环己烯类神经氨酸酶抑制剂的三维定量构效关系研究

环己烯类神经氨酸酶抑制剂是目前效果最好的流感病毒抑制剂.选取26个典型的环己烯类神经氨酸酶抑制剂,应用比较分子力场分析(CoMFA)方法,研究它们与神经氨酸酶(NA)的相互作用,建立了环己烯类NA抑制剂与NA的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型.该模型的最佳非交叉验证系数R2为0.991,交叉验证系数R2cv为0.760,检测值F为521.53,标准偏差SEE为0.098,立体场、静电场的贡献分别为74.6%、25.4%,最佳主成分为4,这表明模型具有很强的稳定性和预测能力.用该模型对随机挑选的3个化合物进行预测,得到了满意的结果.     

基于化学荧光法的双黄连口服液神经氨酸酶抑制活性测定

建立流感病毒神经氨酸酶体外活性荧光检测法测定双黄连口服液的NA抑制生物活性.采用化学荧光法测定双黄连口服液对神经氨酸酶的抑制率.结果表明,反应后溶液荧光强度与产物4-MU浓度在0.1~1.2μg/m L内成良好的线性相关系(Y=39482X-254.05(r=0.9994)),该测定方法的精密度与重复性良好,反应后溶液在4℃条件下4 h内稳定,双黄连口服液对流感病毒神经氨酸酶的抑制率高达64.20%.该方法可用于测定双黄连口服液对神经氨酸酶抑制活性测定.     

碳环类神经氨酸酶抑制剂的2D-QSAR研究

对32个碳环类神经氨酸酶抑制剂进行了二维定量构效关系（2D-QSAR）研究，27个作为训练集，5个作为测试集，对计算所得的理化和量化参数进行预选后，采用偏最小二乘法（Partial least squares，PLS）建立预测模型，该模型的非交叉法验证相关系数为R^2=0．9762，交叉法验证相关系数为RCV^2=0．9651；以此预测模型对测试集的5个化合物的活性进行预测，相关系数为Rpred^2=0．8779，表明该模型具有较强的预测能力，可以指导对已有的流感药物进行化学修饰，并能指导新的神经氨酸酶抑制剂的设计及合成．     

流感病毒神经氨酸酶基因在COS细胞中的表达

将含分泌型甲型流感病毒神经氨酸酶cDNA的SV_(40)晚期区段取代载体转染COS细胞后,可在细胞培养液中测出高酶活力。酶联免疫吸附测定表明,NA在COS细胞培养液中的含量为1μg/ml。为避免新合成的酶在高温下失活,转染后的COS细胞改在28℃培养。培养液不添加pH指示剂。利于NA活力的维持和稳定。     

黄酮类药物抗氧化活性的理论研究

黄酮类药物具有广谱的药理活性和较低毒性,其中抗氧化活性非常重要.本文利用半经验分子轨道AM1方法对黄酮类药物进行了量化计算,通过计算得到羟基氧原子Mulliken电荷值,B环上6个C原子电荷之和QB等量化参数,结合疏水参数logP对黄酮类药物的抗氧化活性进行理论研究.结果表明:黄酮分子上羟基氧的MC(Mulliken Charge)值,QB的大小,羟基数目Nh及其在分子结构上的位置,C2-C3之间是否双键结构以及疏水参数logP对黄酮类药物的抗氧化活性都有重要影响.选取不同参数组合建立三个QSAR方程,经检验其稳定性和预测能力较好.     

近百年来全球气候变暖的倾向和甲型流感病毒神经氨酸酶进化的倾向

用氨基酸对的可预测性量化3874个甲型流感病毒神经氨酸酶,分析其进化趋势,并与近百年来全球气温变化趋势进行比较。结果显示,神经氨酸酶的进化和全球气温的变化有明显的相似趋势,而且这种趋势在一些神经氨酸酶的亚型和不同种属中依然存在。该分析结果是了解全球变暖影响甲型流感病毒进化的第一步。     

流感病毒H3N2血凝素基因和神经氨酸酶基因在真核酵母菌中的表达

目的克隆、表达和鉴定流感病毒H3N2血凝素基因(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶基因(neuramidinase,NA)序列,为制备抗体和基因工程疫苗打下基础。方法在成功克隆流感病毒H3N2全长HA、NA基因并测序的基础上,将部分基因序列克隆到表达载体pMET A上,构建了重组表达质粒pMET A/HA(52 bp～1 549 bp)、pMET A/NA(121 bp～1 260 bp),电转化真核酵母菌pMAD16,甲醇诱导表达,利用Ni2+亲和层析柱对重组蛋白进行纯化,并用Western Blotting和ELISA方法检测其抗原性。结果重组蛋白在酵母菌中可以高效表达,SDS-PAGE显示蛋白表达后形成了二聚体,蛋白纯度占总蛋白的95%以上,ELISA和Western Blotting实验证实,重组蛋白具有良好的抗原性。结论本研究成功克隆和表达了流感病毒H3N2 HA、NA基因序列,为流感病毒H3N2诊断试剂和疫苗开发等进一步研究奠定了基础。     

禽流感病毒HSNl血凝素基因和神经氨酸酶基因在真核酵母菌中的表达毒

目的克隆、表达和鉴定禽流感病毒HSNI血凝素基因(hemaggludnin,HA)和神经氨酸酶基因(neuramidinase,NA) 序列,为制备抗体和基因T程疫苗打下基础。方法在成功克隆禽流感病毒H5NI全长HA、NA基因并测序的基础 上。将部分基因序列克隆到表达载体pMET A上,构建了重组表达质粒pMET A／HA(49一l 587 bp)、pMET A／NA (121—1 200 bp),电转化真核酵母菌pMADl6,甲醇诱导表达,利用Ni“亲和层析柱对重组蛋白进行纯化,并用 Western Blotting和ELISA方法检测其抗原性。结果重组蛋白在酵母菌中可以高效表达,SDS—PAGE显示蛋白表 达后形成了二聚体,蛋白纯度占总蛋白的95％以上,ELISA和Western Blotting实验证实,重组蛋白具有良好的抗原 性。结论本研究成功克隆和表达了禽流感病毒H5NI HA、NA基因序列,为禽流感病毒H5N1诊断试剂和疫苗的 开发等进一步的研究提供了依据。     

禽流感病毒H5N1血凝素基因和神经氨酸酶基因在真核酵母菌中的表达

目的克隆、表达和鉴定禽流感病毒H5N1血凝素基因（hemagglutinin,HA）和神经氨酸酶基因（neuramidinase,NA）序列,为制备抗体和基因工程疫苗打下基础。方法在成功克隆禽流感病毒H5N1全长HA、NA基因并测序的基础上,将部分基因序列克隆到表达载体pMET A上,构建了重组表达质粒pMET A/HA（49～1 587 bp）、pMET A/NA（121～1 200 bp）,电转化真核酵母菌pMAD16,甲醇诱导表达,利用Ni2＋亲和层析柱对重组蛋白进行纯化,并用Western Blotting和ELISA方法检测其抗原性。结果重组蛋白在酵母菌中可以高效表达,SDS-PAGE显示蛋白表达后形成了二聚体,蛋白纯度占总蛋白的95%以上,ELISA和Western Blotting实验证实,重组蛋白具有良好的抗原性。结论本研究成功克隆和表达了禽流感病毒H5N1 HA、NA基因序列,为禽流感病毒H5N1诊断试剂和疫苗的开发等进一步的研究提供了依据。     

神经氨酸苷酶抑制剂研究进展

神经氨酸苷酶(NA)是流感病毒的一种主要表面糖蛋白,在病毒致病过程中起重要作用.本文对以NA为药物靶点,设计的各种NA抑制剂作以综述.     

苯的衍生物的HQSAR研究

应用分子全息结构描述子表征69种苯的衍生物建立相关QSAR模型，并且对分子全息产生过程中的碎片区分参数及碎片长度与模型质量的关系进行了探讨．在最佳全息条件下产生的模型相关系数r^2为0．997、交叉验证相关系数q^2LOO为0．841，研究结果表明所建立模型具有良好的拟合效果，同时具有较高的预测能力．     

二吡啶苯并二氮杂酮化合物抑制HIV-1的定量构效关系研究

应用量子化学MP3方法对电子结构进行优化,并用MNDO方法计算了21种二吡啶苯并氮杂酮化合物的电子结构,并对其抑制HIV-1病毒活性进行了QSAR研究,结果得到了一个多元线性方程.二吡啶苯并氮杂草酮化合物的活性与7位上的净电荷Q7、偶极矩DIPO以及C环上的净电荷Qc之间有较大的关系.当7位上的正电荷越多则活性越大,分子的偶极矩越小则活性越大,当C环上的净电荷总和越负则活性越大.相关分析的数据还表明,在影响活性大小的诸多因素中,Q7的影响最大.其次是logP与DIPO.据此,可以预测并指导合成有关的抗HIV-1的药物.     

基于人芳香酶的雄甾烷衍生物抗乳腺癌构效关系研究

为研究以雄甾烷衍生物作为人芳香酶抑制剂的构效关系,以ZINC数据库中80%相似性的5045种类似结构化合物为配体,利用蛋白质晶体数据(3EQM)通过Sybyl软件中的SurFlex模块进行分子对接虚拟筛选并打分,得到分值在8.0分以上的25个化合物作为中靶化合物.     

硝基芳烃对隆线蚤的毒性作用及QSAR研究

得到２４种硝基芳烃对隆线蚤的半数有效抑制浓度值,其毒性由高到低的顺序为：二硝基氯苯〉二硝基苯〉二氯硝基苯〉硝基苯胺＝硝基氯苯＝硝基甲苯〉硝基苯酚〉硝基苯,其中１１种化合物对隆线蚤的－ｌｇＥＣ５０,以Ｉ,Ｘ－Ｅ１／２,∑σ,ΔＨｆ,－Ｅｌｕｍｏ,ｌｇｐ七种物理化学参数做ＱＳＡＲ计算,得出八种回归方程。     

直立黄芪中黄酮类似物的研究

从直立黄芪（Ａ．ａｄｓｕｒｇｅｕｓｐａｌｌ）中分离鉴定了５种黄酮类化合物，分别为３’，７－羟基－２＇，４＇－二甲氧基异黄烷Ｉ；札坡替宁２；黄芪甙３；异槲皮甙４；芸香甙５．其中１、２两种化合物在豆科植物中首次分离得到。     

SVR—CKNN预测用于HIV-1蛋白酶抑制剂QSAR建模

为提高药物定量构效关系（QSAR）模型预测精度,发展了一种新的QSAR建模方法SVR—CKNN。该法基于支持向量机回归（SVR）自动筛选化合物结构描述符,以k-最近邻建立多个子模型实施组合预测（CKNN）。应用于49种HIV-1蛋白酶抑制剂QSAR研究,留一法预测结果表明SVR—CKNN预测精度明显优于多元线性回归（MLR）、逐步回归（SLR）、偏最小二乘回归（PLS）和神经网络（BP—ANN）等传统模型。SVR—CKNN基于结构风险最小,具非线性、适于小样本、泛化推广能力强、稳定性好、不依赖操作者经验等诸多优点,在药物设计等研究中应用前景广泛。     

1,4-苯并二氮杂-2,5-二酮类化合物的三维构效关系研究

利用比较分子场分析（ Ｃｏｍ ｐａｒａｔｉｖｅ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｆｉｅｌｄ Ａｎａｌｙｓｉｓ, Ｃｏ Ｍ Ｆ Ａ）对２２ 种１,４苯并二氮杂艹卓２,５二酮类化合物进行了三维定量构效关系研究（３ Ｄ Ｑ Ｓ Ａ Ｒ）． 结果表明影响其活性的主要因素为空间立体作用能,得到了具有较强预测能力的 Ｑ Ｓ Ａ Ｒ 模型,为合理药物分子设计提供了有益的信息     

硝基苯化合物生物毒性的定量构效关系研究

为深入认识硝基苯类化合物活性与其结构之间的关系,基于逐步回归方法,建立了精度较高的QSAR多元回归模型.研究中提取了35种硝基苯类化合物的5种结构参数、5种量子化学描述符及1种分子指示变量.运用逐步回归方法进行了变量的压缩和选择.进而实施了多元回归分析,并由所得结果进行了硝基苯类化合物结构与生物毒性关系的理论解释.