人类基因组序列初步分析结果发表

作为一项科学成就 ,人们把这一揭示人体全部DNA约 30亿个碱基对之谜的工作与月球的攀登、原子的裂解以及汽车的发明等重大科技成就相媲美     

科学家绘出狗基因组序列草图

美目研究人员首次绘出了狗的基因组序列草图。通过对草图进行初步分析发现，被视为“人类最好朋友”的狗，在基因水平上与人类的相似程度要超过鼠。在9月26日出版的美国《科学》杂志上，美国马里兰州基因学研究所和基因组学促进中心的研究人员发表了这一研究成果。     

α1型干扰素等位基因在人基因组中分布的研究

人α型干扰素IFN-α家族相当庞大,家族成员之间的关系也很复杂叫.它除了包括近20个亚型成员外,某些亚型中还存在等位基因的变异.IFN-α的这一特点在IFN-α1和IFN-α2两种主要亚型中表现得尤为突出.例如,IFN-α2包括IFN-α2a,IFN-α2b和IFN-α2c三种等位基因产物.相似的情况亦存在于IFN-α1当中.Nagata等1980年从人胎肝染色体基因文     

蟑螂浓核病毒全核苷酸序列与基因组结构

测定了黑胸大蠊浓核病毒（ｐｆＤＮＶ）复制型（ＲＦ）ＤＮＡ的核苷酸序列,确定ｐｆＤＮＶ基因组全长为５４５４个核苷酸,基因组两末端存在典型的发夹结构和侄 置重复序列,ＰｆＤＮＶ基因正链有４个大的可读框（ＯＲＦ）,负链含３个大的可读框,并且可读框都集中在敏条链的５′端,两个可能的功能性启动了分别位于图距单位３和９７处,基因组存在基因重叠现象和内含子区域,半对ｐｆＤＮＶ基因组与同科其他细小病毒进行同源性比     

中国明对虾基因组串联重复序列分析

串联重复序列包括微卫星和小卫星重复序列, 前者的重复单位长度为1~6 bp, 后者的重复单位长度在7 bp以上. 通过对中国明对虾884 kb总长度的随机基因组DNA序列的分析, 从中共找到了2159个串联分布的重复序列, 其中微卫星序列1714个, 占总重复序列的79.4%, 小卫星序列445个, 占总重复序列的20.6%. 这些重复序列的总长度为116685 bp, 占总序列的比例为13.2%, 其中微卫星序列长度占9.78%, 小卫星序列长度占3.42%. 依据重复序列数目的多少, 前20种重复序列类型依次是: AT(557个)、AC(471个)、AG(274个)、AAT(92个)、A(56个)、AAG(28个)、ATC(27个)、ATAG(27个)、AGG(18个)、ACT(15个)、C(11个)、AAC(11个)、ACAT(11个)、CAGA(10个)、AGAA(9个)、AGGG(7个)、CAAA(7个)、CGCA(6个)、ATAA(6个)、AGAGAA(6个). 其中两碱基重复序列, 无论是在数目还是在序列长度上, 都占有绝对的优势, 而五碱基重复序列的数目和种类都很少, 只发现了AGAGA, GAGGC, AAAGA 3种; 同时发现由7, 11, 13等数学上称为质数的长度重复单位所组成的重复序列的数目和种类都要比其两边的重复序列的种类和数量要少.     

人类基因组序列图并非完美

在被问及人类基因组最新的一张碱基序列图时,冰岛科学家们认为其中有大约100个片段需要认真修改。 凯撒西部保留地大学(Case Western Reserve)的     

22周孕龄人胎肝表达序列标签数据更新与初步分析

随着国际上转录组数据及本室22周孕龄人胎肝表达序列标签数据的不断增加, 先前该组织表达谱的研究有必要进行更新与完善. 本研究首先将22周孕龄人胎肝每一表达序列标签与自身数据库, UniGene, DoTS, MGC以及Twinscan预测的人类转录组数据库进行比对以归类. 然后, 经过电子拼接和基因鉴定, 对已知基因进行GO (gene ontology)分类, 对未知基因进行Pfam和ScanProsite功能预测. 最后, 对人胎肝、成人肝、骨髓、胸腺及淋巴结这些拥有造血作用或可表明人胎肝特性的5种组织进行了层次聚类分析. 结果表明: (ⅰ) 与5种最新人类转录组数据库比对, 极大地降低了那些属于一个基因但互不交叠的序列被划分到不同簇的可能性, 因此在进行EST归类时, 推荐与互联网上有关最新数据进行比对; (ⅱ) 一些先前未知EST已被鉴定为已知基因, 1379个EST被鉴定为本室独有的全新序列; (ⅲ) 通过GO分类, 对22周孕龄人胎肝有了一个大致了解, 同时获得了6个细胞迁移基因和6个造血相关基因; (ⅳ) 通过基因功能预测获得了277个模体(profile), 其中有5个类型可分布于10个以上基因之中; (ⅴ) 层次聚类表明, 5种组织关系与它们的功能相一致; (ⅵ) 建立了世界上最大的22周孕龄人胎肝表达序列标签数据库. 总之, 22周孕龄人胎肝表达序列标签数据的更新与初步分析将有助于对人胎肝造血机制及细胞迁移机制的了解, 可促进未来对该组织进行全面深入的研究.     

大豆中NBS类抗病基因同源序列的分离与鉴定

植物抗病原克隆研究对于植物抗病育种和抗病机制的理解具有重要意义。根据预测结构域可将已知植物抗病基因分为4类,其中以NBS（nucleotide binding site)结构域为主。NBS结构域包括P环（激酶1a)、激酶2a和激酶3a。这为利用同源技术克隆植物抗病基因提供了可能。根据烟草抗花叶病毒N基因和拟南芥抗丁香假单孢杆菌RPS2基因设计兼并引物,从大豆抗花叶病毒品种科丰1号的基因组中扩增获得358个克隆,鉴定出4个能读的且与抗病基因NBS结构域同源的片段：KNBS1,KNBS2,KNBS3和KNBS4.Southern杂交表明NBS类抗病基因在大豆中为多拷贝家族;RFLP分析将KNBS4定位于F连锁群,而NBS2则与大豆抗花叶病毒基因Rsa的SCAR标记同位于J连锁群。Northern分析表明KNBS2类在大豆的根、茎和叶中为低丰度组成型表达,这为最终克隆大豆抗病基因打下了基础。     

基因组怎样为进化作准备

插入基因组一些DNA序列的,是那些能促发迅疾而广泛的遗传改变的区段。著名作家和癌学家刘易斯·托马斯（LewisThomas）曾经写道：“DNA对稍稍出错的包容,真是奇妙的事。没有这个特性,我们会仍是厌氧细菌,更不会有音乐。”像许多其他学者──诺贝尔奖金获得者巴巴拉·麦克琳托克（BarbaraMcClintock）是著名的例外──托马斯认为,遗传的改变,也即新物种的进化,源于一些基因的个别、微小、随机的突变。但是,大量增长的论据──多数发表于今年六月纽约科学院主持召开的《生物进化的分子策略》研讨会──表明,生物学家之主流必须…     

中国猕猴全基因组序列多态数据公布

近日,我国科学家在基因组学的知名刊物《Genome Biology》上首次发表了中国猕猴全基因组序列多态数据。猕猴是人类的近亲,也是在研究中最广泛使用的非人灵长类模式动物。虽然猕猴在生物学和医学方面的应用已经有很长的时间,     

第一个中国人基因组图谱绘制完成

第一个完整中国人基因组图谱（又称“炎黄一号”）近日由中国科学家在深圳盐田绘制完成，这也是第一个亚洲人全基因序列图谱。该项目是我国科学家用新一代测序技术独立完成的100％中国人基因组图谱。     

猪瘟病毒石门株全基因组cDNA文库构建、序列测定及分析

根据已发表的猪瘟病毒序列 ,设计并合成了 1 8对覆盖全长基因组的引物 .应用RT PCR技术从猪瘟病毒石门株感染的猪血中扩增出各相应的cDNA片段 ,分别克隆 ,构建了石门株全基因组的cDNA文库并完成了序列测定 .石门株基因组全长 1 2 2 98nt,其中 5′端和 3′端非编码区长度分别为 373和 2 31nt,中间一个大的开放阅读框长 1 1 6 97nt,翻译成一个包含3898个氨基酸残基的多聚蛋白 .还对石门株序列与其他猪瘟病毒序列进行了分析比较     

"双图"争辉--科学家绘出鸡基因组序列草图和遗传差异图谱

鸡基因组序列草图 2004年3月1日,美国人类基因组研究所发布新闻公报称,美国华盛顿大学威尔逊博士领导的一个小组经过一年工作,首次成功测绘出鸡的基因组序列草图。这也是迄今完成的首张禽鸟类物种的基因组序列草图。 威尔逊博士选择了家鸡的远祖——红原鸡(见上图)为测绘对象,绘出的草图中约包含10亿对碱     

人类基因组测序引起世人瞩目

人类基因组序列第一部分今日问世 由世界各国科学家联合参与、旨在破译人体细胞全部遗传密码的“人类基因组计划”取得第一次堪称里程碑的重大突破。今天,英国剑桥桑格中心的伊恩·邓纳姆（Ｉａｎ Ｄｕｎｈａｍ）及其同事在《自然》杂志上发表了２２号染色体的基因序列。２２号染色体是人类２３对染色体（位于细胞核内分离的ＤＮＡ分子）中次小的一对。 ２２号染色体的ＤＮＡ序列测定是包括美国、英国和日本在内的世界各国研究人员大规模联合攻关的结果。尽管它还含有一些小空白（由于技术原因尚未测序的ＤＮＡ段落）,但仍不失为一项令人…     

新世纪植物遗传学具有里程碑意义的科学事件——首例植物基因组序列测定

到目前为止,基因组已完全弄清楚了的生物有酵母菌、线虫、果蝇以及３０多种细菌,人类基因组的破译也基本接近尾声。今天,科学家们往这份名单上添加了一种植物：并在《自然》杂志上宣布,他们已完成了拟南芥菜（Arabidopsis thaliana,一种与芥菜有亲缘关系的小草）的ＤＮＡ测序。 人们对科学家选择一种野草作为生物学史上这么重要的一个里程碑似乎感到奇怪,因为它毕竟不会被用作人类食物也不会被用作家庭装饰。但拟南芥莱确实是一种非常典型的生物：遗传学家已由此学会了如何来预防小麦病害,促进番茄成熟,甚至使油菜的产量翻一番。典…     

不用比较的基因组分析

2004年4月29日的《自然》杂志发表了一篇论文 ,描述了一种检测蛋白质的选择压力的新方法 ,其新颖之处在于 :它可以只以一种单一基因组为研究对象 ,而不用 (传统方法 )比较核苷酸序列。经典的对蛋白质 (承受 )的选择压力进行测量的方法需要比较来自为数众多的个体或物种的核苷酸     

超越人类基因组

掌握了编码人类的所有DNA,随之而来的挑战就是怎样利用它了。也许一些最早的成果将出自称为蛋白组学(proteomics)的这一新兴领域。     

首批癌症基因组序列揭示变异如何导致疾病产生

<正>科学家从45岁身患黑素瘤皮肤癌和55岁身患小细胞肺癌的患者体内提取癌变细胞,然后利用基因测序仪分别解读患者的癌变细胞和健康组织的完整基因组。通过比对病变和健康细胞的遗传构造,科学家在建立仅在癌变组织中发现的所有分类目录后,     

《水稻基因组工程》序言

与美国启动人类基因组计划时的情形相仿,水稻基因组计划在我国启动的时候,也经历了曲折。“花了很多钱,将基因组的ＤＮＡ顺序全测出来了,也是一本不为人所看得懂的天书。”这是反对者的主要理由。纯粹的学术上争论是科学发展的一种动力,是件好事。当然,ＤＮＡ顺序本身不是天书。关于这一点,现在已是国际科学界的共识了。１９９６年,在众多国家实验室的共同努力下,完成了酿酒酵母１２０６．８万个核苷酸的全序列测定。从中确定了约５８８５个蛋白质基因,１４０个ｒＲＮＡ,４０个ＳｎＲＮＡ和２７５个ｔＲＮＡ基因。人们从此第一次…     

人脑新EST的分离及其表达特异性分析

为了解离发育和分化的机制,利用差异显著技术从１３和３３周和脑中分离到９０个ＥＳＴ。比较ＧｅｎＢａｎｋ以后发现其中的７４个ＥＳＴ代表新的基因,当中的一些与某些脑发育相关的基因同源。将来自差异显示的７个ＥＳＴ固定在膜上,用来自不同组织的总ｃＤＮＡＲＰＷＳＱＦ ＧＮ ＡＤＷ ＶＳ ＵＱ 进一步鉴定了其在胎儿脑中的差异表达。