拟步甲科部分种类Cytb基因序列比较及系统发育分析

测定了拟步甲科(Tenebrionidae)10种昆虫线粒体细胞色素b(Cytb)基因长度为579 bp的序列片段,结合Genbank的赤拟粉甲(Tribolium castaneum)的同源序列进行了分析.结果表明,11种拟步甲昆虫该片段中碱基T,C,A,G的平均含量分别为34.0%,22.5%,32.8%和10.7%, A T平均含量明显高于G C平均含量.密码子第3位点A T含量高达75.3%,而该位点G的平均含量仅为3.2%.碱基替换多发生于第3位点,转换略多于颠换,转换主要以C←→T为主,颠换以A←→T为主.以步甲科Blackburnia fossipennis为外群构建的系统发育树表明,土甲族、拟粉甲族和琵甲族有着很近的亲缘关系,三者聚为一支,漠王族和漠甲族聚为一支;而鳖甲族这一分支的系统关系与传统的分类存在一定的分歧,表现出与拟步甲亚科、漠甲亚科有着平行的进化关系,对产生这种分歧的原因进行了探讨.     

9种拟步甲16S rDNA部分序列及其亲缘关系

测定了9种拟步甲的16S rDNA部分基因序列,并与GenBank中的1种步甲的基因序列作同源性比较,计算其核苷酸使用频率并构建了分子系统树.在获得的435 bp的序列中,A+T约占74.4%,颠换(transversion)取代的速率大于转换(transition)取代的速率,其中277个核苷酸位点存在变异.结果表明:属内种间的碱基序列差异范围为3.4%～6.2%;族内属间为9.4%～11.0%;科内族间为10.8%～17.7%;科与科间的差异达到46.7%～50.3%.分子系统树表明:拟步甲科为一单系群,其中琵甲族较为进化,漠甲族与漠王族相对原始;琵甲族与土甲族的亲缘关系较近;漠甲族、漠王族与鳖甲族的亲缘关系较近.本结果与传统的分类观点相吻合.     

蝽亚科部分昆虫mt DNA-16S rRNA序列多态性分析(半翅目:蝽科)

以16S rRNA基因作为分子标记,对蝽亚科6种昆虫及外群异蝽科昆虫进行特异性扩增和序列测定,对序列的碱基组成、转换颠换、遗传距离等进行分析,探讨了16S rRNA基因在该亚科的分子进化机制.并基于16S rRNA基因序列数据,采用邻接法(NJ)建立蝽亚科部分昆虫分子系统发育关系[1].获得的16S rRNA基因序列片段的长度在439~441 bp之间,且保守性序列较多.该片段中碱基T,C,A,G的平均含量分别为32.9%,17.9%,40.5%,8.8%,A+T平均含量为73.4%,明显高于G+C含量(26.7%),存在较强的A+T含量偏向性;密码子第三位点A+T含量更高,达77.1%.通过测定该基因片段的序列发现,不同种群存在丰富的DNA序列多态性.     

从Cytb基因序列探讨蝽类部分昆虫的系统发生

通过对蝽总科18种昆虫线粒体DNA细胞色素6基因部分序列进行PCR扩增和序列测定,比较其同源性,统计密码子使用频率并应用生物学软件构建系统发育树．在获得的432bp序列中,碱基T,C,A和G的平均含量分别为37．4％,18．8％,31．8％和12．0％,表现出强烈的AT偏向性．就每个氨基酸密码子采看,第3位点的A＋T含量较高,达到83．6％．谊序列片段中共有215个核苷酸位点发生变异（约占49．8％）,种间变异较大．在氨基酸组成上,共编码144个氨基酸。其中有47个发生变异。变异率为32．7％．碱基替换主要发生在密码子第3位点,转换略多于颠换．以筛豆龟蝽（Megacopta cribraria）为外群构建的系统发育树支持荔蝽、盾蝽作为独立的科与蝽科并列,滴蝽从蝽亚科划出归属于舌盾蝽亚科,但蝽科内各亚科间及蝽亚科各族间的系统进化关系与传统的形态分类结果不完全一致,还有待于进一步研究．     

我国西双版纳地区缘蝽科昆虫及其区系分析

前言缘蝽科Coreidae是半翅目昆虫中比较大的科,全部为植食性,能吸食多种植物幼嫩部分的汁液,引起植物的枯萎、干瘪甚至死亡。它们为害的经济作物种类很多,在西双版纳地区有棘缘蝽属Cletus种类危害水稻、黑胫侎缘蝽Mictis fuscipes Hsiao危害豆类、山竹缘蝽Notobitus montanus Hsiao等4种竹缘蝽危害毛竹、凤尾竹等甚为严重。菲缘蝽Physomerus grossipes(Fab-     

鹿角菜18S rDNA序列分析及其系统发生分析

通过制备鹿角菜DNA,PCR扩增得到鹿角菜18S rDNA序列.测序拼接后全长1733 bp,碱基A、T、C、G含量分别为25.45%、26.72%、26.72%、21.12%,序列已提交Gene Bank登录号为GQ433994.该序列与NCBI数据库中其他褐藻18S rDNA序列比对后,得到可变碱基位点184个,简约信息位点161个,单碱基变化位点23个.转换碱基值Si为44,颠换碱基值Sv为30,转换颠换比值R约为1.5.NJ法构建的系统发生树显示18S rDNA在褐藻门中具有保守性,可用于辅助传统分类.PLACE数据库预测发现在鹿角菜18S rDNA保守区有多个与水分胁迫、光诱导、Ca2+信号传导等相关转录元件,这表明18S rDNA可能参与细胞重要调控途径.     

蜻科部分种类Cytb基因序列比较及系统发育分析(蜻蜒目:差翅亚目)

从分子生物学角度入手,以mtDNA的Cytb(Cytochrome b)基因作为分子遗传标记,用昆虫Cytb基因的特异性引物进行PCR扩增及DNA测序,共获得蜻蜓目差翅亚目蜻科7属8种(基斑蜻Libelluladepressa,黄蜻Pantala flavescens,庆褐蜻Trithemis festive,晓褐蜻Trithemis aurora,纹蓝小蜻Diplacodestrivialis,网脉蜻Neurothemis fulvia,六斑曲缘蜻Palpoleura sex-maculata,玉带蜻Pseudothemis zxmata)及2种外群(黄翅绿色螅Mnais auripennis,华艳色螅Neurobasischinensis)的Cytb基因部分序列(576 bp).这8种蜻蜓Cytb基因的部分核苷酸序列(长度为576 bp)中碱基T,C,A,G的平均含量分别为37.0%,18.3%,31.3%和13.4%,A T平均含量为68.3%,明显高于G C平均含量(31.7%).密码子第3位点的A T平均含量较高,为81.0%,碱基替换多发生在密码子第3位点.以束翅亚目的黄翅绿色螅和华艳色螅作为外群构建系统发育树,结果显示玉带蜻属与褐蜻属、脉蜻属与曲缘蜻属的亲缘关系较近.     

青岛崂山半翅目昆虫区系分析

通过对近四年崂山采集的半翅目昆虫标本的研究,共鉴定半翅目昆虫31种,隶属于7科30属,其中蝽科18种,猎蝽科4种,缘蝽科5种,异蝽科1种,蝎蝽科1种,黾蝽科1种,仰蝽科1种.区系分析结果表明崂山半翅目昆虫东洋性质显著(100%),古北性质次之(86.67%),大多数种类为东洋-古北共有种.在我国动物区系亚区水平上以华中区系和华北区系成分为主,分别占总数的100%和87.10%,与西南区(80.64%)、华南区(77.42%)联系也较为密切,东北属性稍弱(61.29%),蒙新、青藏属性最弱,分别为45.16%和38.71%.     

苜蓿盲蝽属(Adelphocoris)细胞色素B基因片段序列分析(半翅目:异翅亚目:盲蝽科)

用蛋白酶K消化法提取并正反链双向测序获得半翅目盲蝽科盲蝽亚科苜蓿盲蝽属（Adelphocoris）6个种以及苜蓿盲蝽Ad．lineaolatus的3个种群的线粒体DNA细胞色素b基因片段的序列,应用Mega计算该8个cytb432bp片段序列的碱基组成、核苷酸的种间变异率和所编码的144个氨基酸的变异率,序列的碱基组成中A＋T的平均含量较高且在第三位点最高。平均达到81．6％,表明该基因在密码子的使用上具有偏向性,变异位点和信号位点多发生在三联体密码子的第三位点,第二位点最为保守,不同异型序列间的转换＋颠换（ns＋nv）值最高的为100,最小的为0;转换／颠换（ns／nv）值最高为9．33,在Ad．fasciaticollis与Ad．sutualis之间,最低为0．88,在Ad．lineaolatus的宁夏和甘肃种群之间。几种颠换类型都能够在本属的异型序列之间看到,苜蓿盲蝽属的不同异型序列间的差别大小各异,差异最大的是苜蓿盲蝽Ad．lineaolatus的甘肃种群（Ad．lineaozatus2）与内蒙古种群（Ad．lineaolatus3）之间,具有100个碱基的差异,宁夏种群与甘肃种群之间的核苷酸变异率为7％,而二者与内蒙古种群的变异率分别为23％和28％,大于或等于与其他种类间的变异,所以该2个种群与内蒙古种群（典型的Ad．lineaolatus）已处在种化过程的末期,已经形成不同的新种,种间差异最小的是Ad．rufescens与Ad．luridus,变异率为0,应为同一个种,所以Ad．rufescens的分类地位有待于进一步研究证实。     

基于mt16S rDNA的长蝽总科(异翅亚目:蝽次目)系统发育的研究

利用16S rDNA分子约540 bp的序列对长蝽总科9个科29个种进行系统发育分析.运用MP法、ML法和NJ法分析,结果表明:原来属于广义长蝽科的Pachygronthidae、Rhyparochromidae、Cymidae、Geocoridae、Blis-sidae、Oxycarenidae和狭义Lygaeidae并不形成一个单系的广义长蝽科;梭长蝽科Pachygronthidae的两个族Pachygronthini和Teracriini分成两支而形成多系;莎长蝽科Cymidae与梭长蝽科Pachygronthidae的Pachygronthi-ni族总是聚成一支形成姐妹群.研究说明广义长蝽科是多系,这与最近的形态学研究一致,从分子水平上支持Henry(1997)把广义长蝽科中的部分亚科提升为科的修订.与现有的形态分类系统有所不同的是,地长蝽科和狭义长蝽科都是多系群.     

基于COII全基因序列对蜻科部分昆虫的分子系统发育分析(蜻蜓目:差翅亚目)

通过设计蜻蜓目COII全基因的非特异性引物,获得蜻科5亚科15属21种蜻蜓的21条COII基因全序列.采用Clustal X(1.8),MEGA 2.1,Phylip 3.6以及MrBayes 3.0等生物学软件对其进行分子系统学研究,结果显示,①蜻科COII的A+T含量非常低(69%),这与蜻蜓目是一比较原始类群的观点相一致;②蜻科COII全序列均含有2个半胱氨酸,这一点有别于其他类群;③各属内的种类基本聚在一起,大黄赤蜻与红蜻近缘而远离赤蜻属,褐蜻属与赤蜻属近缘,曲缘蜻亚科与赤蜻亚科近缘;④斜痣蜻亚科的进化速度相对较慢,蜻亚科与赤蜻亚科的进化速度稍快.     

广西十万大山昆虫区系考察初报

对广西南部十万大山中部山区昆虫考察，已定名昆虫有１２目１０４科２９１属３８８种，以鳞翅目、鞘翅目、半翅目和直翅目的种类居多，分别占１９．３３％、１８．３０％、１７．０１％和１７．０１％。种类较多的科有斑腿蝗科２８种，蝽科２５种，缘蝽科１９种，猎蝽科、蜻科、铁甲科和凤蝶科各１２种，斑翅蝗科１０种。各林带采集到的昆虫种类占总采集量的百分率分别为：山顶矮林带（海拔８５０ｍ以上）约占８．４％；常绿阔叶林带     

中华按蚊的分子鉴定标准

中华按蚊（Anopheles sinensis）是重要的传疟媒介之一,广泛分布于中国和东南亚,它的形态特征和赫坎按蚊种团（Anopheles hyrcanus Group）其他蚊种十分近似,建立中华按蚊的分子鉴定标准十分重要。本研究从实验室中华按蚊品系的一个个体测序了线粒体DNA COI和COII基因,以及核糖体DNA D2、D3和ITS2位点,测序片段长度分别为658、663、551、365、556 bp。这些序列和近缘蚊种对应序列分别用最大似然法构建系统发育树,结果表明中华按蚊的序列均聚合为同一支。将测序的中华按蚊COII序列和已知蚊种的对应序列比对发现其中的保守位点分别是第133位点C,321位点C,382位点C,435位点T,516位点A和651位点C,线粒体DNA COI和COII基因序列的碱基组成具有AT偏向性,分别占69.15%和74.96%。提交了5条序列到NCBI数据库,其中核糖体DNA D2位点序列是首次在中华按蚊中公开报道。     

Evidence for Base Substitutions and Repair of DNA Mismatch Damage Induced by Low Energy N^＋ Ion Beam Implantation in E. coli

Ever since the low energy N^ ion beam has been accepted, the mutations of ionizing radia-tion are attributable mainly to avoidance of DNA damages repair. Evidences based on in vivo proof results are limited. Using the E. coli wild type and mutator strains, the mutant frequencies suggest that base substitutions in rpoB gene are induced by the N^ implantation. A highly con-served region is selected to get the direct evidence for base substitutions by sequence of the high fi-delity PCR amplification products in mutants. Most of the mutants (90.9%, 40/44) have at least one base substitution in the amplification region. The evidences for CG to TA (55 %, 22/40), AT to GC (20%, 8/40) and TA to CG (5%, 2/40) transitions are identified. The transversions are AT to TA ( 15 %, 6/40) and GC to CG (5 %, 2/40). It is suggested that DNA cytosine methylase might play an important role in mismatch repair of DNA damage induced by N^ implantation by analysis of the mutant frequencies of mutator strains.     

秦巴山区缘蝽科分类初步研究(昆虫纲:半翅目异翅亚目:缘蝽科)

缘蝽科是半翅目异翅亚目(Hemiptera-Heteroptera)中的一个较大的科,我国记录有200多 种.该文针对秦岭及大巴山地区缘蝽科47个种的形态特征编写了种的检索表,并应用形态分类学 方法和SPSS软件进行了种间聚类分析.     

Altering the pathway of immunoglobulin hypermutation by inhibiting uracil-DNA glycosylase

A functional immune system depends on the production of a wide range of immunoglobulin molecules. Immunoglobulin variable region (IgV) genes are diversified after gene rearrangement by hypermutation. In the DNA deamination model, we have proposed that deamination of dC residues to dU by activation-induced deaminase (AID) triggers this diversification. In hypermutating chicken DT40 B cells, most IgV mutations are dC --> dG/dA or dG --> dC/dT transversions, which are proposed to result from replication over sites of base loss produced by the excision activity of uracil-DNA glycosylase. Blocking the activity of uracil-DNA glycosylase should instead lead to replication over the dU lesion, resulting in dC --> dT (and dG --> dA) transitions. Here we show that expression in DT40 cells of a bacteriophage-encoded protein that inhibits uracil-DNA glycosylase shifts the pattern of IgV gene mutations from transversion dominance to transition dominance. This is good evidence that antibody diversification involves dC --> dU deamination within the immunoglobulin locus itself.     

内蒙古齿爪盲蝽亚科(Deraeocorinae)昆虫的区系分析

对内蒙古齿爪盲蝽亚科(Deraeocorinae)昆虫进行区系分析.在世界动物地理区系中,内蒙古齿爪盲蝽亚科昆虫可分为古北界种类、古北东洋两界共有种类和古北、新北两界共有种类,其中以古北界种类占绝对优势,有13种,占总数的76.47%;在中国动物地理区划中,内蒙古齿爪盲蝽亚科昆虫主要归属于东北、华北、蒙新3个区,其中分布于华北区的种类最多,共有15种,占总数的88.24%;在内蒙古地带性植被带中,属于草原带的种类最多,有16种,占总数的94.12%.     

内蒙古长蝽科昆虫及中国新记录属种记述

对内蒙古长蝽科(Lygaeidae Schilling)昆虫种类、分布、寄主、外生殖器的比较解剖、区系分析等进行了较系统的研究．记录了内蒙古长蝽科71种昆虫．隶属于11个亚科39属，对1个中国新记录属(Raglim Stal．，1872)和2个中国新记录种(Hyalocoris Vinokurov和Drymus orientalis Kerzhner)进行了描述，并对国内原有记载的个别种进行了修订．     

中国斑腿蝗科线粒体基因的分子系统学研究(英文)

使用线粒体基因COⅠ,COⅡ,Cytb分析并建立中国斑腿蝗科部分种属的系统发育关系,其中对7个新种(Apalacris eminifronta,Caryanda pseudodentata,Caryanda bannaensis,Caryanda ruiliensis,Longchuanacris fui,Longchuanacris xiaoheis-hanensis,Podismodes dabieshanensis)的归属从分子角度也做了讨论。本研究将实验所获得的56条序列与NCBI中所收录的斑腿蝗科序列进行联合分析,采用最大似然法、贝叶斯推论等系统分析方法并综合P距离进行分析,最终得出以下几点结论:①龙川蝗属Longchuanaceis Zheng et Fu划归卵翅蝗亚科Caryandinae;②蹦蝗属Sinopodisma Chang、云秃蝗属Yunnanacris Chang均为华秃蝗属Podismodes Ramme的同物异名;③不支持Storozhenko将豫蝗属Yupodisma Zhang et Xia并入安秃蝗属AnapodismaDovnar-Zapolskii,从本研究所建的系统发育树来看,豫蝗属仍应作为秃蝗亚科Podisminae的一个独立属;④前人利用形态特征鉴定的七个新种与分子系统发育分析结果一致,新种独立有效。     

Past temperature and delta18O of surface ocean waters inferred from foraminiferal Mg/Ca ratios

Determining the past record of temperature and salinity of ocean surface waters is essential for understanding past changes in climate, such as those which occur across glacial-interglacial transitions. As a useful proxy, the oxygen isotope composition (delta18O) of calcite from planktonic foraminifera has been shown to reflect both surface temperature and seawater delta18O, itself an indicator of global ice volume and salinity. In addition, magnesium/calcium (Mg/Ca) ratios in foraminiferal calcite show a temperature dependence due to the partitioning of Mg during calcification. Here we demonstrate, in a field-based calibration experiment, that the variation of Mg/Ca ratios with temperature is similar for eight species of planktonic foraminifera (when accounting for Mg dissolution effects). Using a multi-species record from the Last Glacial Maximum in the North Atlantic Ocean we found that past temperatures reconstructed from Mg/Ca ratios followed the two other palaeotemperature proxies: faunal abundance and alkenone saturation. Moreover, combining Mg/Ca and delta18O data from the same faunal assemblage, we show that reconstructed surface water delta18O from all foraminiferal species record the same glacial-interglacial change--representing changing hydrography and global ice volume. This reinforces the potential of this combined technique in probing past ocean-climate interactions.