Hsp16.3中一个高度保守疏水残基的定点突变

结核杆菌小分子热休克蛋白Ｈｓｐ１６．３为一由三个三聚体组成的寡聚蛋白,并具有分子伴娘活性（Ｃｈａｎｇｅｔａｌ．,Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．,１９９６,２７１：７２１８～７２２３）。为研究高度保守疏水片段中高度保守疏水亮氨酸残基（Ｌｅｕ１２１）对寡聚体结构和活性的影响,该残基被分别定点突变成天冬氨酸（Ａｓｐ）、天冬酰胺（Ａｓｎ）、缬氨酸（Ｖａｌ）和丙氨酸（Ａｌａ）等。结果发现当Ｌｅｕ１２１被突变成Ｖａｌ和Ａｌａ时,通过ＳＤＳ－ＰＡＧＥ凝胶电泳检测仍可见重组蛋白在大肠杆菌中的高水平表达,而当被突变成Ａｓｐ和Ａｓｎ时,在ＳＤＳ－ＰＡＧＥ胶上,见不到Ｈｓｐ１６．３蛋白带。表明该残基可能对寡聚蛋白的结构稳定起重要作用。     

NARMAX模型辨识的直交化最小二乘新算法

基于实际中常用的ＣＧＳ（ＣｌａｓｓｉｃａｌＧｒａｍ－Ｓｃｈｍｉｄｔ）、ＭＧＳ（ＭｏｄｉｆｉｅｄＧｒａｍ－Ｓｃｈｍｉｄｔ）、ＨＴ（ＨｏｕｓｅｈｏｌｄｅｒＴｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ）及Ｇｉｖｅｎｓ算法，给出了１类改进的直交化最小二乘新算法，分别称之为改进的ＣＧＳ、ＭＧＳ、ＭＨＴ及ＭＧＶ算法，改善了原算法的数值稳定性．将改进算法用于非线性ＮＡＲＭＡＸ模型辨识，构造出了１种新的模型结构与参数辨识的一体化算法．新算法基于逐步回归进行模型选项并消去模型中的冗余项，保证了最终模型的结构优化，并可给出比Ｂｉｌｉｎｇｓ等算法精度更高的参数估计．仿真结果证明了文章中算法的优越性     

CONTENTS JOURNAL OF HOHAI UNIVERSITY 2 0 0 1(Figures in brackets are No.Pagere spectively)

ＲｅｓｅａｒｃｈｏｆＯｎｅ ｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌＣｏｎｓｏｌｉｄａｔｉｏｎＴｈｅｏｒｙＣｏｎｓｉｄｅｒｉｎｇＮｏｎｌｉｎｅａｒＣｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆＳｏｉｌＳＨＩＪｉａｎ ｙｏｎｇ ,ＹＡＮＧＬｉ ａｎｇ ,ＺＨＡＯＷｅｉ ｂｉｎｇ ,ｅｔａｌ (1,1)………………………………………………………………………ＮｕｍｅｒｉｃａｌＣａｌｃｕｌａｔｉｏｎｆｏｒＩｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｂｅｔｗｅｅｎＮｏｎｌｉｎｅａｒＲａｎｄｏｍＷａｖｅｓａｎｄＶｅｒｔｉｃａｌＷａｌｌｓａｎｄＳｔａｔｉｓｔｉｃａｌＡｎａｌｙ…     

不同分子量的探针在细胞间的运输

利用Ｏｐｔｏｎ显微注射系统（Ｍｉｃｒｏｉｎｊｅｃｔｉｏｎｓｙｓｔｅｍ）将不同分子量的荧光分子探针分别注射到不同生育期的紫竹梅雄蕊花丝毛细胞内，在ＯｌｙｍｐｕｓＢＨ—２型荧光显微镜下观察探针在细胞内的转移情况，取得以下结果，花蕾和开放花的雄蕊花丝毛细胞的胞间连丝允许ＬＲＢ（５５９Ｄａ），ＦＩＴＣ－（Ａｌａ）６（８７０．３Ｄａ）通过，而ＦＩＴＣ－Ｌｅｕ－Ａｒｇ－Ａｒｇ－Ａｌａ－Ｓｅｒ－Ｖａｌ－Ａｌａ（１１６１．３Ｄａ）难以通过．花蕾和开放花的雄蕊花丝毛细胞间的胞间连丝的通透性差异不大．且允许通过的分子探针不超过１１６１．３Ｄａ．在花蕾和开放花的雄蕊花丝毛细胞间不能通过的分子探针ＦＩＴＣ－Ｌｅｕ－Ａｒｇ－Ａｒｇ－Ａｌａ－Ｓｅｒ－Ｖａｌ－Ａｌａ（１１６１．３Ｄａ），ＦＩＴＣ－ＩｎｓｕｌｉｎＡＣｈａｉｎ（２９２１．０Ｄａ）在衰老花雄蕊花丝毛细胞间可以转移，但分子量为４４００．０Ｄｅ和９４００．０Ｄａ的ＦＩＴＣ－Ｄｅｒｔｒａｎ探针却难以转移．胞间连丝的通透性能，随着植物的生长发育发生相应的变化．     

Three-dimensional Mathematical Modeling of a Glass Melting System

Ｔｈｒｅｅ┐ｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌＭａｔｈｅｍａｔｉｃａｌＭｏｄｅｌｉｎｇｏｆａＧｌａｓｓＭｅｌｔｉｎｇＳｙｓｔｅｍＱｉＪｉａｎｗｅｉ（祁建伟），ＨｕＷｅｉｌｉｎ（胡桅林），ＧｕｏＺｅｎｇｙｕａｎ（过增元）ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎ...     

浅析MFC消息映射机制

Ｗｉｎｄｏｗｓ操作系统是一个基于消息的操作系统 ,其程序总要同消息打交道 ,这正是Ｗｉｎｄｏｗｓ程序同Ｄｏｓ程序不同的地方。实际上 ,Ｗｉｎｄｏｗｓ系统通过Ｗｉｎｄｏｗｓ消息告诉所有应用程序发生了什么事件 ,例如用户点击了鼠标、用户点击了键盘的哪个键等 ,每个应用程序都有消息处理函数或一组消息响应函数 ,用于对消息进行响应。使用ＷｉｎｄｏｗｓＡＰＩ函数编程时 ,你将不得不使用许多复杂的代码去处理Ｗｉｎｄｏｗｓ消息。ＭＦＣ合理的封装了ＷＩＮ3 2ＡＰＩ函数 ,并设计了一套方便的消息映射机制。但这套机制本身比较庞大和复杂 ,对它的分析和了解无疑有助于我们写出更为合理的高效的程序。1　消息映射的声明 :ＤＥＣＬＡＲＥ＿ＭＥＳＳＡＧＥ＿ＭＡＰ宏在ＭＦＣ的框架结构下 ,进行消息处理的类的头文件里一般都含有这样的结构 :ｃｌａｓｓＣＤｅｒｉｖｅｄＣｌａｓｓ :ＰｕｂｌｉｃＣＢａｓｅＣｌａｓｓ{　 ...　ＤＥＣＬＡＲＥ＿ＭＥＳＳＡＧＥ＿ＭＰＡ()};在这里ＤＥＣＬＡＲＥ＿ＭＥＳＳＡＧＥ＿ＭＡＰ宏相当于为类声明了如下的一种数据类型 :#ｄｅｆｉｎｅＤＥＣＬＡＲＥ＿ＭＥＳＳＡＧＥ＿ＭＡＰ()ｐｒｉｖａｔｅ :　ｓｔａｔｉｃｃ...     

人免疫缺陷病毒2型（HIV—2）穿膜蛋白基因片段克隆表达

以人免疫缺陷病毒２（ＨＩＶ－２）的原病毒基因组为模板,通过套式ＰＣＲ扩增得到了ＨＩＶ２的一段特异性膜抗原蛋白基因片段;随后将此片段克隆入诱导表达载体ｐＧＥＸ－５Ｘ－１,获得了重组表达质粒ｐＧＥＸ３６－ＥＮＶ．ＩＰＴＧ对重组表达菌株诱导后,ＳＤＳ－ＰＡＧＥ结果显示重组菌株有特异性表达蛋白带产生。     

人免疫缺陷病毒2型(HIV-2)穿膜蛋白基因片段克隆表达

以人免疫缺陷病毒２（ Ｈ Ｉ Ｖ２） 的原病毒基因组为模板,通过套式 Ｐ Ｃ Ｒ 扩增得到了 Ｈ Ｉ Ｖ２ 的一段特异性膜抗原蛋白基因片段;随后将此片段克隆入诱导表达载体ｐ Ｇ Ｅ Ｘ５ Ｘ１ ,获得了重组表达质粒ｐ Ｇ Ｅ Ｘ３６ Ｅ Ｎ Ｖ． Ｉ Ｐ Ｔ Ｇ 对重组表达菌株诱导后, Ｓ Ｄ Ｓ Ｐ Ａ Ｇ Ｅ 结果显示重组菌株有特异性表达蛋白带产生     

UsingArtificialNeuralNetworksinNaphthasRVPModeling

ＵｓｉｎｇＡｒｔｉｆｉｃｉａｌＮｅｕｒａｌＮｅｔｗｏｒｋｓｉｎＮａｐｈｔｈａｓＲＶＰＭｏｄｅｌｉｎｇＨｅＸｉａｏｒｏｎｇ（何小荣），ＡａｍａｎｄＣａｒｓｔｅｎ＋ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＣｈｅｍｉｃａｌＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，ＴｓｉｎｇｈｕａＵｎｉｖｅ...     

IdealClasGroupsofRealQuadraticFieldsofGeneralizedERD─type

ＩｄｅａｌＣｌａｓＧｒｏｕｐｓｏｆＲｅａｌＱｕａｄｒａｔｉｃＦｉｅｌｄｓｏｆＧｅｎｅｒａｌｉｚｅｄＥＲＤ┐ｔｙｐｅ＊ＺｈａｎｇＸｉａｎｋｅ（张贤科），ＸｕＦｕｈｕａ（许甫华）ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＡｐｐｌｉｅｄＭａｔｈｅｍａｔｉｃｓ，Ｔｓｉｎｇｈｕ...     

印迹膜测序法分析结核分枝杆菌抗原蛋白

把WesternBlot技术分析抗原抗体反应的高度特异性与用PVDF膜作载体进行蛋白质氨基酸序列分析的高度敏感性相结合对结核分枝杆菌 (Mycobacteriumtuberculosis,TB)的特异性、保护性抗原进行筛选和分析鉴定 ,获得了分子量为 31KDa、30KDa的抗原 这两种抗原与抗结核分枝杆菌的单克隆抗体和结核病人血清均发生阳性反应 ,而与正常小鼠血清和健康人血清呈阴性反应 用印迹膜测序法测出 31KDa抗原蛋白的N 末端序列为AlaGluValAspTrpLeuValPheAlaValSerTrpProValGly ,30KDa蛋白序列为PheSerArgProGlyLeuProValGluTry 印迹膜测序为分子生物学研究提供了一种有效的新途径     

一株南海珊瑚细菌L-4抗肿瘤活性次生

 在研究珊瑚微生物混合共培养时发现：在混合培养中南海珊瑚内生细菌L-4对真菌的次生代谢产物明显产生影响,甚至产生此二微生物单独培养时所不产生的物质。对L-4发酵液进行次生代谢产物研究,从中分离纯化得到8个单体化合物,通过现代波谱分析（MS、NMR等）和物理常数对照等手段确定其结构依次为：环（色-丙）二肽（1）、环（甘-酪）二肽（2）、环（丙-酪）二肽（3）、环（缬-酪）二肽（4）、环（甘-苯丙）二肽（5）、环（甘-脯）二肽（6）、环（丙-缬）二肽（7）、环（甘-丙）二肽（8）均为环二肽类物质,且均首次从南海珊瑚内生细菌中分离得到,对进一步研究其可能的代谢机制具有重要意义。     

含酸性基团温度敏感色谱材料的制备及其在氨基酸分离中的应用

用自由基聚合法制备了分别含有聚(N-异丙基丙烯酰胺/2-丙烯酰胺基-2-甲基丙磺酸)和聚(异丙基丙烯酰胺/甲基丙烯酸异丁酯/丙烯酸)的2种酸性温敏色谱填料.用热失重和元素分析表征了接枝率.用HPLC研究了异硫氰酸苯酯衍生化丙氨酸、缬氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、精氨酸、亮氨酸等6种氨基酸的色谱保留行为.结果显示,采用纯水相为流动相,仅通过控制柱温即可实现分离,证明被分离物的色谱保留性质随温度的改变而变化,制得的色谱填料具有温度敏感性.     

Structure of the HP1 chromodomain bound to histone H3 methylated at lysine 9

Specific modifications to histones are essential epigenetic markers---heritable changes in gene expression that do not affect the DNA sequence. Methylation of lysine 9 in histone H3 is recognized by heterochromatin protein 1 (HP1), which directs the binding of other proteins to control chromatin structure and gene expression. Here we show that HP1 uses an induced-fit mechanism for recognition of this modification, as revealed by the structure of its chromodomain bound to a histone H3 peptide dimethylated at Nzeta of lysine 9. The binding pocket for the N-methyl groups is provided by three aromatic side chains, Tyr21, Trp42 and Phe45, which reside in two regions that become ordered on binding of the peptide. The side chain of Lys9 is almost fully extended and surrounded by residues that are conserved in many other chromodomains. The QTAR peptide sequence preceding Lys9 makes most of the additional interactions with the chromodomain, with HP1 residues Val23, Leu40, Trp42, Leu58 and Cys60 appearing to be a major determinant of specificity by binding the key buried Ala7. These findings predict which other chromodomains will bind methylated proteins and suggest a motif that they recognize.     

Cloning of the mycobacterial epitope recognized by T lymphocytes in adjuvant arthritis

Adjuvant arthritis (AA) is a chronic disease inducible in rats by immunization with an antigen of Mycobacterium tuberculosis. After the isolation of arthritogenic T-cell lines and clones, it became possible to demonstrate that the critical M. tuberculosis antigen contained an epitope cross-reactive with a self-antigen in joint cartilage. Like AA rats, patients suffering from rheumatoid arthritis demonstrated specific T-lymphocyte reactivity to the M. tuberculosis fraction containing the cross-reactive epitope. To characterize the critical M. tuberculosis epitope we used AA T-cell clones to screen mycobacterial antigens expressed in Escherichia coli and genetically engineered truncated proteins and synthetic peptides. The AA T-cell clones recognized an epitope formed by the amino acids at positions 180-188 in the sequence of a Mycobacterium bovis BCG antigen. Administration of this antigen to rats induced resistance to subsequent attempts to produce AA.     

七叶苷与牛血清白蛋白相互作用的分子对接研究

采用分子对接方法研究了药物小分子七叶苷与牛血清白蛋白(BSA)之间的相互作用,获得了七叶苷与BSA的结合模式信息.分子对接结果表明,七叶苷分子与蛋白活性空腔内的氨基酸残基形成疏水作用和氢键作用.这些基团之间的相互作用是七叶苷与BSA稳定结合的关键因素.研究结果可为相关实验研究提供微观结构信息.     

南海海洋细菌110的代谢产物的研究

南海海洋细菌１１０的代谢产物的研究黄钟奇周世宁吴雄宇姜广策林永成（中山大学化学系，广州５１０２７５）关键词海洋细菌，代谢产物，环二肽，结构分类号Ｏ６２４．４２１海洋微生物的研究进入９０年代以来发展较快，迄今从海洋微生物中已分离到大量有意义的各种类型的...     

大亚湾沉积物中氨基酸的垂直分布——沉积物柱样W9中的水解氨基酸和游离氨基酸

目的：研究沉积物中水解和游离氨基酸的垂直分布特征。方法：采集60 cm大亚湾柱状沉积物样品，每2cm为一层分割，用反相高效液相色谱法分析每层样品中的水解和游离氨基酸含量，对分析结果进行曲线拟合的相关分析。结果：15种游离氨基酸和水解氨基酸中的丝氨酸、苏氨酸、丙氨酸、缬氨酸、异亮氨酸和亮氨酸含量的对数值与深度之间存在显著的线性关系；中性氨基酸甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、丙氨酸、缬氨酸、异亮氨酸和亮氨酸的水解和游离氨基酸含量之间存在显著的相关关系。结论：15种游游离氨基酸和6种中性水解氨基酸的垂直分布可用指数方程来描述；中性水解氨基酸和游离基酸之间存在显著的相关性。     

ABEEMσπ-GB／SA方法计算6种氨基酸四肽溶剂化自由能

使用ABEEMσπ浮动电荷极化分子力场，在298 K ，NVT 系综下对5种构象的A la四肽水溶液进行了动力学模拟。计算了动力学平衡态下A la四肽中非氢原子的均方根偏差。结合广义玻恩模型（GB）计算了溶剂化自由能的极性部分，使用SA 方法计算了溶剂化自由能的非极性部分。溶剂化自由能的结果表明，A la四肽αR螺旋和β折叠构象容易在水溶液中存在。使用类似方法分别对Gly ，Leu ，Val ，Asn和Asp四肽的αL螺旋构象水溶液进行了动力学研究，计算了这5种四肽的溶剂化自由能。结果表明，A sp和A sn四肽亲水性较强，Leu、Val和Ala四肽疏水性较强，Gly 四肽居中，此结论与实际相符。该类研究为ABEEMσπ浮动电荷力场用于其他生物大分子体系奠定了很好的基础。     

二蕊荷莲豆中的一个新环肽

从石竹科植物二蕊荷莲豆 (DrymariadiandraBl.)中分离得到一个新的环九肽 ,其结构经波谱鉴定为环 ( -脯 -脯 -苯丙 -苯丙 -缬 -异亮 -丙 -苯丙 -亮 - ) .