探讨染色质重塑复合物SAGA的DUBm及其同源物的功能

染色质重塑复合物SAGA是真核细胞内非常重要的多亚基复合物,它参与了细胞内多种生物功能,SAGA的去泛素化亚模块（DUBm）及其同源物在近年来被提出,由于其重要性以及与SAGA功能的紧密联系而受到广泛的关注,本文对SAGA的DUBm及其同源物的组成及功能做了简要介绍。     

新研究解决核孔复合物调控亚端粒基因沉默

端粒是真核生物染色体中基因调控的一个特殊的位点,位于端粒附近的基因其转录活性往往受到抑制,但细胞如何精确地调控端粒末端基因转录沉默的作用机理尚不清楚。我国科研人员应用系统生物学手段分析,发现核孔复合物Nup170的缺失能导致端粒位置效应的消失,Nup170与组蛋白泛素化、组蛋白乙酰化、染色质重塑分子等众多参与染色质结构的基因存在着遗传互作,并发现其与染色质重塑分子Sth1之间存在着物理相互作用。研究人员还系统地绘制了Nup170在基因组的结合草图,发现了Nup170与亚端粒的结合依赖于端粒沉默信息分子Sir4途径。这项研究成果首次揭示出核孔复合物通过与染色质重塑分子作用调控亚端粒区     

高温影响拟南芥减数分裂染色质上5-甲基胞嘧啶的分布（英文）

在许多植物中,DNA甲基化的水平和分布能够影响DNA双链断裂和同源交叉在染色体上的形成和分布.在拟南芥中,高温会抑制DNA双链断裂和联会复合体的形成,从而影响同源交叉的形成和分布.然而,表观遗传修饰尤其是染色体的DNA甲基化是否会影响同源重组对高温的反应尚不清楚.研究利用针对5mC的抗体,对高温处理过的拟南芥前期染色体上5-甲基胞嘧啶（5mC）的分布进行了初步分析.在对照温度下,5mC信号主要位于4’,6-二氨基-2-苯基吲哚（DAPI）染色较深的染色体区域,即异染色质区域.而在高温条件下,5mC在不同的染色质区域的分布均发生了改变,这表明DNA甲基化位置在温度升高的情况下发生了改变.研究结果暗示环境温度升高可能通过改变DNA甲基化在染色体上的分布从而影响DNA双链断裂和/或同源交叉的模式.     

小麦染色体和间期集缩染色质孔洞及内在结构的观察

对小麦根端分生组织进行常规电镜观察的结果表明：小麦染色体和间期集缩染色质中均存在孔洞，里面有由颗粒和纤维构成的、类似于骨架的结构，对有关染色体骨架和染色质骨架之间以及它们与核基质之间的相互关系进行了讨论。     

1q42.3染色质区域一个前列腺癌特异性超级增强子样元件通过染色质相互作用促进细胞迁移

前列腺癌在全球男性中发病率居于前列,遗传因素是影响前列腺癌发生发展的主要因素. 研究报道1号染色体长臂42 区3 带至43 区(1q42.3-43)存在一个潜在的前列腺癌易感染色体座位,但这个易感座位与肿瘤关联的分子机制迄今未得到确认. 增强子是能够改变染色质活化状态的DNA 序列,通过精准调控基因时空表达从而决定细胞身份命运. 通过ChIP-seq 发现1q42.3 染色质区域存在一个前列腺癌特异性超级增强子样元件;利用CRISPR/Cas9 系统敲除该区段后发现细胞迁移能力明显降低,并利用RNA-seq 筛选出多个差异表达的基因;通过Hi-C 鉴定出与该超级增强子样元件相互作用的染色质区段;最后将RNA-seq 和Hi-C 进行综合分析预测出该超级增强子样元件直接调控的基因.     

小麦根端分生组织细胞内染色体/质上ATP酶活性的超微结构定位

本文采用磷酸铅沉淀的细胞化学方法，对小麦根端分生组织细胞内染色体上的ATPase活性进行了超微结构定位，结果显示：染色体上有大量ATPase的分布；同时还看到间期细胞核中染色质和核仁上ATPase的活性也很高．综合染色体／质的结构特点和ATPase在生命活动中的功能，作为染色体／质骨架的组成成分，ATPase除了与染色体／染色质在细胞周期中的动态变化密切相关外，可能还执行着一定的其它生物学功能。     

RNA-蛋白质复合物结构预测研究进展

RNA-蛋白质复合物是生命体中参与细胞活动的重要生物大分子,相关复合物三级结构的测定对理解细胞活动过程和相关疾病的治疗有重要帮助.然而,实验测定RNA-蛋白质复合物分子结构需要大量的时间和财力,高分辨率的复合物结构测定依然面临重大挑战. RNA-蛋白质复合物结构预测是目前软物质物理和生物物理学领域最具挑战性和影响力的研究方向之一.本文首先综述了RNA-蛋白质复合物结构预测的研究进展与挑战,随后讨论了如何优化复合物结构采样和结构评估,最后对如何利用生物分子大数据和深度学习模型进一步优化RNA-蛋白质复合物预测方法做了展望.     

中华大蟾蜍染色质、染色体细微结构的光镜研究

DNA螺旋如何包扎形成染色体,是细胞生物学中一个尚未完全解决的问题.七十年代以后,由于核小体的发现,对染色体一、二级结构已有许多研究.认为染色体一级结构为100(?)的串珠状染色质纤维,100(?)纤维经过螺旋以螺线管的方式形成300(?)纤维.至于300(?)纤维何如形成染色体,即染色体高级结构怎样形成,仍无统一的认识,争论问题之一是染色质300(?)纤维与中期染色体之间,有否直径为0.4μm的中间级构等级,即染色体三级结构.(Bak称之为单位线.)     

关于染色质结构研究的若干进展

染色质是真核细胞间期核中DNA和蛋白质组成的复合体。关于染色质结构的研究一直是细胞生物学的重大理论课题。1973年,人们发现了染色质的基本结构单位——核粒。这是染色质结构研究中的突破性进展。七十年代里,一些学者对染色质结构的研究情况做过综述。八十年代以来,关于染色质结构的研究发展很快。目前,人们对于核粒核心的结构细节、核粒结构的动态变化以及染色质高层次结构等等问题都有了进一步的了解。下面仅就上述几个问题的近年来研究进展做一简要介绍。     

蛋白质光谱探针研究进展

蛋白质分析是生命科学研究中的重要课题。蛋白质内源紫外吸收光谱和荧光光谱可以用于蛋白质分析，但其灵敏度不能满足微量分析的要求。蛋白质光谱探针（包括金属离子、有机试剂和金属络合物）能够与蛋白质相互作用生成超分子复合物并引起体系光谱信号的变化，由此可以提供蛋白质含量或结构方面的信息。根据光分析方法的不同，蛋白质光谱探针可以分为吸光探针、荧光探针和光散射探针3类。本文中，笔者综述了蛋白质光谱探针的研究进展，讨论了发展趋势。