2-芳基苯并二氢吡喃-4-酮类衍生物抗菌活性的定量构效关系研究及分子设计

为了研究2-杂环芳基苯并二氢吡喃-4-酮类衍生物对水稻稻疫病杀菌活性,开发新型高活性杀菌剂.采用分子连接性指数和分子电性距离矢量表征2-杂环芳基苯并二氢吡喃-4-酮类衍生物的分子结构,通过最佳变量子集回归的方法建立34个化合物杀菌活性的四元线性回归方程,非交叉相关系数(R2)和交叉相关系数(R2v)分别为0.854和0...     

哒嗪酮类(1,3)-β-D-葡聚糖合成酶抑制剂的三维定量构效关系研究

为了探讨哒嗪酮类(1,3)-β-D-葡聚糖合成酶抑制剂的结构与其药理活性的相互关系,本次研究拟对20个哒嗪酮类化合物分别利用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)进行三维定量构效关系(3D-QSAR)的研究,并各自建立起相应的模型.通过对计算结果进行分析发现:利用CoMFA建立起来的模型相关系数r~2=0.999,交叉验证系数q~2=0.585;而CoMSIA模型的相关系数r~2=0.987,交叉验证系数q~2=0.534,均满足标准模型的需要.而将这2种方法建立起来的3D-QSAR模型用于哒嗪酮类化合物的抗真菌活性的预测,也均表现出良好的效果.并且从等值面图的分析可以看出,在哒嗪酮类(1,3)-β-D-葡聚糖合成酶抑制剂的结构上适当引入一些疏水基团和氢键受体可以增强该类化合物的抗真菌活性.     

吡喃酮类化合物定量构效关系研究

采用分子结构描述符对吡喃酮类化合物进行结构表征和抗人类免疫缺陷病毒(HIV)的活性预测,通过逐步回归(SMR)方法建立了分子结构描述符与活性之间的定量模型,取得了良好的结果,其模型相关系数R=0.985 7;继以留一法(LOO)进行交互检验,相关系数R=0.954 6,说明定量相关模型具有良好的稳定性和预测能力。     

降糖药二肽基肽酶-4抑制剂的构效关系研究进展

二肽基肽酶-4抑制剂特异性地抑制肠促胰岛素的降解,GLP-1和GIP,这两者都是血糖稳态的重要调节剂.由于其潜在的生物功能,二肽基肽酶-4抑制剂目前已经成为治疗糖尿病的有效的治疗策略.目前,几种二肽基肽酶-4抑制剂已被批准用于2型糖尿病的治疗或正在进行临床评估.在以二肽基肽酶-4抑制剂为中心的长期研发过程中,化学稳定性、选择性和药代动力学性能一直受到重视.文章介绍了自1998年起二肽基肽酶-4抑制剂的发展状况,并将其根据核心结构分为几类同时讨论其构效关系.     

6-甲基-4-羟基-2-吡喃酮的合成

本文报道了以Meldrum酸为原料经两步合成6-甲基-4-羟基-2-吡喃酮的方法:将文献中酸催化关环,加热脱羧两步反应改进为在溶剂中回流一步完成.     

新型1,5-二芳基咪唑类选择性COX-2抑制剂的抗炎构效关系

采用PM5半经验量子化学方法对29个新型1,5-二芳基咪唑类选择性环氧合酶(COX-2)抑制剂的结构进行了全优化,从数据库搜寻或计算了它们的430种结构参数,利用遗传算法和逐步回归方法,建立了经典结构-活性关系(2D-QSAR)。抑制剂结构优化表明活性1,5-二芳基咪唑类选择性环氧合酶(COX-2)抑制剂具有类似塞来昔布等三环类环氧合酶-2选择性抑制剂的立体结构,但构效关系研究则表明该类抑制剂具有不同于塞来昔布等传统COX-2选择性抑制剂的新型构效关系。     

5-乙酰胺基-4-(4-氯苯基)-2-甲基-6-氧代-5,6-二氢-4H-吡喃-3-羧酸乙酯的合成及晶体结构

乙酰基甘氨酸与对氯苯甲醛通过经典的Erlenmeyer步骤合成了(Z)-2-甲基-4-对氯苯亚甲基-5(4 H)-噁唑酮,然后与乙酰乙酸乙酯在三乙胺催化下发生Michael加成,之后经酮式烯醇式的互变,再通过分子内的亲核加成得到5-乙酰胺基-4-(4-氯苯基)-2-甲基-6-氧代-5,6-二氢-4 H-吡喃-3-羧酸乙酯,并用IR、NMR、MS及X-单晶衍射法对其结构进行研究。结果表明,晶体结构属正交晶系,Pbca空间群,晶胞参数:a=1.189 29(13)nm,b=0.968 44(10)nm,c=3.172 1(2)nm,V=3.653 5(6)nm3,Z=8,Mr=351.77,Dc=1.279 Mg/m3,λ=0.071 073nm,μ(MoKα)=0.234mm-1,F(000)=1 472,最终偏离因子(对I2σ(I)的1 413个衍射点)R=0.098 5,wR=0.245 4,化合物中的N—H和氧原子形成的分子间氢键使整个分子连接成一维链状的稳定结构。     

2-苯基-4,5-二(4′-溴苯基)咪唑的合成及反应机理

研究2-苯基-4,5-二(4′-溴苯基)咪唑的合成及反应机理.以对溴苯甲醛为原料通过催化,氧化生成1,2-二(4′-溴苯基)乙二酮,再以其与苯甲醛、醋酸胺和醋酸通过德布斯法合成2-苯基-4,5-二(4′-溴基苯基)咪唑.优化对最后环合加成反应的工艺条件并研究其反应机理,较佳反应条件为1,2-二(4′-溴苯基)乙二酮∶苯甲醛∶醋酸铵物质的量比为1∶1.2 ∶10,醋酸2 mL,反应时间5 h .在此条件下,目标产物收率达92.3 %.     

4-氨磺酰基苯基重氮氨基-4-苯基-2-噻唑的合成及与汞的显色反应

本文合成了4—氨磺酰基苯基重氮氨基—4—苯基—2—噻唑（SPDAPT）．在pH10.4的硼砂缓冲介质中,十二烷基苯磺酸钠存在下,SPDPT与Hg2形成2:1的紫红色配合物．配合物的λmax为520nm,表现摩尔吸光系数＝6.75×104L·mol-1．汞量在0～480μg·L-1符合比尔定律．最低检测限为24μg·L－1。用于废水中微量Hg2的测定,结果满意．     

1,4-苯并二氮杂-2,5-二酮类化合物的三维构效关系研究

利用比较分子场分析（ Ｃｏｍ ｐａｒａｔｉｖｅ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｆｉｅｌｄ Ａｎａｌｙｓｉｓ, Ｃｏ Ｍ Ｆ Ａ）对２２ 种１,４苯并二氮杂艹卓２,５二酮类化合物进行了三维定量构效关系研究（３ Ｄ Ｑ Ｓ Ａ Ｒ）． 结果表明影响其活性的主要因素为空间立体作用能,得到了具有较强预测能力的 Ｑ Ｓ Ａ Ｒ 模型,为合理药物分子设计提供了有益的信息     

一类鬼臼毒素衍生物抗癌(KB细胞)活性的三维定量构效关系

采用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似因子分析(CoMSIA)方法,对99个鬼臼毒素衍生物的抗癌活性系统地作了三维定量构效关系研究,均得到了较为理想的模型.coMFA所得模型的交叉验证系数q2=0.644,非交叉验证相关系数r2=0.930,标准偏差S=0.134,F=161.325,立体场与静电场贡献分别为64.6%和35.4%.CoMSIA所得模型的q2=0.764,r2=0.964,S=0.096,F=324.112,立体场、静电场、疏水场、氢键给体场、氖键受体场贡献分别为9.5%,22.0%,21.9%,23.9%和22.7%.两模型的等值面图为改造此类化合物的结构、提高药物活性提供了理论依据和研究方向.     

地棘蛙素类似物的CoMFA和CoMSIA的3D-QSAR研究

采用比较分子力场 (CoMFA)分析法和比较分子相似性指标场(CoMSIA)分析法,进行偏最小二乘法(PLS)分析,建立了地棘蛙素类化合物的三维构效模型.通过验证,说明该系列化合物分子立体场、静电场、氢键场和疏水场的分布与生物活性之间有良好的相关性.用模型预测同系列测试集分子,结果与实验值偏差较小.预测结果表明,该力场模型有一定的预测能力.并得出了新的药效团定义模型,可用来指导设计新的地棘蛙素类化合物烟碱型乙酰胆碱配体.     

5-HT 6受体拮抗剂三维定量构效关系研究

为指导合成高效的5-HT6受体拮抗剂,采用比较分子场分析(CoMFA)和比较相似性指数分析(CoMSIA)对143个5-HT6受体拮抗剂数据进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,分别得到了具有良好可靠性和预测能力的CoMFA(Q2=0.513,R2ncv=0.864,R2pre=0.731)和CoMSIA模型(Q2=0.515,R2ncv=0.844,R2pre=0.777).由模型的等势线图分析,可得如下结论:大体积及/或电负性较大的R2取代基、疏水性R3和疏水性苯环R1位取代基、可作氢键受体的R2取代基、可作氢键供体的R3取代基有助于增大活性.这些结论能够更好地帮助理解5-HT6受体拮抗剂的抑制机理,并为今后的药物设计与合成提供新思路.     

抗癌药物α,β不饱和羰基化合物3D-QSAR研究

采用CoMFA和CoMSIA方法对31个α,β不饱和羰基化合物进行了三维定量构效关系研究,所得模型都具有良好统计学意义.CoMFA:q~2=0.687,R~2=0.956,N=9,SEE=0.090;CoMSIA:q~2=0.756,R2=0.954,N=9,SEE=0.093.通过三维等值图分析其影响抑制剂分子的活性因素,并设计出了新的活性较高抑制性分子.     

Study on structure-activity relationship of mutation-dependent herbicide resistance acetohydroxyacid synthase through 3D-QSAR and mutation

Seventy-four sulfonylureas were synthesized and tested for their inhibitory activity against the whole enzyme of E. coli acetohydroxyacid synthase (AHAS, EC 2.2.1.6) isoenzyme II, and 3D-QSAR analyses were performed based on these inhibitory activities. The binding conformation of chlorimuron-ethyl, a commercial herbicide of AHAS, in the crystal structure of AHAS complex was extracted and used as template to build the initial three-dimensional structure of other sulfonylureas, and then all structures were fully geometry optimized. After systematic optimization of the alignment rule, molecular orienta- tion, grid space and attenuation factor, two satisfactory models with excellent performances (CoMFA: q2 = 0.735, r2 = 0.954, n = 7, r 2 pred = 0.832; CoMSIA: q2 = 0.721, r2 = 0.913, n = 8, r 2pred = 0.844) were estab- lished. By mapping the 3D contour maps of CoMFA and CoMSIA models into the possible inhibitory active site in the crystal structure of catalytic subunit of yeast AHAS, a plausible binding model for AHAS, with best fit QSAR in the literature so far, was proposed. Moreover, the results of 3D-QSAR were further utilized to interpret resistance of site-directed mutants. A relative activity index (RAI) for AHAS enzyme mutant was defined for the first time to relate the 3D-QSAR and resistance of mutants. This study, for the first time, demonstrated that combination of 3D-QSAR and enzyme mutation can be used to decipher the molecular basis of ligand-receptor interaction mechanism. This study refined our understanding of the ligand-receptor interaction and resistance mechanism in AHAS-sulfonylurea system, and provided basis for designing new potent herbicides to combat the herbicide resistance.     

定量构效关系研究进展及其应用

定量构效关系是目前国际上一个比较活跃的研究领域.本文简要介绍了定量构效关系的发展历史及定量构效关系研究中常用方法等,其中较为详细地介绍了三维定量构效关系中广泛应用的CoMFA方法.综述了定量构效关系在环境污染物分析以及在农药、医药设计中的应用,并对定量构效关系研究的发展趋势进行了展望.     

6-(1-萘甲基)取代S-DABO类逆转录酶抑制剂的3D-QSAR研究

以活性化合物15为例,采用分子对接的方法模拟了化合物与HIV-1逆转录酶的作用,从而探讨了系列6-萘甲基取代S-DABO类化合物的作用机制.并基于分子对接后的活性构象,应用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似因子分析(CoMSIA)法对该类化合物的三维定量构效关系进行了研究,建立了有较好预测能力3D-QSAR模型,为该类化合物进一步的结构优化提供理论指导.     

比较分子力场分析法研究3-芳基喹唑啉酮衍生物的定量构效关系研究

运用比较分子力场分析（CoMFA）方法对45个3-芳基喹唑啉酮衍生物进行了三维定量构效关系研究．考察了不同的步长、探针原子以及电荷的计算方法等对构建模型的影响．建立的最佳模型交叉验证相关系数（q^2）为0．662，非交叉验证相关系数（R^2）为0．963，标准偏差（s）为0．203．该模型的建立为选择性雌激素受体β亚型调节剂的结构优化提供了理论支持．