云平台下基因 基因相互作用识别算法

针对现有的快速方差分析算法进行并行可扩展性改进, 设计一种高效的并行计算模型, 并提出一种基于MapReduce模型的基因 基因相互作用识别算法--MRANOVA算法. 该算法有效解决了现有基因 基因相互作用识别算法在海量数据规模下普遍存在计算复杂度过高的问题. 实验结果表明, 该算法充分利用了云平台的并行计算能力, 随着数据量的增大, 加速比逐渐接近于集群数量, 可高效准确地完成基因 基因相互作用的识别.     

基于酵母基因组高通量数据的基因-基因相互作用预测

后基因组时代的显著特点是大规模基因组和蛋白质组实验平台所产生的大量高通量数据,整合并利用基因组和蛋白组信息成为这一时代的主要挑战之一. 因此,基因-基因相互作用将有助于理解细胞内基因之间的相互作用以及信号传导通路研究提供有价值的参考. 为预测酵母基因组中基因-基因相互作用,我们利用高通量数据中的蛋白-蛋白相互作用、遗传表型数据、基因微阵列表达数据以及功能基因注释数据等来分析酵母中的基因-基因相互作用. 本文建立的预测方法为在系统水平上理解酵母基因组中的基因功能提供了依据,也为揭示酵母基因组中的基因-基因相互作用网络奠定理论基础.     

基于迭代回归的基因相互作用定义方法

基因相互作用是生物信息学中的重要课题,主要研究在非等位基因缺失条件下基因之间的功能联系,为细胞信号通路分析和药物重定位等提供了新的方向.经典的基因相互作用定义方式采用确定的预期中立函数,但是这种固定的中立函数往往不能反映具体实验数据的特征,而基于机器学习定义基因相互作用的方法可以较好地解决这个问题.首先,通过回归分析方...     

压力、神经递质和激素神经内分泌及其基因机制

本论文集主题是压力、神经递质和激素，其内容体现了东西方学者关于压力的生物基础的最前沿的探索。以往有关压力的书往往在个体或者群体的水平上，使用定性的方法，根据个体与社会环境的交互作用，来推断压力的来源，阐述其对个体生活的影响，对压力的缓解提出建议并给出可操作性方法。     

抑郁的分子遗传学研究及基因与环境的交互作用

抑郁的发生受到遗传和环境的影响,啮齿类的分子遗传学的研究表明单胺类分子如五羟色胺、去甲肾上腺素和多巴胺,HPA系统的相关的激素分子以及神经营养类分子如脑源性神经营养因子(BDNF)都可能参与了抑郁发生的神经生理过程.编码以上分子的基因型的差异有可能是导致个体对应激反应的敏感性和抑郁发生差异的遗传基础.童年早期和成年经历的压力生活事件是影响抑郁发生的常见的环境因素.遗传因素赋予个体对应激不同的敏感性,环境因素也会影响基因的表达,二者的交互作用影响了个体相关脑区的神经回路的功能从而影响了抑郁的发生.     

孤独症儿童家长亲职压力及焦虑抑郁状况——融合教育与特殊教育机构的比较

采用亲职压力量表和心境与焦虑症状问卷对36名特殊教育机构孤独症儿童的父亲/母亲以及17名融合教育机构孤独症儿童的父亲/母亲的亲职压力及焦虑抑郁状况进行比较,以发现不同教育机构孤独症儿童父母的心理健康状况.结果表明,融合教育机构孤独症儿童的父亲/母亲的亲职压力和抑郁水平都显著低于特殊教育机构孤独症儿童的父亲/母亲,而其焦虑水平与特殊教育机构孤独症儿童父亲/母亲的焦虑水平却没有显著差异.这说明,融合教育对孤独症儿童父母的心理健康有着积极的作用.     

Q:每个基因都决定相貌吗?

正A:在日常生活中,我们常常可以听到这样的评论:这孩子的眼睛长得像爸爸!那孩子的鼻子长得像妈妈!……在这些评论的背后,其实蕴含着一个科学道理:人的相貌与遗传有关。染色体是遗传物质的主要载体,基因就位于染色体上,它通过指导蛋白质的合成来控制生物体的性状。任何生物都有许多性状,这些性状都是由基因控制的。性状有的是形态结构方面的,有的是生理特征方面的,有的是行为方式方面的,等等。因此,每个基因各司其职,并不是所有的     

脑卒中患者生活质量的痛点:抑郁、睡眠与认知

 随着脑血管病治疗的进展,卒中后死亡率显著下降。但是在长期存活的卒中患者中,抑郁、阻塞性睡眠呼吸暂停、认知功能障碍这3个卒中后常见的并发症在很大程度上影响其生活质量。本文综述了近年来以上3大卒中后并发症的发病情况、诊断及治疗原则。其中,卒中后抑郁的确诊率很低,需要及时发现并综合运用心理治疗、药物治疗和康复训练等多种治疗手段;睡眠障碍的并发可直接影响卒中复发率,需要经过睡眠监测,经鼻持续气道正压通气治疗是有效的治疗方法;认知障碍也是一个与患者预后明显相关的因素。发现此3种并发症后应采取积极治疗,否则会显著增加脑血管病复发、死亡、残疾的风险,同时对患者生活质量、人际关系及社会功能有着严重的不良影响。     

女性对女性客体化与进食障碍、抑郁的关系:外观焦虑的中介作用

采用方便取样抽取285名中国女大学生同时施测女性对女性客体化量表(WOWS)中文版、外观焦虑量表简版(AAS-BV)、进食障碍量表(EDI)和抑郁量表(SDS)。结果表明:女性对女性客体化与外观焦虑、进食障碍和抑郁均呈显著正相关(r=0.522,r=0.472,r=0.350;P0.001),外观焦虑与进食障碍、抑郁均呈显著正相关(r=0.348,r=0.484;P0.001);外观焦虑在女性对女性客体化与进食障碍、抑郁关系间均起部分中介作用,间接效应分别占总效应的56.4%和51.3%。结论:女性对女性客体化既可以直接作用于进食障碍、抑郁,又可以通过外观焦虑间接影响进食障碍和抑郁。     

小反刍兽疫病毒融合蛋白基因的克隆、序列分析及表达

根据GenBank报道的小反刍兽疫病毒(PPRV)融合蛋白(F)基因序列,用特异性引物对PPRV疫苗株F蛋白基因进行了RT-PCR扩增,并将其克隆到pGEM-T载体中进行测序。结果表明:F基因ORF全长1641 bp,编码546个氨基酸;推导的氨基酸序列中第1~18位氨基酸构成信号肽序列,第488~510氨基酸为跨膜区。构建原核表达载体pETF1和pETF2,转化E.coliBL21(DE3),用IPTG诱导表达。SDS-PAGE和Western-blotting的分析结果表明,F1和F2基因在大肠杆菌中均获得了表达,且均具有良好的反应原性。用Ni-NTA试剂盒纯化F1和F2重组蛋白,为研发检测PPRV特异性抗体的诊断试剂奠定了基础。     

鸭瘟病毒强、弱毒株TK基因的克隆与序列测定

根据GenBank上已发表的鸭瘟病毒TK基因核苷酸序列,设计并合成了1对引物,分别扩增鸭瘟病毒标准强毒株(DPV-F34)和鸭瘟鸡胚化弱毒疫苗株(C-KCE)的TK基因,将它们分别克隆入pBS-T载体,转化TOP10大肠杆菌,对阳性的重组质粒进行序列测定.结果表明:DPV-F34与DPVC-KCE的TK基因长度均为1077bp,编码358个氨基酸,二者的核苷酸与氨基酸组成具有很高的同源性,分别为99.4%和98.9%.     

HPV16、18型E6/E7融合基因痘苗病毒表达载体的构建

目的:构建一种含人乳头瘤病毒(HPV)16型、18型E6/E7融合基因痘苗病毒表达载体.方法:PCR扩增HPV16型、18型E6、E7基因,克隆到pSC-A载体中,通过定点突变方法,分别构建成含E6/E7融合基因的质粒,即pSC-A.HPV16 E6/E7和pSC-A-HPV18 mE6/E7,并将二者连接成载体pSC-A-HPV16 E6/E7-HPV18mE6/E(pSC-T,HPV16 E6/E7-HPV18mE6/E7:T),最后以痘苗病毒表达载体pJ38为转移载体,构建质粒pJ38-HPV16 E6/E7-HPV18mE6/E7(pJ38-T),对所有重组质粒进行酶切鉴定和测序分析.结果:E6/E7融合基因成功克隆到pJ38上.结论:成功构建表达HPV E6/E7融合基因重组痘苗病毒载体,为研制宫颈癌治疗性疫苗奠定基础.     

内地新疆班高中生生活事件与焦虑、抑郁:学校适应的作用——以浙江省温州中学新疆部为例

采用青少年生活事件量表(ALSEC)、焦虑自评量表(SAS)、抑郁自评量表(SDS)和学校适应量表(SSBS)对587名内地新疆班学生进行调查,结果发现:①内地新疆班高中生受生活事件影响较小,焦虑症状检出率低,抑郁症状比例较高,学校适应良好;②ALSEC,SAS,SDS和SSBS存在一定的群体差异,并且彼此之间显著相关;③ALSEC直接预测,并通过积极社会行为间接预测了SAS和SDS,通过消极社会行为间接预测了焦虑.认为内地新疆班学生的焦虑和抑郁直接受到生活事件影响,其学校适应行为在影响过程中发挥了部分中介作用.     

企业“互联网+”转型模式、基因与绩效:基于中国创业板上市公司的实证研究

基于企业转型理论、企业创业理论和互联网等相关研究,以中国创业板上市公司为样本,对企业“互联网+”转型的模式、基因和绩效的关系提出并验证假设。研究表明:企业应注重互联网信息技术能力的培养和资源积累,进行“互联网+”转型;企业无论是否掌握IT能力,都可以通过外部资源快速进行融合,掌握先动者优势;企业无论采用何种模式实施“互联网+”转型战略,都必须重视互联网信息技术与业务产品等自身资源的深度融合。     

埃马纽埃尔·卡彭蒂耶、珍妮弗·杜德纳:因CRISPR/Cas9基因剪刀而获2020年诺贝尔化学奖的两位女科学家

埃马纽埃尔·卡彭蒂耶和珍妮弗·杜德纳,因合作开发基因编辑技术——CRISPR/Cas9基因剪刀而获得2020年诺贝尔化学奖.CRISPR/Cas9技术的低成本、强易用性和高效率,促进了生命科学的突破性发展,也使它拥有了巨大的商业价值.通过回顾两位科学家的科研历程和基因编辑领域的成就,提出了相关的思考和启示.     

埃马纽埃尔·卡彭蒂耶、珍妮弗·杜德纳:因CRISPR/Cas9基因剪刀而获2020年诺贝尔化学奖的两位女科学家

埃马纽埃尔·卡彭蒂耶和珍妮弗·杜德纳,因合作开发基因编辑技术——CRISPR/Cas9基因剪刀而获得2020年诺贝尔化学奖.CRISPR/Cas9技术的低成本、强易用性和高效率,促进了生命科学的突破性发展,也使它拥有了巨大的商业价值.通过回顾两位科学家的科研历程和基因编辑领域的成就,提出了相关的思考和启示.