的氨基酸序列与其它冠状病毒的同源性比较分析表明,SARS冠状病毒和其它冠状病毒均含有一个高度保守的基序“FYYLGTGP”.     

SARS与环境

SARS与冠状病毒最近“非典”成为全国上下关注的头等大事，因为它具有极强的传染力和致命性。这个病在半年左右的时间内，传播到全世界20多个国家，成为了世界卫生组织（WHO）和多个国家开始全力着手研究、预防和寻找治疗方法的新型传染病。世界卫生组织将这次出现的“非典”正式命名为SARS（中文译音：萨斯），是英文Severe Acute Res-piratory Syndrome的缩写，译文为：严重急性呼吸系统综合症。什么是SARS的致病原因？世界卫生组织已公布：SARS是病毒，而不是细菌或衣原体。这就是为什么各种抗菌素对此病无效的原因。病毒是世…     

SARS冠状病毒基因组复制酶起始结合位点的预测

严重急性呼吸综合征(Severe Acute Respiratory Syndrome,SARS)传染性强,死亡率高,给全世界约30个国家造成了巨大损失．其病原体为SARS冠状病毒(Severe acute Respiratory Syndrome Associated Coronavirus,SARS—CoV),是冠状病毒(Coronavirus)的新变异种．作者以“最大信息量”理论和方法为基础,使用结合位点搜寻软件等生物信息学方法,对冠状病毒基因组的3’非翻译区(Untranslated Regions,UTRs)进行分析,预测出了2株SARS—CoV(来自北京的SARSBJ01和浙江的SARSZJ01)以及其他38株冠状病毒株的复制酶起始结合位点(Replicase initial binding sites,RIBS)．在该预测结果中,不难发现,这些RIBS的序列与前人的研究成果有很大的相似之处,与公认的冠状病毒的顺式作用元件极为相似的基序也存在其中,而且其预测的二级结构与鼠肝炎病毒MHV基因组的某些蛋白结合位点类似．因此,预测的RIBS在病毒的复制中可能起重要作用．     

SARS冠状病毒基因芯片的制作与初步临床样本验证

为了实现对非典(SARS)冠状病毒感染患者的早期诊断,构建了一套以基因芯片为基础的SARS冠状病毒基因分析检测系统。首先从患者痰、血样本中快速分离出SARS冠状病毒的RNA,然后通过巢式RT-PCR对分离的RNA进行扩增获得特定的DNA片段,最后让固定在基因芯片上的DNA探针与扩增产物进行杂交以检验扩增产物的序列匹配性,达到最终确认SARS冠状病毒感染患者的目的。对首期两例患者痰样本和两例全血样本的分析结果表明,这4例患者样本中均存在SARS冠状病毒。     

引起人非典型性肺炎的冠状病毒基因组与其它冠状病毒基因组的初步比较

一种在世界范围内突然爆发的致命流行病——急性呼吸窘迫综合症(SARS)击倒了数干人，一种全新的冠状病毒被认为是其病原．5个SARS相关冠状病毒的全基因组序列已经完成．我们进行了SARS相关冠状病毒和其它冠状病毒的基因组进化分析和序列比较，结果显示：1．SARS相关冠状病毒不直接来自于任何已知的冠状病毒；2．E蛋白的基因可能是在近期从其它病毒横向转移到SARS病毒中来的；3．Sl和S2基因发生了较大范围的缺失或插入突变．这些基因横向转移和突变改变了SARS相关病毒的表面结构和抗原性，极有可能是导致其获得侵染人类细胞的主要原因．     

SARS冠状病毒N蛋白的表达及二级结构预测分析

通过RT-PCR获得SARS冠状病毒N蛋白基因，分别克隆到原核表达载体pET21a，pET32a和pGEX-4T-1中，将3种重组质粒pET2la-N，pET32a-N和pGEX-4T-1-N分别转化大肠杆菌BL21(DE3)，经IPTG诱导，细菌中分别表达出约46kD的重组N蛋白、约60kD的6xHis-N融合蛋白和约70kD的GST-N融合蛋白，表达量分别达总蛋白的45％、40％和30％．进一步的分析表明：6xHis-N融合蛋白在大肠杆菌中为可溶性表达，该可溶性组分占细菌裂解液的70％左右，且能被6xHis抗体所识别．用蛋白分析软件对N蛋白进行了序列分析和二级结构预测．SARS冠状病毒N蛋白在大肠杆菌中的高效可溶性表达，有助于进一步结晶后进行X射线晶体衍射分析其结构与功能．     

SARS与野生动物

今年上半年，SARS疫情席卷全球３０多个国家，整个世界为之惊恐，产生的影响和造成的损失非其他灾害能比。作为SARS疫情始发地和最大受害国的我国，负有追查引发疫情“元凶”的责任。前段时间，国内外大都推测，“元凶”就是野生动物。更有研究机构认定，“元凶”就是果子狸，证据就是引发人类SARS疫情的冠状病毒与从果子狸标本中分离到的冠状病毒同源。此结果一经发布，不少地方闻风而动，立即展开了清剿果子狸的行动，个别地方还准备制订立法禁食野生动物。在我看来，这种结论值得质疑。在SARS病毒的出处未经科学确认的情况下，我…     

SARS病毒RNA二级结构及RNAi作用靶位的计算机预测

该研究使用两个基于不同算法的RNA二级结构预测软件RNAstructure 3．71和RNAdraw V1．1b2，通过对SARS冠状病毒BJ01和TOR02株的基因组序列的二级结构进行计算机初步模拟，得到可能用于RNAi作用药物设计的6个结构．     

Modulating multidrug resistance through inhibiting of protein kinase C activity by phenothiazines

In the present study, actions of phenothiazines(PTZ) in reversing multidrug resistance(MDR) and inhibiting PKC activity were investigated. It was found that the three PTZs caused 2.49, 36.58 and 75.78 fold reversal of K562/AO2 MDR cells resistant to adriamycin, respectively, while the chemosensitizer verapamil caused 40 fold reversal in the same condition, indicating that PTZ11 is a novel reversal agent of MDR and a potential chemotherapeutic reagent for tumor therapy. PKC activity analysis in the presence of PTZs showd that PTZ6 and PTZ11 inhibited rat brain protein kinase C activity in a manner of dose_dependent. The IC 50 values were (489.77±31.4) and (113±9.64) μmol/L, respectively. PTZ7 had no inhibition on PKC activity. Further study showed that PTZ11 could reduce PMA_mediated activation of PKC in a manner of dose_dependent, suggesting that PTZ11 might compete for the high_affinity phorbol ester binding site within PKC molecule. Recently, an X_ray structure of PMA in complex with PKC Cys2 activator_binding domain was solved. We therefore decided to explore the possible binding model of PTZ11 with PKC molecule using SYBYL 6.02 program. It was shown that the binding site of PTZ11 with PKC molecule partially overlapped with that of PMA, providing for the first time new data for designing PKC inhibitors and MDR reversal drugs.     

经尿道内窥镜手术治疗输尿管膨出

目的：探讨经尿道内窥镜手术切除输尿管膨出的治疗效果。方法：回顾性分析11例成人输尿管膨出患者采用经尿道内窥镜手术治疗的临床资料。结果：11例患者均经IVU、B超及膀胱镜检查确诊，采用电切镜行输尿管囊肿低位横行切开术4例，3例肾积水消失，1例肾积水改善；7例行输尿管膨出囊壁部分切除术，积水全部消失。11例手术均一次手术成功，术后平均随访19mo，3例术后出现输尿管反流，2例2mo后自行缓解，1例术后3mo行开放手术抗反流。结论：经尿道内窥镜手术切除输尿管膨出是一种安全、简单、有效的治疗方法。可以减少手术创伤及术后并发症，创伤小，恢复快。经尿道囊壁部分切除术效果更为理想。当输尿管反流不能自愈时。应行输尿管膀胱抗反流吻合术。     

Ni(1)，NiB(2),NiB2(1),(NiB+1)(1)吸附C2H4的理论研究

用密度泛函方法对NiC2H4，NiBC2H4，(NiB+1)C2H4，NiB2C2H4进行较高水平的理论计算，发现硼的加入可以提高反应的活性和选择性，C2H4的吸附方式是两个碳原子同时与镍原子相连.     

Ni(1)，NiB(2),NiB2(1),(NiB+1)(1)吸附C2H4的理论研究

用密度泛函方法对NiC2H4，NiBC2H4，(NiB+1)C2H4，NiB2C2H4进行较高水平的理论计算，发现硼的加入可以提高反应的活性和选择性，C2H4的吸附方式是两个碳原子同时与镍原子相连.     

NiB4分子结构特性及成键特性的DFT计算研究

用DFT方法对NiB4单重态和三重态两种多重度的各种可能构型进行计算,结果表明B原子之间存在较强的相互作用,对NiB4分子的稳定性有很大贡献.     

新皮啡肽Ⅰ类似物构效关系的研究

用固相法合成了内源性类阿片肽新皮啡有为Ⅰ（DELⅠ）及其3个类似物（Asp从5位到7位）。实验发现DELⅠ及其类似物的镇痛和免疫活性次序（由大到小）分别是Asp^5(Asp^6)、Asp^4(Asp^7)和Asp^4、Asp^7、Asp^6、Asp^5，这说明DELⅠ类似物序列中碳端疏水氨基酸残基的位置的改变对生物活性和整个分子的三维结构影响很大。     

钼钒砷三元杂多酸催化性能的研究

本文合成了四个钼钒砷三元杂多酸:Hx[AsVnMo12-noy]ZH2O=1-4,简记Vn。经元素分析,pH电位滴定,差热热重分析、红外等确定了结构组成。用程序升温还原(TPR)研完了它们分别与H2和CO反应的氧化催化性能,发现,随钒取代增多,活性降低。在微型反应器中,考查了V1和V3对叔丁醇生成甲基丙烯醛的催化作用,发现V1活性高于V3,选择性则是V3高于V1。即随钒取代增多,活性降低,选择性提高。     

果菠萝蛋白酶在有机溶剂中的变性与失活动力学的研究

测得果菠萝蛋白酶是由单亚基组成,分子量约为30k,pl为4.6,每个酶分子含一个游离疏基和二个硫硫键,甲醇、乙醇、乙二醇对酶活力有明显的抑制作用,甲醇、乙醇表现为非竞争性,乙二醇为竞争性,其抑制常数分别为:20％、16.5％和11％。在有机溶剂作用下,监测荧光(332nm)强度随时间的变化过程,作为变性的指标,测定酶在不同浓度有机溶剂中的变性动力学,并按邹氏法测定酶的失活动力学,对酶构象及催化活力关系进行比较,酶的失活速度大于变性速度,说明酶活性中心处于对有机溶剂较敏感的区域,酶的变性与失活过程均可分为快、慢两相的一级反应,这意味着可能存在着部分活力的中间态。     

Eu3+与微过氧化物酶-11相互作用的研究

用紫外-可见（UV-Vis）吸收光谱法和循环伏安法研究了Eu^3＋与微过氧化物酶-11（MP-11）相互作用,发现一个Eu^3＋离子与一个MP-11分子中血红素基团的两个丙酸基的羧基氧发生强的配位作用,导致MP-11分子中血红素基团的非平面性、电化学可逆性和Fe（Ⅲ）的暴露程度增加.     

Ce（BH4）3和（Gua）Ce（BH4）2催化ε-己内酯聚合性能

合成两个稀土铈硼氢化物Ce(BH4)3和(Gua)Ce(BH4)2(Gua-=(Me3Si)2NC(NC6H11)2-),研究了它们催化ε-己内酯聚合的性能。结果显示,它们都是ε-己内酯开环聚合的有效催化剂,并且所得聚合物的分子量分布在1.40左右。在相同聚合条件下,Ce(BH4)3的催化活性比(Gua)Ce(BH4)2要高。在0℃条件下,Ce(BH4)3催化聚合过程有一定的可控特征。温度对聚合反应有很大的影响,温度越高,Ce(BH4)3的催化活性越高,而聚合物分子量越低。