第一性原理计算水对缬氨酸电子结构的等效势

用第一性原理、全电子、从头计算方法构造了水溶液对缬氨酸(Val)电子结构的等效势.首先用自由团簇计算法得到能量最低时水分子与缬氨酸的相对空间位形,然后用团簇埋入自洽计算(SCCE)方法计算缬氨酸在水分子势下的电子结构,最后用偶极子势代替水分子势.结果表明:由于水溶液的存在,缬氨酸费米面下八个能级每个能级平均上升了约0.775 5 eV;水溶液对缬氨酸电子结构的影响可以很好地被偶极子势模拟.因此,所得的偶极子势可以直接运用到水溶液中蛋白质电子结构的计算中.     

再生丝素水溶液在存放过程中的结构变化

通过拉曼光谱法研究了不同浓度的再生丝素水溶液在常温下存放不同时间的构象变化。发现再生丝素水溶液在静置存放过程中会有结构的变化即无规巷曲和α螺旋向β折叠结构的转变，并且浓度越大，构象转变越快。当溶液处于流动状态时，其构象转变速度要快于静置状态下的转变。同时发现对于新鲜制备出的再生丝素水溶液随浓度的增加，也会发生构象的转变。     

十二烷基硫酸钠分子构象的拉曼光谱研究

本文报导了固体和水溶液状态下十二烷基硫酸钠的拉曼光谱,对其主要振动谱带进行了归属,考察了水溶液中样品浓度以及温度变化对分子构象的影响。结果表明:固体样品分子的烷基链主要以全反式构象存在,而水溶液中样品分子的烷基链则以扭曲式构象存在,分子烷基链的有序性随水溶液中样品浓度的降低和温度的升高而减小;50％的水溶液在296K附近似乎发生了一个由凝胶到液晶相的相变。     

抗菌肽A与抗菌肽B空间构象的喇曼光谱分析

通过抗菌肽Ａ与抗菌肽Ｂ两种分子的粉末固体状态、水溶液状态空间构象的喇曼光谱分析，表明这两种抗菌肽具有不同的主链构象，在固态中分别以无规卷曲、α螺旋为主，在水溶液中分别以α螺旋、β结构为主．两种分子在水溶液中Ｃ－Ｓ侧链构象分别为扭式与反式．但色氨酸侧链环境分析表明，两种分子在水溶液中均为色氨酸残基处于部分或完全暴露状态，这一结论为色氨酸具有使抗菌肽全分子与细胞膜发生密切接触的初级锚定作用直接提供了证明     

一价组胺阳离子结构和性质的计算化学研究

应用第一原理电子结构方法计算了侧链质子化的一价组胺阳离子的各种可能的构象,并且根据所计算的相对吉布斯自由能得到气相和溶液中的最稳定构象.所有的计算结果都表明,无论在气相还是溶液中,g3H构象的相对自由能都是最低,也就是说无论在气相还是溶液中g3H都是最稳定的构象,只不过由于溶剂化作用在水溶液中各个构象之间的自由能差减小,并影响了各个构象在气相和溶液中的相对比率.所得到的这些结构信息对将来计算组胺和各种生物大分子之间的相互作用具有很好的参考价值.     

水环境下氢氧根水分子簇催化缬氨酸旋光异构及羟自由基致其损伤机理

基于MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/6-31+G(d,p)双理论水平, 用自洽反应场(SCRF)理论的SMD模型方法, 考察水环境下氢氧根水分子簇催化缬氨酸旋光异构及羟自由基致其损伤机理. 结果表明： 缬氨酸的旋光异构可在2个通道a和b实现, 通道a为氢氧根水分子簇与α-H和氨基通过氢键作用形成底物, 氢氧根抽取α-H后, α-C在另一侧抽取水分子的H; 通道b为氢氧根水分子簇与α-H和羰基通过氢键作用形成底物, 氢氧根抽取α-H后, α-C在另一侧抽取水分子的H, 通道b中的水分子辅助羟自由基抽取α-H可致缬氨酸损伤; 水液相环境下, 构象Val-1（氨基羧基间为单氢键）和构象Val-2（氨基羧基间为双氢键）在通道a旋光异构的决速步骤能垒分别为60.57,65.24 kJ/mol, 在通道b旋光异构的决速步骤能垒分别为56.76,64.11 kJ/mol, 羟自由基水分子簇致缬氨酸在通道b的损伤为温和的放热反应.     

一种水溶性温敏共聚高分子的制备及溶液性质研究

以N-异丙基丙烯酰胺和N-异丙基甲基丙烯酰胺为共聚单体，合成了一种在水溶液中具有与人体正常体温37℃一致的相转变温度的共聚化合物．利用动态光散射技术研究了这一特殊共聚物在水溶液中高分子链构象行为随温度的变化情况．     

ABEEMσπ-GB／SA方法计算6种氨基酸四肽溶剂化自由能

使用ABEEMσπ浮动电荷极化分子力场，在298 K ，NVT 系综下对5种构象的A la四肽水溶液进行了动力学模拟。计算了动力学平衡态下A la四肽中非氢原子的均方根偏差。结合广义玻恩模型（GB）计算了溶剂化自由能的极性部分，使用SA 方法计算了溶剂化自由能的非极性部分。溶剂化自由能的结果表明，A la四肽αR螺旋和β折叠构象容易在水溶液中存在。使用类似方法分别对Gly ，Leu ，Val ，Asn和Asp四肽的αL螺旋构象水溶液进行了动力学研究，计算了这5种四肽的溶剂化自由能。结果表明，A sp和A sn四肽亲水性较强，Leu、Val和Ala四肽疏水性较强，Gly 四肽居中，此结论与实际相符。该类研究为ABEEMσπ浮动电荷力场用于其他生物大分子体系奠定了很好的基础。     

微晶纤维素硫酸钠溶液的构象

微晶纤维素硫酸钠是一种具有显著抗凝血活性的物质，其抗凝活性与其在溶液中的构象密切相关．为了解其抗凝活性，文中通过旋光度分析、粘度分析和刚果红螺旋一线团过渡分析，研究了微晶纤维素硫酸钠溶液的构象．旋光度分析表明，微晶纤维素硫酸钠在水溶液或弱碱溶液中具有规则的空间构象；由粘度分析也可得出同样的结果；刚果红螺旋一线团过渡分析表明，微晶纤维素硫酸钠在溶液中具有规则的空间构象，同时具有单螺旋结构与高级螺旋结构．     

电喷雾质谱研究乙腈诱导的溶菌酶的构象变化

首次采用电喷雾质谱结合圆二色性光谱以及荧光光谱,研究不同浓度的乙腈诱导对溶菌酶构象变化的影响.在pH2.0的酸性环境下,随着乙腈浓度的上升,电喷雾质谱的谱图中溶菌酶电荷状态分布会变宽,当乙腈浓度达到70%时,会出现15 的高电荷离子峰,电荷中心也从纯水溶剂的10 到了12 ,表明其三级结构发生了变化,即由天然构象转变为部分非折叠的构象.圆二色光谱显示在溶菌酶水溶液中加入乙腈,二级结构中无规卷曲的百分含量在增加.荧光光谱进一步证明在乙腈的作用下,溶菌酶由天然构象转变为部分非折叠的构象.     

嵌段共聚水溶性高分子在空气/水界面吸附态的构象

对于用几种不同疏水／亲水单体比合成的聚(丙烯酸丁酯／丙烯酸)共聚物样品测定了其水溶液的表面张力,运用Gibbs吸附方程求得在样品溶液临界胶束浓度时样品在气／液界面的分子吸附面积,以此推测其吸附态构象。结果表明,亲水单体单元在共聚物中含量多时,样品分子趋于在水中溶解;疏水单体单元多时,样品分子趋于在表面吸附。其吸附态构象为分子链上相邻的数个丁酯侧基吸附于水面,形成“薄煎饼状”疏水微区。     

切变速度和Ca~(2+)对再生丝素蛋白溶液构象转变的影响

采用偏光显微镜和拉曼光谱研究了切变速度和Ca2+对再生丝素蛋白水溶液构象转变的影响.结果表明:切变速度和Ca2+是影响再生丝素蛋白溶液性质的两个主要因素,对于同一再生溶液,切变速度增大,溶液中丝素蛋白分子沿切变方向的有序排列也随之增加,丝素溶液更容易从无规线团或α-螺旋向β-折叠转变,并且转变的程度随着剪切速度的增加而加强;透析溶液中Ca2+含量增加,则样品出现偏光现象的临界切变速度有所降低.拉曼光谱显示丝素蛋白分子构象由SilkⅠ向SilkⅡ转变.     

DNA主链构象与脱氧鸟苷组分构象相关性的喇曼分析

对小牛胸腺ＤＮＡ纤维样品溶解３ｈ内的空间构象变化过程进行了喇曼光谱分析，结果显示了表征脱氧鸟苷糖环折迭不同类型的６７２ｃｍ＾－１与６８３ｃｍ＾－１峰的同时存在，与ＤＮＡ分子主链不同特征峰的同时出现之间有着明显的联系。     

温度/pH双敏感性接枝共聚物P(MAA-g-NIPAM)相行为研究

利用大分子单体技术通过自由基溶液聚合合成了不同组成的接枝共聚物聚(甲基丙烯酸-g-N-异丙基丙烯酰胺)(P(MAA-g-NIPAM)),通过UV透光率的测定和荧光探针技术对接枝共聚物在稀水溶液中的相行为进行了研究.结果表明,接枝共聚物P(MAA-g-NIPAM)具有温度和pH值的双重敏感性,不同组成的P(MAA-g-NIPAM)具有基本相同的低临界溶解温度(LCST).当溶液的pH<6时,随着pH值的降低P(MAA-g-NIPAM)的主链从较为松散的线团构象变为较为压缩的线团构象.     

水溶液中6种氨基酸与甘露醇的焓相互作用

利用2277热活性检测仪的流动混合系统测定了298．15K时甘氨酸、L-丙氨酸、L-丝氨酸、L-缬氨酸、L-脯氨酸和L-苏氨酸分别与甘露醇在水溶液中混合过程的焓变,根据McMillan-Mayer理论得到各级焓作用系数,并与6种氨基酸在纯水溶液中的焓对作用系数h2进行了比较．结果表明,甘露醇对缬氨酸和丝氨酸的焓对作用系数值改变较大,而对侧基极性或非极性都不明显的氨基酸改变值较小．用溶质—溶质相互作用和溶质—溶剂相互作用理论对结果进行了解释．     

高于胶凝临界温度直链淀粉分子分形

应用动态光散射技术,研究直链淀淀粉水溶液在高于胶凝临界温度条件下驰豫谱化的规律,发现动态光散射驰豫谱经历了指数衰减及随后的非指数衰减（慢模）两种模式,对于快模,可用大分子链串滴运动解释,对于慢模,则可用分形构象下的反常扩散加以解释。此外,还测量了直链淀粉水溶液在不同温度、不同浓度下的分维,发现直链淀粉分子符合自避无规行走模型,分维等于１．６７,且随样品浓度、温度的变化而略有变化。     

NMR Study of Hydroxyl-Substituted Macrocyclic Hexaamine in Solution

Ｉｎｏｕｒｐｒｅｖｉｏｕｓｐａｐｅｒ[1] ,ｔｈｅｓｙｎｔｈｅｓｉｓｏｆ3,13 ｄｉｈｙｄｒｏｘｙｌ 1,5 ,8,11,15 ,18 ｈｅｘａａｚａｃｙｃｌｉｃａｍｉｎｅｈｅｘａｈｙｄｒｏｂｒｏｍｉｄｅｈａｓｂｅｅｎｒｅｐｏｒｔｅｄ .Ｔｈｅｃｒｙｓｔａｌｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆｔｈｉｓｃｏｍｐｏｕｎｄ (Ｆｉｇ .1)ｈａｓｂｅｅｎｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄｂｙｓｉｎｇｌｅ ｃｒｙｓｔａｌＸ ｒａｙｄｉｆｆｒａｃｔｉｏｎ[2 ] .ＲｅｃｅｎｔｌｙｔｈｅＮＭＲｍｅｔｈｏｄｓｗｅｒｅａｌｓｏｕｓｅｄｔｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｔｈｅｓｔｅｒｉ…