基于蒙特卡罗方法的蛋白质折叠计算

在一系列解决蛋白质折叠问题的计算方法中，蒙特卡罗方法渐渐引起了人们的兴趣。本文主要介绍新蒙特卡罗方法在采样和构型更新两个方面的改进。可以看出这些改进的方法对于寻求自由能全局最小状态进而模拟蛋白质折叠较为有效。     

蒙特卡罗:从赌城到原子能科学

<正>蒙特卡罗(Monte Carlo)是世界著名的赌城,是摩纳哥的标志。起初,蒙特卡罗方法即赌博方法,后来发展成今天非常强大的数学计算方法,可以求解复杂的科学问题。蒙特卡罗方法系统性的研究开始于1944年前后。当时由于研制原子弹,需要研究中子在裂变物质中的运动规律,提出了一些不易用常规数学方法求解的问题。冯·诺依曼、乌拉姆和费米等科学家发展了这个用于直接模拟的蒙特卡罗方法,解决了这些当时不易解决的难题。如今蒙特卡罗方法在原子能科学技术中有着重要的应用。     

一次γ辐射通量密度的蒙特卡罗模拟

利用蒙特卡罗方法,模拟计算了不同情况下点源、均匀线源以及均匀圆盘源的一次γ辐射通量密度,并与解析方法计算结果进行分析、比较,在误差范围内,两者很好的符合。说明蒙特卡罗方法是解决γ射线屏蔽问题的一种方便、可靠的方法。     

核酸碱基(胞嘧啶)水合作用的蒙特卡罗模拟

生物大分子常处于极性溶剂(水)的环境中,因此生物大分子构型的稳定及其生理功能的正常发挥与溶剂效应密切有关.本文根据估算玻尔兹曼统计平均的蒙特卡罗方法的理论,对核酸硷基的水合作用进行统计热力学的超分子连续统(SuPermolecule-Continuum)的蒙特卡罗模拟处理,计算由于溶剂效应而产生的热焓(H)、亥姆兹自由能(A)以及熵(S)的变化.     

蛱蝶科亚科间的分歧时间估计

基于自行测定的以及GenBank收录的线粒体COI基因和核EF-1α基因序列, 应用最大似然法、贝叶斯推断法及马尔可夫链蒙特卡罗方法探讨了世界蝶类最大科——蛱蝶科亚科间的系统发育关系, 并对该科分子系统发育树各分支间的进化速率进行了差异显著性检验. 结合眼蝶亚科、蛱蝶亚科和苾蛱蝶亚科的化石资料, 获得了蛱蝶科所有12个亚科间首次分歧时间的平均估计值, 为44.2~87.1 Ma. 研究结果有助于人们深入了解该科的起源与进化以及估计蝶类和其他复杂类群的分歧时间.     

太阳中子事件的观测特征与中子能谱的计算

太阳中子事件是与耀斑活动相关的偶发性即刻粒子事件, 主要表现为地面宇宙线探测装置的计数瞬时突增. 太阳中子携带着爆发源区的物理信息: 耀斑大气的元素组成、大气高度、磁场的会聚程度以及磁流体湍动等. 相对于其他带电粒子, 中子能够不受太阳磁场和行星际磁场的束缚而直达地面. 目前, 对太阳中子事件的理论研究, 主要是通过蒙特卡罗模拟, 考虑太阳耀斑环中磁场的螺旋角散射作用和磁镜效应, 计算耀斑磁环模型里各向异性中子的产生与太阳大气高度、时间、角度和能量间的关系, 计算逃逸中子的角分布和能谱, 以及逃逸到地球附近中子的能谱. 观测方面, 主要是结合地面中子监测器记录的超出时间与空间探测到的g射线核谱线发射峰值的时间差, 利用飞行时间方法(Time of Flight Method), 考虑中子监测器的探测效率和中子在地球大气中的衰减因素, 反演日面处的中子能谱. 本文依据已确定的10例太阳中子事件, 评述基本的观测特征, 介绍相应的观测仪器, 探讨太阳中子能谱计算的两种方法(观测法和模型法), 比较不同方法获得的计算结果; 并依托羊八井太阳宇宙线探测装置(中子监测器、太阳中子望远镜), 报道对太阳中子的初步交叉探测特征(1998年11月28日GLE事件和2005年1月20日GLE事件), 指出目前亟待解决的问题.     

增长曲线预测法

引言在科学技术预测和经济预测中,特尔斐法虽然是一种常见的实用方法,但在本质上是一种十分直观的方法,因而有许多缺点。类比法虽然不象特尔斐法那样直观,但也不甚精确。因为无法断定一些事件一旦引起一种特定的后果,同样一些事件是否会再次引起同一种后果。即使考虑到历史的特殊性和历史条件的局限性,类比法最多也只能是一种可接受的论据,而不是可靠的证明。     

人发自由基浓度与生长年龄间关系的研究

作为人体的一部分,人发的研究早就引起人们的注意,对人发蛋白质、微量元素、色素、人发结构等,早就做了多方面的研究工作,应用EsR方法于人发黑素自由基的研究,文献也有报道,最近几年,国内一些学者提出应用EsR饱和功率方法来研究人发自由基与肿瘤间的关系,提出患肿瘤人发与正常人发自由基饱和功率不同,因而可作为诊断肿瘤的一种方     

人类思维的计算机仿真——其前景及限制

人类思维计算机仿真的前景和限制取决于人类思想的概念。就计算机仿真的目的而言,我们将思想定义为对事件进行符号化的过程,然后用各种逻辑的及非逻辑的推论将这些符号进行演算。将思想这个概念会同某个哲学体系一起来考虑看来是合理的,因为概念的形成、判断、推理及问题求解都是一些哲学问题。在本文中讨论了一个问题的各种解决方法,这些解决方法是由一些最重要的哲学体系所引起的。     

低压气相CVD制备六方金刚石薄膜及其鉴定

六方金刚石的存在是由Ergun和Alexander在1962年预言的。他们指出,象立方金刚石中那样与四个等距碳原子成键的碳原子,可能有另外一种堆积方式——六方晶体结构。六方金刚石中碳原子的键长及键角与立方金刚石完全相同,所以,二者有相同的密度及相近的物理、化学性质,但二者可以由X射线衍射加以区分。后来,人们分别用静压法、爆炸法合成了六方金刚石,并在陨石中发现了六方金刚石,陨石是天然六方金刚石的唯一来源。     

关于决策论的基础

人们时常要在不确定条件下从许多备选方案中决定自己的抉择。随着生产及科学技术和社会的发展,决策问题变得起来越复杂,单凭决策者个人的学识和经验作决策就越来越不能适应了。从而出现了一些科学的决策思想和方法。决策分析就是为帮助人们合理地分析决策问题的结构,选择决策方法和评价标准的     

真实的神话

<正>科学家说,如果进行足够的发掘,就能找到传说和神话故事中的一些真相数千年来,神话传说一直激发着人类的想象力。绝大多数的神话传说,仅仅是人们一代代传下来的故事而已。但也有一些根植于过去真实的地质事件,它们向现代人提示着潜在的危机,述说着自古以来人类对地球力量的极大敬畏一些地球物理学家认为,这些传说故事实际上是地质事件目击者对这些事件的记录、评     

随机微分方程Euler法的均方稳定性和指数稳定性

近来出现了大量的求解随机微分方程的文章[1-8] ,特别是对Ｅｕｌｅｒ法求解随机微分方程的稳定性的研究[2 ,3 ,5,6] .Ｅｕ ｌｅｒ法用于求解常微分方程时其指数稳定性和均方稳定性是经典的问题 ,但研究Ｅｕｌｅｒ法求解随机微分方程时其指数稳定则是近几年的事情 .1996年 ,Ｙ .     

向网络水军说Bye-bye

<正>据中国互联网络信息中心(CNNIC)发布的《第31次中国互联网络发展状况统计报告》显示,截至2012年12月底,中国网民规模已达到5.64亿。互联网的飞速发展在改变着人们的生产和生活方式。然而网络的开放性和隐蔽性在为人们提供自由言论的同时,也为一些上不了台面的手段提供了土壤,让一些见不得阳光的欲望得以潜滋暗长。蒙牛的"诽谤门"事件、康师傅的"水源门"、"封杀王老吉"、360与腾讯之争等事件的发生使得"网络水军"这个词频频跃入眼帘,让人们认识到了很多事件背后的"推手",这些"推手"掩盖事实的真相,蒙蔽我们的眼睛。     

中国北部5.3Ma动物群的年龄分布特征与气候恶化事件

气候恶化是地质历史发展中的重要事件,近年倍受地学界所关注.人们一般通过地层物质组成及一些特殊地球化学元素的变化来证实这类事件的存在.从动物年龄分布角度分析气候恶化事件尚未见报道.本文以甘肃武都龙家沟三趾马动物群和陕西府谷老高川庙梁三趾马动物群数千件化石为基础,从动物年龄分布论证了中新世晚期气候恶化事件的存在及影响范围.本文涉及动物群的时代为中新世保德期庙梁亚期,古地磁年龄约5.3Ma.     

多流体复合电喷技术制备多组分微胶囊

微胶囊由于在生物医药、食品科学、材料学等领域有着广泛应用而得到了人们的关注.目前已经发展了很多优异的物理和化学的微胶囊制备方法,如微流体技术、自组装技术、乳化法等[1~4].但是传统方法在多种组分的封装方     

精神负荷评估方法的评述与展望

本文简要介绍了精神负荷评估的基本方法，包括基于绩效的测定方法、主观评定法及生理测定法等。重点评述了各个方法的特点及局限性，并对当前研究中存在的一些问题进行了分析和探讨     

食品科技有看头

近来，食品安全事件相继发生，引发人们对食品问题的极大关注。为杜绝这类事件的发生，一些新颖技术出现在食品生产、包装、保存、销售等各个环节，为食品的安全提供保障，让老百姓放心。     

随机粗糙面电磁散射特性的研究方法

随机粗糙表面电磁散射理论在光学、声学、电磁学、医学等领域有着广泛的应用。由Maxwell方程结合边界条件导出的积分方程是粗糙面电磁散射问题的基本理论依据。本文将研究粗糙面电磁散射的方法分为两类—近似法与数值法。近似法主要有基尔霍夫近似与微扰法;数值法主要有矩量法与时域有限差分方法等。近似法简单,但有一定的适用范围;数值法较精确,但其计算复杂。实际中往往采用近似法计算粗糙面的电磁散射,而用数值法来研究近似法的有效性。     

随机粗糙面电磁散射特性的研究方法

随机粗糙表面电磁散射理论在光学、声学、电磁学、医学等领域有着广泛的应用.由Maxwell方程结合边界条件导出的积分方程是粗糙面电磁散射问题的基本理论依据.本文将研究粗糙面电磁散射的方法分为两类-近似法与数值法.近似法主要有基尔霍夫近似与微扰法;数值法主要有矩量法与时域有限差分方法等.近似法简单,但有一定的适用范围;数值法较精确,但其计算复杂.实际中往往采用近似法计算粗糙面的电磁散射,而用数值法来研究近似法的有效性.