核糖体DNA内转录间隔区序列标记在寄生虫学中的应用

目的：介绍核糖体DNA（rDNA）的内转录间隔区（ITS）序列的结构特征和在寄生虫学研究应用中的最新研究进展。方法：检索有关文献进行综合分析。结果：rDNA ITS1和ITS2序列为寄生虫的鉴定提供了非常有价值的遗传标记。结论：核糖体DNA上的ITS域序列的进化速度较其它区域快,具有高变异性,可以从中获得大量的遗传信息,已成为在种和亚种水平上对寄生虫进行分类鉴定的有效手段。     

淡水豚类mtDNA 16S rRNA基因的系统发生

ｍｔＤＮＡ １６Ｓ ｒＲＮＡ基因我分析支持将现生淡水豚４个属归入不同的科,即白暨豚科（Ｌｉｐｏｔｉｉｄａｅ）、恒河豚科（Ｐｌａｔａｎｉｓｔｉｄａｅ）、亚河豚科（Ｉｎｉｉｄａｅ）和弗西豚科（Ｐｏｎｔｏｐｏｒｉｄａｅ）。基于邻接法的系统发生分析显示淡水豚类由白暨豚＋恒河豚和弗西豚＋亚河豚两个单系组成,但两个单系之间并无姊妹关系。淡水豚类是并系的。１６Ｓ ｒＲＮＡ基因的系统发生树与ｍｔＤＮＡ细胞色素ｂ基     

中华蜜蜂肠道细菌群落的PCR-DGGE分析

肠道微生物与中华蜜蜂的生长发育密切相关,在为宿主提供营养、抵抗病原菌侵袭等方面起重要作用.为了探究中华蜜蜂在封盖一日龄蛹、破巢幼蜂和采集蜂三个重要发育阶段肠道细菌群落的结构组成及差异变化,我们对细菌16S r DNA的V6-V8可变区进行PCR-DGGE和克隆测序,并计算封盖一日龄蛹、破巣蜂和采集蜂阶段中华蜜蜂肠道菌群的多样性指数和相似性系数,结果表明:采集蜂肠道内细菌多样性指数最大,而封盖一日龄蛹和破巣幼蜂之间的肠道菌群相似性较高;测序结果初步得到了Gilliamella、Snodgrassella、Carnobacterium、Neisseriaceae、Frischella、Janthinobacterium、Pseudomonas、Lactobacillus、Lactococcus和Leuconostoc十种菌属,其中封盖一日龄蛹和破巢幼蜂的优势菌属为Snodgrassella和Pseudomonas;采集蜂的优势菌属为Gilliamella和Snodgrassella.本研究旨在为提高中华蜜蜂的环境适应性和病虫害的防治提供依据.     

壳菜果亚科(金缕梅科)与相关亚科的核糖体DNAITS区序列分析及系统发育关系(英文)

测定和分析了金缕梅科（Ｈａｍａｍｅｌｉｄａｃｅａｅ）壳菜果亚科等各亚科代表属的核糖体ＤＮＡＩＴＳ区和５８Ｓ编码区序列．应用最大简约法构建的分子系统树表明：壳菜果亚科（Ｍｙｔｉｌａｒｉｏｉｄｅａｅ）植物形成１个单系类群［含壳菜果属（Ｍｙｔｉｌａｒｉａ）和山桐材属（Ｃｈｕｎｉａ）］,支持壳菜果亚科作为１个独立的亚科．本研究所得到的ＩＴＳ数据表明马蹄荷亚科（Ｅｘｂｕｃｋｌａｎｄｉｏｉｄｅａｅ）与红花荷亚科（Ｒｈｏｄｏｌｅｉｏｉｄｅａｅ）,金缕梅亚科（Ｈａｍａｍｅｌｉｄｉｏｉｄｅａｅ）与双花木亚科（Ｄｉｓａｎｔｈｏｉｄｅａｅ）分别为姐妹群关系（其自展数据支持率各为９５％和５８％）．分子系统树还表明,测得的所有金缕梅科植物形成一单系类群（其自展数据支持率为９９％）,枫香亚科（Ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒｏｉｄｅａｅ）为该科最基础的１个分支．这结果与１９９７年所得到的结论相一致．     

Newly replicated DNA is associated with DNA topoisomerase II in cultured rat prostatic adenocarcinoma cells

DNA topoisomerases have been proposed to function in a variety of genetic processes in both prokaryotes and eukaryotes. Here, we have assessed the role of DNA topoisomerase II in mammalian DNA replication by determining the proximity of newly synthesized DNA to covalent enzyme-DNA complexes generated by treating cultured rat prostatic adenocarcinoma cells with teniposide. Teniposide (VM-26), an epipodophyllotoxin, is known to interact with mammalian DNA topoisomerase II so as to trap the enzyme in a covalent complex with DNA. We have found that the teniposide-induced trapping of such complexes requires MgCl2, is stimulated by ATP and is inhibited by novobiocin. The formation of covalent complexes seems to be reversible on removal of teniposide. Furthermore, analysis of the covalent complexes formed between 3H-thymidine pulse-labelled DNA and topoisomerase II following teniposide treatment reveals a direct association of the enzyme with nascent DNA fragments. Our results suggest that DNA topoisomerase II may interact with newly replicated daughter DNA molecules near DNA replication forks in mammalian cells.     

西鄂尔多斯特有种四合木与同生境下蒺藜科三个种的核rDNA ITS的序列比较研究

为揭示分布于西鄂尔多斯高原的中国特有种四合木对生境的适应性及与其他属的亲缘关系，用PCR直接测序方法，对四合木与同生境蒺藜科(zygophllyaceae)其他3个种的核糖体DNA ITS片段进行了序列分析，结果表明，4种植物在ITS片段长度、GC百分含量和变异位点数上均存在一定差异，ITSl长177-212bp，ITS2长218-237bp；GC含量为57．7％～62％，信息位点比例30．1％，系统发育分析表明，四合木(Tetraena mongolica Maxim)与霸王(Zygo-phyllum xanthoxylum Maxim)在系统位置上较相近，白刺(Nitraria sibirica Pall)与蒺藜(Tribulus terrestris L．)较相近，ITS所揭示的亲缘关系与这些种的形态学和胚胎学特征相似。     

Synthetic RNA-dependent DNA polymerase activity in normal rat liver and hepatomas

Normal adult rat liver contains a high level of a synthetic RNA-dependent DNA polymerase activity, which is distinct from cellular DNA-dependent polymerases. It uses poly(dT).poly(rA) and poly(rA).poly(rU) as templates but has little or no response to DNA or several single-stranded RNAs.     

人类核糖体蛋白加工假基因在进化中的熵变

用生物信息学方法计算出人类核糖体蛋白加工假基因(RP加工假基因)的进化距离.假定在统计意义上,不同进化距离的假基因可粗略代表假基因的进化历程.在此假定基础上从信息论的角度去研究假基因在进化中的熵变.结果发现,1) 假基因序列的紧邻碱基关联随进化逐步增强;2) k-mer信息熵中,小k-mer(k=1,2,…,5)信息熵随进化减少,大k-mer(k=7,8)信息熵随进化先迅速减少,随后增加;3) 关联信息熵随进化减少,其中紧邻碱基关联信息熵的减少幅度最明显.这些可能与背景突变压力作用有关.