胃癌芯片数据中异常转录因子推断与信号通路分析

用一种新的转录因子介导的信号通路分析方法分析肿瘤芯片数据,从中推断异常的转录因子和信号通路.先通过统计目标基因的表达推断转录因子的活性,然后将那些活性异常的转录因子映射到KEGG信号通路上.此方法整合了基因表达调控的实验数据和信号通路信息.利用此方法,对斯坦福芯片数据库中的162个人类胃癌数据进行分析,结果发现,大部分芯片中的TGF-beta,JAK-STAT,NF-kappaB和Notch信号通路被异常激活.进一步对这些通路进行研究,将有助于探究胃癌的发生、发展机理和进行合理的药物设计.     

过表达E3泛素连接酶ABRv1通过泛素化CPK3提高拟南芥干旱耐受

拟南芥基因ABRv1编码了一个E3泛素连接酶,其表达量受到干旱胁迫的诱导.为了探究ABRv1功能,我们构建了ABRv1的过表达株系并进行干旱处理,结果显示ABRv1过表达株系OE-3具有90.4%的存活率,ABRv1过表达株系OE-7有88.2%的存活率,野生型Col的存活率则为53.8%,而abrv1突变体仅有7.7%的存活率,说明过表达ABRv1提高了拟南芥对干旱的耐受能力.我们还测定了干旱处理下的失水率,也能得出与上述一致的结论.此外,我们使用纯化的GSTABRv1、His-CPK3蛋白进行了体外pull-down实验和体外泛素化实验,结果证明ABRv1能够和CPK3发生相互作用,ABRv1具有E3泛素连接酶活性并且能够把CPK3单泛素化.结果揭示了ABRv1作为一个正调控因子通过泛素化作用底物CPK3参与了拟南芥的干旱胁迫应答过程.     

泛素-蛋白酶体通路的转化研究进展

泛素-蛋白酶体通路(UPP)负责细胞内大部分蛋白质的降解,在调整细胞周期、控制信号转导和调节细胞凋亡过程中起着至关重要的作用,并成为肿瘤治疗的靶标。该通路的转化研究促成第一代蛋白酶抑制剂的研发,以及临床应用治疗血液系统恶性肿瘤患者。     

去泛素化酶及其与人类疾病相关性的研究进展

去泛素化酶(Deubiquitinating enzymes,DUBs)通过与泛素化靶蛋白的相互作用,切割或去除靶蛋白的泛素链,进而逆转靶蛋白的降解,参与泛素相关的信号转导及人类许多疾病的发生和发展.研究DUBs系统及其与人类疾病的相关性,挖掘出DUBs中新药的靶点对人类健康有重要作用.近年来,针对DUBs的种类、结构...     

细胞膜去极化通过激活MAPK信号通路促进原代肌母细胞增殖

细胞膜去极化可促进某些细胞包括肌卫星细胞的增殖,但去极化对于肌母细胞的作用还不清楚.本文通过培养基中高浓度的钾离子(K~+)引发小鼠原代肌母细胞膜的去极化,采用直接计数法评估细胞的增殖能力.结果显示,在K~+浓度为25 mmol/L的培养基中培养24 h后,肌母细胞数量较常规培养基(5 mmol/L K~+)明显增加,但K~+高至50 mmol/L和100 mmol/L时对细胞增殖没有促进作用.通过流式细胞技术进行细胞周期分析显示,25 mmol/L K~+处理使G1期的细胞数量减少,S期的细胞数量增加.免疫荧光染色和Western blot研究发现,25 mmol/L K~+处理后,对肌母细胞的肌分化能力没有影响.进一步研究发现,25 mmol/L K~+明显促进了肌母细胞MAPK信号通路(ERK1/2)的激活,并与其促进细胞增殖的效应相关. MEK1/ERK1/2的两种抑制剂U0126和PD98059均可减弱细胞膜去极化引起的细胞增殖促进效应.综上,研究结果表明细胞膜去极化通过激活MAPK通路促进小鼠原代肌母细胞的增殖.     

溴氰菊酯胁迫下小菜蛾泛素化蛋白的分析与鉴定

利用聚丙烯酰胺凝胶电泳、Western Blot和LC MS/MS技术,对在溴氰菊酯胁迫下的小菜蛾(Plutellaxylostella)四龄幼虫的泛素化蛋白(Ubiquitinated protein)的组分进行分析,结果表明小菜蛾溴氰菊酯敏感品系与小菜蛾溴氰菊酯抗性品系里的泛素化蛋白表达量有显著差异.本实验成功证明了在药剂胁迫下小菜蛾泛素化蛋白存在表达上的差异,该研究结果为分析昆虫细胞中泛素的功能及其对昆虫生理、生化和环境胁迫等方面的调节作用提供了参考.     

递增负荷运动通过NO信号通路降低高血压机制的探讨

为探讨大负荷运动通过NO信号通路降低高血压的可能机制,作者利用大鼠高血压模型进行大负荷运动后,再以酶化学方法检测大鼠血液中一氧化氮合酶(NOS)活性变化以及用反转录多聚酶链式反应检测大鼠大动脉组织中NO和NOS的mRNA水平;还以免疫印迹实验检测大鼠大动脉组织中VEGF蛋白水平的变化及动脉血管组织Akt,PI3K水平.结果显示,模型组心脏中NOS活性及NO的mRNA水平显著高于对照组(P<0.05),模型组心脏中NOS及NO的蛋白表达水平也显著高于对照组(P<0.05),模型组心脏组织中激活型Akt,PI3K水平高于对照组,而总Akt,PI3K蛋白水平没有明显增高.以上结果表明,大负荷运动可增强组织中的Akt,PI3K活性,从而调节血液中NOS活性,调节血液中NO水平,并最终降低高血压.     

去泛素化酶7与髓样分化因子88蛋白相互作用的研究

Toll-like受体（TLRs）介导的信号途径不仅参与机体识别病原微生物入侵、诱导免疫应答,而且还可诱导机体产生破坏性炎症反应．通过免疫共沉淀、免疫荧光共定位、间接免疫荧光等实验方法鉴定去泛素化酶7（USP7）和TLR信号途径中重要接头蛋白——髓样分化因子88（MyD88）的相互作用,结果表明USP7和MyD88可在细胞质中共定位并可发生相互作用．该研究对阐释TLR信号通路的机制奠定了重要的基础．     

不同温度下环渤海典型湿地沉积物中二苯并噻吩降解率与功能基因响应关系研究

为了揭示不同温度下环渤海典型湿地沉积物中二苯并噻吩(DBTs)的降解途径, 选择辽河口芦苇湿地、天津北大港滩涂湿地和黄河河口湿地的3种不同湿地沉积物, 在模拟季节性温度条件下, 培养56天, 测定DBT的降解率, 分析DBT降解功能基因的丰度, 建立DBT降解率与功能基因群组定量响应关系模型, 解析不同温度下3种湿地沉积物中DBT的降解途径。实验结果表明, 3种湿地沉积物中DBT的降解率均随培养温度升高而升高, 4ºC培养时, DBT的降解率排序为黄河河口湿地>天津北大港滩涂湿地>辽河口芦苇湿地; 30ºC培养时, DBT的降解率排序为北大港滩涂湿地>黄河河口湿地>辽河口芦苇湿地; catA与dszB基因影响DBT的降解速率。低温条件和中温条件下, 在3种湿地中, 代表Kodama途径的nagAc/nahAc和nidA基因分别起主要作用, 代表4S途径的dszB基因在黄河河口湿地及北大港滩涂湿地中有重要作用。     

MC尼龙热降解动力学的研究

通过热重分析研究了ＭＣ尼龙（单体浇铸尼龙）在空气环境下的热氧降解过程和降解动力学，选用ＭＣ尼龙粉粒为样品，应用日本ＴＡＳ－１００型热分析仪，升温速率分别为５℃／ｍｉｎ、１０℃／ｍｉｎ、１５℃／ｍｉｎ加热到５００℃，得到ＴＧ—ＤＴＧ的数据和曲线。从所得到的结果推断出热氧降解过程中的反应机理是大分子链的无规断裂，反应为一级反应。用小泽丈夫法原理计算相应的反应活化能和反应动力学参数。     

血吸虫血红蛋白降解途径的重构及关键酶蛋白保守结构域的分析

利用生物信息学方法,以疟原虫的血红蛋白降解途径为基础,成功地构建出了日本血吸虫和曼氏血吸虫的血红蛋白降解途径,并对降解途径上的关键酶蛋白的保守结构域进行了序列及结构分析。预测得到的血吸虫血红蛋白降解酶保守结构域,与疟原虫相比,在序列上催化位点高度保守,在结构上空间相对位置较一致,为研究血吸虫血红蛋白降解酶,及其与底物或...     

西达本胺通过线粒体凋亡途径诱导结肠癌HCT-15细胞凋亡

研究西达本胺(Chidamide)对结肠癌细胞系HCT-15的增殖抑制作用及机制. 以不同浓度西达本胺处理HCT-15细胞,CCK-8法检测细胞增殖情况及细胞的药物敏感性;平板克隆形成实验检测细胞体外克隆形成能力;流式细胞术检测细胞凋亡;EdU实验检测细胞增殖周期;Western blot检测乙酰化组蛋白、线粒体凋亡途径相关蛋白、细胞周期相关蛋白表达水平的变化. 结果表明:西达本胺抑制HCT-15细胞增殖呈浓度和时间依赖性,细胞体外克隆形成能力减弱,凋亡增多,细胞分裂相明显减少、总周期变慢,乙酰化组蛋白H3和H4、线粒体介导的相关凋亡蛋白表达上调、p21、p27表达上调、CDK2、CyclinA2蛋白表达下调. 西达本胺可抑制HCT-15细胞增殖,通过线粒体途径诱导细胞凋亡并阻滞细胞周期.     

尼龙1010热氧降解过程与动力学研究

用ＴＧ—ＤＴＧ法研究尼龙１０１０在空气流中的热氧降解过程和动力学，发现尼龙１０１０的热氧降解过程由３个紧连的步骤组成，随升温速率提高，降解温度的变化比较复杂，对应于各ＤＴＧ峰时的降解率则呈峰值变化，但对总降解率影响不大，降解过程中均有约６％的残碳存在；用Ｃｏａｔｓ—Ｒｅｄｆｅｒｎ方程进行动力学处理，确定尼龙１０１０热氧降解的表观反应级数为１．１级，反应活化能为３１３．３ｋＪ／ｍｏｌ。     

一株毛霉(Mucor.sp.)对氧化乐果降解作用的初步研究

在氧化乐果和葡萄糖共基质条件下,毛霉通过共代谢作用降解氧化乐果.基质中葡萄糖浓度为2 500mg/L、氧化乐果浓度在154～616 mg/L范围时菌体生长以及氧化乐果的降解均较快.氧化乐果浓度超过1 232 mg/L时,菌体生长受抑制,氧化乐果的降解缓慢.     

超声降解生活污水中有害物质的实验方法

研究了不同空化状态下超声作用下对厦门湖水、污染处理厂污水、啤酒废水及不同浓度的洗涤水中有害物质的降解作用,从而探讨超声作用温度、时间、功率及PH值变化对废水中有害物质降解的影响,发现一些超声作用与有害物质之间的基本关系：超声作用对生活污水中洗涤剂和氨氮有明显的解作用,并且其作用受pH影响较大,降解程度随超声作用的功率,作用时间的增加而增加,随温度的提高先增高后降低,随起始pH值降低而增高,对声作用降解有害物质的初步搜索结果,为进一步研究、开发新的降解途径作了必要的铺垫。     

医用藻酸盐敷料体外降解的研究

研究藻酸盐医用敷料体外降解的规律及不同降解时间其产物对内皮细胞增殖情况的影响,为藻酸盐医用敷料在临床使用中提供参考。以PBS缓冲液(模拟体液环境)为降解介质,对藻酸盐敷料进行体外降解;用藻酸盐敷料的失重率、分子质量变化表征本体的变化规律;用降解液中降解产物的糖醛酸含量变化表征降解产物的变化规律。将降解液与内皮细胞共培养,用MTT法检测内皮细胞增殖情况。藻酸盐敷料在模拟体液环境条件下,可以被降解,42 d失重率为61.2%,降解过程中其分子质量逐渐减小,最终产物为糖醛酸,其浓度不断增大。不同时间的降解产物均能促进内皮细胞的增殖。藻酸盐医用敷料体外降解比较快,完全降解的最终产物为糖醛酸,其降解液可以促进内皮细胞的增殖、分化,提高细胞新陈代谢能力,增加新细胞的再生速度,促进伤口的愈合。     

淀粉/聚乙烯薄膜中聚乙烯的降解特性研究

对含３０％淀粉的淀粉／聚乙烯薄膜进行环境降解、环境生物降解和环境曝晒试验,发现淀粉／聚乙烯薄膜在环境中暴晒降解的速度远远大于生物降解的速度,在应用环境中经过４周的降解,薄膜中聚乙烯的分子量损失达６２．５％;经５周的曝晒降解后,薄膜中聚乙炮的分子量损失达８７．５％;薄膜降解后,平板流变粘度降低２个数量级以上。     

细菌纤维素的体内降解及其组织相容性

为了研究细菌纤维素（BC）植入皮下组织后对其周围组织细胞产生的影响,以及由于周围细胞的长入和组织液中相关成分的直接接触,使材料在体内复杂环境下所发生的物理结构变化。以组织工程用支架基体材料细菌纤维素为研究对象,对这种材料的体内降解行为和体内组织相容性进行研究。选取成熟的Wistar大鼠,采取背部皮下植入的方式。将BC植入一定时间后。对取出的BC清洗干净后进行材料学检测分析。对植入部位的组织进行透射电镜观察分析。对取出的材料进行结构和形貌表征可知。随着植入时间的延长,在细胞和组织液的综合作用下,BC分子链中部分C—O—C键断裂,分子间结合力降低。结晶度逐渐下降。因此,BC在体内复杂环境的影响下会发生轻微降解。BC与皮下组织有较好的生物相容性,材料周围组织细胞状态良好。能长入材料30μm处的空间网络结构中．并且伴有血管生成．