一株来自深海沉积物的低温、嗜压菌的分离鉴定

从西太平洋5060m深的海底沉积物中分离到一组低温菌．对其中一株细菌WP02—2—25进行了生理生化和分子水平鉴定．结果表明：该菌革兰氏染色阴性；温度生长范围在28℃以下．最适生长温度15℃．pH耐受范围为4．5～9．5；最适pH值7．5．能够利用D-葡萄糖、甘油和麦芽糖作为唯一碳源生长并产酸．氧化酶和接触酶呈阳性．可以水解明胶和还原硝酸盐．但不能继续还原亚硝酸盐．产H2S气体．依据其生理生化性质、系统发育学、16SrDNA序列同源性分析初步鉴定该菌属于深海中特有的菌属：Morifella属．与嗜压菌Moritella ja ponica种有99．47％的同源性．生理生化指标表明．这两株菌不完全相同．Moritella．ja apoinca可以利用果糖、不能利用麦芽糖．而WP02—2—25正好相反．另外．两的最适生长温度也不一致．前属于嗜冷菌的范畴；后属于耐冷菌．     

北极深海沉积物中嗜冷细菌的系统发育分析

从北极白令海深海沉积物中分离得到19株嗜冷细菌,通过测定16S rDNA序列对它们进行了分类鉴定及系统发育分析,并且与从热带西太平洋“暖池”区沉积物中分离的嗜冷细菌进行了比较.结果表明,由北极海底沉积物中分离得到的细菌主要属于γ-变形菌(γ-Proteobacteria),此外还有少量的α-变形菌和革兰氏阳性菌.在γ-变形菌中主要的菌属为假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas),假单胞菌属(Pseudomonas)和希瓦氏菌属(Shewanella).与西太平洋“暖池”区沉积物中的嗜冷细菌的比较分析表明,假交替单胞菌属和假单胞菌属在两个海域中普遍存在,而希瓦氏菌属的分布则表现出一定的地域性.系统发育分析表明,相同菌属但来自北极和西太平洋海域两个不同环境的嗜冷细菌在系统发育树中的位置都相对独立,有的还形成了独立的分支,说明其分子进化过程可能受到生存环境条件的影响.     

深海抗锰细菌的分离鉴定

从太平洋深海底泥样品中富集、筛选得到50株锰抗性细菌，16S rDNA鉴定结果表明这50株细菌中含有40株芽孢杆菌、3株短杆菌、1株短状杆菌、1株考克氏菌、4株副球菌和1株食烷菌．50株中80％是芽孢杆菌，有6个种．90％以上为革兰氏阳性菌．短小芽孢杆菌（B．pumilus）Mn12对Mn^2＋的耐受能力最好，最高的Mn^2＋耐受浓度是130mmol／L．该菌在28℃以200r／min培养24h后，能去除含锰（Ⅱ）10mmol／L培养基中90％的锰（Ⅱ）（锰含量由高碘酸盐分光光度法测定）．而Mn59在同样条件下，可耐受30mmol／L锰（Ⅱ），可去除99％的锰（Ⅱ），具有抗性高、去除率高、速度快的优点，具有极大的应用前景．     

深海抗锰细菌的分离鉴定

从太平洋深海底泥样品中富集、筛选得到50株锰抗性细菌, 16S rDNA鉴定结果表明这50株细菌中含有40株芽孢杆菌、3株短杆菌、1株短状杆菌、1株考克氏菌、4株副球菌和1株食烷菌.50株中80%是芽孢杆菌,有6个种.90%以上为革兰氏阳性菌.短小芽孢杆菌(B. pumilus)Mn12对Mn2 的耐受能力最好,最高的Mn2 耐受浓度是130 mmol/L.该菌在28℃以200 r/min培养24 h后,能去除含锰(Ⅱ)10 mmol/L培养基中90%的锰(Ⅱ)(锰含量由高碘酸盐分光光度法测定).而Mn59在同样条件下,可耐受30 mmol/L锰(Ⅱ),可去除99%的锰(Ⅱ),具有抗性高、去除率高、速度快的优点,具有极大的应用前景.     

一株来源于深海热液区嗜热细菌的分离及鉴定

从西南印度洋热液区沉积物样品中分离纯化获得一株中度嗜热产芽孢杆菌,命名为M6.菌株M6为革兰氏阳性菌,短杆状,可成对.菌株M6的生长温度为35～65 ℃(最适生长温度60 ℃),生长pH为6.5～8.5(最适生长pH为7.0～8.0),生长NaCl质量分数为0～4%(最适NaCl质量分数为2%),生长盐度为0～80人工海水(最适盐度为40).16S rRNA基因相似性分析表明,菌株M6属于不产氧芽孢杆菌属(Anoxybacillus),与Anoxybacillus rupiensis菌株同源性最高,达99%;但16S～23S rDNA 间隔区PCR扩增分析表明,该菌与同属菌株有较大差异.通过以上形态学、生理特征以及分子生物学鉴定,认为菌株M6为不产氧芽孢杆菌属的菌株.另外,菌株M6可分泌胞外高温淀粉酶.菌株M6胞内含有内生质粒,其大小约为10 kb,命名为pAB01.     

一株溶藻细菌的分离、筛选与分子鉴定

为了筛选对铜绿微囊藻有溶藻活性的菌株,采用试管法筛选溶藻效果好的细菌,显微观察高效溶藻菌的溶藻作用方式,对其热稳定性、耐酸碱能力及紫外稳定性进行考察,并采用16S r DNA序列分析鉴定溶藻菌种类。共筛选获得7株具有溶藻效果的细菌,其中F15菌株对铜绿微囊藻溶藻效果最好。菌株F15的溶藻活性物质为胞外产物,当其生长到对数期时,其胞外产物的溶藻效果达到最大,按体积比1∶6将其加入藻液,培养3 d后,铜绿微囊藻的去除率达55%以上。该溶藻活性产物对加热、酸碱及紫外线处理均具有较好的稳定性。16S r DNA序列分析表明,F15菌株与Bacillus cereus strain ATCC 14579同源性最高,达99%,被鉴定为蜡状芽孢杆菌。F15菌株溶藻效果好,稳定性高,具有开发成生物控藻菌剂的潜在价值。     

一株中度嗜盐菌Halomonas sp．NY-011的分离与鉴定

从盐生杜氏藻(Dunaliella salina)培养物内筛选到一株能在广泛NaCl浓度范围(0.5 %～21 %, w/v)和广泛pH值范围(pH 5～11)生长的嗜碱耐盐菌NY-011.细胞形态电镜观察和生理生化分析表明, NY-011呈杆状,大小为(0.51～1.53)μm×(1.02～2.55)μm,革兰氏阴性,有荚膜,无鞭毛,不运动,好氧生长,淀粉水解酶呈阴性,接触酶呈阳性.其最适培养条件为:2% NaCl,30 ℃,起始pH值10.16S rDNA序列比对和构建的系统发育树表明该菌属于盐单胞菌属(Halomonas).Biolog分析显示,在检测的95种碳源中,该菌仅有10种的代谢指纹能与数据库类型相匹配,且代谢情况和其亲缘关系最近的Halomonas pantelleriensis亦有差异.     

两株银杉根际土壤真菌的分离与分子鉴定

对银杉根际土壤中的真菌进行培养分离,得到了形态上很相似的两株真菌F-1和F-2.在基于形态特征鉴定困难的情况之下,对真菌F-1和F-2的rDNA ITS区进行PCR扩增和测序.真菌F-1和F-2的ITS序列与来自于10个属30个种的不同真菌的ITS序列进行序列比较和系统发育分析,结果表明:真菌F-1属于木霉属(Trichoderma),真菌F-2属于被孢霉属(Mortierella).结果表明,基于分子水平的鉴定方法具有快速、准确、简便、高效等特点,在真菌鉴定分类研究中起着重要作用.     

一株碱性纤维素降解菌的分离与分子鉴定

以纤维素为唯一碳源,采用刚果红选择性培养基,分离到一株降解纤维素的细菌L1,L1适宜在碱性条件下生长,在pH值为7-11的范围内能够产生纤维素酶。为了确定L1的分类地位,PCR扩增后测定其16SrDNA序列,在GenBank中进行同源性比对,并与一些同源性较高的细菌构建系统发育树,初步将菌株L1鉴定为节杆菌(Arthrobacter sp.strain L1)。菌株L1产生的碱性纤维素酶在工业领域中将具有良好的应用前景。     

一株中度嗜盐菌Halomonas sp.NY-011的分离与鉴定

从盐生杜氏藻（Dunaliella salina）培养物内筛选到一株能在广泛NaCl浓度范围（0.5 %～21 %, w/v）和广泛pH值范围（pH 5～11）生长的嗜碱耐盐菌NY011.细胞形态电镜观察和生理生化分析表明, NY-011呈杆状,大小为（0.51～1.53）μm×（1.02～2.55）μm,革兰氏阴性,有荚膜,无鞭毛,不运动,好氧生长,淀粉水解酶呈阴性,接触酶呈阳性.其最适培养条件为：2% NaCl,30 ℃,起始pH值10.16S rDNA序列比对和构建的系统发育树表明该菌属于盐单胞菌     

一株耐高温纤维素降解菌的分离筛选及鉴定

为了分离筛选耐高温的纤维素高效降解菌,从鸡粪蘑菇渣高温堆肥中取样,采用滤纸富集培养基进行富集培养、刚果红纤维素培养基进行分离纯化培养、滤纸条培养基和刚果红纤维素培养基进行初筛培养、液体发酵测定纤维素酶活法进行复筛培养,利用形态特征观察、生理生化特征检测和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析法进行初步鉴定,结果分离筛选到1株耐高温纤维素降解菌XD-3.该菌株在50 ℃生长良好、羧甲基纤维素酶(CMCase)活力达6.14±0.37 U/mL.综合形态特征、生理生化特性、基于16S rRNA基因序列的系统发育分析,菌株XD-3初步鉴定为解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）.     

有机磷降解菌的分离筛选及初步鉴定

目的:从不同根系土壤分离筛选高效降解有机磷的细菌.方法:通过平板法进行初筛,根据水解圈直径和菌落直径比值大小筛选到水解圈直径和菌落直径比值较大的菌株,进一步通过液体摇瓶培养复筛,对其解磷能力进行了测定,并通过形态特征、生理生化特性和16 S rDNA序列测定等一系列试验时其进行鉴定.结果:分离纯化出10株解磷菌,经平板...     

解磷细菌德氏嗜酸菌D86菌株的分离、筛选及鉴定

从昆明磷矿土壤中分离筛选出降解无机磷的8株解磷细菌,通过平板初筛得到3株降解无机磷能力较强的菌株.进一步液体摇瓶复筛,得到1株降解无机磷能力最强的菌株D86.通过菌落形态、生理生化特性和16S r DNA序列比对,初步鉴定该菌株为德氏嗜酸菌(Acidovorax delafieldii).     

一株解钾解磷菌株的筛选

实验分离筛选到一株既能解钾又能解磷的路德维希肠杆菌,可作微生物肥料的备选菌株。     

腈水合酶产生菌的分离、鉴定及部分酶学性质研究

从长期被腈化物污染的土壤中筛选到一株腈水合酶产生茵YL-1，经过对分离菌株形态特征及生理生化指标的鉴定，该菌株初步鉴定为Rhodococcus．在含有丙烯腈的培养基中，细胞的生长与产物腈水合酶的合成相关，酶学性质研究表明：酶反应最适温度为30℃，最适pH为7．0．该酶在50℃以下，pH为6．0至9．0范围内较稳定。     

两株苯酚降解菌的初步鉴定及培养特性

通过驯化、筛选和富集，从南充炼油厂生化曝气池的活性污泥中分离到2株能以苯酚作为唯一碳源和能源生长的菌株，编号为S1，S2，菌种初步鉴定分别为芽孢杆菌属（Bacillus）和假单孢杆菌属（Pseudomonas sp.）。由正交实验得出两菌株的最适培养条件为：S1温度30℃，pH值7，纱布层数6层；S2温度25℃，pH值7.2，纱布层数4层。研究发现混合培养对菌株的生长有一定的促进作用。     

一株纤维素降解菌的分离和鉴定

为得到降解纤维素能力较强的细菌,以腐殖土壤为菌株来源筛选、分离纤维素降解细菌。对所取土样稀释一定比例进行涂布平板,以羧甲基纤维素钠（CMC-Na）为唯一碳源培养,用刚果红染色的方法筛选有透明圈的菌株,得到一株编号为YBX-52的纤维素降解细菌。在产酶培养基中以30 ℃培养48 h,用DNS法测得滤纸酶活力(FPA)为221.75 μmol/min、羧甲基纤维素酶活力(CMC)为274.56 μmol/min。以16 SrDNA通过序列对比,构建YBX-52系统发育树,结合其生理生化特征将其鉴定为苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)。     

耐有机溶剂脂肪酶产生菌的筛选和鉴定

从国内各地采取土样分离筛选产耐有机溶剂脂肪酶的新菌株,通过形态和生理生化特征以及系统进化树分析,筛选到的新菌株命名为Pseudomonas aeruginosa CS-2.来自Pseudomonas aeruginosa CS-2的粗脂肪酶液在乙腈中酶活提高,在苯、氯仿、正己烷、石油醚和异辛烷中表现出较高的稳定性.     

南极深海底泥中产Ectoine中度嗜盐菌NJS-2的分离筛选及其性质研究

从南极深海底泥中分离到一株中度嗜盐菌NJS-2,经过16S rDNA(已提交GenBank,其登录号为DQ789389)序列分析、形态学和生理生化特征分析,该菌株初步鉴定为色盐杆菌属(Chromohalobacter).以其16S rDNA序列相似性为基础构建了包括8种相关种属在内的系统发育树.同源性分析表明,NJS-2与Chromohalobacter salexigens 的16S rDNA相似性达到99%以上,应归属于色盐杆菌属,命名该菌株为Chromohalobacter sp.NJS-2.研究了菌株NJS-2的相容性溶质四氢嘧啶(Ectoine)的累积及累积条件.研究发现,30℃条件下,在含2 mol/L NaCl的培养基中培养48 h,可最大诱导生成Ectoine 300 mg/L.反复渗透性休克试验表明:NJS-2在低渗条件下能够快速将细胞内的Ectoine分泌到细胞外,而在高渗环境中能够较快地重新合成.