小麦SSR标记的应用

SSR技术是建立在PCR技术上的新型分子标记,同其他分子标记相比,具有多态性高,重复性好、探作简单、结果稳定等特点.本文阐述了小麦SSR标记的技术路线,概括介绍了SSR标记在小麦中的应用.     

利用SSR标记构建沿阶草种质资源分子身份证

利用SSR分子标记构建沿阶草种质资源的分子身份证来鉴定各品种,选用已测序的、具有代表性的O.bodinieri(Tibet2387,Tibet3031,GY14,nie2370和nie2139)的种质基因组DNA为模板,从22对SSR引物中筛选出7对多态性好的核心引物,构建11份沿阶草种质资源的分子身份证,可有效区分各品种。建立优良的沿阶草条形码分子身份证,以及基于基因组测序或高密度连锁图谱构建开发一套备用引物,对沿阶草的高效利用将具有重要的意义。     

基于SSR分子标记吉安地区的水稻亲缘关系鉴定分析

稻种亲缘关系分析是生产优质杂交水稻的必要条件。本研究选取均匀分布于水稻基因组12条染色体的SSR分子标记,对8份水稻样品进行SSR分子标记分析,通过聚类分析法将其归类并计算得出遗传相似系数后,对8份水稻样品的亲缘关系进行了鉴定。结果表明：所选取的8份水稻样品中,其相似系数为0.65～1.00,在遗传相似系数0.65处,8份水稻样品聚为两大类群,其中5号‘赣迟A04’单独为一类,其他水稻样品聚为一类。在遗传相似系数0.80处,可划分为三大类群：第一类囊括了6种样品,表明这6个品种亲缘关系较近,其中6号‘赣早A02’与7号‘吉安早A07’疑似同一样品,3号‘井冈山迟A03’与4号‘井冈山早A05’的亲缘关系最近,而6号、7号同时与8号‘吉安迟A09’保持有最近的亲缘关系;第二类只含有2号‘迟-2’样品株;第三类则仅有5号稻株‘赣迟A04’,说明其与其他7份水稻样品的亲缘关系最远。本研究结果为杂交水稻的应用提供重要信息。     

SSR分子标记在作物遗传多样性研究中的应用现状

微卫星(microsatellites)或简单序列重复(simple sequence repeats,SSRs)是以1-6个碱基为基本单元的串联重复序列,具有含量丰富、多态性高、共显性和检测方法简单等优点,是研究植物遗传多样性的主要的分子标记方法之一,已被用于多种农作物的遗传多样性研究。概述了微卫星DNA标记的原理及特点,探讨了其在农作物物遗传多样性研究中的应用和发展前景。     

大豆SSR标记的遗传图谱的研究

SSR(简单重复序列)标记具有匀称、随机广泛地分布与大豆基因组,多态性高,呈孟德尔式遗传,共显性等特点,在基因组中的位置相对稳定,可以做其他标记的锚定标记。在大豆分子标记遗传图谱构建有重要的应用价值。     

分子标记研究的若干进展

分子标记（molecularInarker）即指与蛋白质和核酸相关的分子水平上的遗传标记,大致可分为同Ⅰ酶标记,RFLP标记和RADP标记等。研究生物遗传多样性和系统进化关系,首先必须找到恰当的遗传标记（geneticmarker）。恰当的遗传标记是随机选取的能代表生物体遗传组成,具有足够变异类型的标记组合。在生物系统进化和分类研究方面,经典的方法是以形态性状、杂交亲和性、地理生态分布、核型分析和染色体显带等特性作为遗体标记。无疑,经典的方法是重要的研究手段,然而,这些经典的方法基本上建立在宏观的形态观测水平,受环境影响大,研…     

新型的分子标记--SNPs

SNPs(Single nucleotide polymorphisms)是近年来发展起来的最有效的新一代分子标记。本文对SNPs的发展、基本原理、检测，以及在确定疾病相关基因研究中的应用进行了介绍和评述。     

利用SSR及ISSR分子标记研究苜蓿属及其近缘植物的亲缘关系

利用30对SSR引物和12个ISSR引物对苜蓿属(Medicago)及其近缘植物共11个物种的亲缘关系进行研究。通过遗传多样性研究及UPGMA聚类分析显示,"阔荚类群"(subgen.Platycapos)的4个种在两种分子标记下都聚为一支,符合其相似的形态学特征;"阔荚类群"在SSR分子标记中与胡卢巴属(Trigonella)聚成一支,网脉胡卢巴(T.cancellata)在ISSR分子标记中聚在"阔荚类群"中;两种分子标记中,"紫花苜蓿复合体"(Medicago sativa complex)3个种间的遗传距离都最短;南苜蓿(M.polymorpha)在两种分子标记下的聚类结果有所不同,SSR分子标记下与胡卢巴属的亲缘关系更近。研究说明苜蓿属与胡卢巴属具有很近的亲缘关系,苜蓿属内不同物种与胡卢巴属的亲缘关系有远有近,其中苜蓿属中的"阔荚类群"与胡卢巴属的关系最近,苜蓿属中其他物种与胡卢巴属的亲缘关系较远。     

分子标记及AFLP技术

分子标记类型可以基因表达的结果为基础,对基因的间接反映;分子标记则是DNA分子碱基序列变异的直接反映.早期利用限制性内切酶,酶切生物体DNA后来检测不同遗传位点等位变异(RFLP)和以一个碱基顺序随机排列的寡核苷酸序列为引物,利用对基因组DNA随机扩增来鉴别DNA多态性(RAPDs).真核生物基因组中普遍存在的重复序列产生了微卫星(microsatellites)标记技术.而RFLP与RAPDs有机结合形成了有着更为广阔的应用前景的AFLP技术.SNP标记利用大多数基因位点上都会有若干个等位型(alleles)为DNA芯片技术应用于遗传作图提供了基础.     

蓖麻遗传图谱构建初报

以YC1×YF181自交形成的161个F2单株为作图群体,利用345对SSR引物和30对ISSR选扩引物,在亲本YC1和YF181之间进行了多态性检测,筛选出80对SSR和1对ISSR引物用于F2群体分析.利用上述引物组合共检测到145个多态性标记位点,其中的124个标记构建了蓖麻分子连锁图谱该图谱覆盖基因组全长396 cM,平均图距7.76cM.     

SSR标记分离技术的研究概况

SSR标记是植物中目前运用的最广泛的分子标记之一，广泛地运用于植物种质鉴定、分子标记连锁图的构建和群体遗传学等诸多领域．由于SSR为共显性标记，可以区分纯合、杂合基因型，因而得到更广泛的应用．目前出现了有筛选文库、筛选富集文库、与其他现有技术结合、STMP技术等SSR标记方法．在这些技术中，目前运用最广泛而且比较成熟的方法是筛选富集文库的方法，STMP技术是目前效率最高的分离单个微卫星位点的方法，可以开发SSR标记．本文对这些技术的原理作了论述．     

利用小麦微卫星引物建立黑麦特异标记及其局限性

用50对小麦SSR引物对13种黑麦基因组DNA进行扩增,只有Xgwm232,Xgwm260,Xgwm644这3对小麦SSR引物能扩增出黑麦特异的片段．这些黑麦特异片段主要集中在500bp,600bp,800bp和1000bp左右,并包含了启动子区域．然而这3对SSR引物都不能从所有13种黑麦中扩增出黑麦特异条带．这一结果表明尽管利用小麦微卫星引物能够开发黑麦特异DNA标记,但这类标记不是对所有黑麦都适用．利用某一物种的微卫星引物开发其近缘种属的特异DNA标记虽然可行,但不一定具有通用性．     

不同作物间共用SSR引物的初步研究

根据相关报道,利用互联网在GENE BANK中查询油菜的简单重复序列及其两端序列来设计引物,并合成了2对甘蓝型油菜的SSR引物（Bn92A,Bn72A),通过所建立的降温PCR（Touchdown PCR)方法,对来自禾本科,十字花科,芸香科,锦葵科等12种经济作物的DNA进行PCR扩增。结果显示,PCR扩增产物条带清晰。所有12份材料用2对SSR引物扩增出的主带片段大小一致,分别为150bp(Bn92A),250bp(Bn72A）。这与文献报道在甘蓝型油菜中SSR扩增出的片段大小完全一致。本研究说明,各物种基因组间存在着相当大的相似性,这2对甘蓝型油菜的SSR引物可在其它经济作物分子标记的基因组比较作图应用。     

小麦中源于中间偃麦草抗白粉病基因PmCH5026的SSR定位

CH5026是衍生于八倍体小偃麦TAI7045的新品系,用高感品种(系)CH5065、晋太170分别与CH5026配置组合,于温室接种并调查F2、F3、BC1F2群体的抗感分离之比进行遗传分析,结果表明CH5026成株期对白粉菌E09小种的抗性受1对显性基因控制,暂命名为PmCH5026.使用集群分离分析法(BSA),用378对SSR引物对CH5026×CH5065 F2代群体进行分析,筛选到标记Xcfd233、Xbarc11和Xgwm539与抗性基因连锁,位置顺序为:Xcfd233-7.2cM-PmCH5026-4.9cM-Xbarc11-5.5cM-Xgwm539.根据小麦微卫星遗传连锁图及利用中国春第2同源群缺四体、双端体对SSR标记的定位结果,将PmCH5026定位在染色体2DL上.     

豇豆SSR标记在豌豆中的可转移性与应用初探

利用豇豆SSR引物筛选在豌豆具通用性的SSR引物。13对豇豆SSR引物中检测出8对引物在豌豆中可扩增,其中5对SSR引物表现出多态性,进而分析11个豌豆品种和5个豇豆品种的遗传多样性与遗传关系。结果表明:平均等位基因数、平均有效等位基因数、平均Shannon指数,在豌豆品种群中分别为2.00、1.64、0.55,豇豆品种群中分别为2.00、1.80、0.53,上述遗传参数反映出供试豌豆品种和豇豆品种具有中等水平的遗传多样性;利用UPGMA聚类分析,能将豌豆品种群和豇豆品种群分为两类,且每个品种群内的各个体之间能进行区分,尤其是两个豌豆品种亚群的聚类结果与其地理来源基本一致。     

Chromosomal Location of Gene for Earbranching of Barley Natural Mutant ＂f151＂ Using SSR Markers

0　IntroductionHighgrainyieldisoneoftheimportanttargetsinbarleybreeding .Thenumberofgrainsperearisoneofthethreeconstitutivefactorsofyieldinbarley ,andthenumberofspikeletsperearisanimportantfactorwhichaffectsonthenumberofgrainsperear .Earbranching ,differentfromgeneralbranching ,hasbeensuggestedbyAsana (1 970 )asaplanttypewhichbearsagreaternum berofspikeletsandtherebyincreasesthegrainproduc tion[1] .Therefore ,theexcavationandcultivationofear branchingbarleycouldlayasoundfoundationforsignifi c…     

利用SSR分子标记鉴定华南型黄瓜‘川绿15号’杂交种子纯度

目的 为了快速、简便和准确地鉴定华南型黄瓜‘ 川绿15号’杂交种子的纯度,方法 选用240个均匀分布在黄瓜基因组上的SSR分子标记对‘ 川绿15号’及其亲本进行多态性筛选及纯度鉴定。结果 本研究从240个黄瓜SSR分子标记筛选到2对SSR标记（Cs100和Cs109）符合父母本间呈互补带型的要求,可用于川绿15号’杂交种子的纯度鉴定。准确性验证结果显示Cs100和Cs109的分子鉴定结果与田间形态的鉴定结果一致并且均能将掺入的其他品种黄瓜种子区分开来。结论 本研究构建了以黄瓜特异性SSR分子标记Cs100和Cs109为核心引物的‘川绿15号’杂交种子纯度鉴定的技术方法,可快速、简便和准确地鉴定该品种的种子纯度,为该品种的制种和大面积推广提供技术支持。